Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
PAX8
Белок PAX8 PDB 1k78.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

2К27

Идентификаторы
ПсевдонимыPAX8 , парная коробка 8
Внешние идентификаторыOMIM : 167415 MGI : 97492 HomoloGene : 2589 GeneCards : Pax8
Расположение гена ( человек )
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человека) [1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение PAX8
Геномное расположение PAX8
Группа2q14.1Начинать113 215 997 п.н. [1]
Конец113 278 921 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 2 (мышь)
Chr.Хромосома 2 (мышь) [2]
Хромосома 2 (мышь)
Геномное расположение PAX8
Геномное расположение PAX8
Группа2 A3 | 2 16,43 смНачинать24 420 560 п.н. [2]
Конец24 475 599 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE PAX8 121 в формате fs.png

PBB GE PAX8 207921 x в формате fs.png

PBB GE PAX8 207923 x в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• Связывание ДНК • Связывание ДНК, специфичное
для последовательности
• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции
• GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 ДНК-связывающая активность активатора транскрипции, специфическая
для РНК-полимеразы II • GO: 0000980 Цис-регуляторная область РНК-полимеразы II, специфичное связывание ДНК
• Активность рецептора тироид -стимулирующего гормона
• Связывание с белком GO: 0001948
• Последовательность основного промотора РНК-полимеразы II специфическое связывание ДНК
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ДНК-связывающий фактор транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II
Сотовый компонент• нуклеоплазма
• ядро клетки
Биологический процесс• регуляция процесса апоптоза
• развитие пронефроса
• регуляция дифференцировки эпителиальных клеток метанефрических канальцев нефрона
• дифференцировка клеток
• развитие мезонефрических канальцев
• положительная регуляция ветвления, участвующая в морфогенезе зачатка мочеточника
• развитие эпителия почек
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• положительная регуляция Дифференцировка метанефрических DCT-клеток
• негативная регуляция процесса апоптоза мезенхимальных клеток, участвующего в морфогенезе метанефрических нефронов
• негативная регуляция апоптоза процесса , связанный с метанефрическим собирающего развитием канала
• развития почек
• Спецификация pronephric поля
• положительного регулирование мезенхимального к эпителиальному переходу , участвующему в вторичной почке морфогенеза
• анатомической структуры морфогенезе
• развитие метанефрического эпителия
• мезенхимальных к эпителиального переход участвует в вторичной почке морфогенез
• транскрипции от Промотор РНК-полимеразы II
• регуляция секреции тиреотропного гормона
• транскрипция, ДНК-шаблон
• развитие отических пузырьков
• Развитие метанефрических дистальных извитых канальцев
• негативная регуляция апоптотического процесса мезенхимальных клеток, участвующая в развитии метанефроса
• развитие мезонефроса
• позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• образование метанефрических канальцев нефрона
• развитие многоклеточного организма
• развитие центральной нервной системы
• морфогенез тела метанефрической запятой
• ветвление, участвующее в морфогенезе зачатка мочеточника
• развитие щитовидной железы
• положительная регуляция выработки тироидных гормонов
• отрицательная регуляция апоптотического процесса, участвующего в развитии канальцев нефрона метанефрона
• S-образный морфогенез тела
• морфогенез внутреннего уха
• развитие мочеполовой системы
• метаболический процесс соединений серы
• S-образный метанефрический морфогенез тела
• развитие метанефроса
• клеточный ответ на стимул гонадотропина
• положительная регуляция транскрипция с промотора РНК-полимеразы II
• сигнальный путь тиреотропного гормона
• негативная регуляция процесса апоптоза клеток сердечной мышцы
• развитие межжелудочковой перегородки
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

7849

18510

Ансамбль

ENSG00000125618

ENSMUSG00000026976

UniProt

Q06710

Q00288

RefSeq (мРНК)

NM_003466
NM_013951
NM_013952
NM_013953
NM_013992

NM_011040

RefSeq (белок)

NP_003457
NP_039246
NP_039247
NP_054698

NP_035170

Расположение (UCSC)Chr 2: 113,22 - 113,28 МбChr 2: 24,42 - 24,48 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Соединенный гена коробки 8 , также известный как Pax8 , является белком , который в организме человека кодируется Pax8 геном . [5]

Функция [ править ]

Этот ген является членом семейства факторов транскрипции парных боксов ( PAX ) . Члены этого семейства генов обычно кодируют белки, которые содержат парный бокс-домен , октапептид и гомеодомен парного типа . Семейство генов PAX играет важную роль в формировании тканей и органов во время эмбрионального развития и поддержании нормальной функции некоторых клеток после рождения. Гены PAX дают инструкции по созданию белков, которые прикрепляются к определенным участкам ДНК. [6] Этот ядерный белок участвует в фолликулярной клетке щитовидной железы.развитие и экспрессия генов, специфичных для щитовидной железы. PAX8 выделяет гормоны, важные для регулирования роста, развития мозга и обмена веществ. Также функционирует на самых ранних стадиях органогенеза почек, мюллерова системы и тимуса. [7] Кроме того, PAX8 экспрессируется в выделительной системе почек, эпителиальных клетках эндоцервикса, эндометрия, яичника, фаллопиевых труб, семенных пузырьков, придатка яичка, островковых клеток поджелудочной железы и лимфоидных клеток. [8] PAX8 и другие факторы транскрипции играют роль в связывании с ДНК и регулируют гены, которые управляют синтезом гормонов щитовидной железы (Tg, TPO, Slc5a5 и Tshr).

PAX8 (и PAX2) - один из важных регуляторов морфогенеза мочеполовой системы. Они играют роль в спецификации первых почечных клеток эмбриона и остаются важными участниками на протяжении всего развития. [9]

Было показано, что PAX8 взаимодействует с гомеобоксом 1 NK2 . [10]

Клиническое значение [ править ]

Ген PAX8 также связан с врожденным гипотиреозом из-за дисгенезии щитовидной железы из-за его роли в росте и развитии щитовидной железы. Мутация в гене PAX8 может препятствовать нормальному развитию или нарушать его. Эти мутации могут влиять на различные функции белка, включая связывание ДНК, активацию гена, стабильность белка и взаимодействие с коактиватором p300. Недостаток гена PAX может привести к дефектам развития, называемым врожденными аномалиями почек и мочевыводящих путей (CAKUT).

Рак [ править ]

Мутации PAX8 связаны с различными формами рака.

Механизмы [ править ]

PAX8 считается «главным регуляторным фактором транскрипции». [8] Как главный регулятор, возможно, что он регулирует экспрессию генов, отличных от специфичных для щитовидной железы. Несколько известных генов-супрессоров опухолей, таких как TP53 и WT1, были идентифицированы как мишени транскрипции в клетках астроцитомы человека. Более 90% опухолей щитовидной железы возникают из фолликулярных клеток щитовидной железы. [8] Слитый белок, PAX8-PPAR-γ , вовлечен в некоторые фолликулярные карциномы щитовидной железы и фолликулярный вариант папиллярной карциномы щитовидной железы. [11] Механизм этого преобразования не совсем понятен, но есть несколько предложенных возможностей. [12] [13] [14]

  • Ингибирование нормальной функции PPAR y химерным белком PAX8 / PPARy посредством доминирующего отрицательного эффекта
  • Активация нормальных мишеней PPARy из-за сверхэкспрессии химерного белка, который содержит все функциональные домены PPAR y дикого типа
  • Отмена регулирования функции PAX8
  • Активация набора генов, не связанных как с PPARy дикого типа, так и с PAX8 дикого типа

Ген PAX 8 имеет некоторую связь с фолликулярными опухолями щитовидной железы. Было замечено, что PAX8 / PPAR y- положительные опухоли редко экспрессируют в комбинации мутации RAS . Это говорит о том, что фолликулярные карциномы развиваются двумя разными путями либо с PAX8 / PPAR y, либо с RAS .

Были охарактеризованы альтернативные варианты транскрипционного сплайсинга, кодирующие разные изоформы. [5] Механизм включения генов неизвестен. Некоторые исследования показали, что почечные гены PAX действуют как факторы, способствующие выживанию, и позволяют опухолевым клеткам сопротивляться апоптозу. Подавляющая регуляция экспрессии гена PAX подавляет рост клеток и индуцирует апоптоз. Это может быть возможным путем для достижения терапевтических целей при раке почек.

Некоторые исследования полногеномного секвенирования показали, что PAX8 также нацелен на BRCA1 (канцерогенез), пути MAPK (злокачественные новообразования щитовидной железы) и Ccnb1 и Ccnb2 (процессы клеточного цикла). Показано, что PAX8 участвует в пролиферации и дифференцировке опухолевых клеток, передаче сигналов, апоптозе, полярности и транспорте клеток, подвижности и адгезии клеток. [8]

Связанные типы рака [ править ]

Мутации в этом гене были связаны с дисгенезии щитовидной железы , щитовидной железы , фолликулярная карцинома и атипичные фолликулярная щитовидной железы аденомы .

Перестройка PAX8 / PPARy составляет 30-40% фолликулярных карцином обычного типа [15] и менее 5% онкоцитарных карцином (также известных как новообразования Hurthle-Cell). [16]

Экспрессия PAX8 повышена в опухолевых тканях почек, опухолях Вильмса, раке яичников и карциномах Мюллера. По этой причине иммунодетекция PAX8 широко используется для диагностики первичных и метастатических опухолей почек. О реактивации экспрессии PAX8 (или Pax2) сообщалось в педиатрических опухолях Вильмса, почти во всех подтипах почечно-клеточной карциномы, нефрогенных аденомах, раковых клетках яичников, карциномах мочевого пузыря, простаты и эндометрия. [9]

Опухоли, экспрессирующие PAX8 / PPARy , обычно присутствуют в молодом возрасте, имеют небольшой размер, имеют сплошную / гнездовую структуру роста и часто включают сосудистую инвазию.

См. Также [ править ]

  • Гены pax

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000125618 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026976 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ a b «Ген Энтреса: PAX8 парный бокс-ген 8» .
  6. ^ "Ген PAX8" . Домашний справочник по генетике . 2016-03-28 . Проверено 5 апреля 2016 .
  7. ^ Лаури AR, R Перец, Бяо Н, Крейн ДФ, Барлетты JA, французский C, Chirieac LR, Lis R, Loda М, Hornick ДЛ, Drapkin R, Hirsch МС (июнь 2011 г.). «Комплексный анализ экспрессии PAX8 в эпителиальных опухолях человека». Американский журнал хирургической патологии . 35 (6): 816–26. DOI : 10,1097 / PAS.0b013e318216c112 . PMID 21552115 . S2CID 14297595 .  
  8. ^ a b c d Фернандес Л. П., Лопес-Маркес А., Сантистебан П. (январь 2015 г.). «Факторы транскрипции щитовидной железы в развитии, дифференциации и болезни». Обзоры природы. Эндокринология . 11 (1): 29–42. DOI : 10.1038 / nrendo.2014.186 . hdl : 10261/117036 . PMID 25350068 . S2CID 39778077 .  
  9. ^ a b Шарма Р., Санчес-Феррас О, Бушар М. (август 2015 г.). «Гены Pax в развитии, заболеваниях и регенерации почек». Семинары по клеточной биологии и биологии развития . Факторы парамутации и транскрипции Pax. 44 : 97–106. DOI : 10.1016 / j.semcdb.2015.09.016 . PMID 26410163 . 
  10. ^ Ди Пальмы Т, Ницш Р, Mascia А, Ницш л, Ди Лауро Р, М Заннини (январь 2003). «Спаренный фактор, содержащий домен Pax8, и фактор, содержащий гомеодомен, TTF-1 напрямую взаимодействуют и синергетически активируют транскрипцию» . Журнал биологической химии . 278 (5): 3395–402. DOI : 10.1074 / jbc.M205977200 . PMID 12441357 . 
  11. ↑ Raman P, Koenig RJ (октябрь 2014 г.). «Слитый белок Pax-8-PPAR-γ при карциноме щитовидной железы» . Обзоры природы. Эндокринология . 10 (10): 616–23. DOI : 10.1038 / nrendo.2014.115 . PMC 4290886 . PMID 25069464 .  
  12. ^ Rüsch A, Erway LC, Оливер D, Vennström B, D Форрест (декабрь 1998). «Бета-зависимая экспрессия рецептора тироидного гормона проводимости калия во внутренних волосковых клетках в начале слуха» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (26): 15758–62. Bibcode : 1998PNAS ... 9515758R . DOI : 10.1073 / pnas.95.26.15758 . PMC 28117 . PMID 9861043 .  
  13. ↑ Weiss RE, Xu J, Ning G, Pohlenz J, O'Malley BW, Refetoff S (апрель 1999 г.). «Мыши с дефицитом коактиватора стероидных рецепторов 1 (SRC-1) устойчивы к гормону щитовидной железы» . Журнал EMBO . 18 (7): 1900–4. DOI : 10.1093 / emboj / 18.7.1900 . PMC 1171275 . PMID 10202153 .  
  14. ^ Brown NS, Smart A, Sharma V, Brinkmeier ML, Greenlee L, Camper SA, Jensen DR, Eckel RH, Krezel W, Chambon P, Haugen BR (июль 2000 г.). «Устойчивость к тироидным гормонам и повышенная скорость метаболизма у RXR-гамма-дефицитных мышей» . Журнал клинических исследований . 106 (1): 73–9. DOI : 10.1172 / JCI9422 . PMC 314362 . PMID 10880050 .  
  15. ^ Никифорова М., Линч Р., Biddinger PW, Александр EK, Дорн GW, Tallini G, Kroll TG, Никифоров YE (май 2003). «Точечные мутации RAS и гамма-перестройка PAX8-PPAR в опухолях щитовидной железы: доказательства различных молекулярных путей в фолликулярной карциноме щитовидной железы» . Журнал клинической эндокринологии и метаболизма . 88 (5): 2318–26. DOI : 10.1210 / jc.2002-021907 . PMID 12727991 . 
  16. ↑ Abel ED, Boers ME, Pazos-Moura C, Moura E, Kaulbach H, Zakaria M, Lowell B, Radovick S, Liberman MC, Wondisford F (август 1999). «Дивергентные роли изоформ бета-рецепторов тироидных гормонов в эндокринной системе и слуховой системе» . Журнал клинических исследований . 104 (3): 291–300. DOI : 10.1172 / JCI6397 . PMC 408418 . PMID 10430610 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Полеев А., Фикеншер Х, Мундлос С., Винтерпахт А, Забель Б., Фидлер А., Грусс П., Плахов Д. (ноябрь 1992 г.). «PAX8, ген парного бокса человека: выделение и экспрессия в развивающихся опухолях щитовидной железы, почек и Вильмса». Развитие . 116 (3): 611–23. PMID  1337742 .
  • Полеев А., Вендлер Ф., Фикеншер Х., Заннини М.С., Ягинума К., Эбботт С., Плахов Д. (март 1995 г.). «Отличительные функциональные свойства трех изоформ человеческого парного белка PAX8, полученных в результате альтернативного сплайсинга в опухолях щитовидной железы, почек и Вильмса». Европейский журнал биохимии / FEBS . 228 (3): 899–911. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1995.tb20338.x . PMID  7737192 .
  • Стэплтон П., Вейт А., Урбанек П., Козмик З., Басслингер М. (апрель 1993 г.). «Хромосомная локализация семи генов PAX и клонирование нового члена семьи, PAX-9». Генетика природы . 3 (4): 292–8. DOI : 10.1038 / ng0493-292 . PMID  7981748 . S2CID  21338655 .
  • Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
  • Козмик З., Курцбауэр Р., Дёрфлер П., Басслингер М. (октябрь 1993 г.). «Альтернативный сплайсинг транскриптов гена Pax-8 регулируется в процессе развития и генерирует изоформы с различными свойствами трансактивации» . Молекулярная и клеточная биология . 13 (10): 6024–35. DOI : 10.1128 / mcb.13.10.6024 . PMC  364662 . PMID  8413205 .
  • Pilz AJ, Povey S, Gruss P, Abbott CM (1993). «Картирование человеческих гомологов генов, содержащих парные коробки». Геном млекопитающих . 4 (2): 78–82. DOI : 10.1007 / BF00290430 . PMID  8431641 . S2CID  30845070 .
  • Боналду М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. DOI : 10.1101 / gr.6.9.791 . PMID  8889548 .
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID  9373149 .
  • Fraizer GC, Shimamura R, Zhang X, Saunders GF (декабрь 1997 г.). «PAX 8 регулирует транскрипцию человеческого WT1 через новый сайт связывания ДНК» . Журнал биологической химии . 272 (49): 30678–87. DOI : 10.1074 / jbc.272.49.30678 . PMID  9388203 .
  • Macchia PE, Lapi P, Krude H, Pirro MT, Missero C, Chiovato L, Souabni A, Baserga M, Tassi V, Pinchera A, Fenzi G, Grüters A, Busslinger M, Di Lauro R (май 1998 г.). «Мутации PAX8, связанные с врожденным гипотиреозом, вызванным дисгенезией щитовидной железы». Генетика природы . 19 (1): 83–6. DOI : 10.1038 / ng0598-83 . PMID  9590296 . S2CID  33957230 .
  • Мансури А., Чоудхури К., Грусс П. (май 1998 г.). «Фолликулярным клеткам щитовидной железы необходима функция гена Pax8». Генетика природы . 19 (1): 87–90. DOI : 10.1038 / ng0598-87 . PMID  9590297 . S2CID  205342136 .
  • Телль Дж., Пеллиццари Л., Эспозито Дж., Пусилло С., Macchia PE, Ди Лауро Р., Даманте Дж. (Июль 1999 г.). «Структурные дефекты мутанта Pax8, которые вызывают врожденный гипотиреоз» . Биохимический журнал . 341 (1): 89–93. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3410089 . PMC  1220333 . PMID  10377248 .
  • De Leo R, Miccadei S, Zammarchi E, Civitareale D (ноябрь 2000 г.). «Роль p300 в индукции экспрессии гена тиреопероксидазы Pax 8» . Журнал биологической химии . 275 (44): 34100–5. DOI : 10.1074 / jbc.M003043200 . PMID  10924503 .
  • Робертс Е.К., Дид Р.В., Иноуэ Т., Нортон Д.Д., Шаррокс А.Д. (январь 2001 г.). «Белки Id спираль-петля-спираль противодействуют активности фактора транскрипции pax, ингибируя связывание ДНК» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (2): 524–33. DOI : 10.1128 / MCB.21.2.524-533.2001 . PMC  86614 . PMID  11134340 .
  • Vilain C, Rydlewski C, Duprez L, Heinrichs C, Abramowicz M, Malvaux P, Renneboog B, Parma J, Costagliola S, Vassart G (январь 2001 г.). «Аутосомно-доминантная передача врожденной гипоплазии щитовидной железы из-за мутации потери функции PAX8». Журнал клинической эндокринологии и метаболизма . 86 (1): 234–8. DOI : 10,1210 / jc.86.1.234 . PMID  11232006 .
  • Congdon T, Nguyen LQ, Nogueira CR, Habiby RL, Medeiros-Neto G, Kopp P (август 2001 г.). «Новая мутация (Q40P) в PAX8, связанная с врожденным гипотиреозом и гипоплазией щитовидной железы: доказательства фенотипической изменчивости у матери и ребенка» . Журнал клинической эндокринологии и метаболизма . 86 (8): 3962–7. DOI : 10,1210 / jc.86.8.3962 . PMID  11502839 .
  • Miccadei S, De Leo R, Zammarchi E, Natali PG, Civitareale D (апрель 2002 г.). «Синергетическая активность фактора транскрипции щитовидной железы 1 и Pax 8 зависит от взаимодействия промотора / энхансера» . Молекулярная эндокринология . 16 (4): 837–46. DOI : 10,1210 / me.16.4.837 . PMID  11923479 .
  • Marques AR, Espadinha C, Catarino AL, Moniz S, Pereira T., Sobrinho LG, Leite V (август 2002 г.). «Экспрессия перегруппировок PAX8-PPAR гамма 1 как в фолликулярных карциномах щитовидной железы, так и в аденомах». Журнал клинической эндокринологии и метаболизма . 87 (8): 3947–52. DOI : 10,1210 / jc.87.8.3947 . PMID  12161538 .
  • Ди Пальма Т., Нитч Р., Маския А., Нитч Л., Ди Лауро Р., Заннини М. (январь 2003 г.). «Спаренный фактор, содержащий домен Pax8, и фактор, содержащий гомеодомен, TTF-1 напрямую взаимодействуют и синергетически активируют транскрипцию» . Журнал биологической химии . 278 (5): 3395–402. DOI : 10.1074 / jbc.M205977200 . PMID  12441357 .

Внешние ссылки [ править ]

  • PAX8 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • «Ген Xenbase: Резюме для pax8, виды: Xenopus tropicalis» . Xenbase . xenbase.org . Проверено 17 июля 2009 . Ресурс Xenopus laevis и tropicalis

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .