• транспорт фолиевой кислоты • транспорт воды • активация тромбоцитов • развитие многоклеточных организмов • регуляция формы клеток • транспорт аминокислот • позитивная регуляция перехода эпителия в мезенхиму • позитивная регуляция миграции клеток • передача сигнала Rho-белка • заживление ран, распространение клеток • положительная регуляция разборки внеклеточного матрикса • организация инвадоподий • регуляция морфогенеза ламеллиподий • клеточный морфогенез • лимфангиогенез • негативная регуляция пролиферации клеток • развитие легких • негативная регуляция апоптотического процесса • развитие лимфатических узлов • позитивная регуляция движения клеточных компонентов • обязательство судьбы лимфатических эндотелиальных клеток • актин-опосредованное сокращение клеток • регуляция распространения клеток, зависящая от адгезии субстрата • позитивная регуляция агрегации тромбоцитов • регуляция сокращения миофибробластов • трансмембранный транспорт аминокислот
Podoplanin является белком , который в организме человека кодируется «PDPN» ген . [4] [5] [6]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Структура и функции
2 Клиническое значение
3 ссылки
4 Дальнейшее чтение
5 Внешние ссылки
Структура и функции [ править ]
Подопланин - это белок муцинового типа с массой от 36 до 43 кДа. Он относительно хорошо сохраняется между видами, с гомологами у людей, мышей, крыс, собак и хомяков. [7]
Этот ген кодирует интегральную мембрану типа I, сильно O- гликозилированный гликопротеин с разнообразным распределением в тканях человека. Физиологическая функция этого белка может быть связана с его муциновым характером. Гомологичный белок у других видов был описан как дифференцирующий антиген и рецептор вируса гриппа. Специфическая функция этого белка не определена, но предполагается, что он является маркером повреждения легких. Были идентифицированы альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие разные изоформы. [6]
Было обнаружено, что этот белок выполняет функции в альвеолярных клетках легких, подоцитах почек и лимфатических эндотелиальных клетках. Совсем недавно этот белок был обнаружен в нервной ткани как у мышей, так и у людей. [8]
В лимфатических эндотелиальных клетках эксперименты показали, что подпланин играет роль в правильном формировании связей между сердечно-сосудистой системой и лимфатической системой, обычно вызывая жировую болезнь печени у этих мышей. [8]
Хотя точная функция во многих тканях неизвестна, подпланин обычно поддается обнаружению с помощью иммунофлуоресцентного окрашивания и, как было показано, совместно локализуется с белком нестином , белком промежуточных филаментов типа VI, экспрессируемым почти в основном в нервных тканях. [9] В настоящее время единственный белок, который, как известно, физиологически взаимодействует с подопланином, - это CLEC-2 , лектин 2 С-типа, экспрессируемый на тромбоцитах и кроветворных клетках . [10] Оба играют роль в правильном формировании кровеносных / лимфатических связей в эмбриональном развитии.
Клиническое значение [ править ]
PDPN широко изучалась в области рака. Это специфический маркер лимфатических сосудов, и, поскольку уровни лимфангиогенеза коррелируют с плохим прогнозом у онкологических больных, его можно использовать в качестве диагностического маркера. [7] Он часто активируется при определенных типах рака, включая несколько типов плоскоклеточного рака , злокачественную мезотелиому и опухоли головного мозга . [7] Более того, он может быть активирован ассоциированными с раком фибробластами (CAF) в строме опухоли [7] [11], где это было связано с плохим прогнозом. [12]
В плоскоклеточных карциномах PDPN, как полагают, играет ключевую роль в инвазивности раковых клеток, контролируя инвадоподии и, таким образом, опосредуя эффективную деградацию ECM . [13]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000162493 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Zimmer G, Oeffner F, Фон Messling В, Tschernig Т, Gröness HJ, Klenk HD, Herrler G (июль 1999 г.). «Клонирование и характеристика gp36, гликопротеина муцинового типа человека, предпочтительно экспрессируемого в эндотелии сосудов» . Биохимический журнал . 341 (Pt 2) (Pt 2): 277–84. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3410277 . PMC 1220357 . PMID 10393083 .
^ Ма Т, Ян Б, Matthay М.А., Verkman А.С. (июль 1998 года). «Доказательства против роли мыши, крысы и двух клонированных изоформ t1alpha человека в качестве водного канала или регулятора водных каналов аквапоринового типа». Американский журнал респираторной клетки и молекулярной биологии . 19 (1): 143–9. DOI : 10,1165 / ajrcmb.19.1.2953 . PMID 9651190 .
^ a b "Энтрез Ген: PDPN подпланин" .
^ а б в г Астарита Дж. Л., Актон С. Е., Терли С. Дж. (2012). «Подопланин: новые функции в развитии, иммунной системе и раке» . Границы иммунологии . 3 : 283. DOI : 10.3389 / fimmu.2012.00283 . PMC 3439854 . PMID 22988448 .
^ a b Fu J, Gerhardt H, McDaniel JM, Xia B, Liu X, Ivanciu L, Ny A, Hermans K, Silasi-Mansat R, McGee S, Nye E, Ju T, Ramirez MI, Carmeliet P, Cummings RD, Лупу Ф., Ся Л. (ноябрь 2008 г.). «Дефицит O-гликана эндотелиальных клеток вызывает неправильные соединения крови / лимфатической системы и, как следствие, жировую болезнь печени у мышей» . Журнал клинических исследований . 118 (11): 3725–37. DOI : 10.1172 / JCI36077 . PMC 2567837 . PMID 18924607 .
^ Имайдзуми Y, Амано I, Цуруга E, H Kojima, Савва Y (октябрь 2010). «Иммуногистохимическое исследование распределения клеток, экспрессирующих подопланин, в развивающихся зачатках коренных зубов мышей» . Acta Histochemica et Cytochemica . 43 (5): 115–21. DOI : 10,1267 / ahc.10023 . PMC 2965832 . PMID 21060740 .
↑ Herzog BH, Fu J, Wilson SJ, Hess PR, Sen A, McDaniel JM, Pan Y, Sheng M, Yago T, Silasi-Mansat R, McGee S, May F, Nieswandt B, Morris AJ, Lupu F, Coughlin SR , МакЭвер Р.П., Чен Х., Кан М.Л., Ся Л. (октябрь 2013 г.). «Подопланин поддерживает высокую целостность эндотелиальных венул, взаимодействуя с CLEC-2 тромбоцитов» . Природа . 502 (7469): 105–9. Bibcode : 2013Natur.502..105H . DOI : 10,1038 / природа12501 . PMC 3791160 . PMID 23995678 .
^ Китано Н, Кагеяма S, Хьюитт С.М., Hayashi R, Доки Y, Озаки Y, Фуджино S, Takikita М, Кубо Н, J Фукуока (октябрь 2010 г.). «Экспрессия подопланина в раковой строме индуцирует лимфангиогенез и предсказывает лимфатическое распространение и выживаемость пациентов» . Архив патологии и лабораторной медицины . 134 (10): 1520–7. DOI : 10.1043 / 2009-0114-OA.1 (неактивный 2021-01-10). PMC 7556323 . PMID 20923309 .CS1 maint: DOI неактивен с января 2021 г. ( ссылка )
^ Чжуан WY, Yeh CJ, Чао Ю.К., Лю YH, Чжан Ю.С., Цзэн CK, Chang HK, Ван Ю.Л., Сюэ C (2014). «Конкордантная экспрессия подопланина в связанных с раком фибробластах и опухолевых клетках является неблагоприятным прогностическим фактором при плоскоклеточной карциноме пищевода» . Международный журнал клинической и экспериментальной патологии . 7 (8): 4847–56. PMC 4152045 . PMID 25197355 .
^ Мартин-Вильяр Э, Борда-д'Агуа Б, Карраско-Рамирес П, Ренарт Дж, Парсонс М, Кинтанилья М, Джонс Дж. Э. (август 2015 г.). «Подопланин опосредует деградацию ЕСМ клетками плоскоклеточной карциномы посредством контроля стабильности инвадоподий» . Онкоген . 34 (34): 4531–44. DOI : 10.1038 / onc.2014.388 . PMC 4430312 . PMID 25486435 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Викки А., Кристофори Г. (январь 2007 г.). «Потенциальная роль подпланина в опухолевой инвазии» . Британский журнал рака . 96 (1): 1–5. DOI : 10.1038 / sj.bjc.6603518 . PMC 2360213 . PMID 17179989 .
Робертсон Н.Г., Хетарпал У., Гутьеррес-Эспелета Г.А., Бибер Ф.Р., Мортон С.К. (сентябрь 1994 г.). «Выделение новых и известных генов из библиотеки кДНК улитки человеческого плода с использованием субтрактивной гибридизации и дифференциального скрининга». Геномика . 23 (1): 42–50. DOI : 10.1006 / geno.1994.1457 . PMID 7829101 .
Cross SH, Чарльтон JA, Nan X, Bird AP (март 1994). «Очистка CpG-островков с использованием колонки для связывания метилированной ДНК». Генетика природы . 6 (3): 236–44. DOI : 10.1038 / ng0394-236 . PMID 8012384 . S2CID 12847618 .
Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. DOI : 10.1101 / gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
Като Ю., Фудзита Н., Кунита А., Сато С., Канеко М., Осава М., Цуруо Т. (декабрь 2003 г.). «Молекулярная идентификация Aggrus / T1alpha как фактора, вызывающего агрегацию тромбоцитов, экспрессируемого в колоректальных опухолях» . Журнал биологической химии . 278 (51): 51599–605. DOI : 10.1074 / jbc.M309935200 . PMID 14522983 . S2CID 11119751 .
Канеко М., Като Ю., Кунита А., Фудзита Н., Цуруо Т., Осава М. (сентябрь 2004 г.). «Функциональный сиалированный O-гликан для агрегации тромбоцитов на молекулах Aggrus (T1alpha / Podoplanin), экспрессируемых в клетках яичников китайского хомячка» . Журнал биологической химии . 279 (37): 38838–43. DOI : 10.1074 / jbc.M407210200 . PMID 15231832 . S2CID 37651644 .
Мартин-Виллар Э., Шолль Ф.Г., Гамалло С., Юррита М.М., Муньос-Герра М., Крусес Дж., Кинтанилья М. (март 2005 г.). «Характеристика человеческого антигена PA2.26 (T1alpha-2, подопланин), небольшого мембранного муцина, индуцируемого при плоскоклеточном раке полости рта». Международный журнал рака . 113 (6): 899–910. DOI : 10.1002 / ijc.20656 . hdl : 10261/81190 . PMID 15515019 . S2CID 2895153 .
Шахт V, Дадрас СС, Джонсон Л.А., Джексон Д.Г., Хонг Ю.К., Детмар М. (март 2005 г.). «Повышение регуляции лимфатического маркера подопланина, трансмембранного гликопротеина муцинового типа в плоскоклеточных карциномах человека и опухолях зародышевых клеток» . Американский журнал патологии . 166 (3): 913–21. DOI : 10.1016 / S0002-9440 (10) 62311-5 . PMC 1602360 . PMID 15743802 .
Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т., Хаяси К., Судзуки Ю., Ямамото Дж., Вакамацу А., Кимура К., Сакамото К., Хатано Н., Кавай Ю., Исии С., Сайто К., Кодзима С., Сугияма Т., Оно Т., Окано К. , Йошикава Ю., Аотсука С., Сасаки Н., Хаттори А., Окумура К., Нагаи К., Сугано С., Исогай Т. (2007). «Сигнальная последовательность и ключевое слово ловушка in silico для отбора полноразмерных кДНК человека, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек олигокапированных кДНК» . Исследования ДНК . 12 (2): 117–26. DOI : 10.1093 / dnares / 12.2.117 . PMID 16303743 .
Hultgård-Ekwall AK, Mayerl C, Rubin K, Wick G, Rask-Andersen H (март 2006 г.). «Интерстициальная сеть клеток, экспрессирующих подпланин, в эндолимфатическом протоке человека» . Журнал Ассоциации исследований в области отоларингологии . 7 (1): 38–47. DOI : 10.1007 / s10162-005-0021-8 . PMC 2504586 . PMID 16408168 .
Дюмофф К.Л., Чу С.С., Харрис Е.Е., Хольц Д., Сюй Х, Чжан П.Дж., Acs G (май 2006 г.). «Низкая экспрессия подопланина в материале биопсии перед лечением предсказывает плохой прогноз при запущенной стадии плоскоклеточного рака шейки матки, подвергнутого лечению первичным облучением». Современная патология . 19 (5): 708–16. DOI : 10.1038 / modpathol.3800580 . PMID 16528371 . S2CID 502212 .
Омачи Т., Каваи Й, Мизуно Р., Номияма Т., Миягава С., Охаши Т., Накаяма Дж. (Февраль 2007 г.). «Иммуногистохимическая демонстрация пролиферирующих лимфатических сосудов при колоректальной карциноме и ее клинико-патологическое значение». Письма о раке . 246 (1–2): 167–72. DOI : 10.1016 / j.canlet.2006.02.013 . PMID 16574316 .
Мисима К., Като Ю., Канеко М.К., Нисикава Р., Хиросе Т., Мацутани М. (май 2006 г.). «Повышенная экспрессия подопланина в злокачественных астроцитарных опухолях как новый молекулярный маркер злокачественного прогрессирования». Acta Neuropathologica . 111 (5): 483–8. DOI : 10.1007 / s00401-006-0063-у . PMID 16596424 . S2CID 17760421 .
Wicki A, Lehembre F, Wick N, Hantusch B, Kerjaschki D, Christofori G (апрель 2006 г.). «Инвазия опухоли в отсутствие эпителиально-мезенхимального перехода: подпланин-опосредованное ремоделирование актинового цитоскелета». Раковая клетка . 9 (4): 261–72. DOI : 10.1016 / j.ccr.2006.03.010 . PMID 16616332 .
Мисима К., Като Ю., Канеко М.К., Накадзава Ю., Кунита А., Фудзита Н., Цуруо Т., Нисикава Р., Хиросе Т., Мацутани М. (июнь 2006 г.). «Экспрессия Podoplanin в первичных опухолях зародышевых клеток центральной нервной системы: полезный гистологический маркер для диагностики герминомы». Acta Neuropathologica . 111 (6): 563–8. DOI : 10.1007 / s00401-006-0033-4 . PMID 16718353 . S2CID 25060022 .
Внешние ссылки [ править ]
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q86YL7 (Human Podoplanin) в PDBe-KB .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q62011 (Mouse Podoplanin) в PDBe-KB .
