• развитие экзокринной поджелудочной железы • негативная регуляция внутреннего апоптотического сигнального пути, вызванного стрессом эндоплазматического ретикулума • дифференцировка клеток • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • гомеостаз глюкозы • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • секреция инсулина • негативная регуляция транскрипции с РНК промотор полимеразы II • образование метаболитов-предшественников и энергии • транскрипция, ДНК-шаблон • развитие многоклеточного организма • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция пролиферации клеток • положительная регуляция пролиферации клеток • передача сигнала, опосредованная оксидом азота • метаболический процесс глюкозы • морфогенез органов животных • развитие поджелудочной железы • развитие печени • положительная регуляция секреции инсулина, участвующая в клеточном ответе на глюкозный стимул • морфогенез эмбрионального эпителия • пищеварительная система развитие тракта • негативная регуляция процесса апоптоза клеток поджелудочной железы типа B • негативная регуляция пролиферации клеток • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • развитие эндокринной поджелудочной железы • дифференцировка клеток поджелудочной железы типа B • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • обнаружение глюкозы • сглаживание сигнального пути • развитие центральной нервной системы • ответ на ранение • ответ на глюкозу • ответ на ион железа (II) • реакция на хлорат • старение органов животных • регуляция экспрессии генов • положительная регуляция гибели клеток • реакция на органические циклические соединения • регенерация органов животных • реакция на уровни питательных веществ • положительная регуляция секреции инсулина • ответ на витамин • ответ на липиды • ответ на цитокин • ответ на никотин • ответ на лекарство • ответ на лейцин • ответ на алкалоиды • положительное регулирование связывания ДНК • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • дифференцировка стволовых клеток • ответ на глюкокортикоиды • трансдифференцировка • ответ на жирные кислоты
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
3651
18609
Ансамбль
ENSG00000139515
ENSMUSG00000029644
UniProt
P52945
P52946
RefSeq (мРНК)
NM_000209
NM_008814
RefSeq (белок)
NP_000200
NP_032840
Расположение (UCSC)
Chr 13: 27.92 - 27.93 Мб
Chr 5: 147.27 - 147.28 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
PDX1 ( панкреатический и двенадцатиперстный гомеобокс 1 ), также известный как фактор промотора инсулина 1 , является фактором транскрипции в кластере генов ParaHox . [5] У позвоночных Pdx1 необходим для развития поджелудочной железы , включая созревание β-клеток и дифференцировку двенадцатиперстной кишки . У человека этот белок кодируется геном PDX1 , ранее называвшимся IPF1 . [6] [7] Ген был первоначально идентифицирован у когтистой лягушки Xenopus laevis [8]и широко присутствует в эволюционном разнообразии двустворчатых животных, хотя в ходе эволюции он был утерян у членистоногих и нематод. [5] Несмотря на название гена Pdx1 , у большинства животных ген Pdx2 отсутствует ; Однокопийные ортологи Pdx1 были идентифицированы у всех млекопитающих . [9] Целакант и хрящевые рыбы пока единственные позвоночные, у которых обнаружено два гена Pdx , Pdx1 и Pdx2 . [10]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Функция
1.1 Развитие поджелудочной железы
1.2 созревание и выживание β-клеток
1,3 двенадцатиперстная кишка
2 Патология
3 взаимодействия
4 ссылки
5 Дальнейшее чтение
6 Внешние ссылки
Функция [ править ]
Развитие поджелудочной железы [ править ]
В поджелудочная развитии , Pdx1 выражаются популяциями клеток в задней передней кишки области окончательной эндодермы и Pdx1 + эпителиальные клетки дают начало развивающейся панкреатическим почкам , и в конечном счете, все из поджелудочной железы-ее экзокринная, эндокринная и популяции клеток протоков. [11] Pdx1 + клетки поджелудочной железы сначала возникают в эмбриональные дни мышей 8.5-9.0 (E8.5-9.0), а экспрессия Pdx1 продолжается до E12.0-E12.5. [12] Гомозиготные мыши с нокаутом Pdx1 образуют зачатки поджелудочной железы, но не могут развить поджелудочную железу, [13] и трансгенные мыши, у которыхПрименение тетрациклина приводит к гибели клеток Pdx1 + , почти полностью апанкреатических, если доксициклин (производное тетрациклина) вводится на протяжении всей беременности этих трансгенных мышей, что свидетельствует о необходимости клеток Pdx1 + в развитии поджелудочной железы. [12]
Pdx1 считается самым ранним маркером дифференцировки поджелудочной железы, при этом судьбы клеток поджелудочной железы контролируются нижестоящими факторами транскрипции. [13] Первоначально панкреатическая почка состоит из Pdx1 + панкреатических клеток - предшественников , которые одновременно экспрессируют Hlxb9 , Hnf6 , Ptf1a и NKX6-1 . Эти клетки далее пролиферируют и разветвляются в ответ на передачу сигналов FGF-10 . После этого начинается отмирание клеток поджелудочной железы; популяция клеток имеет подавленную передачу сигналов Notch и, следовательно , экспрессирует Ngn3 . Это Ngn3 +Популяция - это временная популяция эндокринных предшественников поджелудочной железы, которая дает начало клеткам α, β, Δ, PP и ε островков Лангерганса . [12] Другие клетки дадут начало популяциям экзокринных и протоковых клеток поджелудочной железы.
Созревание и выживание β-клеток [ править ]
Заключительные стадии развития поджелудочной железы включают производство различных эндокринных клеток, в том числе инсулин-продуцирующих β-клеток и глюкагон-продуцирующих α-клеток . Pdx1 необходим для созревания β-клеток: развивающиеся β-клетки коэкспрессируют Pdx1, NKX6-1 и инсулин , процесс, который приводит к подавлению MafB и экспрессии MafA , необходимому переключению в созревании β-клеток. [11] На этой стадии развития поджелудочной железы экспериментальное снижение экспрессии Pdx1 приводит к продукции меньшего количества β-клеток и связанному с этим увеличению числа α-клеток. [14]
В зрелой поджелудочной железе экспрессия Pdx1, по-видимому, необходима для поддержания и выживания β-клеток. Например, экспериментальное снижение уровня экспрессии Pdx1 на этой стадии заставляет β-клетки продуцировать большее количество глюкагона [15], предполагая, что Pdx1 ингибирует превращение β-клеток в α-клетки. Более того, Pdx1, по-видимому, играет важную роль в опосредовании действия инсулина на апоптотическую запрограммированную клеточную гибель β-клеток: небольшая концентрация инсулина защищает β-клетки от апоптоза, но не в клетках, где экспрессия Pdx1 подавлена. [16] [17]
Двенадцатиперстная кишка [ править ]
Pdx1 необходим для развития проксимального отдела двенадцатиперстной кишки и поддержания гастро-дуоденального перехода. [18] Дуоденальные энтероциты , железы Бруннера и энтероэндокринные клетки (включая клетки антрального отдела желудка ) зависят от экспрессии Pdx1. Это ген ParaHox , который вместе с Sox2 и Cdx2 определяет правильную клеточную дифференцировку в проксимальном отделе кишечника. [18] У зрелых мышей двенадцатиперстной кишки было идентифицировано несколько генов, которые зависят от экспрессии Pdx1 и включают некоторые из них, влияющие на всасывание липидов и железа. [19]
Патология [ править ]
Эксперименты на животных моделях показали, что снижение экспрессии Pdx1 может вызывать симптомы, характерные для сахарного диабета 1 типа и сахарного диабета 2 типа . [20] Кроме того, экспрессия Pdx1 теряется при раке желудка , что предполагает роль гена как супрессора опухоли. [21] Диабет зрелого возраста у молодых (тип 4) может быть вызван гетерозиготными мутациями в Pdx1. [22] [23] Толстая песчаная крыса Psammomys obesus , вид с предрасположенностью к симптомам сахарного диабета 2 типа , имеет сильно отличающуюся последовательность гена Pdx1 по сравнению с другими млекопитающими.[24]
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что Pdx1 взаимодействует с MAFA . [25]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000139515 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029644 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ а б Брук, Нью-Мексико, Гарсия-Фернандес, Дж., и Холланд, П. У. (1998). Кластер генов ParaHox является эволюционной сестрой кластера генов Hox. Природа, 392 (6679), 920.
^ "PDX1" . HGNC . Проверено 22 апреля 2016 года .
^ Штоффель M, Stein R, Райт CV, Эспиноса R, Le Beau MM, Bell GI (июль 1995). «Локализация человеческого гомеодоменного фактора транскрипции инсулинового промотора фактора 1 (IPF1) в полосе хромосомы 13q12.1». Геномика . 28 (1): 125–6. DOI : 10.1006 / geno.1995.1120 . PMID 7590740 .
^ Mulley JF, Голландия PW (октябрь 2010). «Параллельное удержание генов Pdx2 у хрящевых рыб и латимерии» . Молекулярная биология и эволюция . 27 (10): 2386–91. DOI : 10.1093 / molbev / msq121 . PMID 20463047 .
^ a b D'Amour KA, Bang AG, Eliazer S, Kelly OG, Agulnick AD, Smart NG, Moorman MA, Kroon E, Carpenter MK, Baetge EE (ноябрь 2006 г.). «Производство эндокринных клеток, экспрессирующих гормон поджелудочной железы, из человеческих эмбриональных стволовых клеток». Nat. Biotechnol . 24 (11): 1392–401. DOI : 10.1038 / nbt1259 . PMID 17053790 . S2CID 11040949 .
^ a b c Stanger BZ, Tanaka AJ, Melton DA (февраль 2007 г.). «Размер органа ограничен количеством эмбриональных клеток-предшественников в поджелудочной железе, но не в печени». Природа . 445 (7130): 886–91. Bibcode : 2007Natur.445..886S . DOI : 10,1038 / природа05537 . PMID 17259975 . S2CID 4379651 .
^ Gannon M, Ables ET, Crawford L и др. Функция pdx-1 особенно необходима в эмбриональных бета-клетках для генерации соответствующего количества типов эндокринных клеток и поддержания гомеостаза глюкозы. Dev Biol. 2007; 314 (2): 406-17. DOI: 10.1016 / j.ydbio.2007.10.038
^ Альгрен У., Йонссон Дж., Йонссон Л., Симу К., Эдлунд Х. Бета-клеточная инактивация мышиного гена Ipf1 / Pdx1 приводит к потере фенотипа бета-клеток и зрелому диабету. Genes Dev. 1998; 12 (12): 1763-8.
↑ Johnson JD, Ahmed NT, Luciani DS, Han Z, Tran H, Fujita J, Misler S, Edlund H, Polonsky KS (апрель 2003 г.). «Повышенный апоптоз островков у мышей Pdx1 +/-» . J. Clin. Инвестируйте . 111 (8): 1147–60. DOI : 10.1172 / JCI16537 . PMC 152933 . PMID 12697734 .
↑ Johnson JD, Bernal-Mizrachi E, Alejandro EU, Han Z, Kalynyak TB, Li H, Beith JL, Gross J, Warnock GL, Townsend RR, Permutt MA, Polonsky KS (декабрь 2006 г.). «Инсулин защищает островки от апоптоза через Pdx1 и специфических изменений протеома островков человека» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 103 (51): 19575–80. Bibcode : 2006PNAS..10319575J . DOI : 10.1073 / pnas.0604208103 . PMC 1748267 . PMID 17158802 .
^ а б Голландия AM, Гарсия S, Населли G, Макдональд RJ, Харрисон LC (2013). «Ген Parahox Pdx1 необходим для поддержания позиционной идентичности в передней кишке взрослых» . Int. J. Dev. Биол . 57 (5): 391–8. DOI : 10.1387 / ijdb.120048ah . PMID 23873371 .
Перейти ↑ Chen C, Sibley E (2012). «Профили экспрессии идентифицируют новые гены-мишени и функции для Pdx1 в двенадцатиперстной кишке зрелых мышей» . Являюсь. J. Physiol. Гастроинтест. Liver Physiol . 302 (4): G407–19. DOI : 10,1152 / ajpgi.00314.2011 . PMC 3287393 . PMID 22135308 .
^ Фудзимото, Кей и Кеннет С. Полонски. «Pdx1 и другие факторы, регулирующие выживаемость β-клеток поджелудочной железы». Диабет, ожирение и метаболизм 11 (2009): 30-37.
^ Ма Дж, Чен М, Ван Дж, Ся ХХ, Чжу С, Лян И, Гу Q, Цяо Л, Дай И, Цзоу Б., Ли З, Чжан И, Лан Х, Вонг, Британская Колумбия (2008). «Гомеобокс-1 поджелудочной железы двенадцатиперстной кишки (PDX1) действует как опухолевый супрессор при раке желудка» . Канцерогенез . 29 (7): 1327–33. DOI : 10.1093 / carcin / bgn112 . PMID 18477649 .
^ Фаянс SS, Bell GI, Полонский KS (сентябрь 2001). «Молекулярные механизмы и клиническая патофизиология диабета зрелого возраста у молодых». N. Engl. J. Med . 345 (13): 971–80. DOI : 10.1056 / NEJMra002168 . PMID 11575290 .
^ Харгривз А.Д., Чжоу л, Кристенсен Дж, Marlétaz F, S Лю, Ли Ф, и др. (Июль 2017 г.). «Последовательность генома грызуна, склонного к диабету, обнаруживает горячую точку мутации вокруг кластера генов ParaHox» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 114 (29): 7677–7682. DOI : 10.1073 / pnas.1702930114 . PMC 5530673 . PMID 28674003 .
↑ Zhao L, Guo M, Matsuoka TA, Hagman DK, Parazzoli SD, Poitout V, Stein R (март 2005 г.). «Обогащенный островковыми бета-клетками активатор MafA является ключевым регулятором транскрипции гена инсулина» . J. Biol. Chem . 280 (12): 11887–94. DOI : 10.1074 / jbc.M409475200 . PMID 15665000 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Чжоу К., Браун Дж., Канарек А., Раджагопал Дж., Дуглас А., Мелтон Д.А. (2008). «Перепрограммирование in vivo экзокринных клеток поджелудочной железы в β-клетки». Природа . 455 (7213): 627–32. Bibcode : 2008Natur.455..627Z . DOI : 10,1038 / природа07314 . PMID 18754011 . S2CID 205214877 .
Хуэй Х., Перфетти Р. (2002). «Гомеобокс-1 поджелудочной железы двенадцатиперстной кишки регулирует развитие поджелудочной железы во время эмбриогенеза и функцию островковых клеток во взрослом возрасте» . Евро. J. Endocrinol . 146 (2): 129–41. DOI : 10,1530 / eje.0.1460129 . PMID 11834421 .
Леонард Дж., Пирс Б., Джонсон Т. и др. (1994). «Характеристика трансактивирующего соматостатин фактора-1, нового гомеобокса, который стимулирует экспрессию соматостатина в клетках островков поджелудочной железы». Мол. Эндокринол . 7 (10): 1275–83. DOI : 10,1210 / me.7.10.1275 . PMID 7505393 .
Стоффель М., Стейн Р., Райт К.В. и др. (1995). «Локализация человеческого гомеодоменного фактора транскрипции инсулинового промотора фактора 1 (IPF1) в полосе хромосомы 13q12.1». Геномика . 28 (1): 125–6. DOI : 10.1006 / geno.1995.1120 . PMID 7590740 .
Иноуэ Х., Риггс А.С., Танизава Й. и др. (1996). «Выделение, характеристика и хромосомное картирование гена фактора 1 промотора инсулина человека (IPF-1)». Диабет . 45 (6): 789–94. DOI : 10.2337 / diabetes.45.6.789 . PMID 8635654 .
Ватада Х., Каджимото Й., Кането Х. и др. (1997). «Вовлечение гомеодомен-содержащего фактора транскрипции PDX-1 в транскрипцию гена островкового амилоидного полипептида». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 229 (3): 746–51. DOI : 10.1006 / bbrc.1996.1875 . PMID 8954967 .
Маршак С., Тотари Х, Сераси Е., Меллоул Д. (1997). «Очистка бета-клеточного фактора, чувствительного к глюкозе, который дифференцированно трансактивирует ген инсулина в нормальных и трансформированных островковых клетках» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 93 (26): 15057–62. DOI : 10.1073 / pnas.93.26.15057 . PMC 26355 . PMID 8986763 .
Стофферс Д.А., Зинкин Н.Т., Станоевич В. и др. (1997). «Агенез поджелудочной железы, связанный с делецией одного нуклеотида в кодирующей последовательности гена IPF1 человека». Nat. Genet . 15 (1): 106–10. DOI : 10.1038 / ng0197-106 . PMID 8988180 . S2CID 25406130 .
Шарма С., Джала США, Джонсон Т. и др. (1997). «Гормональная регуляция островкового энхансера в гене гомеобокса поджелудочной железы STF-1» . Мол. Клетка. Биол . 17 (5): 2598–604. DOI : 10.1128 / mcb.17.5.2598 . PMC 232109 . PMID 9111329 .
Карти MD, Lillquist JS, Peshavaria M, et al. (1997). «Идентификация цис- и транс-активных факторов, регулирующих экспрессию гена островкового амилоидного полипептида человека в бета-клетках поджелудочной железы» . J. Biol. Chem . 272 (18): 11986–93. DOI : 10.1074 / jbc.272.18.11986 . PMID 9115263 .
Макфарлейн В.М., Смит С.Б., Джеймс Р.Ф. и др. (1997). «Каскад митоген-активируемой протеинкиназы p38 / реактивирующей киназы опосредует активацию фактора транскрипции инсулина, предшествующего фактору 1, и транскрипцию гена инсулина за счет высокого уровня глюкозы в бета-клетках поджелудочной железы» . J. Biol. Chem . 272 (33): 20936–44. DOI : 10.1074 / jbc.272.33.20936 . PMID 9252422 .
Macfarlane WM, Frayling TM, Ellard S, et al. (1999). «Миссенс-мутации в гене фактора-1 промотора инсулина предрасполагают к диабету 2 типа» . J. Clin. Инвестируйте . 104 (9): R33–9. DOI : 10.1172 / JCI7449 . PMC 481047 . PMID 10545530 .
Хани Э. Х., Стофферс Д. А., Шевр Дж. К. и др. (1999). «Дефектные мутации в гене фактора-1 промотора инсулина (IPF-1) при сахарном диабете 2 типа с поздним началом» . J. Clin. Инвестируйте . 104 (9): R41–8. DOI : 10.1172 / JCI7469 . PMC 409821 . PMID 10545531 .
Глик Э, Лешковиц Д, Уокер Мэриленд (2000). «Фактор транскрипции BETA2 действует совместно с E2A и PDX1 для активации промотора гена инсулина» . J. Biol. Chem . 275 (3): 2199–204. DOI : 10.1074 / jbc.275.3.2199 . PMID 10636926 .
Schwartz PT, Perez-Villamil B, Rivera A и др. (2000). «Фактор транскрипции гомеодомена поджелудочной железы IDX1 / IPF1, экспрессируемый в развивающемся мозге, регулирует транскрипцию гена соматостатина в эмбриональных нервных клетках» . J. Biol. Chem . 275 (25): 19106–14. DOI : 10.1074 / jbc.M000655200 . PMID 10751390 .
Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Genome Res . 10 (11): 1788–95. DOI : 10.1101 / gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
Лю Ю., Макдональд Р.Дж., Свифт Г.Х. (2001). «Связывание ДНК и активация транскрипции тримером PDX1.PBX1b.MEIS2b и сотрудничество со специфическим для поджелудочной железы основным комплексом спираль-петля-спираль» . J. Biol. Chem . 276 (21): 17985–93. DOI : 10.1074 / jbc.M100678200 . PMID 11279116 .
Самарас С.Е., Сиссел М.А., Герриш К. и др. (2002). «Консервативные последовательности в тканеспецифической регуляторной области гена pdx-1 опосредуют транскрипцию в бета-клетках поджелудочной железы: роль ядерного фактора гепатоцитов 3 бета и Pax6» . Мол. Клетка. Биол . 22 (13): 4702–13. DOI : 10.1128 / MCB.22.13.4702-4713.2002 . PMC 133887 . PMID 12052878 .
Чжоу Дж., Пинейро М.А., Ван Х и др. (2002). «Эксендин-4 дифференцировка клеточной линии протока поджелудочной железы человека в эндокринные клетки: участие факторов транскрипции PDX-1 и HNF3beta» . J. Cell. Physiol . 192 (3): 304–14. DOI : 10.1002 / jcp.10143 . PMID 12124776 .
Внешние ссылки [ править ]
GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о перманентном неонатальном сахарном диабете
PDX1 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .
vтеPDB галерея
2h1k : Кристаллическая структура гомеодомена Pdx1 в комплексе с ДНК.
vтеФакторы транскрипции и внутриклеточные рецепторы
(1) Базовые домены
(1.1) Базовая лейциновая молния ( bZIP )
Активирующий фактор транскрипции
AATF
1
2
3
4
5
6
7
АП-1
c-Fos
FOSB
FOSL1
FOSL2
JDP2
с-июн
JUNB
JunD
БАХ
1
2
BATF
BLZF1
C / EBP
α
β
γ
δ
ε
ζ
CREB
1
3
L1
CREM
ДАД
DDIT3
ГАБПА
GCN4
HLF
MAF
B
F
грамм
K
NFE
2
L1
L2
L3
NFIL3
NRL
NRF
1
2
3
XBP1
(1.2) Базовая спираль-петля-спираль ( bHLH )
Группа А
AS-C
ASCL1
ASCL2
ATOH1
РУКА
1
2
MESP2
Миогенные регуляторные факторы
MyoD
Миогенин
MYF5
MYF6
NeuroD
1
2
Нейрогенины
1
2
3
ОЛИГ
1
2
Paraxis
TCF15
Склераксис
SLC
LYL1
TAL
1
2
Крутить
Группа B
FIGLA
Мой с
c-Myc
l-Myc
n-Myc
MXD4
TCF4
Группа C bHLH- PAS
AhR
AHRR
ARNT
ARNTL
ARNTL2
ЧАСЫ
HIF
1А
EPAS1
3А
NPAS
1
2
3
SIM
1
2
Группа D
BHLH
2
3
9
Pho4
Я БЫ
1
2
3
4
Группа E
HES
1
2
3
4
5
6
7
ПРИВЕТ
1
2
L
Группа F bHLH-COE
EBF1
(1.3) bHLH-ZIP
АП-4
МАКСИМУМ
MXD1
MXD3
MITF
MNT
MLX
MLXIPL
MXI1
Мой с
SREBP
1
2
USF1
(1.4) НФ-1
NFI
А
B
C
Икс
SMAD
R-SMAD
1
2
3
5
9
I-SMAD
6
7
4 )
(1.5) RF-X
RFX
1
2
3
4
5
6
АНК
(1.6) Базовая спираль-пролет-спираль (bHSH)
АП-2
α
β
γ
δ
ε
(2) ДНК-связывающие домены цинкового пальца
(2.1) Ядерный рецептор (Cys 4 )
подсемейство 1
Гормон щитовидной железы
α
β
МАШИНА
FXR
LXR
α
β
PPAR
α
β / δ
γ
PXR
RAR
α
β
γ
ROR
α
β
γ
Rev-ErbA
α
β
VDR
подсемейство 2
КУП-ТФ
( Я
II
Ухо-2
HNF4
α
γ
PNR
RXR
α
β
γ
Рецептор яичка
2
4
TLX
подсемейство 3
Стероидный гормон
Андроген
Эстроген
α
β
Глюкокортикоид
Минералокортикоид
Прогестерон
Связанный с эстрогеном
α
β
γ
подсемейство 4
NUR
NGFIB
NOR1
NURR1
подсемейство 5
LRH-1
SF1
подсемейство 6
GCNF
подсемейство 0
DAX1
SHP
(2.2) Другой Cys 4
GATA
1
2
3
4
5
6
MTA
1
2
3
TRPS1
(2.3) Cys 2 His 2
Общие факторы транскрипции
TFIIA
TFIIB
TFIID
TFIIE
1
2
ТФИИФ
1
2
TFIIH
1
2
4
2I
3А
3C1
3C2
ATBF1
BCL
6
11А
11B
CTCF
E4F1
EGR
1
2
3
4
ERV3
GFI1
GLI- Kruppel семьи
1
2
3
ОТДЫХ
S1
S2
YY1
ИК
1
2
HIVEP
1
2
3
IKZF
1
2
3
ILF
2
3
KLF
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
ПРОДАЖА
1
2
3
4
SP
1
2
4
7
8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
7А
7B
ZBTB
11
16
17
20
32
33
40
цинковый палец
3
7
9
10
19
22
24
33B
34
35 год
41 год
43 год
44 год
51
74
143
146
148
165
202
217
219
238
239
259
267
268
281
295
300
318
330
346
350
365
366
384
423
451
452
471
593
638
644
649
655
804A
(2.4) Cys 6
HIVEP1
(2.5) Чередующийся состав
AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
1
2
4
ДЖАРИД
1А
1B
1С
1D
2
JMJD1B
(2.6) WRKY
WRKY
(3) Домены спираль-поворот-спираль
(3.1) Гомеодомен
Antennapedia класс Antp
protoHOX Hox-подобный
ParaHox
GSX
1
2
Xlox
PDX1
Cdx
1
2
4
расширенный Hox: Evx1
Evx2
MEOX1
MEOX2
Homeobox
A1
A2
A3
A4
A5
A7
A9
A10
A11
A13
B1
Би 2
B3
B4
B5
B6
B7
B8
B9
B13
C4
C5
C6
C8
C9
C10
C11
C12
C13
D1
D3
D4
D8
D9
D10
D11
D12
D13
GBX1
GBX2
MNX1
metaHOX NK-подобный
BARHL1
BARHL2
BARX1
BARX2
BSX
DBX
1
2
DLX
1
2
3
4
5
6
EMX
1
2
EN
1
2
HHEX
HLX
LBX1
LBX2
MSX
1
2
NANOG
NKX
2-1
2-2
2-3
2-5
3-1
3-2
HMX1
HMX2
HMX3
6-1
6-2
НАТО
TLX1
TLX2
TLX3
VAX1
VAX2
Другой
ARX
CRX
CUTL1
FHL
1
2
3
HESX1
HOPX
LMX
1А
1B
NOBOX
СКАЗКА
IRX
1
2
3
4
5
6
MKX
Я ЕСТЬ
1
2
АТС
1
2
3
PKNOX
1
2
ШЕСТЬ
1
2
3
4
5
PHF
1
3
6
8
10
16
17
20
21А
POU домен
PIT-1
БРН-3 : А
B
C
Фактор транскрипции октамера : 1
2
3/4
6
7
11
SATB2
ZEB
1
2
(3.2) Парная коробка
PAX
1
2
3
4
5
6
7
8
9
PRRX
1
2
PROP1
ФОКС
2А
2B
RAX
SHOX
SHOX2
VSX1
VSX2
Бикоид
GSC
BICD2
OTX
1
2
PITX
1
2
3
(3.3) Головка вилки / крылатая спираль
E2F
1
2
3
4
5
FOX белки
A1
A2
A3
C1
C2
D3
D4
E1
E3
F1
G1
H1
I1
J1
J2
K1
K2
L2
M1
N1
N3
O1
O3
O4
P1
P2
P3
P4
(3.4) Факторы теплового удара
HSF
1
2
4
(3.5) Кластеры триптофана
ELF
2
4
5
EGF
ELK
1
3
4
ERF
ETS
1
2
ЭРГ
СПИБ
ETV
1
4
5
6
FLI1
Факторы регуляции интерферона
1
2
3
4
5
6
7
8
MYB
MYBL2
(3.6) Домен TEA
фактор усиления транскрипции
1
2
3
4
(4) Факторы β-каркаса с малыми контактами канавок
(4.1) Область гомологии Rel
NF-κB
NFKB1
NFKB2
REL
РЕЛА
RELB
NFAT
C1
C2
C3
C4
5
(4.2) СТАТИСТИКА
СТАТИСТИКА
1
2
3
4
5
6
(4.3) p53-подобный
p53 p63 семья p73
p53
TP63
стр. 73
TBX
1
2
3
5
19
21 год
22
TBR1
TBR2
TFT
MYRF
(4.4) Коробка MADS
Mef2
А
B
C
D
SRF
(4.6) ТАТА-связывающие белки
TBP
TBPL1
(4.7) Высокомобильная группа
BBX
HMGB
1
2
3
4
HMGN
1
2
3
4
HNF
1А
1B
SOX
1
2
3
4
5
6
8
9
10
11
12
13
14
15
18
21 год
SRY
SSRP1
TCF / LEF
TCF
1
3
4
LEF1
ТОКС
1
2
3
4
(4.9) Зернистая голова
TFCP2
(4.10) Область холодного удара
CSDA
YBX1
(4.11) Runt
CBF
CBFA2T2
CBFA2T3
RUNX1
RUNX2
RUNX3
RUNX1T1
(0) Другие факторы транскрипции
(0.2) HMGI (Y)
HMGA
1
2
HBP1
(0.3) Карманный домен
Руб.
RBL1
RBL2
(0.5) Факторы, связанные с AP-2 / EREBP
Апетала 2
EREBP
B3
(0.6) Разное
ARID
1А
1B
2
3А
3B
4А
КОЛПАЧОК
ЕСЛИ Я
16
35 год
MLL
2
3
T1
MNDA
NFY
А
B
C
Ро / Сигма
см. также дефицит фактора транскрипции / корегулятора