PEX13

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
1WXU

Идентификаторы

Псевдонимы

PEX13 , NALD, PBD11A, PBD11B, ZWS, фактор пероксисомального биогенеза 13

Внешние идентификаторы

OMIM : 601789 MGI : 1919379 HomoloGene : 1967 GeneCards : PEX13

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 2 (человека) ^[1]

Группа	2п15	Начинать	61 017 225 п.н. ^[1]
Группа	2п15	Конец	61 051 990 п.н. ^[1]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• Связывание с белком GO: 0001948
Сотовый компонент	• пероксисома • пероксисомальная мембрана • мембрана • неотъемлемый компонент пероксисомальной мембраны • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • неотъемлемый компонент мембраны • пероксисомальный импортомер-комплекс
Биологический процесс	• миграция клеток коры головного мозга • транспорт белка • сосательное поведение • альфа-окисление жирных кислот • локализация пероксисом на основе микротрубочек • локомоторное поведение • импорт белка в матрикс пероксисомы, стыковка • миграция нейронов • транспорт • нацеливание белка на пероксисому • убиквитинирование белка
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


5194


72129

Ансамбль


ENSG00000162928


ENSMUSG00000020283

UniProt


Q92968


Q9D0K1

RefSeq (мРНК)


NM_002618


NM_023651

RefSeq (белок)


NP_002609


NP_076140

Расположение (UCSC)

Chr 2: 61.02 - 61.05 Мб

н / д

PubMed поиск

^[2]

^[3]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Пероксисом мембранный белок PEX13 представляет собой белок , который у человека кодируется PEX13 гена . ^[4]^[5] Он расположен на хромосоме 2 рядом с KIAA1841.

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что PEX13 взаимодействует с PEX14 , ^[6] PEX5 ^[6]^[7] и PEX19 . ^[8]^[9]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000162928 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Björkman J, Stetten G, Мур CS, Гулд SJ, Кран DI (декабрь 1998). «Геномная структура PEX13, кандидата гена нарушения биогенеза пероксисомы». Геномика . 54 (3): 521–8. DOI : 10.1006 / geno.1998.5520 . PMID 9878256 .
^ "Энтрез Ген: фактор биогенеза пероксисомы PEX13 13" .
^ а б Отера Х, Сетогучи К., Хамасаки М, Кумаширо Т., Симидзу Н., Фудзики Y (март 2002 г.). «Рецептор пероксисомного нацеленного сигнала Pex5p взаимодействует с грузами и компонентами импортного оборудования пространственно-временным дифференцированным образом: консервативные мотивы Pex5p WXXXF / Y имеют решающее значение для импорта матричного белка» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (6): 1639–55. DOI : 10.1128 / MCB.22.6.1639-1655.2002 . PMC 135613 . PMID 11865044 .
↑ Gould SJ, Kalish JE, Morrell JC, Bjorkman J, Urquhart AJ, Crane DI (октябрь 1996 г.). «Pex13p представляет собой белок SH3 пероксисомной мембраны и фактор стыковки для преимущественно цитоплазматического рецептора PTs1» . Журнал клеточной биологии . 135 (1): 85–95. DOI : 10,1083 / jcb.135.1.85 . PMC 2121023 . PMID 8858165 .
^ Сакстедера К. Джонс JM, South ST, Ли X, Y Liu, Гулд SJ (март 2000). «PEX19 связывает множество белков пероксисомальной мембраны, является преимущественно цитоплазматическим и требуется для синтеза пероксисомальной мембраны» . Журнал клеточной биологии . 148 (5): 931–44. DOI : 10,1083 / jcb.148.5.931 . PMC 2174547 . PMID 10704444 .
^ Fransen M, Wylin T, Бульоны C, Маннартс GP, Ван Вельдховен PP (июль 2001). «Pex19p человека связывает интегральные пероксисомные мембранные белки в областях, отличных от их сортирующих последовательностей» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (13): 4413–24. DOI : 10.1128 / MCB.21.13.4413-4424.2001 . PMC 87101 . PMID 11390669 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Гулд С.Дж., Калиш Дж. Э., Моррелл Дж. К., Бьоркман Дж., Уркхарт А. Дж., Крейн Д. И. (октябрь 1996 г.). «Pex13p представляет собой белок SH3 пероксисомной мембраны и фактор стыковки для преимущественно цитоплазматического рецептора PTs1» . Журнал клеточной биологии . 135 (1): 85–95. DOI : 10,1083 / jcb.135.1.85 . PMC 2121023 . PMID 8858165 .
Альбертини М., Релинг П., Эрдманн Р., Гирзальский В., Киль Дж. А., Винхейс М., Кунау WH (апрель 1997 г.). «Pex14p, пероксисомальный мембранный белок, связывающий оба рецептора двух PTS-зависимых путей импорта» (PDF) . Cell . 89 (1): 83–92. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80185-3 . PMID 9094717 . S2CID 18878596 .
Франсен М., Терлеки С. Р., Субрамани С. (июль 1998 г.). «Идентификация стыковочного белка человеческого рецептора PTS1, необходимого для импорта пероксисомального белка» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (14): 8087–92. Bibcode : 1998PNAS ... 95.8087F . DOI : 10.1073 / pnas.95.14.8087 . PMC 20933 . PMID 9653144 .
Гирзальский В., Релинг П., Стейн К., Киппер Дж., Бланк Л., Кунау В.Х., Эрдманн Р. (март 1999 г.). «Вовлечение Pex13p в локализацию Pex14p и пероксисомный нацеленный сигнал 2-зависимого импорта белка в пероксисомы» . Журнал клеточной биологии . 144 (6): 1151–62. DOI : 10.1083 / jcb.144.6.1151 . PMC 2150583 . PMID 10087260 .
Симозава Н., Судзуки Ю., Чжан З., Имамура А., Тояма Р., Мукаи С. и др. (Июнь 1999 г.). «Нонсенс и чувствительные к температуре мутации в PEX13 являются причиной комплементации группы H нарушений биогенеза пероксисом» . Молекулярная генетика человека . 8 (6): 1077–83. DOI : 10.1093 / HMG / 8.6.1077 . PMID 10332040 .
Тояма Р., Мукаи С., Итагаки А., Тамура С., Симозава Н., Сузуки Ю. и др. (Сентябрь 1999 г.). «Выделение, характеристика и анализ мутаций PEX13-дефектных мутантов клеток яичника китайского хомячка» . Молекулярная генетика человека . 8 (9): 1673–81. DOI : 10.1093 / HMG / 8.9.1673 . PMID 10441330 .
Лю Й., Бьоркман Дж., Уркхарт А., Вандерс Р. Дж., Крейн Д. И., Гулд С. Дж. (Сентябрь 1999 г.). «PEX13 мутирован в группе комплементации 13 нарушений биогенеза пероксисомы» . Американский журнал генетики человека . 65 (3): 621–34. DOI : 10,1086 / 302534 . PMC 1377968 . PMID 10441568 .
Sacksteder KA, Jones JM, South ST, Li X, Liu Y, Gould SJ (март 2000 г.). «PEX19 связывает множество белков пероксисомальной мембраны, является преимущественно цитоплазматическим и требуется для синтеза пероксисомальной мембраны» . Журнал клеточной биологии . 148 (5): 931–44. DOI : 10,1083 / jcb.148.5.931 . PMC 2174547 . PMID 10704444 .
Fransen M, Wylin T., Brees C., Mannaerts GP, Van Veldhoven PP (июль 2001 г.). «Pex19p человека связывает интегральные пероксисомные мембранные белки в областях, отличных от их сортирующих последовательностей» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (13): 4413–24. DOI : 10.1128 / MCB.21.13.4413-4424.2001 . PMC 87101 . PMID 11390669 .
Джонс Дж. М., Моррелл Дж. К., Гулд С. Дж. (Июнь 2001 г.). «Множество различных сигналов нацеливания в интегральных белках пероксисомальной мембраны» . Журнал клеточной биологии . 153 (6): 1141–50. DOI : 10.1083 / jcb.153.6.1141 . PMC 2192020 . PMID 11402059 .
Отера Х., Сетогучи К., Хамасаки М., Кумаширо Т., Симидзу Н., Фудзики Й. (март 2002 г.). «Рецептор пероксисомного нацеленного сигнала Pex5p взаимодействует с грузами и компонентами импортного оборудования пространственно-временным дифференцированным образом: консервативные мотивы Pex5p WXXXF / Y имеют решающее значение для импорта матричного белка» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (6): 1639–55. DOI : 10.1128 / MCB.22.6.1639-1655.2002 . PMC 135613 . PMID 11865044 .
Fransen M, Brees C, Ghys K, Amery L, Mannaerts GP, Ladant D, Van Veldhoven PP (март 2002 г.). «Анализ взаимодействий пероксина млекопитающих с использованием бактериального двухгибридного анализа, не основанного на транскрипции» . Молекулярная и клеточная протеомика . 1 (3): 243–52. DOI : 10.1074 / mcp.M100025-MCP200 . PMID 12096124 .
Франсен М., Вастиау И., Брис С., Брис В., Маннаертс Г.П., Ван Вельдховен П.П. (март 2004 г.). «Возможная роль Pex19p в сборке стыковочных комплексов PTS-рецепторов» . Журнал биологической химии . 279 (13): 12615–24. DOI : 10.1074 / jbc.M304941200 . PMID 14715663 .
Хашимото К., Като З., Нагасе Т., Шимодзава Н., Кувата К., Омоя К. и др. (Август 2005 г.). «Молекулярный механизм термочувствительного фенотипа при нарушении пероксисомального биогенеза» . Педиатрические исследования . 58 (2): 263–9. DOI : 10,1203 / 01.PDR.0000169984.89199.69 . PMID 16006427 .
Нгуен Т., Бьоркман Дж., Патон BC, Крейн Д.И. (февраль 2006 г.). «Неспособность микротрубочек-опосредованного деления пероксисом и торговля нарушениями с пониженным изобилием пероксисом» . Журнал клеточной науки . 119 (Pt 4): 636–45. DOI : 10,1242 / jcs.02776 . PMID 16449325 .

Внешние ссылки [ править ]

GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о нарушениях биогенеза пероксисом, спектре синдрома Зеллвегера
Записи OMIM о нарушениях биогенеза пероксисом, спектре синдрома Зеллвегера

Эта статья о гене на хромосоме 2 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000162928 - Ensembl , май 2017 г.

[2] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[3] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9878256-4] Björkman J, Stetten G, Мур CS, Гулд SJ, Кран DI (декабрь 1998). «Геномная структура PEX13, кандидата гена нарушения биогенеза пероксисомы». Геномика . 54 (3): 521–8. DOI : 10.1006 / geno.1998.5520 . PMID 9878256 .

[entrez-5] "Энтрез Ген: фактор биогенеза пероксисомы PEX13 13" .

[pmid11865044-6] а б Отера Х, Сетогучи К., Хамасаки М, Кумаширо Т., Симидзу Н., Фудзики Y (март 2002 г.). «Рецептор пероксисомного нацеленного сигнала Pex5p взаимодействует с грузами и компонентами импортного оборудования пространственно-временным дифференцированным образом: консервативные мотивы Pex5p WXXXF / Y имеют решающее значение для импорта матричного белка» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (6): 1639–55. DOI : 10.1128 / MCB.22.6.1639-1655.2002 . PMC 135613 . PMID 11865044 .

[pmid8858165-7] Gould SJ, Kalish JE, Morrell JC, Bjorkman J, Urquhart AJ, Crane DI (октябрь 1996 г.). «Pex13p представляет собой белок SH3 пероксисомной мембраны и фактор стыковки для преимущественно цитоплазматического рецептора PTs1» . Журнал клеточной биологии . 135 (1): 85–95. DOI : 10,1083 / jcb.135.1.85 . PMC 2121023 . PMID 8858165 .

[pmid10704444-8] Сакстедера К. Джонс JM, South ST, Ли X, Y Liu, Гулд SJ (март 2000). «PEX19 связывает множество белков пероксисомальной мембраны, является преимущественно цитоплазматическим и требуется для синтеза пероксисомальной мембраны» . Журнал клеточной биологии . 148 (5): 931–44. DOI : 10,1083 / jcb.148.5.931 . PMC 2174547 . PMID 10704444 .

[pmid11390669-9] Fransen M, Wylin T, Бульоны C, Маннартс GP, Ван Вельдховен PP (июль 2001). «Pex19p человека связывает интегральные пероксисомные мембранные белки в областях, отличных от их сортирующих последовательностей» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (13): 4413–24. DOI : 10.1128 / MCB.21.13.4413-4424.2001 . PMC 87101 . PMID 11390669 .

[1]