PEX19

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
2W85 , 2WL8 , 3AJB , 3MK4

Идентификаторы

Псевдонимы

PEX19 , D1S2223E, HK33, PBD12A, PMP1, PMPI, PXF, PXMP1, фактор пероксисомального биогенеза 19

Внешние идентификаторы

OMIM: 600279 MGI: 1334458 HomoloGene: 134253 Генные карты : PEX19

Расположение гена (человек)

Chr.	Хромосома 1 (человека) ^[1]

Группа	1q23.2	Начинать	160 276 812 п.н. ^[1]
Группа	1q23.2	Конец	160 286 348 п.н. ^[1]

Расположение гена (Мышь)

Chr.	Хромосома 1 (мышь) ^[2]

Группа	1 H3 \| 1 79,54 см	Начинать	172 126 755 п.н. ^[2]
Группа	1 H3 \| 1 79,54 см	Конец	172 136 493 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание с целевой последовательностью класса 1 пероксисомной мембраны • связывание с N-концом белка • связывание с АТФазой • связывание с белком GO: 0001948
Сотовый компонент	• цитоплазма • неотъемлемый компонент мембраны • цитозоль • мембрана • пероксисомальная мембрана • пероксисома • нуклеоплазма • мембрана щеточной каймы • ядро клетки • макромолекулярный комплекс
Биологический процесс	• нацеливание белка на пероксисомы • опосредованный шапероном транспорт белка • организация пероксисом • стабилизация белка • биогенез пероксисомной мембраны • деление пероксисомы • импорт белка в мембрану пероксисомы • трансмембранный транспорт • установление локализации белка в пероксисоме • отрицательная регуляция связывания липидов • опосредованное шапероном сворачивание белка
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


5824


19298

Ансамбль


ENSG00000162735


ENSMUSG00000003464

UniProt


P40855


Q8VCI5

RefSeq (мРНК)


NM_001131039 NM_001193644 NM_002857


NM_001159525 NM_023041 NM_001356513 NM_001356514

RefSeq (белок)


NP_001180573 NP_002848


NP_001152997 NP_075528 NP_001343442 NP_001343443

Расположение (UCSC)

Chr 1: 160.28 - 160.29 Мб

Chr 1: 172.13 - 172.14 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Пероксисом фактор биогенеза 19 представляет собой белок , который у человека кодируется PEX19 гена . ^[5]^[6]^[7]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что PEX19 взаимодействует с:

ABCD1 , ^[8]^[9]
ABCD2 , ^[8]^[9]
ABCD3 , ^[8]^[9]^[10]^[11]
PEX10 , ^[10]^[12]
PEX11B , ^[10]^[12]
PEX12 , ^[10]^[12]
PEX13 , ^[10]^[12]
PEX16 , ^[12] и
PEX3 . ^[8]^[10]^[12]^[13]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000162735 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000003464 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Каммерер S, Арнольд Н, Gutensohn Вт, Мьюз HW, Kunau WH, Höfler G, Рошер А. А., Браун А (ноябрь 1997 года). «Геномная организация и молекулярная характеристика гена, кодирующего HsPXF, человеческий пероксисомальный фарнезилированный белок». Геномика . 45 (1): 200–10. DOI : 10.1006 / geno.1997.4914 . PMID 9339377 .
^ Matsuzono Y, Киношиты N, S Тамура, Shimozawa N, Hamasaki М, Ghaedi К, Вандерс RJ, Suzuki Y, Kondo N, Фудзики Y (апрель 1999 г.). «PEX19 человека: клонирование кДНК посредством функциональной комплементации, анализ мутаций у пациента с синдромом Зеллвегера и потенциальная роль в сборке пероксисомальной мембраны» . Proc Natl Acad Sci USA . 96 (5): 2116–21. DOI : 10.1073 / pnas.96.5.2116 . PMC 26746 . PMID 10051604 .
^ «Энтрез Ген: фактор 19 пероксисомального биогенеза PEX19» .
^ a b c d Mayerhofer PU, Kattenfeld T, Roscher AA, Muntau AC (март 2002 г.). «Два варианта сплайсинга человеческого PEX19 проявляют различные функции в пероксисомной сборке». Biochem. Биофиз. Res. Commun . 291 (5): 1180–6. DOI : 10.1006 / bbrc.2002.6568 . PMID 11883941 .
^ a b c Gloeckner CJ, Mayerhofer PU, Landgraf P, Muntau AC, Holzinger A, Gerber JK, Kammerer S, Adamski J, Roscher AA (апрель 2000 г.). «Человеческий адренолейкодистрофический белок и родственные пероксисомные переносчики ABC взаимодействуют с пероксисомальным сборочным белком PEX19p». Biochem. Биофиз. Res. Commun . 271 (1): 144–50. DOI : 10.1006 / bbrc.2000.2572 . PMID 10777694 .
^ a b c d e f Sacksteder KA, Jones JM, South ST, Li X, Liu Y, Gould SJ (март 2000 г.). «PEX19 связывает несколько белков пероксисомальной мембраны, является преимущественно цитоплазматическим и требуется для синтеза пероксисомальной мембраны» . J. Cell Biol . 148 (5): 931–44. DOI : 10,1083 / jcb.148.5.931 . PMC 2174547 . PMID 10704444 .
^ Biermanns М, Гертнер J (июль 2001 г.). «Направляющие элементы в аминоконцевой части направляют человеческий интегральный мембранный белок пероксисомы 70 кДа (PMP70) в пероксисомы». Biochem. Биофиз. Res. Commun . 285 (3): 649–55. DOI : 10.1006 / bbrc.2001.5220 . PMID 11453642 .
^ a b c d e f Fransen M, Wylin T, Brees C, Mannaerts GP, Van Veldhoven PP (июль 2001 г.). «Pex19p человека связывает интегральные мембранные белки пероксисомы в областях, отличных от их сортирующих последовательностей» . Мол. Клетка. Биол . 21 (13): 4413–24. DOI : 10.1128 / MCB.21.13.4413-4424.2001 . PMC 87101 . PMID 11390669 .
^ Руала ДФ, Венкатесан К, Хао Т, Hirozane-Kishikawa Т, Dricot А, Ли Н, Беррис Г.Ф., Джиббонс ФО, Дрезе М, Ayivi-Guedehoussou Н, Klitgord Н, Саймон С, Boxem М, Мильштейн S, Розенберг J, Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраугтон С., Лламосас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.Й., Смоляр А., Босак С. , Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. DOI : 10,1038 / природа04209 . PMID 16189514 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Браун А., Каммерер С., Вайссенхорн В., Вайс Э. Х., Клив Н. (1994). «Последовательность предполагаемого человеческого гена домашнего хозяйства (HK33), локализованного на хромосоме 1» . Джин . 146 (2): 291–5. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90308-5 . PMID 8076834 .
Гётте К., Гирзальский В., Линкерт М., Баумгарт Э., Каммерер С., Кунау В.Х., Эрдманн Р. (1998). «Pex19p, фарнезилированный белок, необходимый для биогенеза пероксисом» . Мол. Клетка. Биол . 18 (1): 616–28. DOI : 10,1128 / MCB.18.1.616 . PMC 121529 . PMID 9418908 .
Sacksteder KA, Jones JM, South ST, Li X, Liu Y, Gould SJ (2000). «Pex19 связывает множество белков пероксисомальной мембраны, является преимущественно цитоплазматическим и необходим для синтеза пероксисомальной мембраны» . J. Cell Biol . 148 (5): 931–44. DOI : 10,1083 / jcb.148.5.931 . PMC 2174547 . PMID 10704444 .
Gloeckner CJ, Mayerhofer PU, Landgraf P, Muntau AC, Holzinger A, Gerber JK, Kammerer S, Adamski J, Roscher AA (2000). «Человеческий адренолейкодистрофический белок и родственные пероксисомные переносчики ABC взаимодействуют с пероксисомальным сборочным белком PEX19p». Biochem. Биофиз. Res. Commun . 271 (1): 144–50. DOI : 10.1006 / bbrc.2000.2572 . PMID 10777694 .
Сугихара Т., Каул С.К., Като Дж., Реддел Р.Р., Номура Х., Вадхва Р. (2001). «Pex19p подавляет путь опухолевого супрессора p19ARF-p53-p21WAF1» . J. Biol. Chem . 276 (22): 18649–52. DOI : 10.1074 / jbc.C100011200 . PMID 11259404 .
Fransen M, Wylin T, Brees C, Mannaerts GP, Van Veldhoven PP (2001). «Pex19p человека связывает пероксисомальные интегральные мембранные белки в областях, отличных от их сортировочных последовательностей» . Мол. Клетка. Биол . 21 (13): 4413–24. DOI : 10.1128 / MCB.21.13.4413-4424.2001 . PMC 87101 . PMID 11390669 .
Бирманнс М., Гертнер Дж. (2001). «Направляющие элементы в аминоконцевой части направляют человеческий пероксисомный интегральный мембранный белок (PMP70) массой 70 кДа в пероксисомы». Biochem. Биофиз. Res. Commun . 285 (3): 649–55. DOI : 10.1006 / bbrc.2001.5220 . PMID 11453642 .
Mayerhofer PU, Kattenfeld T, Roscher AA, Muntau AC (2002). «Два варианта сплайсинга человеческого PEX19 проявляют различные функции в пероксисомной сборке». Biochem. Биофиз. Res. Commun . 291 (5): 1180–6. DOI : 10.1006 / bbrc.2002.6568 . PMID 11883941 .
Fransen M, Brees C, Ghys K, Amery L, Mannaerts GP, Ladant D, Van Veldhoven PP (2002). «Анализ взаимодействий пероксина млекопитающих с использованием бактериального двухгибридного анализа, не основанного на транскрипции» . Мол. Клетка. Протеомика . 1 (3): 243–52. DOI : 10.1074 / mcp.M100025-MCP200 . PMID 12096124 .
Ито М., Иидава С., Изука М., Хайто С., Сегава Х, Кувахата М., Окидо I, Оно Х, Миямото К. (2004). «Взаимодействие фарнезилированного белка с почечным ко-транспортером Na / Pi типа IIa в ответ на паратироидный гормон и диетический фосфат» . Biochem. Дж . 377 (Pt 3): 607–16. DOI : 10.1042 / BJ20031223 . PMC 1223893 . PMID 14558883 .
Джонс Дж. М., Моррелл Дж. К., Гулд С. Дж. (2004). «PEX19 является преимущественно цитозольным шапероном и рецептором для импорта пероксисомных мембранных белков класса 1» . J. Cell Biol . 164 (1): 57–67. DOI : 10,1083 / jcb.200304111 . PMC 2171958 . PMID 14709540 .
Muntau AC, Roscher AA, Kunau WH, Dodt G (2004). Взаимодействие PEX3 и PEX19 визуализировано с помощью флуоресцентного резонансного переноса энергии (FRET) . Adv. Exp. Med. Биол . Успехи экспериментальной медицины и биологии. 544 . С. 221–4. DOI : 10.1007 / 978-1-4419-9072-3_27 . ISBN 978-1-4613-4782-8. PMID 14713233 .
Франсен М., Вастиау I, Брис С., Брис В., Маннаертс Г.П., Ван Велдховен П.П. (2004). «Возможная роль Pex19p в сборке стыковочных комплексов PTS-рецепторов» . J. Biol. Chem . 279 (13): 12615–24. DOI : 10.1074 / jbc.M304941200 . PMID 14715663 .
Фанг Y, Моррелл JC, Джонс JM, Гулд SJ (2004). «PEX3 действует как док-фактор PEX19 при импорте пероксисомальных мембранных белков класса I» . J. Cell Biol . 164 (6): 863–75. DOI : 10,1083 / jcb.200311131 . PMC 2172291 . PMID 15007061 .
Колланд Ф., Жак Икс, Троплин В., Мужен С., Грозело С., Гамбург А, Мейл А., Войчик Дж., Легрен П., Готье Дж. М. (2004). «Функциональное картирование протеомики сигнального пути человека» . Genome Res . 14 (7): 1324–32. DOI : 10.1101 / gr.2334104 . PMC 442148 . PMID 15231748 .
Шибата Х, Кашивама Й, Иманака Т, Като Х (2004). «Доменная архитектура и активность человеческого Pex19p, шапероноподобного белка для внутриклеточного переноса белков пероксисомальной мембраны» . J. Biol. Chem . 279 (37): 38486–94. DOI : 10.1074 / jbc.M402204200 . PMID 15252024 .

Внешние ссылки [ править ]

GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о нарушениях биогенеза пероксисом, спектре синдрома Зеллвегера
Записи OMIM о нарушениях биогенеза пероксисом, спектре синдрома Зеллвегера
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P40855 (фактор пероксисомального биогенеза 19) в PDBe-KB .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000162735 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000003464 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9339377-5] Каммерер S, Арнольд Н, Gutensohn Вт, Мьюз HW, Kunau WH, Höfler G, Рошер А. А., Браун А (ноябрь 1997 года). «Геномная организация и молекулярная характеристика гена, кодирующего HsPXF, человеческий пероксисомальный фарнезилированный белок». Геномика . 45 (1): 200–10. DOI : 10.1006 / geno.1997.4914 . PMID 9339377 .

[pmid10051604-6] Matsuzono Y, Киношиты N, S Тамура, Shimozawa N, Hamasaki М, Ghaedi К, Вандерс RJ, Suzuki Y, Kondo N, Фудзики Y (апрель 1999 г.). «PEX19 человека: клонирование кДНК посредством функциональной комплементации, анализ мутаций у пациента с синдромом Зеллвегера и потенциальная роль в сборке пероксисомальной мембраны» . Proc Natl Acad Sci USA . 96 (5): 2116–21. DOI : 10.1073 / pnas.96.5.2116 . PMC 26746 . PMID 10051604 .

[entrez-7] «Энтрез Ген: фактор 19 пероксисомального биогенеза PEX19» .

[pmid11883941-8] Mayerhofer PU, Kattenfeld T, Roscher AA, Muntau AC (март 2002 г.). «Два варианта сплайсинга человеческого PEX19 проявляют различные функции в пероксисомной сборке». Biochem. Биофиз. Res. Commun . 291 (5): 1180–6. DOI : 10.1006 / bbrc.2002.6568 . PMID 11883941 .

[pmid10777694-9] Gloeckner CJ, Mayerhofer PU, Landgraf P, Muntau AC, Holzinger A, Gerber JK, Kammerer S, Adamski J, Roscher AA (апрель 2000 г.). «Человеческий адренолейкодистрофический белок и родственные пероксисомные переносчики ABC взаимодействуют с пероксисомальным сборочным белком PEX19p». Biochem. Биофиз. Res. Commun . 271 (1): 144–50. DOI : 10.1006 / bbrc.2000.2572 . PMID 10777694 .

[pmid10704444-10] Sacksteder KA, Jones JM, South ST, Li X, Liu Y, Gould SJ (март 2000 г.). «PEX19 связывает несколько белков пероксисомальной мембраны, является преимущественно цитоплазматическим и требуется для синтеза пероксисомальной мембраны» . J. Cell Biol . 148 (5): 931–44. DOI : 10,1083 / jcb.148.5.931 . PMC 2174547 . PMID 10704444 .

[pmid11453642-11] Biermanns М, Гертнер J (июль 2001 г.). «Направляющие элементы в аминоконцевой части направляют человеческий интегральный мембранный белок пероксисомы 70 кДа (PMP70) в пероксисомы». Biochem. Биофиз. Res. Commun . 285 (3): 649–55. DOI : 10.1006 / bbrc.2001.5220 . PMID 11453642 .

[pmid11390669-12] Fransen M, Wylin T, Brees C, Mannaerts GP, Van Veldhoven PP (июль 2001 г.). «Pex19p человека связывает интегральные мембранные белки пероксисомы в областях, отличных от их сортирующих последовательностей» . Мол. Клетка. Биол . 21 (13): 4413–24. DOI : 10.1128 / MCB.21.13.4413-4424.2001 . PMC 87101 . PMID 11390669 .

[pmid16189514-13] Руала ДФ, Венкатесан К, Хао Т, Hirozane-Kishikawa Т, Dricot А, Ли Н, Беррис Г.Ф., Джиббонс ФО, Дрезе М, Ayivi-Guedehoussou Н, Klitgord Н, Саймон С, Boxem М, Мильштейн S, Розенберг J, Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраугтон С., Лламосас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.Й., Смоляр А., Босак С. , Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. DOI : 10,1038 / природа04209 . PMID 16189514 .

[1]