• связывание идентичных белковых • гомодимеризация активность белка • транскрипции связывания ДНК - последовательность конкретных регуляторной области • последовательность ДНК-специфическое связывание • связывания ДНК • РНК - полимеразы II активирующего фактора транскрипции связывания • РНК - полимеразы II транскрипции фактора связывания • GO: 0001105 транскрипции коактиватор активность • хроматина Связывание ДНК • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • Связывание с белком GO: 0001948 • ГО: 0000980 РНК - полимеразы II цис-регуляторной области последовательности-специфической ДНК связывания • хроматина связывания • рибонуклеопротеиновый комплекс связывания • ГО: 0001131, ГО: 0001151, ГО: 0001130, ГО: 0001204 ДНК-связывающий активность фактора транскрипции • ГО: 0001078, ГО : 0001214, ГО: 0001206 ДНК-связывающий репрессор активность транскрипции, РНК - полимеразы II , специфичные • связывания фактора транскрипции • фосфопротеином связывания • ГО: 0001200, ГО: 0001133, ГО: 0001201 ДНК-связывающий фактор активности транскрипции, РНК - полимеразы II-специфический
Сотовый компонент
• ядро клетки • цитоплазма • комплекс регуляторов транскрипции • нуклеоплазма
Биологический процесс
• реакция на витамин А • развитие женских половых желез • сосудистой гладкой дифференцировку мышечных клеток • регуляция транскрипции с РНК - полимеразы II промотор • Развитие скелетных мышечных тканей • пролиферации клеток , участвующих в оттоке путей морфогенеза • пролактин секретирующих дифференцировки клеток • внутриутробно эмбрионального развития • гипофиз развитие • васкулогенез • регуляция пролиферации клеток • слияние миобластов • дифференцировка волосковых клеток • развитие селезенки • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • развитие глаза эмбриональной камеры • морфогенез желудочковой перегородки • энтодермальный морфогенез пищеварительного тракта • определение левой / правой симметрии • развитие ткани сердечной мышцы • положительная регуляция транскрипции, ДНК- шаблонный • гипоталамического ядро развитие • желудочковой развития клеток сердечной мышцы • левой / правая спецификация оси • миграция гипоталамуса клетки • животного орган морфогенез • регуляция миграции клеток • развитие сердца • эмбриональный морфогенез пищеварительного тракта • ветвление, участвующее в морфогенезе кровеносных сосудов • дифференциация клеток сердечной мышцы • развитие пищеварительной системы • развитие многоклеточных организмов • развитие атриовентрикулярного клапана • морфогенез легочной вены • миграция клеток нервного гребня сердца, участвующих в тракте оттока морфогенез • эмбриональный морфогенез задних конечностей • развитие легких • морфогенез верхней полой вены • положительная регуляция связывания ДНК • развитие экстраокулярных скелетных мышц • развитие легочного миокарда • развитие дельтовидной бугристости • морфогенез ткани сердечной мышцы предсердия • развитие мужских гонад • морфогенез анатомической структуры • развитие мозга • дифференцировка нейронов • одонтогенез дентинсодержащего зуба • сигнальный путь Wnt • морфогенез секреции левого легкого • соматотропный путь дифференцировка клеток • положительная регуляция пролиферации миобластов • развитие глаз по типу камеры • ответ на гормон • одонтогенез • морфогенез радужки • миграция нейронов • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
Соединенный-подобный фактор транскрипции 2 гомеодоменовый также известный как гипофиз гомеобоксом 2 представляет собой белок , который у человека кодируется Pitx2 гена . [5] [6] [7]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Функция
2 Клиническое значение
3 ссылки
4 Дальнейшее чтение
5 Внешние ссылки
Функция [ править ]
Этот ген кодирует член семейства гомеобоксного RIEG / PITX, который находится в Bicoid класса гомеодоменовых белков. Этот белок действует как фактор транскрипции [8] и регулирует экспрессию гена проколлаген-лизилгидроксилазы . Этот белок участвует в развитии глаз, зубов и органов брюшной полости. Этот белок действует как регулятор транскрипции, участвующий в основной и регулируемой гормонами активности пролактина . Подобный белок у других позвоночных участвует в определении лево-правой асимметрии во время развития. Для этого гена были идентифицированы три варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. [7]
Pitx2 отвечает за установление оси влево-вправо, асимметричное развитие сердца, легких и селезенки, скручивание кишечника и желудка, а также за развитие глаз. После активации Pitx2 будет локально экспрессироваться в левой латеральной мезодерме , трубчатом сердце и раннем кишечнике, что приводит к асимметричному развитию органов и образованию петель в кишечнике. Когда Pitx2 удаляется, нерегулярный морфогенез органов возникает с левой стороны. Pitx2 экспрессируется слева латерально, контролируя морфологию левых внутренних органов. Экспрессия Pitx2 контролируется интронным энхансером ASE и Nodal. Похоже, что в то время как Nodal контролирует краниальную экспрессию Pitx2, ASE контролирует лево-правую экспрессию Pitx2, что ведет к асимметричному развитию левых висцеральных органов, таких как селезенка и печень. В совокупности Pitx2 сначала действует, чтобы предотвратить апоптоз экстраокулярных мышц, а затем действует как миогенный программист экстраокулярных мышечных клеток. [9] [10] [11] Также были проведены исследования, показывающие различные изоформы фактора транскрипции: Pitx2a, Pitx2b и Pitx2c, каждая из которых имеет различные и неперекрывающиеся функции. [12]
Исследования показали, что у куриных эмбрионов Pitx2 является прямым регулятором cVg1, фактора роста, гомологичного GDF1 млекопитающих . cVg1 представляет собой бета- сигнал трансформирующего фактора роста, который экспрессируется сзади до образования зародышевых листков эмбриона. [13] Pitx2 регуляция cVg1 важна как во время нормального эмбрионального развития, так и во время установления полярности у близнецов, созданных экспериментальным делением одного исходного эмбриона. Pitx2, как показано, важен для активации cVg1 посредством связывания энхансеров и необходим для правильной экспрессии cVg1 в задней маргинальной зоне. Экспрессия cVg1 в PMZ, в свою очередь, необходима для правильного развития примитивной полоски.. Экспериментальные нокауты гена PITX2 связаны с последующей активацией родственного Pitx1, который способен частично компенсировать потерю Pitx2. Способность Pitx2 регулировать полярность эмбриона может быть ответственной за способность развивающихся цыплят устанавливать правильную полярность в эмбрионах, созданных разрезами, выполняемыми уже на стадии бластодермы . [14]
Pitx2 играет роль в миогенезе конечностей . Pitx2 может определять развитие и активацию гена MyoD (гена, ответственного за миогенез скелета). Исследования показали, что экспрессия Pitx2 происходит до того, как MyoD экспрессируется в мышцах. Дальнейшие исследования показывают, что Pitx2 непосредственно задействован для воздействия на основной энхансер MyoD и, таким образом, направляет экспрессию гена MyoD . Pitx 2 находится на параллельном пути с Myf5 и Myf6, поскольку оба пути влияют на выражение MyoD. Однако в отсутствие параллельного пути Pitx2 может продолжать активировать гены MyoD. Экспрессия Pitx2 сохраняет экспрессию гена MyoD и продолжает экспрессировать этот ген для миогенеза конечностей. Тем не менее, Pitx 2 путем является Рах3 зависимыми и требует этого гена ввести в действие миогенеза конечности. Исследования подтверждают это заключение , как и в случае отсутствия Рах3 , существует дефицит экспрессии Pitx2 и , таким образом, MyoD не выражаются в миогенезе конечности. Таким образом, показано, что ген Pitx2 находится ниже по течению от Pax3 и служит промежуточным звеном между Pax3 и MyoD. В заключение, Pitx2 играет неотъемлемую роль в миогенезе конечностей. [15]
Изоформы Pitx2 экспрессируются сексуально диморфным образом во время развития гонад крыс. [16]
Клиническое значение [ править ]
Мутации в этом гене связаны с синдромом Аксенфельда-Ригера (ARS), синдромом иридогониодисгенеза (IGDS) и спорадическими случаями аномалии Петерса . Этот белок играет роль в терминальной дифференцировке фенотипов соматотрофных и лактотрофных клеток. [7]
Pitx2 сверхэкспрессируется при многих формах рака. Например, рак щитовидной железы [17] яичников [18] и рак толстой кишки [19] имеют более высокие уровни Pitx2 по сравнению с доброкачественными тканями. Ученые предполагают, что раковые клетки неправильно включают Pitx2, что приводит к неконтролируемой пролиферации клеток. Это согласуется с ролью Pitx2 в регуляции регулирующих рост генов cyclin D2 , [20] cyclin D1, [21] и C-Myc. [21]
При раке почек Pitx2 регулирует экспрессию ABCB1 , переносчика множества лекарственных средств, путем связывания с промоторной областью ABCB1. [22] Повышенная экспрессия Pitx2 в раковых клетках почек связана с повышенной экспрессией ABCB1. [22] Таким образом, клетки рака почек, которые сверхэкспрессируют ABCB1, обладают большей устойчивостью к химиотерапевтическим агентам. [22] В экспериментах, в которых экспрессия Pitx2 была снижена, клетки рака почек показали снижение клеточной пролиферации и большую чувствительность к лечению доксорубицином, что согласуется с другими результатами. [22]
При плоскоклеточной карциноме пищевода человека (ESCC) Pitx2 сверхэкспрессируется по сравнению с нормальными плоскоклеточными клетками пищевода. [23] Кроме того, большая экспрессия Pitx2 положительно коррелирует с клинической агрессивностью ESCC. [23] Кроме того, пациенты с ESCC с высокой экспрессией Pitx2 не реагировали также на радикальную химиолучевую терапию (CRT) по сравнению с пациентами с ESCC с низкой экспрессией Pitx2. [23] Таким образом, врачи могут использовать экспрессию Pitx2 для прогнозирования реакции пациентов с ESCC на лечение рака. [23]
В врожденном пороке сердца , гетерозиготные мутации в Pitx2 были вовлечены в развитии Тетрады Фалло , дефект межжелудочковой перегородки , дефект межпредсердной перегородки , транспозиция магистральных артерий и эндокард подушки дефекта (ECD). [24] [25] [26] Мутации гена Pitx2 создаются путем альтернативного сплайсинга . Изоформа Pitx2, важная для кардиогенеза, - это Pitx2c. Отсутствие экспрессии этой конкретной изоформы коррелирует с этими врожденными дефектами. Мутации Pitx2 значительно снижают транскрипционную активность Pitx2 и синергетическую активацию между Pitx2 и NKX2.(также важно для развития сердца). [24] Большой фенотипический спектр из-за мутации Pitx2 может быть отнесен к множеству факторов, включая: различный генетический фон, эпигенетические модификаторы и отсроченную / полную пенетрантность. [25] Важно отметить, что мутация Pitx2 не определяется как причина этих врожденных пороков сердца, но в настоящее время воспринимается как фактор риска их развития. [26]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000164093 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028023 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Аракава Х, Накамура Т, Жаданов А.Б., Фиданза В, Яно Т, Буллрих Ф, Шимицу М, Блехман Дж, Мазо А, Канаани Э, Кроче CM (апрель 1998 г.). «Идентификация и характеристика гена ARP1, мишени для гена ALL1 острой лейкемии человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (8): 4573–8. Bibcode : 1998PNAS ... 95.4573A . DOI : 10.1073 / pnas.95.8.4573 . PMC 22531 . PMID 9539779 .
^ Хон E, Шет BP, Kalenak JW, Sunden SL, Streb LM, Taylor CM, Alward WL, Sheffield VC, Stone EM (август 1995). «Связь аутосомно-доминантной гипоплазии радужки с областью локуса синдрома Ригера (4q25)». Молекулярная генетика человека . 4 (8): 1435–9. DOI : 10.1093 / HMG / 4.8.1435 . PMID 7581385 .
^ a b c «Ген Энтреза: фактор транскрипции парного гомеодомена 2 PITX2» .
^ Logan M, Паган-Вестфаль SM, Smith DM, Paganessi L, Tabin CJ (август 1998). «Фактор транскрипции Pitx2 опосредует ситу-специфический морфогенез в ответ на лево-правые асимметричные сигналы». Cell . 94 (3): 307–17. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81474-9 . PMID 9708733 . S2CID 14375165 .
^ Кампьоне М, Steinbeisser Н, Schweickert А, Дайслер К, ван Беббер Ж, Лоу Л., Nowotschin S, Viebahn С, Haffter Р, МР Кюн, Блюм М (март 1999). «Ген гомеобокса Pitx2: медиатор асимметричной передачи сигналов слева направо в сердце и петле кишечника позвоночных». Развитие . 126 (6): 1225–34. PMID 10021341 .
Перейти ↑ Shiratori H, Yashiro K, Shen MM, Hamada H (август 2006). «Консервативная регуляция и роль Pitx2 в ситус-специфическом морфогенезе висцеральных органов» . Развитие . 133 (15): 3015–25. DOI : 10.1242 / dev.02470 . PMID 16835440 .
^ Захария AL, Lewandoski M, Рудницкий MA, Гейдж PJ (январь 2011). «Pitx2 является вышестоящим активатором экстраокулярного миогенеза и выживания» . Биология развития . 349 (2): 395–405. DOI : 10.1016 / j.ydbio.2010.10.028 . PMC 3019256 . PMID 21035439 .
^ L'Оноре A, Ouimette JF, Lavertu-Джолин M, Drouin J (ноябрь 2010). «Pitx2 определяет альтернативные пути, действующие через MyoD во время миогенеза конечностей и сомитов» . Развитие . 137 (22): 3847–56. DOI : 10.1242 / dev.053421 . PMID 20978076 .
Перейти ↑ Nandi SS, Ghosh P, Roy SS (2011). «Экспрессия фактора транскрипции гомеодомена PITX2 во время развития гонад крыс сексуально диморфным образом» . Клеточная физиология и биохимия . 27 (2): 159–70. DOI : 10.1159 / 000325218 . PMID 21325833 .
^ Хуанг Y, Guigon CJ, Вентилятор J, Ченг С.Ю., Чжу ГЗ (апрель 2010 г.). «Гипофизарный гомеобокс 2 (PITX2) способствует канцерогенезу щитовидной железы путем активации циклина D2» . Клеточный цикл . 9 (7): 1333–41. DOI : 10.4161 / cc.9.7.11126 . PMID 20372070 .
↑ Hirose H, Ishii H, Mimori K, Tanaka F, Takemasa I, Mizushima T, Ikeda M, Yamamoto H, Sekimoto M, Doki Y, Mori M (октябрь 2011 г.). «Значение сверхэкспрессии PITX2 при колоректальном раке человека». Анналы хирургической онкологии . 18 (10): 3005–12. DOI : 10.1245 / s10434-011-1653-Z . PMID 21479692 . S2CID 25710972 .
^ Kioussi С, Р Briata, Бэк SH, роза DW, Hamblet Н.С., Герман Т, Ohgi К.А., Лин С, Gleiberman А, Ван - J, Brault В, Руис-Лозано P, Нгуен HD, Кемлеру R, стекло CK, Wynshaw- Борис А, Розенфельд М.Г. (ноябрь 2002 г.). «Идентификация пути Wnt / Dvl / бета-катенин -> Pitx2, опосредующего клеточную пролиферацию во время развития». Cell . 111 (5): 673–85. DOI : 10.1016 / s0092-8674 (02) 01084-х . PMID 12464179 . S2CID 16108479 .
^ a b Пэк С.Х., Киусси С., Бриата П., Ван Д., Нгуен HD, Охги К.А., Гласс С.К., Виншоу-Борис А., Роуз Д.В., Розенфельд М.Г. (март 2003 г.). «Регулируемая подгруппа генов контроля роста G1 в ответ на дерепрессию путем Wnt» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (6): 3245–3250. Bibcode : 2003PNAS..100.3245B . DOI : 10.1073 / pnas.0330217100 . PMC 152277 . PMID 12629224 .
^ a b c d Ли В.К., Чакраборти П.К., Тевенод Ф. (август 2013 г.). «Гомеобокс 2 гипофиза (PITX2) защищает линии клеток рака почек от токсичности доксорубицина путем активации транскрипции переносчика множества лекарственных средств ABCB1». Международный журнал рака . 133 (3): 556–67. DOI : 10.1002 / ijc.28060 . PMID 23354914 . S2CID 39427967 .
^ a b c d Zhang JX, Tong ZT, Yang L, Wang F, Chai HP, Zhang F, Xie MR, Zhang AL, Wu LM, Hong H, Yin L, Wang H, Wang HY, Zhao Y (июнь 2013 г.) . «PITX2: многообещающий прогнозирующий биомаркер прогноза пациентов и химиорадиорезистентности при плоскоклеточном раке пищевода» . Международный журнал рака . 132 (11): 2567–2577. DOI : 10.1002 / ijc.27930 . PMID 23132660 . S2CID 44870191 .
^ a b Вс, Y (15 февраля 2016 г.). «Мутация потери функции PITX2 способствует тетралогии Фалло». Джин . 577 (2): 258–264. DOI : 10.1016 / j.gene.2015.12.001 . PMID 26657035 .
↑ a b Zhao, C (20 апреля 2015 г.). «Мутация потери функции PITX2 способствует врожденному дефекту эндокардиальной подушки и синдрому Аксенфольда-Ригера» . PLOS ONE . 10 (4): e0124409. Bibcode : 2015PLoSO..1024409Z . DOI : 10.1371 / journal.pone.0124409 . PMC 4404345 . PMID 25893250 .
^ a b Донг, Вэй (14 января 2014 г.). «Новые мутации потери функции PITX2c, связанные со сложным врожденным пороком сердца» . Международный журнал молекулярной медицины . 33 (5): 1201–1208. DOI : 10.3892 / ijmm.2014.1689 . PMID 24604414 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Франко Д., Кампионе М. (май 2003 г.). «Роль Pitx2 в развитии сердца. Связывание передачи сигналов слева направо и врожденных пороков сердца». Тенденции сердечно-сосудистой медицины . 13 (4): 157–63. DOI : 10.1016 / S1050-1738 (03) 00039-2 . PMID 12732450 .
Хьялт Т.А., Семина Е.В. (ноябрь 2005 г.). «Современное молекулярное понимание синдрома Аксенфельда-Ригера» . Обзоры экспертов в области молекулярной медицины . 7 (25): 1–17. DOI : 10.1017 / S1462399405010082 . PMID 16274491 .
Мюррей Дж. К., Беннет С. Р., Квитек А. Е., Смолл К. В., Шинцель А., Алвард В. Л., Вебер Д. Л., Белл Г. И., Буетоу К. Х. (сентябрь 1992 г.). «Связывание синдрома Ригера с областью гена эпидермального фактора роста на хромосоме 4». Генетика природы . 2 (1): 46–9. DOI : 10.1038 / ng0992-46 . PMID 1303248 . S2CID 8778187 .
Уолтер М.А., Мирзаянс Ф., Мирс А.Дж., Хики К., Пирс В.Г. (ноябрь 1996 г.). «Аутосомно-доминантный иридогониодисгенез и синдром Аксенфельда-Ригера генетически различны». Офтальмология . 103 (11): 1907–15. DOI : 10.1016 / s0161-6420 (96) 30408-9 . PMID 8942889 .
Семина Е.В., Рейтер Р., Лейсенс Нью-Джерси, Алвард В.Л., Смолл К.В., Датсон Н.А., Сигель-Бартельт Дж., Бирке-Нельсон Д., Битоун П., Забель БУ, Кэри Дж. К., Мюррей Дж. С. (декабрь 1996 г.). «Клонирование и характеристика нового гена фактора транскрипции гомеобокса, связанного с бикоидом, RIEG, вовлеченного в синдром Ригера». Генетика природы . 14 (4): 392–9. DOI : 10.1038 / ng1296-392 . PMID 8944018 . S2CID 21122544 .
Alward WL, Semina EV, Kalenak JW, Héon E, Sheth BP, Stone EM, Murray JC (январь 1998 г.). «Аутосомно-доминантная гипоплазия радужки вызвана мутацией в гене синдрома Ригера (RIEG / PITX2)». Американский журнал офтальмологии . 125 (1): 98–100. DOI : 10.1016 / S0002-9394 (99) 80242-6 . PMID 9437321 .
Кулак С.К., Козловский К., Семина Е.В., Пирс В.Г., Уолтер М.А. (июль 1998 г.). «Мутация в гене RIEG1 у пациентов с синдромом иридогониодисгенеза» . Молекулярная генетика человека . 7 (7): 1113–7. DOI : 10.1093 / HMG / 7.7.1113 . PMID 9618168 .
Амендт Б.А., Сазерленд Л.Б., Семина Е.В., Руссо А.Ф. (август 1998 г.). «Молекулярные основы синдрома Ригера. Анализ активности гомеодоменного белка Pitx2» . Журнал биологической химии . 273 (32): 20066–72. DOI : 10.1074 / jbc.273.32.20066 . PMID 9685346 .
Йошиока Х., Мено С., Кошиба К., Сугихара М., Ито Х., Ишимару Й., Иноуэ Т., Охучи Х., Семина Е. В., Мюррей Дж. К., Хамада Х., Нодзи С. (август 1998 г.). «Pitx2, ген гомеобокса бикоидного типа, участвует в лево-сигнальном пути определения лево-правой асимметрии». Cell . 94 (3): 299–305. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81473-7 . PMID 9708732 . S2CID 17712261 .
Дауард В., Первен Р., Ллойд И.К., Риджвей А.Э., Уилсон Л., Блэк Г.К. (февраль 1999 г.). «Мутация в гене RIEG1, связанная с аномалией Петерса» . Журнал медицинской генетики . 36 (2): 152–5. doi : 10.1136 / jmg.36.2.152 (неактивен 2021-01-14). PMC 1734311 . PMID 10051017 .CS1 maint: DOI неактивен с января 2021 г. ( ссылка )
Pellegrini-Bouiller I, Manrique C, Gunz G, Grino M, Zamora AJ, Figarella-Branger D, Grisoli F, Jaquet P, Enjalbert A (июнь 1999 г.). «Экспрессия членов семейства транскрипционных факторов Ptx в аденомах гипофиза человека». Журнал клинической эндокринологии и метаболизма . 84 (6): 2212–20. DOI : 10,1210 / jc.84.6.2212 . PMID 10372733 .
Hjalt TA, Amendt BA, Murray JC (февраль 2001 г.). «PITX2 регулирует экспрессию гена проколлаген-лизилгидроксилазы (PLOD): последствия для патологии синдрома Ригера» . Журнал клеточной биологии . 152 (3): 545–52. DOI : 10,1083 / jcb.152.3.545 . PMC 2196000 . PMID 11157981 .
Пристон М., Козловски К., Гилл Д., Летвин К., Байс Ю., Левин А. В., Вальтер М. А., Хеон Э. (август 2001 г.). «Функциональный анализ двух недавно идентифицированных мутантов PITX2 раскрывает новый молекулярный механизм синдрома Аксенфельда-Ригера» . Молекулярная генетика человека . 10 (16): 1631–8. DOI : 10.1093 / HMG / 10.16.1631 . PMID 11487566 .
Green PD, Hjalt TA, Kirk DE, Sutherland LB, Thomas BL, Sharpe PT, Snead ML, Murray JC, Russo AF, Amendt BA (2002). «Антагонистическая регуляция экспрессии Dlx2 с помощью PITX2 и Msx2: последствия для развития зубов» . Экспрессия гена . 9 (6): 265–81. DOI : 10.3727 / 000000001783992515 . PMC 5964948 . PMID 11763998 .
Винсент А.Л., Биллингсли Дж., Байс Й., Левин А.В., Пристон М., Тропе Дж., Уильямс-Лин Д., Эон Е. (февраль 2002 г.). «Дигенное наследование глаукомы с ранним началом: CYP1B1, потенциальный ген-модификатор» . Американский журнал генетики человека . 70 (2): 448–60. DOI : 10.1086 / 338709 . PMC 384919 . PMID 11774072 .
Borges AS, Susanna R, Carani JC, Betinjane AJ, Alward WL, Stone EM, Sheffield VC, Nishimura DY (февраль 2002 г.). «Генетический анализ PITX2 и FOXC1 у пациентов с синдромом Ригера из Бразилии». Журнал глаукомы . 11 (1): 51–6. DOI : 10.1097 / 00061198-200202000-00010 . PMID 11821690 . S2CID 26094053 .
Cox CJ, Espinoza HM, McWilliams B, Chappell K, Morton L, Hjalt TA, Semina EV, Amendt BA (июль 2002 г.). «Дифференциальная регуляция экспрессии генов изоформами PITX2» . Журнал биологической химии . 277 (28): 25001–10. DOI : 10.1074 / jbc.M201737200 . PMID 11948188 .
Quentien MH, Pitoia F, Gunz G, Guillet MP, Enjalbert A, Pellegrini I (август 2002 г.). «Регулирование экспрессии пролактина, GH и генов Pit-1 в передней доле гипофиза с помощью Pitx2: подход с использованием мутантов Pitx2» . Эндокринология . 143 (8): 2839–51. DOI : 10.1210 / en.143.8.2839 . PMID 12130547 .
Внешние ссылки [ править ]
PITX2 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .
vтеPDB галерея
1yz8 : структура решения гомеодомена pitx2 класса k50, связанного с ДНК, и последствия для мутаций, вызывающих синдром ригера
vтеФакторы транскрипции и внутриклеточные рецепторы
(1) Базовые домены
(1.1) Базовая лейциновая молния ( bZIP )
Активирующий фактор транскрипции
AATF
1
2
3
4
5
6
7
АП-1
c-Fos
FOSB
FOSL1
FOSL2
JDP2
с-июн
JUNB
JunD
БАХ
1
2
BATF
BLZF1
C / EBP
α
β
γ
δ
ε
ζ
CREB
1
3
L1
CREM
ДАД
DDIT3
ГАБПА
GCN4
HLF
MAF
B
F
грамм
K
NFE
2
L1
L2
L3
NFIL3
NRL
NRF
1
2
3
XBP1
(1.2) Базовая спираль-петля-спираль ( bHLH )
Группа А
AS-C
ASCL1
ASCL2
ATOH1
РУКА
1
2
MESP2
Миогенные регуляторные факторы
MyoD
Миогенин
MYF5
MYF6
NeuroD
1
2
Нейрогенины
1
2
3
ОЛИГ
1
2
Paraxis
TCF15
Склераксис
SLC
LYL1
TAL
1
2
Крутить
Группа B
FIGLA
Мой с
c-Myc
l-Myc
n-Myc
MXD4
TCF4
Группа C bHLH- PAS
AhR
AHRR
ARNT
ARNTL
ARNTL2
ЧАСЫ
HIF
1А
EPAS1
3А
NPAS
1
2
3
SIM
1
2
Группа D
BHLH
2
3
9
Pho4
Я БЫ
1
2
3
4
Группа E
HES
1
2
3
4
5
6
7
ПРИВЕТ
1
2
L
Группа F bHLH-COE
EBF1
(1.3) bHLH-ZIP
АП-4
МАКСИМУМ
MXD1
MXD3
MITF
MNT
MLX
MLXIPL
MXI1
Мой с
SREBP
1
2
USF1
(1.4) НФ-1
NFI
А
B
C
Икс
SMAD
R-SMAD
1
2
3
5
9
I-SMAD
6
7
4 )
(1.5) RF-X
RFX
1
2
3
4
5
6
АНК
(1.6) Базовая спираль-пролет-спираль (bHSH)
АП-2
α
β
γ
δ
ε
(2) ДНК-связывающие домены цинкового пальца
(2.1) Ядерный рецептор (Cys 4 )
подсемейство 1
Гормон щитовидной железы
α
β
МАШИНА
FXR
LXR
α
β
PPAR
α
β / δ
γ
PXR
RAR
α
β
γ
ROR
α
β
γ
Rev-ErbA
α
β
VDR
подсемейство 2
КУП-ТФ
( Я
II
Ухо-2
HNF4
α
γ
PNR
RXR
α
β
γ
Рецептор яичка
2
4
TLX
подсемейство 3
Стероидный гормон
Андроген
Эстроген
α
β
Глюкокортикоид
Минералокортикоид
Прогестерон
Связанный с эстрогеном
α
β
γ
подсемейство 4
NUR
NGFIB
NOR1
NURR1
подсемейство 5
LRH-1
SF1
подсемейство 6
GCNF
подсемейство 0
DAX1
SHP
(2.2) Другой Cys 4
GATA
1
2
3
4
5
6
MTA
1
2
3
TRPS1
(2.3) Cys 2 His 2
Общие факторы транскрипции
TFIIA
TFIIB
TFIID
TFIIE
1
2
ТФИИФ
1
2
TFIIH
1
2
4
2I
3А
3C1
3C2
ATBF1
BCL
6
11А
11B
CTCF
E4F1
EGR
1
2
3
4
ERV3
GFI1
GLI- Kruppel семьи
1
2
3
ОТДЫХ
S1
S2
YY1
ИК
1
2
HIVEP
1
2
3
IKZF
1
2
3
ILF
2
3
KLF
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
ПРОДАЖА
1
2
3
4
SP
1
2
4
7
8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
7А
7B
ZBTB
11
16
17
20
32
33
40
цинковый палец
3
7
9
10
19
22
24
33B
34
35 год
41 год
43 год
44 год
51
74
143
146
148
165
202
217
219
238
239
259
267
268
281
295
300
318
330
346
350
365
366
384
423
451
452
471
593
638
644
649
655
804A
(2.4) Cys 6
HIVEP1
(2.5) Чередующийся состав
AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
1
2
4
ДЖАРИД
1А
1B
1С
1D
2
JMJD1B
(2.6) WRKY
WRKY
(3) Домены спираль-поворот-спираль
(3.1) Гомеодомен
Antennapedia класс Antp
protoHOX Hox-подобный
ParaHox
GSX
1
2
Xlox
PDX1
Cdx
1
2
4
расширенный Hox: Evx1
Evx2
MEOX1
MEOX2
Homeobox
A1
A2
A3
A4
A5
A7
A9
A10
A11
A13
B1
Би 2
B3
B4
B5
B6
B7
B8
B9
B13
C4
C5
C6
C8
C9
C10
C11
C12
C13
D1
D3
D4
D8
D9
D10
D11
D12
D13
GBX1
GBX2
MNX1
metaHOX NK-подобный
BARHL1
BARHL2
BARX1
BARX2
BSX
DBX
1
2
DLX
1
2
3
4
5
6
EMX
1
2
EN
1
2
HHEX
HLX
LBX1
LBX2
MSX
1
2
NANOG
NKX
2-1
2-2
2-3
2-5
3-1
3-2
HMX1
HMX2
HMX3
6-1
6-2
НАТО
TLX1
TLX2
TLX3
VAX1
VAX2
Другой
ARX
CRX
CUTL1
FHL
1
2
3
HESX1
HOPX
LMX
1А
1B
NOBOX
СКАЗКА
IRX
1
2
3
4
5
6
MKX
Я ЕСТЬ
1
2
АТС
1
2
3
PKNOX
1
2
ШЕСТЬ
1
2
3
4
5
PHF
1
3
6
8
10
16
17
20
21А
POU домен
PIT-1
БРН-3 : А
B
C
Фактор транскрипции октамера : 1
2
3/4
6
7
11
SATB2
ZEB
1
2
(3.2) Парная коробка
PAX
1
2
3
4
5
6
7
8
9
PRRX
1
2
PROP1
ФОКС
2А
2B
RAX
SHOX
SHOX2
VSX1
VSX2
Бикоид
GSC
BICD2
OTX
1
2
PITX
1
2
3
(3.3) Головка вилки / крылатая спираль
E2F
1
2
3
4
5
FOX белки
A1
A2
A3
C1
C2
D3
D4
E1
E3
F1
G1
H1
I1
J1
J2
K1
K2
L2
M1
N1
N3
O1
O3
O4
P1
P2
P3
P4
(3.4) Факторы теплового удара
HSF
1
2
4
(3.5) Кластеры триптофана
ELF
2
4
5
EGF
ELK
1
3
4
ERF
ETS
1
2
ЭРГ
СПИБ
ETV
1
4
5
6
FLI1
Факторы регуляции интерферона
1
2
3
4
5
6
7
8
MYB
MYBL2
(3.6) Домен TEA
фактор усиления транскрипции
1
2
3
4
(4) Факторы β-каркаса с малыми контактами канавок
(4.1) Область гомологии Rel
NF-κB
NFKB1
NFKB2
REL
РЕЛА
RELB
NFAT
C1
C2
C3
C4
5
(4.2) СТАТИСТИКА
СТАТИСТИКА
1
2
3
4
5
6
(4.3) p53-подобный
p53 p63 семья p73
p53
TP63
стр. 73
TBX
1
2
3
5
19
21 год
22
TBR1
TBR2
TFT
MYRF
(4.4) Коробка MADS
Mef2
А
B
C
D
SRF
(4.6) ТАТА-связывающие белки
TBP
TBPL1
(4.7) Высокомобильная группа
BBX
HMGB
1
2
3
4
HMGN
1
2
3
4
HNF
1А
1B
SOX
1
2
3
4
5
6
8
9
10
11
12
13
14
15
18
21 год
SRY
SSRP1
TCF / LEF
TCF
1
3
4
LEF1
ТОКС
1
2
3
4
(4.9) Зернистая голова
TFCP2
(4.10) Область холодного удара
CSDA
YBX1
(4.11) Runt
CBF
CBFA2T2
CBFA2T3
RUNX1
RUNX2
RUNX3
RUNX1T1
(0) Другие факторы транскрипции
(0.2) HMGI (Y)
HMGA
1
2
HBP1
(0.3) Карманный домен
Руб.
RBL1
RBL2
(0.5) Факторы, связанные с AP-2 / EREBP
Апетала 2
EREBP
B3
(0.6) Разное
ARID
1А
1B
2
3А
3B
4А
КОЛПАЧОК
ЕСЛИ Я
16
35 год
MLL
2
3
T1
MNDA
NFY
А
B
C
Ро / Сигма
см. также дефицит фактора транскрипции / корегулятора