• Связывание с ионным каналом • Связывание с доменом белка • Активность кальциевого канала • Связывание с белком GO: 0001948 • Связывание с протеинкиназой • Связывание с углеводами
• кальций-независимая адгезия клетки и матрикса • транспорт ионов кальция • регуляция катаболического процесса протеасомных белков • развитие мезонефрических канальцев • развитие почечной системы • каскад JAK-STAT • морфогенез метанефрических дистальных канальцев • регуляция организации митотического веретена • развитие мезонефрических протоков • развитие почек • цитоплазматическая секвестрация фактора транскрипции • положительная регуляция концентрации ионов кальция в цитозоле • морфогенез анатомической структуры • развитие кровеносных сосудов плаценты • эмбрионального развития плаценты • внутриутробна эмбриональное развитие • реакция на жидкость напряжения сдвига • развитие половых органов • метанефрических восходящей разработка тонких конечностей • метанефрическая проксимальные каналец развитие • Развитие сердца • развитие хряща • регуляция клеточной адгезии • Процесс соединение азота , метаболический • развития кровеносных сосудов • трансмембранный транспорт ионов кальция • фосфорилирование пептидил-серина • морфогенез лимфатических сосудов • остановка клеточного цикла • развитие нервной трубки • экспорт белка из ядра • обнаружение механического стимула • установление полярности клеток • развитие спинного мозга • развитие метанефрического собирательного протока • развитие печени • положительная регуляция связывания белка • развитие пищеварительного тракта • адгезия клеточного матрикса • развитие эпителия легких • морфогенез ветвления эпителиальной трубки • конденсация хряща • позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • развитие кожи • гомофильная клеточная адгезия через молекулы адгезии плазматической мембраны • межклеточная адгезия
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
5310
18763
Ансамбль
ENSG00000008710
ENSMUSG00000032855
UniProt
P98161
O08852
RefSeq (мРНК)
NM_000296 NM_001009944
NM_013630
RefSeq (белок)
NP_000287 NP_001009944
NP_038658
Расположение (UCSC)
Chr 16: 2.09 - 2.14 Мб
Chr 17: 24,55 - 24,6 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Polycystin 1 (часто сокращенно PC1 ) представляет собой белок , который в организме человека кодируется PKD1 гена . [5] [6] Мутации PKD1 связаны с большинством случаев аутосомно - доминантным поликистозом почек , тяжелое наследственное заболевание из почек характеризуется развитием почечных кист и тяжелой почечной дисфункции. [7]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Структура и функции белка
2 Джин
3 ссылки
4 Внешние ссылки
Структура и функции белков [ править ]
PC1 взаимодействует с полицистином 2 посредством цитоплазматического домена спиральной спирали.
PC1 представляет собой мембранно-связанный белок длиной 4303 аминокислоты, экспрессирующийся в основном на первичных ресничках , а также на апикальных мембранах , соединениях адгезивов и десмосомах . [8] Он имеет 11 трансмембранных доменов , большой внеклеточный N-концевой домен и короткий (около 200 аминокислот) цитоплазматический C-концевой домен. [8] [9] Этот внутриклеточный домен содержит домен спиральной спирали, через который PC1 взаимодействует с полицистином 2 (PC2), мембраносвязанным Ca 2+ -проницаемым ионным каналом .
Было высказано предположение, что PC1 действует как рецептор, связанный с G-белком . [8] [10] С-концевой домен можно расщеплять различными способами. В одном случае было обнаружено, что часть хвоста размером ~ 35 кДа накапливается в ядре клетки в ответ на уменьшение потока жидкости в почках мыши. [11] В другом случае может быть получен фрагмент 15 кДа, взаимодействующий с активатором транскрипции и коактиватором STAT6 и p100 или компонентами канонического пути передачи сигнала Wnt ингибирующим образом. [12] [13]
Структура комплекса PKD1-PKD2 человека была решена с помощью криоэлектронной микроскопии , которая показала соотношение PKD1 и PKD2 в структуре 1: 3. PKD1 состоит из складки потенциалзависимых ионных каналов, которые взаимодействуют с PKD2. [14]
PC1 опосредует механочувствительность потока жидкости первичной ресничкой в почечном эпителии и механическую деформацию суставного хряща. [15]
Джин [ править ]
Варианты сплайсинга, кодирующие разные изоформы, были отмечены для PKD1 . Ген тесно связан с шестью псевдогенами в известной дублированной области на хромосоме 16p. [16]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000008710 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032855 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
Перейти ↑ Hughes J, Ward CJ, Peral B, Aspinwall R, Clark K, San Millán JL, Gamble V, Harris PC (июнь 1995). «Ген поликистозной болезни почек 1 (PKD1) кодирует новый белок с множественными доменами распознавания клеток». Генетика природы . 10 (2): 151–60. DOI : 10.1038 / ng0695-151 . PMID 7663510 . S2CID 20636101 .
^ «Поликистозная болезнь почек: полная структура гена PKD1 и его белка. Международный консорциум по поликистозной болезни почек». Cell . 81 (2): 289–98. Апрель 1995 г. doi : 10.1016 / 0092-8674 (95) 90339-9 . PMID 7736581 . S2CID 11114706 .
Перейти ↑ Torres VE, Harris PC, Pirson Y (апрель 2007 г.). «Аутосомно-доминантная поликистозная болезнь почек». Ланцет . 369 (9569): 1287–301. DOI : 10.1016 / S0140-6736 (07) 60601-1 . PMID 17434405 . S2CID 1700992 .
^ а б в Чжоу Дж (2009). «Полицистины и первичные реснички: праймеры для развития клеточного цикла». Ежегодный обзор физиологии . 71 : 83–113. DOI : 10.1146 / annurev.physiol.70.113006.100621 . PMID 19572811 .
^ Dalagiorgou G, Basdra EK, Papavassiliou AG (октябрь 2010). «Полицистин-1: функция механосенсора». Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 42 (10): 1610–3. DOI : 10.1016 / j.biocel.2010.06.017 . PMID 20601082 .
^ Trudel М, Яо Q, Цянь F (январь 2016). «Роль расщепления полицистина-1 сайта протеолиза G-протеиновых рецепторов в физиологии почек и поликистозной болезни почек» . Ячейки . 5 (1): 3. DOI : 10,3390 / cells5010003 . PMC 4810088 . PMID 26805887 .
^ Шове В, Тянь Х, Хассон Н, Гримм DH, Ван Т, Т Hiesberger, Hieseberger Т, Игараши Р, Беннет А.М., Ибрагимов-Бескровная О, S Somlo, Каплан МДж (ноябрь 2004 г.). «Механические стимулы вызывают расщепление и ядерную транслокацию С-конца полицистина-1» . Журнал клинических исследований . 114 (10): 1433–43. DOI : 10.1172 / JCI21753 . PMC 1052027 . PMID 15545994 .
↑ Low SH, Vasanth S, Larson CH, Mukherjee S, Sharma N, Kinter MT, Kane ME, Obara T, Weimbs T (январь 2006 г.). «Полицистин-1, STAT6 и P100 действуют в пути, который трансдуцирует механочувствительность ресничек и активируется при поликистозе почек». Клетка развития . 10 (1): 57–69. DOI : 10.1016 / j.devcel.2005.12.005 . PMID 16399078 .
↑ Lal M, Song X, Pluznick JL, Di Giovanni V, Merrick DM, Rosenblum ND, Chauvet V, Gottardi CJ, Pei Y, Caplan MJ (октябрь 2008 г.). «С-концевой хвост полицистина-1 связывается с бета-катенином и ингибирует каноническую передачу сигналов Wnt» . Молекулярная генетика человека . 17 (20): 3105–17. DOI : 10,1093 / HMG / ddn208 . PMC 2722884 . PMID 18632682 .
^ Ши, Игун; Мэй, Чанлинь; Чжоу, Цян; Ван, Тинлян; Юй Шэнцян; Лэй, Цзяньлинь; Ге, Сяофэй; Ху, Фэйчжоу; Су, Цян (07.09.2018). «Структура человеческого комплекса PKD1-PKD2» . Наука . 361 (6406): eaat9819. DOI : 10.1126 / science.aat9819 . ISSN 0036-8075 . PMID 30093605 .
^ Наоли С.М., Alenghat FJ, Ло Y, Williams E, P Василев, Ли X, Elia AE, Lu W, Brown EM, Quinn SJ, Ингбер DE, Чжоу J (февраль 2003). «Полицистины 1 и 2 опосредуют механочувствительность в первичных ресничках почечных клеток». Генетика природы . 33 (2): 129–37. DOI : 10.1038 / ng1076 . PMID 12514735 . S2CID 23149223 .
