Эта статья была обновлена ​​внешним экспертом в рамках модели двойной публикации. Соответствующая рецензируемая статья опубликована в журнале Gene. Щелкните для просмотра.
Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
POLD1
Идентификаторы
ПсевдонимыPOLD1 , CDC2, CRCS10, MDPL, POLD, полимераза (ДНК) дельта 1, каталитическая субъединица, ДНК-полимераза дельта 1, каталитическая субъединица
Внешние идентификаторыOMIM : 174761 MGI : 97741 HomoloGene : 2014 GeneCards : POLD1
Расположение гена ( человек )
Хромосома 19 (человек)
Chr.Хромосома 19 (человека) [1]
Хромосома 19 (человек)
Геномное расположение POLD1
Геномное расположение POLD1
Группа19q13.33Начинать50 384 204 п.н. [1]
Конец50 418 018 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 7 (мышь)
Chr.Хромосома 7 (мышь) [2]
Хромосома 7 (мышь)
Геномное расположение POLD1
Геномное расположение POLD1
Группа7 B3 | 7 28,83 смНачинать44 532 746 п.н. [2]
Конец44 548 849 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE POLD1 203422 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• трансферазной активности
• связывание нуклеотид
• связывания ДНК
• Q14883421
• нуклеотидилтрансфераза активность
• кластер железа серы связывания
• хроматина связывания
• связывание иона металла
• поврежденную ДНК связывания
• ГО: связывание белка 0001948
• 3'-5' экзонуклеазной активности
• 3'-5 '-экзодезоксирибонуклеазная активность
• связывание нуклеиновой кислоты
• ДНК-направленная активность ДНК-полимеразы
• нуклеазная активность
• экзонуклеазная активность
• гидролазная активность
Сотовый компонент• мембрана
• нуклеоплазма
• агресома
• комплекс нуклеотид-эксцизионная репарация
• ядро клетки
• ядерная хромосома, теломерная область
• комплекс дельта-ДНК-полимеразы
• цитозоль
Биологический процесс• нуклеотид-эксцизионная репарация, заполнение зазора ДНК
• синтез ДНК участвует в репарации ДНК
• клеточного ответ на УФ
• репликацию ДНК
• жирных кислот гомеостаза
• ремонт рассогласования
• translesion синтез
• транскрипции в сочетании нуклеотида-эксцизионная репарация
• ремонт нуклеотида-иссечение, рассечение ДНК
• теломеры обслуживание
• ответ на УФ
• ответ повреждения ДНК, обнаружение повреждений ДНК
• ремонт нуклеотид-эксцизионного, разрез ДНК, 5'-к поражению
• лигирования ДНК
• репарация ДНК
• клеточный ответ на стимул повреждения ДНК
• репарация эксцизией оснований, заполнение пробелов
• проверка репликации ДНК
• поддержание теломер посредством полуконсервативной репликации
• ДНК-зависимая репликация ДНК
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

5424

18971

Ансамбль

ENSG00000062822

ENSMUSG00000038644

UniProt

P28340

P52431

RefSeq (мРНК)

NM_001256849
NM_001308632
NM_002691

NM_011131

RefSeq (белок)

NP_001243778
NP_001295561
NP_002682

NP_035261

Расположение (UCSC)Chr 19: 50.38 - 50.42 МбChr 7: 44,53 - 44,55 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Ген полимеразы дельта 1 ( POLD1 ) кодирует большую каталитическую субъединицу POLD1 / p125 комплекса ДНК-полимеразы дельта (Polδ). [5] [6] Фермент Polδ отвечает за синтез отстающей цепи ДНК, а также участвует в некоторых активностях ведущей цепи (рис. 1). Субъединица POLD1 / p125 кодирует как ДНК-полимеризующий, так и экзонуклеазный домены, которые обеспечивают белку важную вторую функцию при проверке, чтобы гарантировать точность репликации во время синтеза ДНК, а также в ряде типов связанной с репликацией репарации ДНК после повреждения ДНК. Мутации зародышевой линии, нарушающие активностьPOLD1 были вовлечены в нескольких типов наследственного рака, в некотором спорадическом раке, и в синдроме развития преждевременного старения, нижнечелюстной гипоплазии , глухота и Progeroid функцию и Липодистрофия (MDPL / синдром ПРЫ ). Исследования POLD1 подчеркивают важность поддержания стабильности генома для ограничения туморогенеза . В настоящее время неясно, является ли усиленный туморогенез, связанный с дефектами POLD1, результатом увеличения замен оснований или из-за коллапса вилки и образования двухцепочечных разрывов ДНК (DSBs). [6] [7] В недавних обзорах были рассмотрены важные функции POLD1 и Polδ. [6] [7]

Открытие [ править ]

Первая ДНК-полимераза, ДНК-полимераза I , была открыта Артуром Корнбергом и его коллегами в 1956 г. [8], обзор приведен в [9]. В 1976 г. Byrnes et al. обнаружил третью активность ДНК-полимеразы в клетках млекопитающих, которую назвали дельта-полимеразой (δ). [10] Он был очищен от гиперпластического эритроидного костного мозга кролика и описан как ДНК-полимераза, обладающая внутренней 3 '- 5' экзонуклеазной активностью. Функция проверки 3'-5'-экзонуклеаз для ДНК-полимераз ( E. coli ) была впервые описана 4 годами ранее Корнбергом и Брутлагом [11], в обзоре [12] . Polδ ДНК человека являетсягетеротетрамер . Четыре субъединицы: (POLD1 / p125), ( POLD3 / p66), ( POLD2 / p50) и ( POLD4 / p12 ) с альтернативными названиями, отражающими молекулярные массы, выраженные в килодальтонах (кДа). Каталитическая субъединица полимеразы была идентифицирована как полипептид 125 кДа путем окрашивания активности в 1991 году. [13] Несколько групп независимо клонировали кДНК POLD1 человека и мыши. [5] [14] [15] После очистки из различных источников, включая тимус теленка, плаценту человека и клетки HeLa, [16] [17] [18] [19] [20]его активность была вовлечена в репарацию ДНК. [21] [22]

Джин [ править ]

Полимераза (ДНК) дельта 1, каталитическая субъединица и POLD1 - это название и символ гена, одобренные Комитетом по номенклатуре генов (HGNC) Организации генома человека (HUGO). [23] POLD1 также известен как CDC2, MDPL, POLD и CRCS10), его длина составляет ~ 34 т.п.н., а его цитогенетическое расположение - хромосома 19 [24] q13.33. [25] Точное местоположение в сборке GRCh38.p2 - от пары оснований 50 384 290 до пары оснований 50 418 018 на хромосоме 19. [26] Ортолог мыши отображается на хромосоме 7 мыши. [27]У человека основной транскрипт POLD1 (NM_002691.3) содержит 27 экзонов и транслируется в 1107 аминокислот субъединицы p125 или A. Сообщалось о более длинной изоформе со вставкой в ​​рамку считывания из 26 аминокислот после аминокислоты 592 (NP_001295561.1). О псевдогене (LOC100422453) сообщалось о длинном плече хромосомы 6. [26] В таблице 1 приведены названия генов и хромосомные положения для различных субъединиц Polδ у людей, мышей, почкующихся дрожжей ( S. cerevisiae ) и делящихся дрожжей ( S Помбе ).

POLD1 промотор гена регулируется с помощью механизма клеточного цикла и экспрессии мРНК POLD1 достигает пика в конце G1 / S фазы при репликации ДНК. [28] Промотор POLD1 обогащен G / C и не имеет блока TATA . Транскрипция этого промотора, содержащего GC-бокс, регулируется факторами транскрипции, связанными с Sp1 и Sp1, такими как Sp3 , при этом их связывание опосредуется последовательностями связывания повторов длиной 11 п.н. [29] [30] POLD1 промотор содержит E2F -подобных последовательности , расположенной вблизи основного сайта инициации транскрипции . [30]Другой регуляторный элемент, область гомологии элемента клеточного цикла / генов клеточного цикла (CDE / CHR), расположенный ниже стартового сайта, важен для транскрипции POLD1 в фазе G2 / M белками E2F1 и p21 . [31] [32] P53 регулирует транскрипцию POLD1 путем непрямой p21-зависимой активации пути p53-p21-DREAM-CDE / CHR. [33] В одном исследовании сообщается, что белок-супрессор опухоли p53 конкурирует с Sp1 за связывание с промотором POLD1 . [29] микроРНК (MIR), микроРНК-155, Подавляет POLD1 косвенно путем подавления фактора транскрипции Foxo3a , [34] , который имеет предполагаемые сайты связывания в POLD1 промотора (RTMAAYA; элемент ответа). [35]

Белок [ править ]

Рисунок 1: Базовая схема функции Polδ на вилке репликации ДНК . Комплекс Polδ (p125, p66, p50 и p12) ассоциирует с вилкой репликации. Одноцепочечные ДНК покрыты репликационным белком А (RPA) (светло-розовым). Polα, связанный с примазой, инициирует синтез отстающей цепи (синяя линия), в данном случае праймер РНК сначала удлиняется с помощью Polα, а затем с помощью Polδ. Ведущая нить (черная линия) показывает Polε и GINS (go-ichi-ni-san), который имеет четыре субъединицы: Sld5, Psf1, Psf2 и Psf3. [36]GINS взаимодействует с Polε, чтобы инициировать синтез ДНК. Недавние данные также подтверждают роль Polδ в синтезе ведущей цепи. PCNA стимулирует обе полимеразы (ядерный антиген пролиферирующих клеток; красное кольцо). Комплекс RFC (фактор репликации C) с RPA действует как зажим-загрузчик для PCNA на ДНК. Отстающая цепь синтезируется в короткие фрагменты, называемые фрагментами Окадзаки , которые затем лигируются лигазами (лигаза I). Ошибки репликации, которые не исправляются полимеразами (светло-серый прямоугольник на новой ведущей цепи), в дальнейшем исправляются с помощью восстановления несоответствия после репликации (MMR).

POLD1 / p125 имеет общую складку B-семейства, подобную другим ДНК-полимеразам (Polα и ε). [37] POLD1 / p125 человека имеет предполагаемый сигнал ядерной локализации на N- конце (остатки 4-19). [24] Остатки 304-533 содержат домен экзонуклеазы (фиг. 2), а остатки 579-974 содержат домен полимеразы. Домен экзонуклеазы представляет собой DnaQ-подобный домен типа DEDDy, общий для семейства B-ДНК-полимераз . [38] Этот домен имеет бета-шпилечную структуру, которая помогает переключаться между активными сайтами полимеразы и экзонуклеазы в случае неправильного включения нуклеотидов.

Мотивы A и C, которые являются наиболее консервативными в полимеразном домене. Они содержат 2 каталитических аспартата в мотиве A (DXXLYPS, D602) и мотиве C (DTDS, D757), которые связывают кальций в активном центре. Мотив A состоит из 11 аминокислот, которые важны для включения нуклеотидов и образования фосфодиэфирной связи .

Тирозин Y701 функционирует аналогично тирозин Y567 в RB69 бактериофаге ортологе как сахар стерического ворот , который предотвращает включение рибонуклеотида. [39] Мотив LXCXE (711-715) опосредует связывание с pRB во время фазы G1 клеточного цикла. [40] Полимеразный домен также имеет высококонсервативный мотив KKRY (остатки от 806 до 809), который важен для связывания и каталитической функции. [41] POLD1 может быть нацелен на ядрышко после подкисления посредством мотива нуклеолярной задерживающей последовательности (NoDS), представленного небольшими мотивами последовательности, рассредоточенными по всей кодирующей области белка. [42] [43] [44]С-концевой домен имеет два законсервированных цистеин -богатой металл-связывающие мотивы (CysA и CysB) (от 1012 и 1083) , необходимых для ядерного антигена пролиферирующих клеток (PCNA) связывание и набор вспомогательных субъединиц соответственно. [45] CysB координирует кластер [4Fe-4S], добавленный через цитозольную сборку железо-серного белка (CIA), которая требует функции механизма сборки митохондриального кластера железа и серы (ISC). [46] Процесс созревания опосредуется комплексом нацеливания на ядро ​​CIA1-CIA2B / FAM96B- MMS19 , который взаимодействует с апопротеином для обеспечения специфической вставки кластера Fe-S. [47] [48]

Рисунок 2: Консервативные мотивы в экзонуклеазном домене p125 человека. Мотивы с I по III консервативны в B-семействе полимераз. Мотивы IV и V недавно были описаны как консервативные между Polδ и Polε. [49] Этот домен также имеет 3 мотива последовательности (ExoI, ExoII и ExoIII), которые имеют специфический паттерн YX (3) D в ExoIII. 4 консервативных кислотных остатка DEDD, которые служат лигандами для ионов металлов, необходимых для катализа, выделены жирным шрифтом (D316 и E318 в мотиве ExoI, D402 в мотиве ExoII и D515 в мотиве ExoIII). Y511 (подчеркнут) определяет p125 суперсемейства экзонуклеаз DDEDy-типа в соответствии с номенклатурой Zuo и Deutscher и требуется для катализа. [50]

Исследования связывания и ассоциации показали, что POLD2 тесно связан с POLD1; POLD3 и POLD2 взаимодействуют друг с другом, а POLD4 взаимодействует как с POLD1, так и с POLD2. [51] [52] Гетеротетрамер Polδ, восстановленный путем коэкспрессии субъединиц в клетках Sf9, имел свойства, аналогичные Polδ, очищенному из тимуса теленка, а полный холофермент очень сильно стимулировался PCNA. [53] Многочисленные исследования показали, что в то время как POLD1 обладает как полимеразной, так и 3'-5'-экзонуклеазной активностью, корректирующей считывание, другие субъединицы увеличивают эту активность, способность связывания ДНК и функционально важные взаимодействия с PCNA и его фиксирующим загрузчиком Фактором репликации C(RFC). Холофермент ДНК Polδ часто считается включающим PCNA и RFC, а также четыре субъединицы полимеразного комплекса (рис. 1).

Ряд других исследований и скринингов выявили дополнительных партнеров по взаимодействию, имеющих отношение к функциям репликации и репарации ДНК. На рисунке 3 показана матрица установленных и предполагаемых взаимодействий во время репликации и репарации, к которой можно получить дальнейший доступ через [54] и. [55] Веб-сайт Университета Вандербильта обеспечивает дополнительное взаимодействие по важной структуре белка POLD1 и различным классам взаимодействия генов и белков на основе таких критериев, как совместное присутствие в комплексе, прямое физическое взаимодействие, регуляторные отношения и совместная экспрессия. [56]


Дельта-субъединицы полимеразы		Название белка
у человека		Homo sapiensMus musculusSaccharomyces cerevisiaeSchizosaccharomyces pombe
А (каталитический)p125POLD1-Chr 19q13.3Pold1-Chr 7B4POL3-Chr IVcdc6-Chr II
B (принадлежность)p50ПОЛД2-ЧР 7п13Полд2-Хр 11А2POL31-Chr Xcdc1-Chr I
C (аксессуар)стр. 66POLD3-Chr 11q14Pold3-Chr 7F1POL32-Chr Xcdc27-Chr II
D (аксессуар)p12POLD4-Chr 11q13Pold4-Chr 19A-cdm1-Chr II
Таблица 1: Названия генов и положения в хромосомах для различных субъединиц дельта-полимеразы у человека, мыши, почкующихся и делящихся дрожжей.

Выражение и регулирование [ править ]

Рисунок 3 . Матрица установленных и предполагаемых партнеров для POLD1, извлеченная из STRING. (извлечено 31.03.2016 [57] ). POLD1 находится в центре (светло-зеленая рамка) с красными линиями, указывающими на его взаимодействия. Светло-синие прямоугольники представляют взаимодействия основного комплекса. Светло-розовые прямоугольники представляют другие предполагаемые взаимодействия в репарации и репликации ДНК. Серые линии представляют установленные и предполагаемые взаимодействия между другими представленными белками. Сеть была нанесена на карту с помощью Cytoscape. [58] Взаимодействия представляют собой экспериментальные данные с высокой степенью достоверности, извлеченные из BIND, DIP, GRID, HPRD, IntAct, MINT и PID, курируемые STRING. [59] Экспериментальные оценки получены из анализов аффинного связывания и хроматографии.

Белок POLD1 / P125 повсеместно экспрессируется на панели тканей человека с высокими уровнями в тканях сердца и легких. [60] Субклеточная локализация POLD1 / p125 преимущественно находится в ядре и нуклеоплазме . [61]

Снижение POLD1 / p125 наблюдалось в стареющих фибробластах кожи человека и в лимфоцитах пожилого населения. [62] [63] Экспрессия POLD1 / p125 эпигенетически регулируется в ответ на повреждение ДНК. [64] Другие исследования также показали, что экспрессия POLD1 / p125 регулируется miR-155, [34] p53 [29] и длинной некодирующей РНК , PVT1 . [65] При наличии повреждения ДНК или стресса репликации ( УФ-свет , метилметансульфонат , гидроксимочевина или афидиколин) субъединица POLD4 / p12 быстро деградирует. Каталитическая активность p125 различна, находится ли он в гетеротетрамере (Polδ4, с p12 [66] [67] ) или в гетеротримере (Polδ3, без p12). [68] Продукция гетеротримеров зависит от деградации p12 под действием E3-лигазы RNF8 , белка, участвующего в репарации DSB и, возможно, гомологичной рекомбинации (HR). [69] Кроме того, E3-лигаза CRL4 Cdt2 может разрушать POLD4 / p12 во время нормальной репликации ДНК и при наличии повреждений ДНК. [70] POLD4 / p12 также может расщепляться протеазой.µ-кальпаин, который участвует в апоптозе, вызванном кальцием . [71] [72]

POLD1 / p125 имеет домен NoDS, который регулирует транспорт к ядрышку в ответ на ацидоз. [44] Ядерный транспорт требует прямого взаимодействия между субъединицей p50 и белком WRN . [73] Во время реакции на повреждение ДНК WRN выходит из ядрышка и тем самым высвобождает Polδ. [74] [75] Также было показано, что POLD1 / p125 взаимодействует с PDIP46 / SKAR [76] и LMO2 . [77] [78]

Функция [ править ]

Репликация ДНК [ править ]

Репликация ДНК - это высокоорганизованный процесс, в котором задействовано множество ферментов и белков, в том числе несколько ДНК-полимераз. Основная репликативная активность в S-фазе клеточного цикла зависит от трех ДНК-полимераз - Полимеразы альфа (Polα), Полимеразы дельта (Polδ) и Полимеразы эпсилон (Polε). После инициации синтеза ДНК с помощью Polα, Polδ или Polε осуществляют синтез отстающей и ведущей цепи соответственно. [79] Эти полимеразы сохраняют очень высокую точность, которая обеспечивается спариванием оснований Уотсона-Крика и активностью 3'-экзонуклеазы (или корректора). [80] Недавние исследования показали, что Polδ может синтезировать ведущую цепь. [80] [81] [82][83] [84] То, как эти полимеразы функционируют во взаимосвязи с другими факторами, участвующими в репликации, представляет большой интерес, поскольку это, вероятно, объясняет мутационный ландшафт, который они производят при дефекте. Поддержание точности репликации - это прекрасный баланс между уникальными ошибками полимераз δ и ε [85], равновесием между корректурным считыванием и MMR и различием в процессинге рибонуклеотидов между двумя цепями. [36] Обширные исследования на моделях дрожжей показали, что мутации в экзонуклеазном домене гомологов Polδ и Polε могут вызывать мутаторный фенотип , обзор см. В [86].Одноцепочечная (ss) ДНК, синтезируемая во время синтеза отстающей цепи, может быть нацелена на повреждающие агенты ss-ДНК, а также является селективной мишенью для мутаций APOBEC . [87] ДНК-связывающие белки, которые быстро реассоциируют после репликации, не позволяют Polδ восстанавливать ошибки, вызванные Polα в зрелой отстающей цепи. [88] Исследования дрожжей показали, что Polδ может корректировать ошибки Polε в ведущей цепи. [89]

Ремонт ДНК [ править ]

Активность POLD1 способствует множественным эволюционно законсервированным процессам репарации ДНК, включая репарацию ошибочного спаривания (MMR), трансфузионный синтез (TLS), эксцизионную репарацию оснований (BER), эксцизионную репарацию нуклеотидов (NER) и репарацию двухцепочечных разрывов (DSB). [6] POLD1 опосредует этапы после разреза в BER, NER и MMR. [6] Polδ взаимодействует с механизмом MMR для поддержки пострепликационной проверки вновь синтезированной ДНК [90] с клетками, несущими мутации, которые инактивируют POLD1 и компоненты MMR, испытывающие повышенную частоту мутаций. [91] [92]Как отмечалось выше, гетеротример Polδ (Polδ3) становится доминирующей олигомерной формой POLD1 и активен во время присутствия повреждений ДНК. Polδ3 менее подвержен ошибкам, чем (Polδ4), и может лучше различать несовпадающие пары, что связано с лучшей корректирующей активностью: однако он имеет пониженную способность обходить некоторые основные повреждения. [74] [93] Напротив, переключение полимеразы Polδ на специализированную полимеразу zeta (Polζ) важно для TLS, поскольку замещение p125 каталитической субъединицы Polζ, p353, обеспечивает лучшую обходную активность. [6]В этом процессе высококонсервативный C-концевой домен (CTD) POLD1 / p125 взаимодействует с CTD-доменом Polζ, а кластеры железа внутри каждого CTD опосредуют взаимодействия, включая связывание с POLD2, которые позволяют переключение полимеразы во время TLS. [94] Некоторые недавние исследования показывают, что переключение с Polδ на Pol лямбда (λ) также поддерживает TLS и восстановление окислительных повреждений ДНК, таких как поражения 7,8-дигидро-8-оксогуанином . [95]

Истощение POLD1 может останавливать клеточный цикл в фазах G1 и G2 / M в клетках человека. [96] Блокировка клеточного цикла в этих фазах обычно указывает на наличие повреждения ДНК и активацию контрольных точек повреждения ДНК. Истощенные POLD1 клетки чувствительны к ингибированию киназ контрольной точки повреждения ДНК ATR и CHK1 . [97] У S. pombe механизмы HR могут перезапускать застопорившиеся репликационные вилки за счет использования активности синтеза цепи Polδ, но такой неаллельный HR-опосредованный перезапуск очень подвержен ошибкам, потенциально приводящим к повышенной нестабильности генома. [98] Polδ структурно и функционально взаимодействует с белком WRN, а WRN рекрутирует Polδ в ядрышко.[73] Ген WRN мутирован при синдроме Вернера ( аутосомно- рецессивное заболевание), что приводит к ускоренному старению и повышенной генетической нестабильности. Взаимодействие с WRN увеличивает процессивность Polδ независимым от PCNA образом. [99] Посредством этих взаимодействий WRN напрямую влияет на репарацию репликации ДНК и способствует Polδ-опосредованному синтезу.

Клиническое значение [ править ]

Рак [ править ]

Было показано, что белки репарации ДНК играют важную роль при заболеваниях человека, включая рак. Например, мутации зародышевой линии в белках репарации ДНК, участвующих в MMR (MSH2, MLH1, MSH6 и PMS2), были описаны при синдроме Линча (LS), который характеризуется наличием микросателлитной нестабильности (MSI). [100] Совсем недавно мутации зародышевой линии были зарегистрированы в экзонуклеазных доменах POLD1 и POLE , каталитической субъединице Polε. Эти мутации связаны с олигоаденоматозным полипозом, колоректальным раком с ранним началом (CRC), раком эндометрия (EDMC), раком груди и опухолями головного мозга .[101] [102] [103] [104] [105], обзор приведен в [7] ). Большинство описанных мутаций POLD1, связанных с раком, присутствуют в экзонуклеазном домене. [7] [101] [102] [106] [107] [108] В отличие от LS, опухоли с мутацией POLD1 стабильны на микросателлитах. Некоторые данные позволяют предположить, чтоопухоли POLD1 связаны с драйверными мутациями в генах, включая APC и KRAS . [101] POLD1 миссенс мутации р. S478N, находящийся в экзонуклеазном домене, был признан повреждающим и патогенным.[101] Были клинически идентифицированыдругиеварианты POLD1 , которые были предсказаны как повреждающие и в настоящее время находятся в стадии дальнейшего исследования (например, стр. D316H, стр. D316G, стр. R409W, стр. L474P и стр. P327L). [102] [103] [104]

У педиатрических пациентов мутации с двойным попаданием в POLD1 или POLE и дефицит репарации двуаллельного несоответствия (bMMRD) приводят к ультрагипермутированным фенотипам опухоли. [109] [110] [111] Такие фенотипы, как ультра-гипермутация в опухолях, могут указывать на лучший ответ на новые разрабатываемые противораковые препараты, хотя это требует прямой оценки на POLD1 . [112] [113] [114] [115] [116] [117] Буффе и др. сообщают о двух братьях и сестрах с bMMRD- мультиформной глиобластомой, у которых есть соматические мутации в POLE (P436H в одном, S461P в другом) и продемонстрировал стойкий ответ на клинические испытания с ингибитором запрограммированной смерти-1 ниволумабом . Мутации POLD1 были изучены на клеточных линиях [118] [119] [120] [121] и на моделях мышей. Например, гомозиготная мутация Polδ у мышей, которая нарушает ферментативную функцию, приводит к очень высокой заболеваемости раком. [122]

MDPL [ править ]

Повреждающие мутации в POLD1 также наблюдались у пациентов с синдромом, известным как гипоплазия нижней челюсти, глухота и прогероидные особенности с синдромом липодистрофии (MDPL / MDP) (# 615381 в базе данных Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM)). [60] [123] [124] Это очень редкий синдром, и сообщалось о нескольких исследованиях, описывающих мутации. Наблюдаемые мутации находятся в областях, которые влияют на домен экзонуклеазы и домены полимеразы. [60] [123] Пять неродственных случаев de novo были описаны с одной и той же гетерозиготнойвариант, c.1812_1814delCTC p.Ser605del (rs398122386). S605 находится в высококонсервативном мотиве А активного сайта полимеразы. Этот вариант не подавляет активность связывания ДНК, но влияет на катализ. Другой вариант был зарегистрирован у отдельного пациента (p.R507C). [123] Этот вариант расположен в высококонсервативном домене ExoIII и еще не полностью охарактеризован.

Варианты POLD1 Ser605del и R507C также были идентифицированы в подгруппе пациентов с атипичным синдромом Вернера (AWS). После молекулярного тестирования эти пациенты были реклассифицированы как пациенты с MDPL / MDP. MDPL / MDP, AWS и синдром Вернера - все присутствуют с прогерией . [125] Первый пример передачи по зародышевой линии наблюдали у матери и сына с мутацией Ser605del. [126] Недавно в двух независимых исследованиях были идентифицированы пациенты с одним и тем же гомозиготным вариантом сплайсинга в POLE1 , каталитической субъединице Polε. У одного был фенотип лицевого дисморфизма , иммунодефицита , ливедо и низкого роста (также известный как синдром FILS).[127] У второго были более серьезные симптомы. [128] Эти случаи присоединяются к растущему числу дефектов развития, связанных с наследственными мутациями, нацеленными на функцию генов полимеразы.

Наблюдается зависимое от возраста подавление POLD1 . [63], хотя пока с этим фенотипом не было связано никакого клинического значения. Также проводятся исследования, чтобы понять, есть ли связь между этими патологиями или этими мутациями и предрасположенностью к раку. Предлагаемые в настоящее время механизмы, с помощью которых дефекты POLD1 являются патогенными, сосредоточены на идее дефектов репликации, ведущих к геномной нестабильности и активации контрольных точек, что в конечном итоге приводит к гибели или клеточному старению. Альтернативно, Polδ связан с ламинами и ядерной оболочкой во время остановки G1 / S или ранней фазы S; мутации в ламинах вызывают липодистрофию, связанную с ядерной оболочкойс фенотипами, сходными с MDPL / MDP и синдромом Вернера. [129]

Оценка риска рака и коммерческое тестирование [ править ]

Наследственный колоректальный рак (CRC), связанный с мутациями в проверочной способности POLD1 и POLE , иногда называют « полипозом, связанным с проверкой полимеразой » (PPAP) (хотя по крайней мере одно исследование выявило мутации POLD1, связанные с неполипозным CRC). [101] [102] [104] [106] [107] Мутации POLD1 также были связаны с повышенной предрасположенностью к раку эндометрия . [101] [104] [105] Недавнее исследование предложило рекомендации по генетическому тестированию на POLD1мутации, которые включают: 1) возникновение 20-100 аденом и 2) семейный анамнез, соответствующий критериям Амстердама II для колоректального рака и рака эндометрия. [103] Текущие руководства по клиническим испытаниям для семей с мутациями в POLD1 / POLE включают колоноскопию (каждые 1-2 года), гастродуоденоскопию (каждые 3 года) с ранним началом (20-25), возможность выявления опухолей головного мозга и скрининг на рак эндометрия (начиная с 40 для женщин-носительниц). [103] В настоящее время проводятся исследования для определения точного риска рака от конкретных мутаций POLD1 . Текущие данные показывают, что мутации в этом гене обладают высокой проникающей способностью.. Другое недавнее исследование показало, что мутации, влияющие на мутации Polδ и Polε, могут сочетаться с мутациями MMR. [110] Это предполагает, что тестирование генов панели должно включать гены MMR и Pol даже у пациентов с MSI.

Существует несколько вариантов коммерческого диагностического тестирования мутаций в POLD1. [130] Генетическое тестирование обычно включает экзоны, кодирующие POLD1 (26), и по меньшей мере 20 оснований в соседних некодирующих областях. Для семей с известными мутациями также доступно тестирование на одном сайте для подтверждения наличия мутации. [130] Доступность этих генетических тестов открыла новые возможности для рака, ранее классифицированного как генетически неопределенный колоректальный рак или колоректальный рак типа «X». [105] Также были разработаны ресурсы для клинического тестирования MDPL / MDP. [131]

Заметки [ править ]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000062822 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038644 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ a b Чунг Д.В., Чжан Дж.А., Тан С.К., Дэви Е.В., Со А.Г., Дауни К.М. (декабрь 1991 г.). «Первичная структура каталитической субъединицы дельта ДНК-полимеразы человека и хромосомное расположение гена» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 88 (24): 11197–201. Bibcode : 1991PNAS ... 8811197C . DOI : 10.1073 / pnas.88.24.11197 . PMC 53101 . PMID 1722322 .  
  6. ^ Б с д е е Prindle МДж, Loeb LA (декабрь 2012). «Дельта ДНК-полимеразы в репликации ДНК и поддержании генома» . Экологический и молекулярный мутагенез . 53 (9): 666–82. DOI : 10.1002 / em.21745 . PMC 3694620 . PMID 23065663 .  
  7. ^ а б в г Райнер Э, ван Гул И. К., Паллес С., Кирси С. Е., Боссе Т., Томлинсон И., Черч Д. Н. (январь 2016 г.). «Множество ошибок: мутации домена коррекции полимеразы при раке» . Обзоры природы. Рак . 16 (2): 71–81. DOI : 10.1038 / nrc.2015.12 . PMID 26822575 . S2CID 9359891 .  
  8. Перейти ↑ Kornberg A, Kornberg SR, Simms ES (апрель 1956). «Синтез метафосфата ферментом из Escherichia coli». Biochimica et Biophysica Acta . 20 (1): 215–27. DOI : 10.1016 / 0006-3002 (56) 90280-3 . PMID 13315368 . 
  9. ↑ Friedberg EC (февраль 2006 г.). «Фермент эврика: открытие ДНК-полимеразы». Обзоры природы Молекулярная клеточная биология . 7 (2): 143–7. DOI : 10.1038 / nrm1787 . PMID 16493419 . S2CID 39605644 .  
  10. ^ Бирнс JJ, Downey К.М., Black VL, Так AG (июнь 1976). «Новая ДНК-полимераза млекопитающих с экзонуклеазной активностью от 3 'до 5': ДНК-полимераза дельта». Биохимия . 15 (13): 2817–23. DOI : 10.1021 / bi00658a018 . PMID 949478 . 
  11. ^ "Ферментативный синтез дезоксирибонуклеиновой кислоты. XXXVI. Функция проверки для 3 5'-экзонуклеазной активности в полимеразе дезоксирибонуклеиновой кислоты" . ResearchGate . Проверено 25 апреля 2016 .
  12. ^ Reha-Кранц LJ (май 2010). «Проверка ДНК-полимеразы: несколько ролей поддерживают стабильность генома». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Белки и протеомика . 1804 (5): 1049–63. DOI : 10.1016 / j.bbapap.2009.06.012 . PMID 19545649 . 
  13. ^ Ли MY, Цзян Уо, Чжан SJ, Туй NL (февраль 1991). «Характеристика дельта ДНК-полимеразы человека и ее иммунохимических взаимоотношений с ДНК-полимеразой альфа и эпсилон» . Журнал биологической химии . 266 (4): 2423–9. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (18) 52261-4 . PMID 1703528 . 
  14. ↑ Ян Ц.Л., Чанг Л.С., Чжан П, Хао Х, Чжу Л., Тумей Н.Л., Ли М.Я. (февраль 1992 г.). «Молекулярное клонирование кДНК для каталитической субъединицы дельта ДНК-полимеразы человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 20 (4): 735–45. DOI : 10.1093 / NAR / 20.4.735 . PMC 312012 . PMID 1542570 .  
  15. ^ Cullmann G, Hindges R, Бертольд МВт, Hubscher U (декабрь 1993). «Клонирование кДНК мыши, кодирующей дельта ДНК-полимеразы: уточнение боксов гомологии». Джин . 134 (2): 191–200. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (93) 90093-я . PMID 8262377 . 
  16. Перейти ↑ Lee MY, Tan CK, So AG, Downey KM (май 1980). «Очистка дельта-полимеразы дезоксирибонуклеиновой кислоты из тимуса теленка: частичная характеристика физических свойств». Биохимия . 19 (10): 2096–101. DOI : 10.1021 / bi00551a015 . PMID 7378348 . 
  17. ↑ Lee MY, Tan CK, Downey KM, So AG (апрель 1984 г.). «Дальнейшие исследования дельта ДНК-полимеразы тимуса теленка, очищенной до гомогенности с помощью новой процедуры». Биохимия . 23 (9): 1906–13. DOI : 10.1021 / bi00304a003 . PMID 6426510 . 
  18. ^ Крут JJ, Wahl AF, Bambara RA (январь 1986). «Очистка и характеристика двух новых высокомолекулярных форм ДНК-полимеразы дельта». Биохимия . 25 (1): 26–36. DOI : 10.1021 / bi00349a005 . PMID 3954990 . 
  19. ↑ Wahl AF, Crute JJ, Sabatino RD, Bodner JB, Marraccino RL, Harwell LW, Lord EM, Bambara RA (декабрь 1986). «Свойства двух форм ДНК-полимеразы дельта тимуса теленка». Биохимия . 25 (24): 7821–7. DOI : 10.1021 / bi00372a006 . PMID 3099836 . 
  20. ^ Ли MY, Туй NL (февраль 1987). «Дельта ДНК-полимеразы плаценты человека: идентификация полипептида мощностью 170 килодальтон путем окрашивания активности и иммуноблоттинга». Биохимия . 26 (4): 1076–85. DOI : 10.1021 / bi00378a014 . PMID 2436659 . 
  21. ^ Дреслер SL, Kimbro KS (май 1987). «Ингибирование 2 ', 3'-дидезокситимидин-5'-трифосфатом репликации ДНК и индуцированного ультрафиолетом синтеза репарации ДНК в клетках человека: доказательства участия дельта ДНК-полимеразы». Биохимия . 26 (10): 2664–8. DOI : 10.1021 / bi00384a002 . PMID 3606985 . 
  22. Перейти ↑ Nishida C, Reinhard P, Linn S (январь 1988 г.). «Синтез репарации ДНК в человеческих фибробластах требует дельта ДНК-полимеразы» . Журнал биологической химии . 263 (1): 501–10. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (19) 57421-X . PMID 3335506 . 
  23. ^ "База данных HGNC названий генов человека | Комитет по номенклатуре генов HUGO" . www.genenames.org . Проверено 25 апреля 2016 .
  24. ^ a b Чунг Д.В., Чжан Дж.А., Тан С.К., Дэви Е.В., Со А.Г., Дауни К.М. (декабрь 1991 г.). «Первичная структура каталитической субъединицы дельта ДНК-полимеразы человека и хромосомное расположение гена» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 88 (24): 11197–201. Bibcode : 1991PNAS ... 8811197C . DOI : 10.1073 / pnas.88.24.11197 . PMC 53101 . PMID 1722322 .  
  25. ↑ Kemper RR, Ahn ER, Zhang P, Lee MY, Rabin M (сентябрь 1992 г.). «Дельта-ген ДНК-полимеразы человека отображается в области 19q13.3-q13.4 путем гибридизации in situ». Геномика . 14 (1): 205–6. DOI : 10.1016 / s0888-7543 (05) 80311-8 . PMID 1427831 . 
  26. ^ a b «Полимераза (ДНК) POLD1 дельта 1, каталитическая субъединица [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 25 апреля 2016 .
  27. ^ Goldsby RE, Singh M, Preston BD (январь 1998). «Дельта-ген ДНК-полимеразы мыши (Pold1) отображается на хромосоме 7». Геном млекопитающих . 9 (1): 92–3. DOI : 10.1007 / s003359900693 . PMID 9434960 . S2CID 42967770 .  
  28. ^ Mjelle R, Hegre SA, Aas PA, Slupphaug G, Drabløs F, Saetrom P, Krokan HE (июнь 2015). «Регуляция клеточного цикла генов репарации ДНК человека и ремоделирования хроматина» . Ремонт ДНК . 30 : 53–67. DOI : 10.1016 / j.dnarep.2015.03.007 . PMID 25881042 . 
  29. ^ a b c Li B, Lee MY (август 2001 г.). «Транскрипционная регуляция гена POLD1 каталитической субъединицы дельта ДНК-полимеразы человека с помощью опухолевого супрессора p53 и Sp1» . Журнал биологической химии . 276 (32): 29729–39. DOI : 10.1074 / jbc.M101167200 . PMID 11375983 . 
  30. ^ a b Чжао Л., Чанг Л.С. (февраль 1997 г.). «Ген POLD1 человека. Идентификация вышестоящей активаторной последовательности, активация Sp1 и Sp3 и регуляция клеточного цикла» . Журнал биологической химии . 272 (8): 4869–82. DOI : 10.1074 / jbc.272.8.4869 . PMID 9030545 . 
  31. ^ Мюллер Г.А., Wintsche А, Stangner К, Прохазка SJ, Стэдлер ПФ, Энгеланд К (2014-01-01). «Сайт CHR: определение и полногеномная идентификация транскрипционного элемента клеточного цикла» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (16): 10331–50. DOI : 10.1093 / NAR / gku696 . PMC 4176359 . PMID 25106871 .  
  32. ↑ Song N, Zhu X, Shi L, An J, Wu Y, Sang J (июнь 2009 г.). «Идентификация и функциональный анализ элемента CDE / CHR в промоторе POLD1». Наука в Китае. Серия C: Науки о жизни . 52 (6): 551–9. DOI : 10.1007 / s11427-009-0077-5 . PMID 19557333 . S2CID 19278457 .  
  33. ↑ Fischer M, Quaas M, Steiner L, Engeland K (январь 2016 г.). «Путь p53-p21-DREAM-CDE / CHR регулирует гены клеточного цикла G2 / M» . Исследования нуклеиновых кислот . 44 (1): 164–74. DOI : 10.1093 / NAR / gkv927 . PMC 4705690 . PMID 26384566 .  
  34. ^ a b Czochor JR, Sulkowski P, Glazer PM (апрель 2016 г.). «Сверхэкспрессия miR-155 способствует нестабильности генома за счет снижения высокоточной дельта-экспрессии полимеразы и активации склонного к ошибкам восстановления DSB» . Молекулярные исследования рака . 14 (4): 363–73. DOI : 10.1158 / 1541-7786.MCR-15-0399 . PMC 5021065 . PMID 26850462 .  
  35. ↑ Chen X, Ji Z, Webber A, Sharrocks AD (февраль 2016 г.). «Полногеномные исследования связывания выявляют механизмы специфичности связывания ДНК и функциональное взаимодействие между факторами транскрипции Forkhead» . Исследования нуклеиновых кислот . 44 (4): 1566–78. DOI : 10.1093 / NAR / gkv1120 . PMC 4770209 . PMID 26578569 .  
  36. ^ a b Lujan SA, Уильямс JS, Kunkel TA (2016-02-01). «Нестабильность генома эукариот в свете асимметричной репликации ДНК» . Критические обзоры в биохимии и молекулярной биологии . 51 (1): 43–52. DOI : 10.3109 / 10409238.2015.1117055 . PMC 4922258 . PMID 26822554 .  
  37. ^ Doublié S, Зан KE (2014-01-01). «Структурное понимание репликации эукариотической ДНК» . Границы микробиологии . 5 : 444. DOI : 10,3389 / fmicb.2014.00444 . PMC 4142720 . PMID 25202305 .  
  38. ^ "NCBI CDD консервативный домен белка DNA_polB_delta_exo" . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 25 апреля 2016 .
  39. ↑ Brown JA, Suo Z (февраль 2011 г.). «Открытие сахарных« стерических ворот »ДНК-полимераз» . Биохимия . 50 (7): 1135–42. DOI : 10.1021 / bi101915z . PMC 3040255 . PMID 21226515 .  
  40. ^ Krucher Н.А., Зигмунт А, Mazloum N, S Tamrakar, Ладлоу JW, Ли МОЯ (ноябрь 2000 года). «Взаимодействие белка ретинобластомы (pRb) с каталитической субъединицей ДНК-полимеразы дельта (p125)» . Онкоген . 19 (48): 5464–70. DOI : 10.1038 / sj.onc.1203930 . PMID 11114723 . 
  41. ↑ Hogg M, Aller P, Konigsberg W, Wallace SS, Doublié S (январь 2007 г.). «Структурное и биохимическое исследование роли в проверке бета-шпильки петли, обнаруженной в экзонуклеазном домене репликативной ДНК-полимеразы семейства B» . Журнал биологической химии . 282 (2): 1432–44. DOI : 10.1074 / jbc.M605675200 . PMID 17098747 . 
  42. ^ Lam YW, Trinkle-Мулкахи л (2015-01-01). «Новое понимание структуры и функции ядрышка» . F1000Prime Reports . 7 : 48. DOI : 10,12703 / P7-48 . PMC 4447046 . PMID 26097721 .  
  43. ^ Mekhail K, Риверо-Лопес L, Аль-Масри A, Brandon C, M Khacho, Ли S (октябрь 2007). «Идентификация общего сигнала субъядерной локализации» . Молекулярная биология клетки . 18 (10): 3966–77. DOI : 10,1091 / mbc.E07-03-0295 . PMC 1995723 . PMID 17652456 .  
  44. ^ a b Audas TE, Джейкоб MD, Lee S (январь 2012 г.). «Иммобилизация белков в ядрышке рибосомными межгенными спейсерами некодирующей РНК» . Молекулярная клетка . 45 (2): 147–57. DOI : 10.1016 / j.molcel.2011.12.012 . PMID 22284675 . 
  45. ^ Netz DJ, Stith CM, Stümpfig M, Köpf G, Vogel D, Genau HM, Stodola JL, Лиль R, бургеры PM, Pierik AJ (январь 2012). «Эукариотическая ДНК-полимераза требует кластера железо-сера для образования активных комплексов» . Природа Химическая биология . 8 (1): 125–32. DOI : 10,1038 / nchembio.721 . PMC 3241888 . PMID 22119860 .  
  46. ^ Пол VD, Лиль R (июнь 2015). «Биогенез цитозольных и ядерных железо-серных белков и их роль в стабильности генома» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Исследование молекулярных клеток . 1853 (6): 1528–39. DOI : 10.1016 / j.bbamcr.2014.12.018 . PMID 25583461 . 
  47. ^ Gari К, Леон Ортис А.М., Бореля В, Флинн Н, Skehel Ю.М., бултон SJ (июль 2012). «MMS19 связывает сборку цитоплазматических железо-серных кластеров с метаболизмом ДНК». Наука . 337 (6091): 243–5. Bibcode : 2012Sci ... 337..243G . DOI : 10.1126 / science.1219664 . PMID 22678361 . S2CID 26605576 .  
  48. ^ Stehling О, Вашишт А.А., Маскаренхас Дж, Йонссон ZO, Шарма Т, нец ди - джей, Pierik AJ, Wohlschlegel JA, Лилла R (июль 2012). «MMS19 собирает железо-серные белки, необходимые для метаболизма ДНК и целостности генома» . Наука . 337 (6091): 195–9. Bibcode : 2012Sci ... 337..195S . DOI : 10.1126 / science.1219723 . PMC 3420340 . PMID 22678362 .  
  49. ^ Hansen MF, Йохансен J, Bjørnevoll I, Sylvander А.Е., Steinsbekk К.С., Sætrom P, Sandvik А.К., Drabløs F, Sjursen W (сентябрь 2015). «Новая мутация ПОЛЮСА, связанная с раком толстой кишки, поджелудочной железы, яичников и тонкой кишки» . Семейный рак . 14 (3): 437–48. DOI : 10.1007 / s10689-015-9803-2 . PMC 4559173 . PMID 25860647 .  
  50. ↑ Zuo Y, Deutscher MP (март 2001 г.). «Суперсемейства экзорибонуклеаз: структурный анализ и филогенетическое распределение» . Исследования нуклеиновых кислот . 29 (5): 1017–26. DOI : 10.1093 / NAR / 29.5.1017 . PMC 56904 . PMID 11222749 .  
  51. ^ Simon M, L GIOT, Faye G (август 1991). «3'-5'-экзонуклеазная активность, локализованная в дельта-субъединице ДНК-полимеразы Saccharomyces cerevisiae, необходима для точной репликации» . Журнал EMBO . 10 (8): 2165–70. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1991.tb07751.x . PMC 452904 . PMID 1648480 .  
  52. ^ Макарова К.С., Крупович М., Кунин Е.В. (2014-01-01). «Эволюция репликативных ДНК-полимераз в архее и их вклад в механизм репликации эукариот» . Границы микробиологии . 5 : 354. DOI : 10,3389 / fmicb.2014.00354 . PMC 4104785 . PMID 25101062 .  
  53. ^ С В, Mazloum Н, Ль L, Rahmeh А, Ли Н, Ли МОЙ (ноябрь 2002 г.). «Воссоздание и характеристика голофермента с четырьмя субъединицами дельта ДНК-полимеразы человека». Биохимия . 41 (44): 13133–42. DOI : 10.1021 / bi0262707 . PMID 12403614 . 
  54. ^ Лаборатория, Майк Тайерс. "База данных белковых, химических и генетических взаимодействий | BioGRID" . thebiogrid.org . Проверено 25 апреля 2016 .
  55. ^ «Белок POLD1 (Homo sapiens) - сетевое представление STRING» . string-db.org . Проверено 25 апреля 2016 .
  56. ^ "База данных метаболизма раковых клеток ~~ Лаборатория биоинформатики и системной медицины ~~" . bioinfo.mc.vanderbilt.edu . Архивировано из оригинала на 2016-04-26 . Проверено 25 апреля 2016 .
  57. ^ «СТРОКА: функциональные сети ассоциации белков» . string-db.org . Проверено 25 апреля 2016 .
  58. ↑ Оно, Кейитиро. «Cytoscape: платформа с открытым исходным кодом для комплексного сетевого анализа и визуализации» . www.cytoscape.org . Проверено 25 апреля 2016 .
  59. ^ «Белок POLD1 (Homo sapiens) - сетевое представление STRING» . string-db.org . Проверено 25 апреля 2016 .
  60. ^ a b c Видон М.Н., Эллард С., Приндл М.Дж., Касвелл Р., Ланго Аллен Х., Орам Р., Годбол К., Яджник С.С. , Сбраксия П., Новелли Дж., Тернпенни П., Макканн Е., Го К.Дж., Ван Й., Фулфорд Дж., Маккалок Л.Дж., Сэвидж Д.Б., О'Рахилли С., Кос К., Леб Л.А., Семпл Р.К., Хаттерсли А.Т. (август 2013 г.). «Делеция в рамке считывания в активном центре полимеразы POLD1 вызывает мультисистемное нарушение с липодистрофией» . Генетика природы . 45 (8): 947–50. DOI : 10.1038 / ng.2670 . PMC 3785143 . PMID 23770608 .  
  61. ^ "Генатлас лист" . genatlas.medecine.univ-paris5.fr . Проверено 25 апреля 2016 .
  62. ^ Такахаши Y, Мориваки S, Сугияма Y, Y Эндо, Ямадзаки К, Т Мори, Такигава М, Иноуэ S (февраль 2005 г.). «Снижение экспрессии генов, ответственных за пост-ультрафиолетовый синтез репарации ДНК при старении: возможный механизм возрастного снижения способности репарации ДНК» . Журнал следственной дерматологии . 124 (2): 435–42. DOI : 10.1111 / j.0022-202X.2004.23591.x . PMID 15675965 . 
  63. ^ a b Wang JL, Guo HL, Wang PC, Liu CG (декабрь 2012 г.). «Возраст-зависимое подавление ДНК-полимеразы δ1 в лимфоцитах человека». Молекулярная и клеточная биохимия . 371 (1-2): 157–63. DOI : 10.1007 / s11010-012-1432-6 . PMID 22915169 . S2CID 15443915 .  
  64. ^ Karkhanis В, Ван L, S Тэ, Ху YJ, Imbalzano А.Н., Сиф S (август 2012). «Белок аргининметилтрансфераза 7 регулирует клеточный ответ на повреждение ДНК путем метилирования промоторных гистонов H2A и H4 гена каталитической субъединицы полимеразы δ, POLD1» . Журнал биологической химии . 287 (35): 29801–14. DOI : 10.1074 / jbc.M112.378281 . PMC 3436169 . PMID 22761421 .  
  65. ^ Цуй М, Ю L, Рен X, Чжао В, Ляо Q, Чжао Y (февраль 2016). «Длинная некодирующая РНК PVT1 и рак». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 471 (1): 10–4. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2015.12.101 . PMID 26850852 . 
  66. ^ Li H, Се B, Чжоу Y, Rahmeh A, Trusa S, Чжан S, Гао Y, Ли EY, Lee MY (май 2006). «Функциональные роли p12, четвертой субъединицы дельта ДНК-полимеразы человека» . Журнал биологической химии . 281 (21): 14748–55. DOI : 10.1074 / jbc.M600322200 . PMID 16510448 . 
  67. ^ Подуст В. Н., Чанг Л.С., Отт R, Дианов GL Фаннинг E (февраль 2002). «Восстановление дельта ДНК-полимеразы человека с использованием рекомбинантных бакуловирусов: субъединица p12 потенцирует ДНК-полимеризирующую активность фермента с четырьмя субъединицами» . Журнал биологической химии . 277 (6): 3894–901. DOI : 10.1074 / jbc.M109684200 . PMID 11711545 . 
  68. ↑ Zhang S, Zhou Y, Trusa S, Meng X, Lee EY, Lee MY (май 2007 г.). «Новый ответ на повреждение ДНК: быстрая деградация субъединицы p12 дельта ДНК-полимеразы» . Журнал биологической химии . 282 (21): 15330–40. DOI : 10.1074 / jbc.M610356200 . PMID 17317665 . 
  69. ↑ Lee MY, Zhang S, Lin SH, Wang X, Darzynkiewicz Z, Zhang Z, Lee EY (01.01.2014). «Хвост, который виляет собакой: p12, наименьшая субъединица ДНК-полимеразы δ, разрушается убиквитинлигазами в ответ на повреждение ДНК и во время прогрессирования клеточного цикла» . Клеточный цикл . 13 (1): 23–31. DOI : 10.4161 / cc.27407 . PMC 3925730 . PMID 24300032 .  
  70. ^ Чжан S, Чжао H, Darzynkiewicz Z, Чжоу P, Zhang Z, Ли EY, Lee MY (октябрь 2013 года). «Новая функция CRL4 (Cdt2): регуляция субъединичной структуры ДНК-полимеразы δ в ответ на повреждение ДНК и во время S-фазы» . Журнал биологической химии . 288 (41): 29550–61. DOI : 10.1074 / jbc.M113.490466 . PMC 3795253 . PMID 23913683 .  
  71. ↑ Fan X, Zhang Q, You C, Qian Y, Gao J, Liu P, Chen H, Song H, Chen Y, Chen K, Zhou Y (01.01.2014). «Протеолиз человеческой дельта-полимеразы наименьшей субъединицы p12 с помощью μ-кальпаина в апоптотических клетках HeLa, запускаемых кальцием» . PLOS ONE . 9 (4): e93642. Bibcode : 2014PLoSO ... 993642F . DOI : 10.1371 / journal.pone.0093642 . PMC 3972206 . PMID 24691096 .  
  72. ↑ Zhang Q, Zhang Q, Chen H, Chen Y, Zhou Y (февраль 2016). «Множественные формы суб-сборки человеческой ДНК-полимеразы дельта в транзакциях клеточной ДНК». Современная наука о белках и пептидах . 17 (8): 746–755. DOI : 10.2174 / 1389203717666160226145006 . PMID 26916162 . 
  73. ^ a b Szekely AM, Chen YH, Zhang C, Oshima J, Weissman SM (октябрь 2000 г.). «Белок Вернера привлекает дельта ДНК-полимеразы к ядрышку» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (21): 11365–70. Bibcode : 2000PNAS ... 9711365S . DOI : 10.1073 / pnas.97.21.11365 . PMC 17206 . PMID 11027336 .  
  74. ^ a b Кармакар П., Бор В.А. (ноябрь 2005 г.). «Клеточная динамика и модуляция белка WRN специфичны для повреждения ДНК» . Механизмы старения и развития . 126 (11): 1146–58. DOI : 10.1016 / j.mad.2005.06.004 . PMID 16087220 . S2CID 6128022 .  
  75. ↑ Lee SY, Lee H, Kim ES, Park S, Lee J, Ahn B (апрель 2015 г.). «Транслокация WRN из ядрышка в нуклеоплазму регулируется SIRT1 и требуется для репарации ДНК и развития химиорезистентности». Мутационные исследования . 774 : 40–8. DOI : 10.1016 / j.mrfmmm.2015.03.001 . PMID 25801465 . 
  76. ↑ Wang X, Zhang S, Zheng R, Yue F, Lin SH, Rahmeh AA, Lee EY, Zhang Z, Lee MY (февраль 2016 г.). «PDIP46 (белок 46, взаимодействующий с ДНК-полимеразой δ) является фактором активации ДНК-полимеразы δ человека» . Oncotarget . 7 (5): 6294–313. DOI : 10.18632 / oncotarget.7034 . PMC 4868757 . PMID 26819372 .  
  77. ↑ Boyer AS, Walter D, Sørensen CS (январь 2016 г.). «Репликация ДНК и рак: от дисфункциональной активности начала репликации к терапевтическим возможностям». Семинары по биологии рака . 37–38: 16–25. DOI : 10.1016 / j.semcancer.2016.01.001 . PMID 26805514 . 
  78. ^ Sincennes MC, Humbert M, Grondin B, Lisi V, Veiga DF, Haman A, Cazaux C, Mashtalir N, Affar el B, Verreault A, Hoang T (февраль 2016 г.). «Онкоген LMO2 регулирует репликацию ДНК в кроветворных клетках» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 113 (5): 1393–8. Bibcode : 2016PNAS..113.1393S . DOI : 10.1073 / pnas.1515071113 . PMC 4747768 . PMID 26764384 .  
  79. ^ Ник МакЭлхинни С.А., Горденин Д.А., Стит СМ, Бургерс П.М., Кункель Т.А. (апрель 2008 г.). «Разделение труда на вилке репликации эукариот» . Молекулярная клетка . 30 (2): 137–44. DOI : 10.1016 / j.molcel.2008.02.022 . PMC 2654179 . PMID 18439893 .  
  80. ^ a b Johnson RE, Klassen R, Prakash L, Prakash S (июль 2015 г.). «Основная роль ДНК-полимеразы δ в репликации как ведущих, так и отстающих нитей ДНК» . Молекулярная клетка . 59 (2): 163–75. DOI : 10.1016 / j.molcel.2015.05.038 . PMC 4517859 . PMID 26145172 .  
  81. ^ Daigaku Y, Keszthelyi A, Мюллер CA, Miyabe I, Брукс T, Retkute R, Hubank M, Nieduszynski CA, Карр AM (март 2015). «Глобальный профиль использования репликативной полимеразы» . Структурная и молекулярная биология природы . 22 (3): 192–8. DOI : 10.1038 / nsmb.2962 . PMC 4789492 . PMID 25664722 .  
  82. ↑ Павлов Ю.И., Щербакова П.В. (март 2010 г.). «ДНК-полимеразы на эукариотической вилке - 20 лет спустя» . Мутационные исследования . 685 (1–2): 45–53. DOI : 10.1016 / j.mrfmmm.2009.08.002 . PMC 2822129 . PMID 19682465 .  
  83. Перейти ↑ Stillman B (июль 2015 г.). «Пересмотр ДНК-полимераз на вилке репликации у эукариот» . Молекулярная клетка . 59 (2): 139–41. DOI : 10.1016 / j.molcel.2015.07.004 . PMC 4636199 . PMID 26186286 .  
  84. ^ Бюргерса PM, Gordenin D, Kunkel TA (февраль 2016). «Кто возглавляет репликационную вилку, Pol ε или Pol δ?» . Молекулярная клетка . 61 (4): 492–3. DOI : 10.1016 / j.molcel.2016.01.017 . PMC 4838066 . PMID 26895421 .  
  85. ^ Korona DA, Lecompte KG, Перселл ZF (март 2011). «Высокая точность и уникальная сигнатура ошибки ДНК-полимеразы человека эпсилон» . Исследования нуклеиновых кислот . 39 (5): 1763–73. DOI : 10.1093 / NAR / gkq1034 . PMC 3061053 . PMID 21036870 .  
  86. ^ Skoneczna А, Kaniak А, М Skoneczny (ноябрь 2015). «Генетическая нестабильность почкующихся и делящихся дрожжей-источников и механизмов» . FEMS Microbiology Reviews . 39 (6): 917–67. DOI : 10.1093 / femsre / fuv028 . PMC 4608483 . PMID 26109598 .  
  87. ^ Hoopes JI, Cortez LM, Mertz TM, Malc EP, Mieczkowski PA, Roberts SA (февраль 2016 г.). «APOBEC3A и APOBEC3B предпочтительно дезаминируют матрицу отстающей цепи во время репликации ДНК» . Отчеты по ячейкам . 14 (6): 1273–82. DOI : 10.1016 / j.celrep.2016.01.021 . PMC 4758883 . PMID 26832400 .  
  88. ^ Reijns М.А., Кемп Н, Дин Дж, де - проц С.М., Джексон А.П., Тейлор МС (февраль 2015). «Репликация отстающей нити формирует мутационный ландшафт генома» . Природа . 518 (7540): 502–6. Bibcode : 2015Natur.518..502R . DOI : 10,1038 / природа14183 . PMC 4374164 . PMID 25624100 .  
  89. ↑ Flood CL, Rodriguez GP, Bao G, Shockley AH, Kow YW, Crouse GF (март 2015 г.). «Репликативная ДНК-полимераза δ, но не ε корректирует ошибки в цис и транс» . PLOS Genetics . 11 (3): e1005049. DOI : 10.1371 / journal.pgen.1005049 . PMC 4351087 . PMID 25742645 .  
  90. ↑ Herr AJ, Kennedy SR, Knowels GM, Schultz EM, Preston BD (март 2014 г.). «Вымирание диплоидных дрожжей, вызванное ошибкой репликации ДНК» . Генетика . 196 (3): 677–91. DOI : 10.1534 / genetics.113.160960 . PMC 3948800 . PMID 24388879 .  
  91. ^ Моррисон А., Джонсон А. Л., Джонстон Л. Х., Сугино А. (апрель 1993 г.). «Путь исправления ошибок репликации ДНК в Saccharomyces cerevisiae» . Журнал EMBO . 12 (4): 1467–73. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1993.tb05790.x . PMC 413358 . PMID 8385605 .  
  92. ^ Li L, Murphy KM, Каневец U, Reha-Кранц LJ (июнь 2005). «Чувствительность к фосфоноуксусной кислоте: новый фенотип для исследования дельта ДНК-полимеразы в Saccharomyces cerevisiae» . Генетика . 170 (2): 569–80. DOI : 10.1534 / genetics.104.040295 . PMC 1450396 . PMID 15802517 .  
  93. ↑ Meng X, Zhou Y, Zhang S, Lee EY, Frick DN, Lee MY (февраль 2009 г.). «Повреждение ДНК изменяет дельта ДНК-полимеразы до формы, которая демонстрирует повышенную дискриминацию в отношении модифицированных оснований матрицы и несовпадающих праймеров» . Исследования нуклеиновых кислот . 37 (2): 647–57. DOI : 10.1093 / NAR / gkn1000 . PMC 2632934 . PMID 19074196 .  
  94. ^ Барановский AG, Lada AG, Siebler HM, Zhang Y, Павлов Ю.И., Таиров TH (май 2012). «ДНК-полимераза δ и ζ переключаются за счет общих дополнительных субъединиц ДНК-полимеразы δ» . Журнал биологической химии . 287 (21): 17281–7. DOI : 10.1074 / jbc.M112.351122 . PMC 3366816 . PMID 22465957 .  
  95. ^ Маркканен E, Castrec B, G Виллани, Hubscher U (декабрь 2012). «Переключение между ДНК-полимеразами δ и λ способствует безошибочному обходу 8-оксо-G повреждений» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 109 (50): 20401–6. Bibcode : 2012PNAS..10920401M . DOI : 10.1073 / pnas.1211532109 . PMC 3528542 . PMID 23175785 .  
  96. ↑ Сонг Дж, Хун П, Лю Ц, Чжан И, Ван Дж, Ван П (01.01.2015). «Человеческий POLD1 модулирует развитие клеточного цикла и восстановление повреждений ДНК» . BMC Biochemistry . 16 : 14. DOI : 10,1186 / s12858-015-0044-7 . PMC 4471906 . PMID 26087769 .  
  97. ^ Хоке S, Го Y, Работа А, Орт М, Ziesch А, Lauber К, Де Тони Е.Н., Гресс ТМ, Herbst А, Б ГОКе, Gallmeier Е (февраль 2016). «Синтетический летальный скрининг идентифицирует ингибирование ATR как новый терапевтический подход к POLD1-дефицитному раку» . Oncotarget . 7 (6): 7080–95. DOI : 10.18632 / oncotarget.6857 . PMC 4872770 . PMID 26755646 .  
  98. ↑ Miyabe I, Mizuno K, Keszthelyi A, Daigaku Y, Skouteri M, Mohebi S, Kunkel TA, Murray JM, Carr AM (ноябрь 2015 г.). «Полимераза δ реплицирует обе цепи после перезапуска вилки, зависимой от гомологичной рекомбинации» . Структурная и молекулярная биология природы . 22 (11): 932–8. DOI : 10.1038 / nsmb.3100 . PMC 4655445 . PMID 26436826 .  
  99. ^ Kamath-Loeb А.С., Shen JC, Schmitt MW, Loeb LA (апрель 2012). «Экзонуклеаза синдрома Вернера способствует деградации ДНК и высокоточной полимеризации ДНК с помощью ДНК-полимеразы человека δ» . Журнал биологической химии . 287 (15): 12480–90. DOI : 10.1074 / jbc.M111.332577 . PMC 3320997 . PMID 22351772 .  
  100. ↑ Янсен А.М., ван Везель Т., ван ден Аккер Б.Э., Вентайол Гарсия М., Руано Д., Топс К.М., Вагнер А., Леттебоер Т.Г., Гомес-Гарсия Э.Б., Девили П., Вайнен Дж.Т., Хес Ф.Дж., Морро Х. (декабрь 2015 г.). «Комбинированное восстановление несоответствия и дефекты POLE / POLD1 объясняют нерешенные случаи рака с подозрением на синдром Линча» . Европейский журнал генетики человека . 24 (7): 1089–1092. DOI : 10.1038 / ejhg.2015.252 . PMC 5070903 . PMID 26648449 .  
  101. ^ a b c d e f Паллес С., Казье Дж. Б., Ховарт К. М., Доминго Е., Джонс А. М., Бродерик П. и др. (Февраль 2013). «Мутации зародышевой линии, затрагивающие проверочные домены POLE и POLD1, предрасполагают к колоректальным аденомам и карциномам» . Генетика природы . 45 (2): 136–44. DOI : 10.1038 / ng.2503 . PMC 3785128 . PMID 23263490 .  
  102. ^ а б в г Валле Л., Эрнандес-Иллан Э., Беллидо Ф., Айса Г., Кастильехо А., Кастильехо М. И. и др. (Июль 2014 г.). «Новые взгляды на мутации зародышевой линии POLE и POLD1 при семейном колоректальном раке и полипозе» . Молекулярная генетика человека . 23 (13): 3506–12. DOI : 10,1093 / HMG / ddu058 . PMID 24501277 . 
  103. ^ a b c d Bellido F, Pineda M, Aiza G, Valdés-Mas R, Navarro M, Puente DA, Pons T, González S, Iglesias S, Darder E, Piñol V, Soto JL, Valencia A, Blanco I, Urioste М., Брюне Дж., Ласаро К., Капелла Дж., Пуэнте XS, Валле Л. (апрель 2016 г.). «Мутации POLE и POLD1 у 529 родственников с семейным колоректальным раком и / или полипозом: обзор зарегистрированных случаев и рекомендации по генетическому тестированию и надзору» . Генетика в медицине . 18 (4): 325–32. DOI : 10.1038 / gim.2015.75 . PMC 4823640 . PMID 26133394 .  
  104. ^ а б в г Бриггс С., Томлинсон I (июнь 2013 г.). «Мутации ε и δ зародышевой линии и соматической полимеразы определяют новый класс гипермутированного рака прямой кишки и эндометрия» . Журнал патологии . 230 (2): 148–53. DOI : 10.1002 / path.4185 . PMC 3709119 . PMID 23447401 .  
  105. ^ a b c Черч Д. Н., Бриггс С. Е., Паллес С., Доминго Е., Кирси С. Дж., Граймс Дж. М., Горман М., Мартин Л., Ховарт К. М., Ходжсон С. В., Каур К., Тейлор Дж., Томлинсон И. П. (июль 2013 г.). «Мутации ДНК-полимеразы ε и δ экзонуклеазного домена при раке эндометрия» . Молекулярная генетика человека . 22 (14): 2820–8. DOI : 10,1093 / HMG / ddt131 . PMC 3690967 . PMID 23528559 .  
  106. ↑ a b Heitzer E, Tomlinson I (февраль 2014 г.). «Репликативные мутации ДНК-полимеразы при раке» . Текущее мнение в области генетики и развития . 24 : 107–13. DOI : 10.1016 / j.gde.2013.12.005 . PMC 4003352 . PMID 24583393 .  
  107. ^ a b Шинброт Э, Хеннингер Э., Вайнхольд Н., Ковингтон К. Р., Гёксенин А. Ю., Шульц Н., Чао Х., Доддапанени Х., Музны Д. М., Гиббс Р. А., Сандер С., Перселл З. Ф., Уиллер Д. А. (ноябрь 2014 г.). «Мутации экзонуклеазы в ДНК-полимеразе эпсилон выявляют характерные для цепи репликации мутации и происхождение репликации у человека» . Геномные исследования . 24 (11): 1740–50. DOI : 10.1101 / gr.174789.114 . PMC 4216916 . PMID 25228659 .  
  108. ↑ Arora S, Yan H, Cho I, Fan HY, Luo B, Gai X, Bodian DL, Vockley JG, Zhou Y, Handorf EA, Egleston BL, Andrake MD, Nicolas E, Serebriiskii IG, Yen TJ, Hall MJ, Golemis EA, Enders GH (декабрь 2015 г.). «Генетические варианты, которые предрасполагают к двухцепочечным разрывам ДНК в лимфоцитах от подгруппы пациентов с семейными колоректальными карциномами» . Гастроэнтерология . 149 (7): 1872–1883.e9. DOI : 10,1053 / j.gastro.2015.08.052 . PMC 4663158 . PMID 26344056 .  
  109. ^ Водопад JJ, Мельцер PS (март 2015). «Лавинные мутации при синдроме дефицита восстановления двуаллельного несоответствия» . Генетика природы . 47 (3): 194–6. DOI : 10.1038 / ng.3227 . PMID 25711864 . S2CID 28165945 .  
  110. ^ a b Schlesner M, Eils R (01.01.2015). «Гиперммутация занимает место водителя» . Геномная медицина . 7 (1): 31. DOI : 10,1186 / s13073-015-0159-х . PMC 4376156 . PMID 25821521 .  
  111. ^ Шлиен А., Кэмпбелл Б. Б., де Борха Р., Александров Л. Б., Мерико Д., Клин Д. и др. (Март 2015 г.). «Комбинированные наследственные и соматические мутации генов восстановления ошибок репликации приводят к быстрому возникновению сверхгипермутированного рака». Генетика природы . 47 (3): 257–62. DOI : 10.1038 / ng.3202 . PMID 25642631 . S2CID 5338516 .  
  112. ^ Bouffet Е, LaRouche В, Кэмпбелл ВВ, Merico Д, де Борха R, Аронсон М., и др. (Март 2016 г.). «Ингибирование иммунной контрольной точки для гипермутантной мультиформной глиобластомы, являющейся результатом недостаточности восстановления двуаллельного несоответствия зародышевой линии». Журнал клинической онкологии . 34 (19): 2206–2211. DOI : 10.1200 / JCO.2016.66.6552 . PMID 27001570 . 
  113. ^ Howitt BE, Шукла С.А., Sholl Л.М., Ritterhouse Л.Л., Watkins JC, Rodig S, Стовера E, Стрикленд KC, D'Andrea AD, Wu CJ, Matulonis UA, Konstantinopoulos PA (декабрь 2015). «Ассоциация рака эндометрия с мутацией e-полимеразой и нестабильным микросателлитом с неоантигенной нагрузкой, количеством инфильтрирующих опухоль лимфоцитов и экспрессией PD-1 и PD-L1» (PDF) . JAMA Онкология . 1 (9): 1319–23. DOI : 10,1001 / jamaoncol.2015.2151 . PMID 26181000 .  
  114. ^ van Gool IC, Eggink FA, Freeman-Mills L, Stelloo E, Marchi E, de Bruyn M, Palles C, Nout RA, de Kroon CD, Osse EM, Klenerman P, Creutzberg CL, Tomlinson IP, Smit VT, Nijman HW , Bosse T, Church DN (июль 2015 г.). «Проверочные мутации POLE вызывают противоопухолевый иммунный ответ при раке эндометрия» . Клинические исследования рака . 21 (14): 3347–55. DOI : 10.1158 / 1078-0432.CCR-15-0057 . PMC 4627582 . PMID 25878334 .  
  115. Перейти ↑ Khanna A (июнь 2015 г.). «Повреждение ДНК при лечении рака: благо или проклятие?» . Исследования рака . 75 (11): 2133–8. DOI : 10.1158 / 0008-5472.CAN-14-3247 . PMID 25931285 . 
  116. ↑ Робертс С.А., Горденин Д.А. (декабрь 2014 г.). «Гипермутация в геномах рака человека: следы и механизмы» . Обзоры природы. Рак . 14 (12): 786–800. DOI : 10.1038 / nrc3816 . PMC 4280484 . PMID 25568919 .  
  117. ^ Руса WP, Томас Д., Kaina B (январь 2016). «Повреждение ДНК и баланс между выживанием и смертью в биологии рака» (PDF) . Обзоры природы. Рак . 16 (1): 20–33. DOI : 10.1038 / nrc.2015.2 . PMID 26678314 . S2CID 10159855 .   
  118. ^ да Коста LT, Лю Б., эль-Дейри В., Гамильтон С. Р., Кинзлер К. В., Фогельштейн Б., Марковиц С., Уилсон Дж. К., де ла Шапель А., Дауни К. М. (январь 1995 г.). «Варианты дельта-полимеразы при колоректальных опухолях RER». Генетика природы . 9 (1): 10–1. DOI : 10.1038 / ng0195-10 . PMID 7704014 . S2CID 19545401 .  
  119. ^ Flohr T, Dai JC, Büttner J, Popanda O, Hagmüller E, Thielmann HW (март 1999). «Обнаружение мутаций в гене дельта ДНК-полимеразы спорадического колоректального рака человека и клеточных линий рака толстой кишки» . Международный журнал рака . 80 (6): 919–29. DOI : 10.1002 / (sici) 1097-0215 ​​(19990315) 80: 6 <919 :: aid-ijc19> 3.0.co; 2-u . PMID 10074927 . 
  120. Перейти ↑ Preston BD, Albertson TM, Herr AJ (октябрь 2010 г.). «Верность репликации ДНК и рак» . Семинары по биологии рака . 20 (5): 281–93. DOI : 10.1016 / j.semcancer.2010.10.009 . PMC 2993855 . PMID 20951805 .  
  121. ^ Popanda О, Т Flohr, Фокс G, Thielmann HW (ноябрь 1999 года). «Мутация, обнаруженная в кДНК ДНК-полимеразы дельта из клеток гепатомы Новикова, коррелирует с аномальными каталитическими свойствами фермента». Журнал исследований рака и клинической онкологии . 125 (11): 598–608. DOI : 10.1007 / s004320050322 . PMID 10541966 . S2CID 11582153 .  
  122. ^ Венкатесан RN, Treuting PM, Фуллер ED, Goldsby RE, Норвуд TH, Gooley Т.А., Ladiges туалет, Престон Д., Леб Л. (ноябрь 2007). «Мутация в активном центре полимеразы дельта ДНК-полимеразы мыши увеличивает нестабильность генома и ускоряет онкогенез» . Молекулярная и клеточная биология . 27 (21): 7669–82. DOI : 10.1128 / MCB.00002-07 . PMC 2169052 . PMID 17785453 .  
  123. ^ a b c Пелосини С., Мартинелли С., Чеккарини Дж., Магно С., Бароне I, Базоло А., Фиерабраччи П., Витти П., Маффей М., Сантини Ф (ноябрь 2014 г.). «Идентификация новой мутации в гене полимеразы дельта 1 (POLD1) у липодистрофического пациента, страдающего гипоплазией нижней челюсти, глухотой, синдромом прогероидных особенностей (MDPL)». Обмен веществ . 63 (11): 1385–9. DOI : 10.1016 / j.metabol.2014.07.010 . PMID 25131834 . 
  124. ^ Reinier Р, Zoledziewska М, Ханна Д, Смит JD, Валентини М, Зара I, Берутти R, Санна S, Оппо М, Кузано R, Satta R, Montesu М.А., Джонс С, Cerimele D, Никерсон Д.А., Angius А, Cucca F, Коттони Ф, Криспони Л. (ноябрь 2015 г.). «Гипоплазия нижней челюсти, глухота, прогероидные особенности и синдром липодистрофии (MDPL) в контексте наследственных липодистрофий». Обмен веществ . 64 (11): 1530–40. DOI : 10.1016 / j.metabol.2015.07.022 . PMID 26350127 . 
  125. ^ Осима J, Сидорова JM, Monnat RJ (март 2016). «Синдром Вернера: клинические особенности, патогенез и возможные терапевтические вмешательства» . Обзоры исследований старения . 33 : 105–114. DOI : 10.1016 / j.arr.2016.03.002 . PMC 5025328 . PMID 26993153 .  
  126. ^ Lessel D, Hisama FM, Szakszon К, Саа В, Sanjuanelo А.Б., Salbert Б.А., Стил Д., Болдуин Дж, Браун WT, Piussan С, Plauchu Н, Szilvássy Дж, Horkay Е, Högel J, Мартин Г. М., г - н AJ, Осима Дж., Кубищ С. (ноябрь 2015 г.). «Мутации зародышевой линии POLD1 у пациентов, у которых изначально диагностирован синдром Вернера» . Мутация человека . 36 (11): 1070–9. DOI : 10.1002 / humu.22833 . PMC 4684254 . PMID 26172944 .  
  127. ^ Pachlopnik Schmid J, Лемуан R, Nehme N, Кормье-Daire В, Revy Р, Debeurme Ж, Дебре М, Nitschke Р, Боле-Feysot С, Legeai-Маллет л, Лим А, де Villartay JP, Picard C, Durandy A , Фишер А., де Сен-Базиль Г. (декабрь 2012 г.). «Мутация полимеразы ε1 в человеческом синдроме с лицевым дисморфизмом, иммунодефицитом, ливедо и низким ростом (« синдром FILS »)» . Журнал экспериментальной медицины . 209 (13): 2323–30. DOI : 10,1084 / jem.20121303 . PMC 3526359 . PMID 23230001 .  
  128. ^ Thiffault я, Сондерс С, Дженкинс Дж, Raje Н, Кэнтите К, М Шарма, Грот л, валлийский HI, Опорос Е, Twist G, Н Миллер, Цвик D, L Zellmer, Kingsmore С.Ф., Сафина Н.П. (2015-01- 01). «Пациент с дефицитом полимеразы E1 (POLE1): клинические особенности и частичное совпадение с синдромами разрыва / нестабильности ДНК» . BMC Medical Genetics . 16 : 31. doi : 10.1186 / s12881-015-0177-y . PMC 4630961 . PMID 25948378 .  
  129. ^ Guénantin переменного тока, Брайанд Н, Бидо G, Афонсу Р, Березья В, Vatier С, Lascols О, Карон-Debarle М, Capeau Дж, Вигуру С (май 2014 г.). «Липодистрофии, связанные с ядерной оболочкой». Семинары по клеточной биологии и биологии развития . 29 : 148–57. DOI : 10.1016 / j.semcdb.2013.12.015 . PMID 24384368 . 
  130. ^ a b "GeneTests.org" . GeneTests.org . Проверено 25 апреля 2016 .
  131. ^ «Синдром MDP, вызванный изменением гена POLD1» .

Внешние ссылки [ править ]

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P28340 (дельта-каталитическая субъединица ДНК-полимеразы человека) в PDBe-KB .