Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
PPP1R15A
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

4XPN

Идентификаторы
ПсевдонимыPPP1R15A , GADD34, регуляторная субъединица 15A протеинфосфатазы 1
Внешние идентификаторыOMIM : 611048 MGI : 1927072 HomoloGene : 8639 GeneCards : PPP1R15A
Расположение гена ( человек )
Хромосома 19 (человек)
Chr.Хромосома 19 (человека) [1]
Хромосома 19 (человек)
Геномное расположение PPP1R15A
Геномное расположение PPP1R15A
Группа19q13.33Начинать48 872 421 п.н. [1]
Конец48 876 058 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 7 (мышь)
Chr.Хромосома 7 (мышь) [2]
Хромосома 7 (мышь)
Геномное расположение PPP1R15A
Геномное расположение PPP1R15A
Группа7 | 7 B3Начинать45 522 916 п.н. [2]
Конец45 526 268 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE PPP1R15A 37028 в формате fs.png

PBB GE PPP1R15A 202014 на fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• Связывание с белками GO: 0001948
• Связывание с протеинкиназой
• Связывание с протеинфосфатазой 1
• Активность активатора протеинфосфатазы
• Активность регулятора протеинфосфатазы
Сотовый компонент• Аппарат Гольджи
• мембрана эндоплазматического ретикулума
• мембрана
• внешняя мембрана митохондрий
• комплекс протеинфосфатазы 1 типа
• эндоплазматический ретикулум
• митохондрия
• цитозоль
• цитоплазма
Биологический процесс• негативная регуляция дефосфорилирования белков
• клеточный ответ на стимул повреждения ДНК
• позитивная регуляция дефосфорилирования eIF2 альфа, вызванного стрессом эндоплазматического ретикулума
• позитивная регуляция инициации трансляции в ответ на стресс
• позитивная регуляция активности фосфопротеинфосфатазы
• внутренний путь апоптотической передачи сигналов в ответ на стресс эндоплазматического ретикулума
• негативная регуляция активности фосфопротеинфосфатазы
• локализация белка в эндоплазматическом ретикулуме
• регуляция инициации трансляции посредством дефосфорилирования eIF2 альфа
• отрицательная регуляция PERK-опосредованного ответа развернутого белка
• регуляция трансляции
• апоптотический процесс
• ответ на стресс эндоплазматического ретикулума
• позитивная регуляция дефосфорилирования пептидилсерина
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

23645

17872

Ансамбль

ENSG00000087074

ENSMUSG00000040435

UniProt

O75807

P17564

RefSeq (мРНК)

NM_014330

NM_008654

RefSeq (белок)

NP_055145

NP_032680

Расположение (UCSC)Chr 19: 48,87 - 48,88 МбChr 7: 45,52 - 45,53 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белок фосфатазы 1 регуляторная субъединица 15A также известная как остановка роста и повреждение ДНК-индуцируемый белок GADD34 является белком , который в организме человека кодируется PPP1R15A геной . [5] [6] [7]

Ген Gadd34 / MyD116 был первоначально обнаружен как член набора генов млекопитающих gadd и MyD, кодирующих кислые белки, которые синергетически подавляют рост клеток. [8] В дальнейшем на нем было охарактеризовано как ген играет определенную роль в ER стресс-индуцированной гибели клеток, являясь мишенью ATF4 , который играет роль в ER-опосредованный клеточной гибели посредством продвижения белки дефосфорилирования из eIF2 α и реверсивного поступательное торможение. [9]

Функция [ править ]

Этот ген является членом группы генов, уровни транскриптов которых повышаются после стрессовых условий остановки роста и лечения агентами, повреждающими ДНК. Индукция этого гена ионизирующим излучением происходит в определенных клеточных линиях независимо от статуса p53 , и его белковый ответ коррелирует с апоптозом после ионизирующего излучения. [7]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что PPP1R15A взаимодействует с:

  • BAG1 [10]
  • LYN , [11]
  • MLL , [12]
  • PPP1CA , [10] [13] [14]
  • PPP1CB , [13] [14]
  • PPP1CC , [13] [14]
  • SMARCB1 , [12] [13] и
  • ТСН . [15]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000087074 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040435 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ↑ Hollander MC, Zhan Q, Bae I, Fornace AJ Jr (июль 1997 г.). «GADD34 млекопитающих, ген, индуцируемый апоптозом и повреждением ДНК» . J Biol Chem . 272 (21): 13731–7. DOI : 10.1074 / jbc.272.21.13731 . PMID 9153226 . 
  6. ^ Korabiowska МЫ, Бетка Н, Кельнер S, Stachura Дж, Шауер А (январь 1998). «Дифференциальная экспрессия остановки роста, генов повреждения ДНК и гена супрессора опухолей p53 в невусах и злокачественных меланомах». Anticancer Res . 17 (5A): 3697–700. PMID 9413226 . 
  7. ^ a b «Ген Entrez: протеинфосфатаза 1 PPP1R15A, регуляторная (ингибиторная) субъединица 15A» .
  8. ↑ Zhan Q, Lord KA, Alamo I, Hollander MC, Carrier F, Ron D, Kohn KW, Hoffman B, Liebermann DA, Fornace AJ (апрель 1994). «Гены gadd и MyD определяют новый набор генов млекопитающих, кодирующих кислые белки, которые синергетически подавляют рост клеток» . Мол. Клетка. Биол . 14 (4): 2361–71. DOI : 10.1128 / mcb.14.4.2361 . PMC 358603 . PMID 8139541 .  
  9. Перейти ↑ Sano R, Reed JC (июль 2013 г.). «ЭР-индуцированный стресс механизмы клеточной гибели» . Биохим. Биофиз. Acta . 1833 (12): 3460–70. DOI : 10.1016 / j.bbamcr.2013.06.028 . PMC 3834229 . PMID 23850759 .  
  10. ^ a b Hung WJ, Роберсон RS, Taft J, Wu DY (2003). «Белки BAG-1 человека связываются с белком клеточной реакции на стресс GADD34 и мешают функциям GADD34» . Мол. Клетка. Биол . 23 (10): 3477–86. DOI : 10.1128 / MCB.23.10.3477-3486.2003 . PMC 164759 . PMID 12724406 .  
  11. ^ Гришин А.В., Ажипа О, Семенов I, Кори SJ (2001). «Взаимодействие между протеином 34, вызывающим остановку роста ДНК, и киназой Lyn Src отрицательно регулирует генотоксический апоптоз» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 98 (18): 10172–7. Bibcode : 2001PNAS ... 9810172G . DOI : 10.1073 / pnas.191130798 . PMC 56934 . PMID 11517336 .  
  12. ^ a b Адлер Х.Т., Чинери Р., Ву Д.Й., Куссик С.Дж., Пейн Дж.М., Форнас А.Дж., Ткачук, округ Колумбия (1999). «Лейкемические слитые белки HRX ингибируют апоптоз, индуцированный GADD34, и связываются с белками GADD34 и hSNF5 / INI1» . Мол. Клетка. Биол . 19 (10): 7050–60. DOI : 10.1128 / mcb.19.10.7050 . PMC 84700 . PMID 10490642 .  
  13. ^ a b c d Ву Д.Ю., Ткачук, округ Колумбия, Роберсон Р.С., Шубах WH (2002). «Человеческий белок SNF5 / INI1 облегчает функцию остановки роста и белка, индуцируемого повреждением ДНК (GADD34), и модулирует активность GADD34-связанной протеинфосфатазы-1» . J. Biol. Chem . 277 (31): 27706–15. DOI : 10.1074 / jbc.M200955200 . PMID 12016208 . 
  14. ^ a b c Коннор JH, Weiser DC, Li S, Hallenbeck JM, Shenolikar S (2001). «Остановка роста и индуцируемый повреждением ДНК белок GADD34 собирает новый сигнальный комплекс, содержащий протеинфосфатазу 1 и ингибитор 1» . Мол. Клетка. Биол . 21 (20): 6841–50. DOI : 10.1128 / MCB.21.20.6841-6850.2001 . PMC 99861 . PMID 11564868 .  
  15. ^ Хасегава Т, Исобе К (1999). «Доказательства взаимодействия между Translin и GADD34 в клетках млекопитающих». Биохим. Биофиз. Acta . 1428 (2–3): 161–8. DOI : 10.1016 / s0304-4165 (99) 00060-4 . PMID 10434033 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID  9373149 .
  • Хасегава Т., Исобе К. (1999). «Доказательства взаимодействия между Translin и GADD34 в клетках млекопитающих». Биохим. Биофиз. Acta . 1428 (2–3): 161–8. DOI : 10.1016 / s0304-4165 (99) 00060-4 . PMID  10434033 .
  • Адлер Х.Т., Чинери Р., Ву Д.Й. и др. (2000). «Лейкемические слитые белки HRX ингибируют апоптоз, индуцированный GADD34, и связываются с белками GADD34 и hSNF5 / INI1» . Мол. Клетка. Биол . 19 (10): 7050–60. DOI : 10.1128 / mcb.19.10.7050 . PMC  84700 . PMID  10490642 .
  • Хасэгава Т., Яги А., Исобе К. (2000). «Взаимодействие между GADD34 и суперсемейством кинезинов, KIF3A». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 267 (2): 593–6. DOI : 10.1006 / bbrc.1999.1991 . PMID  10631107 .
  • Хасэгава Т., Сяо Х, Хамадзима Ф, Исобэ К. (2001). «Взаимодействие между повреждающим ДНК белком GADD34 и новым членом семейства белков теплового шока Hsp40, которое индуцируется повреждающим ДНК реагентом» . Биохим. Дж . 352 (3): 795–800. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3520795 . PMC  1221519 . PMID  11104688 .
  • Гришин А.В., Ажипа О, Семенов И., Кори С.Дж. (2001). «Взаимодействие между протеином 34, вызывающим остановку роста ДНК, и киназой Lyn Src отрицательно регулирует генотоксический апоптоз» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 98 (18): 10172–7. Bibcode : 2001PNAS ... 9810172G . DOI : 10.1073 / pnas.191130798 . PMC  56934 . PMID  11517336 .
  • Коннор Дж. Х., Вейзер Д. К., Ли С. и др. (2001). «Остановка роста и индуцируемый повреждением ДНК белок GADD34 собирает новый сигнальный комплекс, содержащий протеинфосфатазу 1 и ингибитор 1» . Мол. Клетка. Биол . 21 (20): 6841–50. DOI : 10.1128 / MCB.21.20.6841-6850.2001 . PMC  99861 . PMID  11564868 .
  • Ву Д.Ю., Ткачук, округ Колумбия, Роберсон Р.С., Шубах WH (2002). «Человеческий белок SNF5 / INI1 облегчает функцию остановки роста и белка, индуцируемого повреждением ДНК (GADD34), и модулирует активность GADD34-связанной протеинфосфатазы-1» . J. Biol. Chem . 277 (31): 27706–15. DOI : 10.1074 / jbc.M200955200 . PMID  12016208 .
  • Корабёвска М., Кордон-Кардо С. , Бетке Х. и др. (2003). «GADD153 - независимый прогностический фактор при меланоме: иммуногистохимический и молекулярно-генетический анализ». Histol. Histopathol . 17 (3): 805–11. PMID  12168790 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M . DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Кисть MH, Weiser DC, Shenolikar S (2003). «Остановка роста и индуцируемый повреждением ДНК белок GADD34 направляет протеинфосфатазу 1 альфа в эндоплазматический ретикулум и способствует дефосфорилированию альфа-субъединицы фактора инициации трансляции 2 эукариот» . Мол. Клетка. Биол . 23 (4): 1292–303. DOI : 10.1128 / MCB.23.4.1292-1303.2003 . PMC  141149 . PMID  12556489 .
  • Хунг В.Дж., Роберсон Р.С., Тафт Дж., Ву Д.Й. (2003). «Белки BAG-1 человека связываются с белком клеточной реакции на стресс GADD34 и мешают функциям GADD34» . Мол. Клетка. Биол . 23 (10): 3477–86. DOI : 10.1128 / MCB.23.10.3477-3486.2003 . PMC  164759 . PMID  12724406 .
  • Холландер М.С., Пула-Келла С., Форнас А.Дж. (2003). «Функциональные домены Gadd34, участвующие в подавлении роста и апоптозе» . Онкоген . 22 (25): 3827–32. DOI : 10.1038 / sj.onc.1206567 . PMID  12813455 .
  • Powolny A, Takahashi K, Hopkins RG, Loo G (2004). «Индукция экспрессии гена GADD фенэтилизотиоцианатом в клетках аденокарциномы толстой кишки человека». J. Cell. Биохим . 90 (6): 1128–39. DOI : 10.1002 / jcb.10733 . PMID  14635187 . S2CID  33081723 .
  • Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID  14702039 .
  • Ши В., Сунь Ц., Хе Б и др. (2004). «GADD34-PP1c, рекрутируемый Smad7, дефосфорилирует рецептор TGFbeta типа I.» . J. Cell Biol . 164 (2): 291–300. DOI : 10,1083 / jcb.200307151 . PMC  2172339 . PMID  14718519 .
  • Colland F, Jacq X, Trouplin V и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека» . Genome Res . 14 (7): 1324–32. DOI : 10.1101 / gr.2334104 . PMC  442148 . PMID  15231748 .