Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
PRDM1
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

3DAL

Идентификаторы
ПсевдонимыPRDM1 , Blimp1, PRDI-BF1, домен PR 1, PR / домен SET 1
Внешние идентификаторыOMIM : 603423 MGI : 99655 HomoloGene : 925 GeneCards : PRDM1
Расположение гена ( человек )
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человека) [1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение PRDM1
Геномное расположение PRDM1
Группа6q21Начинать105 993 463 п.н. [1]
Конец106 109 939 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 10 (мышь)
Chr.Хромосома 10 (мышь) [2]
Хромосома 10 (мышь)
Геномное расположение PRDM1
Геномное расположение PRDM1
Группа10 B2 | 10 23,24 смНачинать44 437 177 п.н. [2]
Конец44 528 501 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE PRDM1 217192 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• Метилтрансферазная активность
• Трансферазная активность
• Связывание ДНК
• Последовательно-специфичное связывание ДНК
• Связывание гистондеацетилазы
• Связывание с ионами металла
• GO: 0000980 Цис-регуляторная область РНК-полимеразы II, специфичное для последовательности связывание ДНК
• GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфическая
для РНК-полимеразы II • Связывание с белком GO: 0001948
• связывание с нуклеиновой кислотой
• специфическое для промотора связывание с хроматином
• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 ДНК-связывающий фактор транскрипции деятельность
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично
для РНК-полимеразы II
• Связывание ДНК с последовательностью регуляторной области РНК-полимеразы II • Связывание с ДНК хроматина
Сотовый компонент• цитоплазма
• ядро
• нуклеоплазма
Биологический процесс• развитие зародышевых клеток
• дифференцировка гигантских клеток трофобласта
• развитие сердечной перегородки
• обязательство клеточной судьбы
• развитие сердечного клапана
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• развитие желудочковой перегородки
• развитие кишечных эпителиальных клеток
• положительная регуляция дифференцировки B-клеток
• развитие эмбриональной плаценты
• внутриутробное эмбриональное развитие
• негативная регуляция транскрипции РНК-полимеразой II
• постэмбриональное развитие
• развитие коронарной сосудистой сети
• отрицательная регуляция экспрессии генов
• морфогенез ветвящейся структуры
• транскрипция, ДНК-шаблон
• негативная регуляция сигнального пути, опосредованного липополисахаридами
• развитие аорты
• метилирование
• позитивная регуляция экспрессии генов
• развитие материнской плаценты
• регуляция пролиферации популяции клеток
• морфогенез артерий
• развитие фоторецепторных клеток глаза
• пролиферация секретирующих кожный жир клеток
• негативная регуляция пролиферации B-клеток
• адаптивный иммунный ответ
• процесс иммунной системы
• регуляция естественной дифференцировки клеток-киллеров
• регуляция дифференцировки экстратимических Т-клеток
• врожденный иммунный ответ
• регуляция дифференцировки NK-Т-клеток
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

639

12142

Ансамбль

ENSG00000057657

ENSMUSG00000038151

UniProt

O75626

Q60636

RefSeq (мРНК)

NM_001198
NM_182907

NM_007548

RefSeq (белок)

NP_001189
NP_878911

NP_031574

Расположение (UCSC)Chr 6: 105,99 - 106,11 МбChr 10: 44,44 - 44,53 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

PR-домен цинковый палец-белок 1 или белок-1 созревания, индуцированного В-лимфоцитами ( BLIMP-1 ), представляет собой белок у людей, кодируемый геном PRDM1, расположенным на хромосоме 6q21. [5] BLIMP-1 экспрессируется как в B, так и в T-клетках и играет важную роль в развитии B-клеток и продукции антител . В В-клетках он является регулятором дифференцировки плазматических клеток . В Т-клетках он имеет решающее значение для дифференцировки большинства терминальных эффекторных клеток в CD 4 и CD8 Т-лимфоциты. Дирижабль-1 действует как репрессор из бета-интерферонаЭкспрессия гена (β-IFN). Белок специфически связывается с PRDI (положительный регуляторный элемент I домена) промотора гена β-IFN. Транскрипция этого гена увеличивается при индукции вируса. [6]

Функция [ править ]

BLIMP-1 является важным регулятором дифференцировки плазматических клеток. За исключением наивных В-клеток и В-клеток памяти , все секретирующие антитела клетки экспрессируют BLIMP-1 независимо от их местоположения и истории дифференцировки. В отсутствие BLIMP-1 пролиферирующие В-клетки неспособны дифференцироваться в плазматические клетки, что приводит к серьезному снижению продукции всех изотипов иммуноглобулина . [5]

Повышенная экспрессия белка Blimp-1 в В-лимфоцитах , Т-лимфоцитах , NK-клетках и других клетках иммунной системы приводит к иммунному ответу через пролиферацию и дифференцировку плазматических клеток, секретирующих антитела . Blimp-1 также считается «главным регулятором» гемопоэтических стволовых клеток . [7] [8] Другие клетки иммунной системы, такие как моноциты и гранулоциты периферической крови человека, также экспрессируют BLIMP-1. В моноцитарной клеточной линии сверхэкспрессия BLIMP-1 может приводить к дифференцировке в зрелые макрофаги . BLIMP-1 также играет роль в остеокластогенезе.а также в модуляции дендритных клеток .

Как репрессор транскрипции , BLIMP-1 играет критическую роль в основании клона зародышевых клеток мыши , поскольку его нарушение вызывает блокировку на ранних этапах процесса образования первичных зародышевых клеток. BLIMP-1-дефицитные мутантные эмбрионы образуют плотный кластер примерно из 20 первичных зародышевых клеток, подобных клеткам, которые не могут проявлять характерную миграцию, пролиферацию и последовательную репрессию генов гомеобокса, которые обычно сопровождают спецификацию первичных зародышевых клеток. Эксперименты по отслеживанию генетических клонов показывают, что BLIMP-1-позитивные клетки, происходящие из клеток проксимального заднего эпибласта , действительно являются предшественниками первичных зародышевых клеток с ограниченным клонированием. [9]

Развитие В-клеток [ править ]

Во время развития B-клеток B-клетка может дифференцироваться либо в короткоживущие плазматические клетки, либо в B-клетки зародышевого центра после получения надлежащей активации и совместной стимуляции. BLIMP-1 действует как главный ген, регулирующий транскрипционную сеть, которая регулирует терминальную дифференцировку В-клеток. Экспрессия BLIMP-1 тщательно контролируется, поскольку его преждевременная экспрессия в первичных В-клетках приводит к гибели клеток. Таким образом, выжить и дифференцироваться способны только клетки, которые готовы инициировать транскрипцию, управляемую BLIMP-1. [5] [10]

Развитие Т-клеток [ править ]

BLIMP-1 играет ключевую роль в поддержании нормального гомеостаза Т-клеток . Он регулирует реакцию Т-клеток посредством репрессии цитокина IL-2 в петле отрицательной обратной связи. Активация Т-клеток приводит к выработке ИЛ-2. Затем передача сигналов IL-2 приводит к транскрипции PRDM1, а BLIMP-1 отвечает за репрессию транскрипции гена IL-2. [5]

Истощение Т-лимфоцитов [ править ]

BLIMP-1 помогает продуцированию короткоживущих эффекторных Т-клеток и клонально истощенных Т-клеток. Это также помогает с миграцией Т-клеток из селезенки и лимфатических узлов в периферические ткани. Однако BLIMP-1 не способствует производству долгоживущих эффекторных клеток памяти. BLIMP-1 позволяет продуцировать некоторые более долгоживущие эффекторные клетки памяти, но его отсутствие позволяет генерировать клетки долговременной центральной памяти, которые, как считается, имеют более высокий потенциал пролиферации при вторичном заражении. [11]  

Второй рак после лучевой терапии [ править ]

Исследование ассоциации генома определил два генетических вариаций вблизи гена PRDM1 , которые предсказывают повышенную вероятность развития рака второй после лучевой терапии для лимфомы Ходжкина . [12]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000057657 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038151 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ а б в г Бой М., Зукка Э, Ингирами Г., Бертони Ф. (май 2015 г.). «PRDM1 / BLIMP1: ген-супрессор опухолей при В- и Т-клеточных лимфомах». Лейкемия и лимфома . 56 (5): 1223–8. DOI : 10.3109 / 10428194.2014.953155 . PMID 25115512 . 
  6. ^ "Entrez Gene: PRDM1 PR домен, содержащий 1, с ZNF доменом" .
  7. Перейти ↑ Turner CA, Mack DH, Davis MM (апрель 1994). «Blimp-1, новый белок, содержащий цинковые пальцы, который может управлять созреванием В-лимфоцитов в клетки, секретирующие иммуноглобулин». Cell . 77 (2): 297–306. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (94) 90321-2 . PMID 8168136 . S2CID 46200658 .  
  8. ^ Sciammas R, Davis MM (май 2004). «Модульная природа Blimp-1 в регуляции экспрессии генов во время созревания В-клеток» . Журнал иммунологии . 172 (9): 5427–40. DOI : 10.4049 / jimmunol.172.9.5427 . PMID 15100284 . 
  9. ^ Ohinata Y, Плательщик В, D О'Кэррола, Анселин К, Ono У, Сано М., и др. (Июль 2005 г.). «Blimp1 является критическим детерминантом клона зародышевых клеток у мышей». Природа . 436 (7048): 207–13. Bibcode : 2005Natur.436..207O . DOI : 10,1038 / природа03813 . PMID 15937476 . S2CID 4399840 .  
  10. ↑ Fu SH, Yeh LT, Chu CC, Yen BL, Sytwu HK (июль 2017 г.). «Новые сведения о Blimp-1 в Т-лимфоцитах: дивергентный регулятор клеточной судьбы и эффекторной функции» . Журнал биомедицинских наук . 24 (1): 49. DOI : 10,1186 / s12929-017-0354-8 . PMC 5520377 . PMID 28732506 .  
  11. ↑ Валлийский RM (август 2009 г.). «Дирижабль парит над Т-клеточным иммунитетом» . Иммунитет . 31 (2): 178–80. DOI : 10.1016 / j.immuni.2009.08.005 . PMC 3220184 . PMID 19699168 .  
  12. ↑ Best T, Li D, Skol AD, Kirchhoff T, Jackson SA, Yasui Y и др. (Июль 2011 г.). «Варианты на 6q21 вовлекают PRDM1 в этиологию вызванных терапией вторых злокачественных новообразований после лимфомы Ходжкина» . Природная медицина . 17 (8): 941–3. DOI : 10.1038 / nm.2407 . PMC 3229923 . PMID 21785431 . Краткое резюме - Медицинский центр Чикагского университета .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Хуан С. (июль 1994 г.). «Blimp-1 является мышиным гомологом репрессора транскрипции человека PRDI-BF1». Cell . 78 (1): 9. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (94) 90565-7 . PMID  8033216 . S2CID  34007883 .
  • Мок Б.А., Лю Л., ЛеПаслиер Д., Хуанг С. (октябрь 1996 г.). «Фактор транскрипции BLIMP1 / PRDI-BF1, способствующий созреванию В-лимфоцитов, отображается на D6S447 на хромосоме 6q21-q22.1 человека и в синтенической области хромосомы 10 мыши». Геномика . 37 (1): 24–8. DOI : 10.1006 / geno.1996.0516 . PMID  8921366 .
  • Рен Б., Чи К.Дж., Ким Т.Х., Маниатис Т. (январь 1999 г.). «Репрессия PRDI-BF1 / Blimp-1 опосредуется корепрессорами из семейства белков Groucho» . Гены и развитие . 13 (1): 125–37. DOI : 10.1101 / gad.13.1.125 . PMC  316372 . PMID  9887105 .
  • Анжелин-Дюкло С., Катторетти Дж., Лин К.И., Каламе К. (ноябрь 2000 г.). «Приверженность В-лимфоцитов судьбе плазматических клеток связана с экспрессией Blimp-1 in vivo» . Журнал иммунологии . 165 (10): 5462–71. DOI : 10.4049 / jimmunol.165.10.5462 . PMID  11067898 .
  • Гупта С., Энтони А., Пернис А.Б. (май 2001 г.). «Этап-специфическая модуляция функции IFN-регуляторного фактора 4 с помощью белков цинковых пальцев типа Krüppel» . Журнал иммунологии . 166 (10): 6104–11. DOI : 10.4049 / jimmunol.166.10.6104 . PMID  11342629 .
  • Medina F, Segundo C, Campos-Caro A, González-García I, Brieva JA (март 2002 г.). «Неоднородность, демонстрируемая человеческими плазматическими клетками миндалин, крови и костного мозга, выявляет дифференцированные стадии увеличения зрелости, но локальные профили экспрессии молекул адгезии». Кровь . 99 (6): 2154–61. DOI : 10.1182 / blood.V99.6.2154 . PMID  11877292 .
  • Shaffer AL, Lin KI, Kuo TC, Yu X, Hurt EM, Rosenwald A, et al. (Июль 2002 г.). «Blimp-1 управляет дифференцировкой плазматических клеток, подавляя программу экспрессии гена зрелых В-клеток». Иммунитет . 17 (1): 51–62. DOI : 10.1016 / S1074-7613 (02) 00335-7 . PMID  12150891 .
  • Васанвала Ф.Х., Кусам С., Тони Л.М., Дент А.Л. (август 2002 г.). «Подавление функции AP-1: механизм регуляции экспрессии Blimp-1 и дифференцировки B-лимфоцитов протоонкогеном B-клеточной лимфомы-6» . Журнал иммунологии . 169 (4): 1922–9. DOI : 10.4049 / jimmunol.169.4.1922 . PMID  12165517 .
  • Борсон Н.Д., Лейси М.К., Веттштейн П.Дж. (декабрь 2002 г.). «Измененная экспрессия мРНК Pax5 и Blimp-1 в В-клетках при множественной миеломе» . Кровь . 100 (13): 4629–39. DOI : 10.1182 / blood.V100.13.4629 . PMID  12453881 .
  • Дьёри И., Фейер Г., Гош Н., Сето Э., Райт К.Л. (март 2003 г.). «Идентификация функционально нарушенного репрессора транскрипции фактора 1 связывания позитивного регуляторного домена I в клеточных линиях миеломы» . Журнал иммунологии . 170 (6): 3125–33. DOI : 10.4049 / jimmunol.170.6.3125 . PMID  12626569 .
  • Дьори И., Ву Дж., Фейер Дж., Сето Э., Райт К.Л. (март 2004 г.). «PRDI-BF1 привлекает гистоновую H3-метилтрансферазу G9a для подавления транскрипции». Иммунология природы . 5 (3): 299–308. DOI : 10.1038 / ni1046 . PMID  14985713 . S2CID  33178299 .
  • Lotz C, Mutallib SA, Oehlrich N, Liewer U, Ferreira EA, Moos M, et al. (Июль 2005 г.). «Нацеливание на факторы транскрипции фактора 1, связывающего положительный регуляторный домен I, и факторов транскрипции белка 1, связывающего X-бокс, посредством множественных миеломно-реактивных CTL» . Журнал иммунологии . 175 (2): 1301–9. DOI : 10.4049 / jimmunol.175.2.1301 . PMID  16002735 .
  • Там В., Гомес М., Чадберн А., Ли Дж. В., Чан В. К., Ноулз Д.М. (май 2006 г.). «Мутационный анализ PRDM1 указывает на роль супрессора опухолей в диффузных больших B-клеточных лимфомах» . Кровь . 107 (10): 4090–100. DOI : 10.1182 / кровь-2005-09-3778 . PMID  16424392 .
  • Паскуалуччи Л., Компаньо М., Хулдсворт Дж., Монти С., Грюн А., Нандула С.В. и др. (Февраль 2006 г.). «Инактивация гена PRDM1 / BLIMP1 при диффузной В-клеточной лимфоме» . Журнал экспериментальной медицины . 203 (2): 311–7. DOI : 10,1084 / jem.20052204 . PMC  2118216 . PMID  16492805 .
  • Гонсалес-Гарсия I, Оканья Э., Хименес-Гомес Дж., Кампос-Каро А., Бриева Дж. А. (апрель 2006 г.). «Вызванное иммунизацией нарушение пула плазматических клеток крови человека: прогрессирующее созревание, чувствительность к IL-6 и высокая экспрессия PRDI-BF1 / BLIMP1 являются критическими различиями между антиген-специфическими и неспецифическими плазматическими клетками» . Журнал иммунологии . 176 (7): 4042–50. DOI : 10.4049 / jimmunol.176.7.4042 . PMID  16547239 .
  • Гарсия Дж. Ф., Ронкадор Дж., Гарсия Дж. Ф., Санц А. И., Маэстре Л., Лукас Э. и др. (Апрель 2006 г.). «Экспрессия PRDM1 / BLIMP-1 при множественных В- и Т-клеточных лимфомах». Haematologica . 91 (4): 467–74. PMID  16585013 .
  • Лим Дж., Хао Т., Шоу К., Патель А.Дж., Сабо Дж., Руаль Дж. Ф. и др. (Май 2006 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Cell . 125 (4): 801–14. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.03.032 . PMID  16713569 . S2CID  13709685 .

Внешние ссылки [ править ]

  • PRDM1 + ​​белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • FactorBook PRDM1

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .