Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
PRDM2
Белок PRDM2 PDB 2JV0.png
Доступные конструкции
PDBПоиск человеческого UniProt: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

2JV0 , 2QPW

Идентификаторы
ПсевдонимыPRDM2 , HUMHOXY1, KMT8, MTB-ZF, RIZ, RIZ1, RIZ2, PR домен 2, PR / SET домен 2, KMT8A
Внешние идентификаторыOMIM : 601196 MGI : 107628 HomoloGene : 40822 GeneCards : PRDM2
Расположение гена ( человек )
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человека) [1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение PRDM2
Геномное расположение PRDM2
Группа1п36.21Начинать13 700 198 п.н. [1]
Конец13 825 079 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 4 (мышь)
Chr.Хромосома 4 (мышь) [2]
Хромосома 4 (мышь)
Геномное расположение PRDM2
Геномное расположение PRDM2
Группа4 E1 | 4 76,84 смНачинать143 107 391 п.н. [2]
Конец143 212 995 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE PRDM2 203056 s в формате fs.png

PBB GE PRDM2 216433 s в формате fs.png

PBB GE PRDM2 203057 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• ГО: 0001131, ГО: 0001151, ГО: 0001130, ГО: 0001204 ДНК-связывающий фактор активности транскрипции
• метилтрансферазы активности
• трансферазной активности
• связывания ДНК
• ион цинка связывания
• гистонов-лизина N-метилтрансферазы активность
• ион металла связывания
• нуклеиновой кислоты связывание
• Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области транскрипции РНК-полимеразы II
• GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205, ДНК-связывающая активность активатора транскрипции, специфическая
для РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II
• связывание хроматина с ДНК
• связывание с последовательностью ДНК
Сотовый компонент• ядро
• аппарат Гольджи
Биологический процесс• метилирование гистонового лизина
• метилирование
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• определение продолжительности жизни взрослых
• транскрипция, ДНК-шаблон
• транскрипция РНК-полимеразой II
• позитивная регуляция транскрипции РНК-полимеразой II
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

7799

110593

Ансамбль

ENSG00000116731

ENSMUSG00000057637

UniProt

Q13029

н / д

RefSeq (мРНК)

NM_001007257
NM_001135610
NM_012231
NM_015866

NM_001081355
NM_001256380

RefSeq (белок)

NP_001007258
NP_001129082
NP_036363
NP_056950

н / д

Расположение (UCSC)Chr 1: 13,7 - 13,83 МбChr 4: 143.11 - 143.21 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

PR - домен цинковый палец белка 2 представляет собой белок , который у человека кодируется PRDM2 гена . [5] [6]

Функция [ править ]

Этот ген-супрессор опухоли является членом суперсемейства ядерных гистонов / протеин-метилтрансфераз. Он кодирует белок цинкового пальца, который может связываться с белком ретинобластомы, рецептором эстрогена и TPA-чувствительным элементом (MTE) гена гемоксигеназы-1. Хотя функции этого белка не были полностью охарактеризованы, он может (1) играть роль в регуляции транскрипции во время дифференцировки нейронов и патогенезе ретинобластомы, (2) действовать как активатор транскрипции гена гемоксигеназы-1 и ( 3) быть специфическим эффектором действия эстрогенов. Для этого гена обнаружены три варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. [6]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что PRDM2 взаимодействует с рецептором эстрогена альфа [7] и белком ретинобластомы . [5]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000116731 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000057637 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ a b Buyse IM, Shao G, Huang S (май 1995 г.). «Белок ретинобластомы связывается с RIZ, белком цинкового пальца, который имеет общий эпитоп с белком E1A аденовируса» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (10): 4467–71. Bibcode : 1995PNAS ... 92.4467B . DOI : 10.1073 / pnas.92.10.4467 . PMC 41965 . PMID 7538672 .  
  6. ^ a b «Ген Entrez: PRDM2 PR-домен, содержащий 2, с ZNF-доменом» .
  7. ^ Abbondanza С, Н Медичи, Nigro В, Росси В, галло л, Piluso G, Belsito А, Россиньо А, Bontempo Р, Puca А.А., Молинари А.М., Moncharmont В, Puca Г.А. (март 2000). «Взаимодействующий с ретинобластомой белок цинкового пальца RIZ является последующим эффектором действия эстрогена» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (7): 3130–5. DOI : 10.1073 / pnas.050015697 . PMC 16204 . PMID 10706618 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Шапиро В.С., Ли П., Виното А. (октябрь 1995 г.). «Идентификация и клонирование кДНК G3B, кодирующей 3'-сегмент белка, связывающегося с GATA-3». Джин . 163 (2): 329–30. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (95) 00420-B . PMID  7590293 .
  • Мураоса Ю., Такахаши К., Йошизава М., Шибахара С. (февраль 1996 г.). «Клонирование кДНК нового белка, содержащего два домена« цинковые пальцы », которые могут функционировать как фактор транскрипции для гена гемоксигеназы-1 человека» . Европейский журнал биохимии / FEBS . 235 (3): 471–9. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1996.00471.x . PMID  8654390 .
  • Буйсе И.М., Такахаши Э.И., Хуанг С. (май 1996 г.). «Физическое картирование ретинобластомы, взаимодействующей с геном цинкового пальца RIZ с D1S228 на хромосоме 1p36». Геномика . 34 (1): 119–21. DOI : 10.1006 / geno.1996.0249 . PMID  8661032 .
  • Лю Л., Шао Г., Стил-Перкинс Г., Хуанг С. (январь 1997 г.). «Ретинобластома, взаимодействующая с геном цинкового пальца RIZ, продуцирует продукт без домена PR через внутренний промотор» . Журнал биологической химии . 272 (5): 2984–91. DOI : 10.1074 / jbc.272.5.2984 . PMID  9006946 .
  • Се М., Шао Дж., Буйсе И.М., Хуан С. (октябрь 1997 г.). «Репрессия транскрипции, опосредованная геном цинкового пальца PR домена RIZ» . Журнал биологической химии . 272 (42): 26360–6. DOI : 10.1074 / jbc.272.42.26360 . PMID  9334209 .
  • He L, Yu JX, Liu L, Buyse IM, Wang MS, Yang QC, Nakagawara A, Brodeur GM, Shi YE, Huang S. (октябрь 1998 г.). «RIZ1, но не альтернативный продукт RIZ2 того же гена, недоэкспрессируется при раке груди, и принудительная экспрессия RIZ1 вызывает остановку клеточного цикла G2-M и / или апоптоз». Исследования рака . 58 (19): 4238–44. PMID  9766644 .
  • Аббонданза С., Медичи Н., Нигро В., Росси В., Галло Л., Пилусо Г., Белсито А., Роскиньо А., Бонтемпо П., Пука А.А., Молинари А.М., Моншармон Б., Пука Г.А. (март 2000 г.). «Взаимодействующий с ретинобластомой белок цинкового пальца RIZ является последующим эффектором действия эстрогена» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (7): 3130–5. DOI : 10.1073 / pnas.050015697 . PMC  16204 . PMID  10706618 .
  • Диас Нето Э., Корреа Р.Г., Верджовски-Алмейда С., Брионес М.Р., Нагаи М.А., да Силва В., Заго М.А., Бордин С., Коста Ф.Ф., Голдман Г.Х., Карвалью А.Ф., Мацукума А., Байя Г.С., Симпсон Д.Х., Брунштейн А., де Оливейра П.С., Бучер П., Джонженель К.В., О'Хара М.Дж., Соарес Ф., Брентани Р.Р., Рейс Л.Ф., де Соуза С.Дж., Симпсон А.Дж. (март 2000 г.). «Shotgun секвенирование человеческого транскриптома с помощью тегов последовательности, экспрессируемой ORF» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (7): 3491–6. Bibcode : 2000PNAS ... 97.3491D . DOI : 10.1073 / pnas.97.7.3491 . PMC  16267 . PMID  10737800 .
  • Du Y, Carling T, Fang W, Piao Z, Sheu JC, Huang S (ноябрь 2001 г.). «Гиперметилирование при раке человека гена-супрессора опухоли RIZ1, члена суперсемейства гистон / протеин-метилтрансфераза». Исследования рака . 61 (22): 8094–9. PMID  11719434 .
  • Сасаки О, Мегуро К., Тохмия Ю., Фунато Т., Шибахара С., Сасаки Т. (март 2002 г.). «Нуклеотидные изменения гена цинкового пальца, взаимодействующего с белком ретинобластомы, RIZ, при лейкемии человека» . Журнал экспериментальной медицины Тохоку . 196 (3): 193–201. DOI : 10.1620 / tjem.196.193 . PMID  12002276 .
  • Poetsch M, Dittberner T, Woenckhaus C (май 2002 г.). «Мутации сдвига рамки RIZ, но нет точечных мутаций в экзонах RIZ1 в злокачественных меланомах с делециями в 1p36» . Онкоген . 21 (19): 3038–42. DOI : 10.1038 / sj.onc.1205457 . PMID  12082534 .
  • Сасаки О, Мегуро К., Тохмия Й., Фунато Т., Шибахара С., Сасаки Т. (декабрь 2002 г.). «Измененная экспрессия гена цинкового пальца, взаимодействующего с белком ретинобластомы, RIZ, при лейкемии человека» . Британский журнал гематологии . 119 (4): 940–8. DOI : 10.1046 / j.1365-2141.2002.03972.x . PMID  12472571 . S2CID  21560813 .
  • Токумару Ю., Номото С., Херонимо С., Энрике Р., Харден С., Тринк Б., Сидрански Д. (октябрь 2003 г.). «Биаллельная инактивация гена RIZ1 при раке желудка человека» . Онкоген . 22 (44): 6954–8. DOI : 10.1038 / sj.onc.1206403 . PMID  14534544 .
  • Ким К.С., Гэн Л., Хуанг С. (ноябрь 2003 г.). «Инактивация гистон-метилтрансферазы мутациями при раке человека». Исследования рака . 63 (22): 7619–23. PMID  14633678 .
  • Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кантли Л.С., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . DOI : 10.1073 / pnas.0404720101 . PMC  514446 . PMID  15302935 .
  • Pan KF, Lu YY, Liu WG, Zhang L, You WC (сентябрь 2004 г.). «Выявление мутаций сдвига рамки считывания RIZ при раке желудка с микросателлитной нестабильностью» . Всемирный журнал гастроэнтерологии . 10 (18): 2719–22. DOI : 10,3748 / wjg.v10.i18.2719 . PMC  4572200 . PMID  15309726 .
  • Росси М., Аббонданза С., Д'Арканджело А., Газзерро П., Медичи Н., Моншармон Б., Пука, Джорджия (ноябрь 2004 г.). «Zn-finger домен белка RIZ способствует пролиферации клеток MCF-7». Письма о раке . 215 (2): 229–37. DOI : 10.1016 / j.canlet.2004.05.014 . PMID  15488642 .
  • Грундберг Э., Карлинг Т., Брандстрем Х., Хуанг С., Рибом Э.Л., Юнггрен О., Маллмин Х., Киндмарк А (декабрь 2004 г.). «Полиморфизм делеции в гене RIZ, коактиваторе рецептора женских половых стероидных гормонов, демонстрирует пониженную реакцию на эстроген in vitro и ассоциируется с низкой минеральной плотностью костей у молодых шведских женщин» . Журнал клинической эндокринологии и метаболизма . 89 (12): 6173–8. DOI : 10.1210 / jc.2004-0403 . PMID  15579774 .

Внешние ссылки [ править ]

  • PRDM2 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .

  • v
  • т
  • е