Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с PRDX2 )
Перейти к навигации Перейти к поиску
PRDX2
Белок PRDX2 PDB 1qmv.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1QMV

Идентификаторы
ПсевдонимыPRDX2 , HEL-S-2a, NKEF-B, NKEFB, PRP, PRX2, PRXII, PTX1, TDPX1, TPX1, TSA, пероксиредоксин 2
Внешние идентификаторыOMIM : 600538 MGI : 109486 HomoloGene : 21182 GeneCards : PRDX2
Расположение гена ( человек )
Хромосома 19 (человек)
Chr.Хромосома 19 (человека) [1]
Хромосома 19 (человек)
Геномное расположение PRDX2
Геномное расположение PRDX2
Группа19п13.13Начинать12 796 820 п.н. [1]
Конец12 801 800 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 8 (мышь)
Chr.Хромосома 8 (мышь) [2]
Хромосома 8 (мышь)
Геномное расположение PRDX2
Геномное расположение PRDX2
Группа8 C3 | 8 41,4 смНачинать84 969 587 п.н. [2]
Конец84 974 834 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE PRDX2 39729 в ​​формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• Оксидоредуктаза активность
• антиоксидантная активность
• пероксиредоксин активность
• Активность пероксидазы
• GO: 0001948 связывание белка
• тиоредоксинредуктаза активность пероксидазы
Сотовый компонент• цитоплазма
• внеклеточная экзосома
• цитозоль
Биологический процесс• регуляция апоптотического процесса
• негативная регуляция апоптотического процесса
• окислительно-восстановительный процесс
• катаболический процесс перекиси водорода
• окислительно-восстановительный гомеостаз клеток
• ответ на окислительный стресс
• клеточный ответ на окислительный стресс
• удаление супероксидных радикалов
• активация активности MAPK
• вовлечен респираторный взрыв при воспалительной реакции
• регуляция процесса метаболизма перекиси водорода
• позитивная регуляция свертывания крови
• негативная регуляция сигнального пути, опосредованного липополисахаридами
• отрицательная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB
• реакция на липополисахарид
• пролиферация Т-клеток
• процесс метаболизма перекиси водорода
• негативная регуляция дифференцировки Т-клеток
• развитие тимуса
• гомеостаз количества клеток
• негативная регуляция метаболического процесса активных форм кислорода
• негативная регуляция внешнего апоптотического сигнального пути
• негативная регуляция внешнего апоптотического сигнального пути в отсутствие лиганда
• активация лейкоцитов
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

7001

21672

Ансамбль

ENSG00000167815

ENSMUSG00000005161

UniProt

P32119

Q61171

RefSeq (мРНК)

NM_181738
NM_005809
NM_181737

NM_011563
NM_001317385

RefSeq (белок)

NP_005800

NP_001304314
NP_035693

Расположение (UCSC)Chr 19: 12,8 - 12,8 МбChr 8: 84.97 - 84.97 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Пероксиредоксин-2 представляет собой белок , который у человека кодируется PRDX2 гена . [5] [6]

Этот ген кодирует член семейства антиоксидантных ферментов пероксиредоксинов , которые восстанавливают перекись водорода и алкилгидропероксиды. Кодируемый белок может играть антиоксидантную защитную роль в клетках и может способствовать противовирусной активности CD8 (+) Т-клеток. Этот белок может иметь пролиферативный эффект и играть роль в развитии или прогрессировании рака. Кристаллическая структура этого белка была разрешена до 0,27 нм (= 2,7 ангстрем). Для этого гена были идентифицированы варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы. [6]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000167815 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000005161 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Пал P, R Бергер, Харт I, Чэ HZ, Рхи SG, Patterson D (август 1995). «Локализация TDPX1, человеческого гомолога дрожжевого тиоредоксин-зависимого гена пероксидредуктазы (TPX), в хромосоме 13q12». Геномика . 26 (3): 602–6. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (95) 80183-M . PMID 7607688 . 
  6. ^ a b «Ген Энтреза: пероксиредоксин 2 PRDX2» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Яо Ю., Тейлор М., Дэйви Ф., Рени, Эйтон Дж., Кут П., Чен Икс, Ян С.Д. и Ганн-Мур Ф.Дж. (2007). «Взаимодействие связывающей амилоид алкогольдегидрогеназы / Aβ опосредует повышающую регуляцию пероксиредоксина II в мозге пациентов с болезнью Альцгеймера и на модели трансгенных мышей с болезнью Альцгеймера». Молекулярная и клеточная неврология . 35 (2): 377–82. DOI : 10.1016 / j.mcn.2007.03.013 . PMID  17490890 . S2CID  2415008 .CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  • Расмуссен Х. Х., Ван Дамм Дж., Пуйпе М. и др. (1993). «Микропоследовательности 145 белков, записанные в двумерной базе данных гелевых белков нормальных эпидермальных кератиноцитов человека». Электрофорез . 13 (12): 960–9. DOI : 10.1002 / elps.11501301199 . PMID  1286667 . S2CID  41855774 .
  • Шау Х, Баттерфилд Л. Х., Чиу Р., Ким А. (1994). «Клонирование и анализ последовательности генов-кандидатов человеческого фактора увеличения естественных киллеров». Иммуногенетика . 40 (2): 129–34. DOI : 10.1007 / BF00188176 . PMID  8026862 . S2CID  7778993 .
  • Чае Х.З., Робисон К., Пул Л.Б. и др. (1994). «Клонирование и секвенирование тиол-специфического антиоксиданта из мозга млекопитающих: алкилгидропероксидредуктаза и тиол-специфический антиоксидант определяют большое семейство антиоксидантных ферментов» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 91 (15): 7017–21. DOI : 10.1073 / pnas.91.15.7017 . PMC  44329 . PMID  8041738 .
  • Лим Ю.С., Ча М.К., Юн С.Х. и др. (1994). «Очистка и характеристика тиол-специфического антиоксидантного белка из красных кровяных телец человека: новый тип антиоксидантного белка». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 199 (1): 199–206. DOI : 10.1006 / bbrc.1994.1214 . PMID  8123012 .
  • Лим Ю.С., Ча МК, Ким Х.К., Ким И.Х. (1994). «Тиол-специфический антиоксидантный белок из человеческого мозга: клонирование гена и анализ консервативных цистеиновых областей». Джин . 140 (2): 279–84. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90558-4 . PMID  8144038 .
  • Голаз О., Хьюз Г.Дж., Фрутигер С. и др. (1994). «Карты белков плазмы и красных кровяных телец: обновление 1993 года». Электрофорез . 14 (11): 1223–31. DOI : 10.1002 / elps.11501401183 . PMID  8313871 . S2CID  21447827 .
  • Ча МК, Ким И.Х. (1996). «Глутатион-связанная тиолпероксидазная активность человеческого сывороточного альбумина: возможная антиоксидантная роль сывороточного альбумина в плазме крови». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 222 (2): 619–25. DOI : 10.1006 / bbrc.1996.0793 . PMID  8670254 .
  • Джи Х., Рид Г.Е., Мориц Р.Л. и др. (1997). «Двумерная база данных гелей белков карциномы толстой кишки человека». Электрофорез . 18 (3–4): 605–13. DOI : 10.1002 / elps.1150180344 . PMID  9150948 . S2CID  25454450 .
  • Ван З.М., Лю Ц., Дзиарски Р. (2000). «Хемокины являются основными провоспалительными медиаторами в человеческих моноцитах, активируемых Staphylococcus aureus, пептидогликаном и эндотоксином» . J. Biol. Chem . 275 (27): 20260–7. DOI : 10.1074 / jbc.M909168199 . PMID  10751418 .
  • Ча МК, Юн СН, Ким И.Х. (2000). «Взаимодействие человеческого тиол-специфического антиоксидантного белка 1 с плазматической мембраной эритроцитов». Биохимия . 39 (23): 6944–50. DOI : 10.1021 / bi000034j . PMID  10841776 .
  • Шредер Э., Литтлчайлд Я.А., Лебедев А.А. и др. (2000). «Кристаллическая структура декамерного 2-Cys пероксиредоксина из эритроцитов человека при разрешении 1,7 A». Структура . 8 (6): 605–15. DOI : 10.1016 / S0969-2126 (00) 00147-7 . PMID  10873855 .
  • Харрис Дж. Р., Шредер Э., Исупов М. Н. и др. (2001). «Сравнение декамерной структуры пероксиредоксина-II методами просвечивающей электронной микроскопии и рентгеновской кристаллографии». Биохим. Биофиз. Acta . 1547 (2): 221–34. DOI : 10.1016 / s0167-4838 (01) 00184-4 . PMID  11410278 .
  • Но Д.Й., Ан С.Дж., Ли Р.А. и др. (2001). «Сверхэкспрессия пероксиредоксина при раке груди человека». Anticancer Res . 21 (3B): 2085–90. PMID  11497302 .
  • Ким С.Х., Фунтулакис М., Кэрнс Н., Любек Г. (2002). «Уровни белка подтипов пероксиредоксина человека в головном мозге пациентов с болезнью Альцгеймера и синдромом Дауна». J. Neural Transm. Дополнение (61): 223–35. DOI : 10.1007 / 978-3-7091-6262-0_18 . ISBN 978-3-211-83704-7. PMID  11771746 .
  • Рабийо Т., Хеллер М., Гаснье Ф. и др. (2002). «Протеомический анализ клеточного ответа на окислительный стресс. Доказательства переокисления пероксиредоксинов in vivo в их активном центре» . J. Biol. Chem . 277 (22): 19396–401. DOI : 10.1074 / jbc.M106585200 . PMID  11904290 .
  • Анахори Т., Дешо Х., Беннес Р. и др. (2002). «Идентификация новых белков в фолликулярной жидкости зрелых фолликулов человека». Электрофорез . 23 (7–8): 1197–202. DOI : 10.1002 / 1522-2683 (200204) 23: 7/8 <:: АИД тысяча сто девяносто семь-ELPS1197> 3.0.CO; 2-2 . PMID  11981869 .
  • Шен К., Натан С. (2002). «Неизбыточная антиоксидантная защита множественными пероксиредоксинами с двумя цистеинами в клетках рака простаты человека» . Мол. Med . 8 (2): 95–102. DOI : 10.1007 / BF03402079 . PMC  2039972 . PMID  12080185 .
  • Гейбен-Линн Р., Курсар М., Браун Н.В. и др. (2003). «Противовирусная активность ВИЧ-1 рекомбинантных факторов, усиливающих естественные клетки-киллеры, NKEF-A и NKEF-B, членов семейства пероксиредоксинов» . J. Biol. Chem . 278 (3): 1569–74. DOI : 10.1074 / jbc.M209964200 . PMID  12421812 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • v
  • т
  • е