Prolargin является белком , который в организме человека кодируется PRELP гена . [5]
PRELP | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | PRELP , MST161 , MSTP161, SLRR2A, богатый пролином / аргинином конечный белок с высоким содержанием лейцина, повторяющийся белок с высоким содержанием пролина и аргинина | ||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | OMIM : 601914 MGI : 2151110 HomoloGene : 2041 GeneCards : PRELP | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||||||||||
Разновидность | Человек | Мышь | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ансамбль |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (белок) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Расположение (UCSC) | Chr 1: 203.48 - 203.49 Мб | Chr 1: 133.91 - 133.92 Мб | |||||||||||||||||||||||
PubMed поиск | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||
|
Кодируемый этим геном белок представляет собой богатый лейцином повторяющийся белок, присутствующий во внеклеточном матриксе соединительной ткани . Этот белок функционирует как молекула, прикрепляющая базальные мембраны к подлежащей соединительной ткани. Было показано, что этот белок связывает коллаген типа I с базальными мембранами и коллаген типа II с хрящом . Он также связывает базальную мембрану гепарансульфата, протеогликана перлекана . Предполагается, что этот белок участвует в патогенезе прогерии Хатчинсона-Гилфорда (HGP), которая, как сообщается, лишена связывания коллагена в базальных мембранах и хрящах. Наблюдались альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие один и тот же белок. [5]
Рекомендации
- ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000188783 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041577 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ а б «Ген Entrez: PRELP, богатый пролином / аргинином, концевой, богатый лейцином повторяющийся белок» .
дальнейшее чтение
- Льюис М (2003). «PRELP, коллаген и теория прогерии Хатчинсона-Гилфорда». Aging Res. Rev . 2 (1): 95–105. DOI : 10.1016 / S1568-1637 (02) 00044-2 . PMID 12437997 . S2CID 24380511 .
- Bengtsson E, Neame PJ, Heinegård D, Sommarin Y (1995). «Первичная структура основного белка с высоким содержанием лейцина, PRELP, обнаруженного в соединительных тканях» . J. Biol. Chem . 270 (43): 25639–44. DOI : 10.1074 / jbc.270.43.25639 . PMID 7592739 .
- Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов» . Genome Res . 6 (9): 791–806. DOI : 10.1101 / gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
- Гровер Дж., Чен XN, Коренберг Дж. Р. и др. (1997). «Генная организация, расположение хромосом и экспрессия матричного белка массой 55 кДа (PRELP) суставного хряща человека». Геномика . 38 (2): 109–17. DOI : 10.1006 / geno.1996.0605 . PMID 8954791 .
- Гровер Дж, Рафли П.Дж. (1999). «Характеристика промотора гена богатого пролином / аргинином конца белка с богатым лейцином повтора (PRELP) человека и идентификация репрессорного элемента» . Biochem. Дж . 336 (1): 77–82. DOI : 10.1042 / bj3360077 . PMC 1219844 . PMID 9806887 .
- Бенгтссон Э., Моргелин М., Сасаки Т. и др. (2002). «Богатый лейцином повторяющийся белок PRELP связывает перлекан и коллагены и может функционировать как якорь базальной мембраны» . J. Biol. Chem . 277 (17): 15061–8. DOI : 10.1074 / jbc.M108285200 . PMID 11847210 .
- Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK и др. (2002). «Анализ экспрессируемой последовательности меток человеческого RPE / сосудистой оболочки для проекта NEIBank: более 6000 неизбыточных транскриптов, новые гены и варианты сплайсинга». Мол. Vis . 8 : 205–20. PMID 12107410 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
- Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID 14702039 .
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
- Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети белок-белкового взаимодействия человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . DOI : 10,1038 / природа04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
- Джонсон Дж. М., Молодой Т. Л., Рада Дж. А. (2006). «Малые протеогликаны с богатыми лейцином повторами (SLRP) в склере человека: идентификация избыточных уровней PRELP». Мол. Vis . 12 : 1057–66. PMID 17093390 .
- Grover J, Lee ER, Mounkes LC и др. (2007). «Последствия избыточной экспрессии PRELP на коже». Matrix Biol . 26 (2): 140–3. DOI : 10.1016 / j.matbio.2006.10.005 . PMID 17123807 .