Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
"AD4" перенаправляется сюда. Для тендера на эсминец класса Dobbin см. USS Whitney (AD-4) . Для года см. AD 4 .
PSEN2
Идентификаторы
ПсевдонимыПресенилин-2 , AD3L, AD4, CMD1V, PS2, STM2, пресенилин 2
Внешние идентификаторыOMIM: 600759 MGI: 109284 HomoloGene: 386 GeneCard: PSEN2
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человека) [1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение для PSEN2
Геномное расположение для PSEN2
Группа1q42.13Начинать226 870 184 п.н. [1]
Конец226 896 105 п.н. [1]
Расположение гена (Мышь)
Хромосома 1 (мышь)
Chr.Хромосома 1 (мышь) [2]
Хромосома 1 (мышь)
Геномное расположение для PSEN2
Геномное расположение для PSEN2
Группа1 H4 | 1 84,19 смНачинать180 227 004 п.н. [2]
Конец180 263 438 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE PSEN2 204261 s в формате fs.png

PBB GE PSEN2 211373 s в формате fs.png

PBB GE PSEN2 204262 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов
Молекулярная функция• эндопептидазы активность
• пептидаза активность
• ГО: связывание белка 0001948
• гидролазы активности
• аспарагиновая эндопептидазная активность, внутримембранные раскалывания
• эндопептидаза активность аспарагинового типа
Сотовый компонент• неотъемлемый компонент мембраны
• центросому
• Гольджи
• эндоплазматический ретикулум мембраны
• мембраны
• Гольджи мембраны
• клеточной мембраны
• неотъемлемый компонент плазматической мембраны
• нейрональные клетки тела
• ядерная внутренняя мембрана
• Z диск
• эндоплазматический ретикулум
• перинуклеарной область цитоплазмы
• кинетохор
• митохондриальная внутренняя мембрана
• лизосомальная мембрана
• клеток коры головного мозга
• клеточной поверхности
• аксона
• конус роста
• нервно-мышечное соединение
• цилиарный корешок
• дендритный стержень
• мембранный плот
• клеточное ядро
• ранняя эндосома
• синаптический пузырек
• апикальная плазматическая мембрана
• макромолекулярный комплекс
• синаптическая мембрана
• неотъемлемый компонент пресинаптической мембраны
• внутриклеточный
Биологический процесс• Сигнальный путь Notch
• Передача внутриклеточного сигнала GO: 0007243
• ответ на гипоксию
• сигнальный путь рецептора эфрина
• процессинг белка
• GO: 0048554 положительная регуляция каталитической активности
• негативная регуляция апоптотического процесса
• метаболический процесс бета-амилоида
• протеолиз
• эктодомен мембранного белка протеолиз
• протеолиз внутриклеточного домена мембранного белка
• позитивная регуляция апоптотического процесса
• процессинг рецептора Notch
• транспорт ионов кальция
• Катаболический процесс белка-предшественника амилоида
• Процессинг рецептора Notch, лиганд-зависимый
• Регулирование импорта кальция в митохондрии
• Привязка мембраны митохондрии к эндоплазматическому ретикулуму
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

5664

19165

Ансамбль

ENSG00000143801

ENSMUSG00000010609

UniProt

P49810

Q61144

RefSeq (мРНК)

NM_000447
NM_012486

NM_001128605
NM_011183

RefSeq (белок)

NP_000438
NP_036618

NP_001122077
NP_035313

Расположение (UCSC)Chr 1: 226,87 - 226,9 МбChr 1: 180.23 - 180.26 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Пресенилин-2 представляет собой белок , который (в организме человека) кодируется пресенилин-2 гена . [5]

Функция [ править ]

Пациенты с болезнью Альцгеймера (БА) с наследственной формой заболевания несут мутации в протеинах пресенилина ( PSEN1 ; PSEN2) или в протеине-предшественнике амилоида (APP). Эти связанные с болезнью мутации приводят к увеличению выработки более длинной формы бета-амилоида (основного компонента отложений амилоида, обнаруживаемого в мозге при БА). Предполагается, что пресенилины регулируют процессинг АРР за счет своего воздействия на гамма-секретазу , фермент, который расщепляет АРР. Также считается, что пресенилины участвуют в расщеплении рецептора Notch , так что они либо непосредственно регулируют активность гамма-секретазы, либо сами являются протеазами.ферменты. Были идентифицированы два альтернативных транскрипта PSEN2. [6]

В меланоцитарных клетках экспрессия гена PSEN2 может регулироваться MITF . [7]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что PSEN2 взаимодействует с:

  • BCL2-подобный 1 , [8]
  • CAPN1 , [9]
  • CIB1 , [10]
  • Кальсенилин , [11] [12]
  • FHL2 , [13]
  • ЛНБ , [14]
  • KCNIP4 , [15]
  • Никастрин , [16] [17] и
  • UBQLN1 . [18]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000143801 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000010609 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Леви-Лахада Е, Wasco Вт, Poorkaj Р, Романо Д.М., Осима Дж, Pettingell WH, Ю. CE, Jondro PD, Шмидт Д., Ван К (сентябрь 1995 года). «Ген-кандидат в семейный локус болезни Альцгеймера на хромосоме 1». Наука . 269 (5226): 973–977. Bibcode : 1995Sci ... 269..973L . DOI : 10.1126 / science.7638622 . PMID 7638622 . S2CID 27296868 .  
  6. ^ «Энтрез Ген: PSEN2 пресенилин 2 (болезнь Альцгеймера 4)» .
  7. ^ Хоек К.С., Шлегель NC, Eichhoff ОМ, Уидмер Д.С., Преториус С, Эйнарсон ТАК, Valgeirsdottir S, Bergsteinsdottir К, Schepsky А, Dummer Р, Steingrimsson Е (2008). «Новые мишени MITF идентифицированы с использованием двухэтапной стратегии ДНК-микрочипов» . Pigment Cell Melanoma Res . 21 (6): 665–676. DOI : 10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x . PMID 19067971 . 
  8. ^ Passer BJ, Пеллегрини L, P Vito, Ganjei JK, D'Adamio L (август 1999). «Взаимодействие пресенилина-1 и пресенилина-2 болезни Альцгеймера с Bcl-X (L). Потенциальная роль в модулировании порога гибели клеток» . J. Biol. Chem . 274 (34): 24007–13. DOI : 10.1074 / jbc.274.34.24007 . PMID 10446169 . 
  9. ^ Shinozaki К, Маруяма К, Кумэ Н, Томита Т, Saido ТС, Iwatsubo Т, Обата К (май 1998 г.). «Петлевой домен пресенилина 2 взаимодействует с С-концевой областью мю-кальпаина». Int. J. Mol. Med . 1 (5): 797–9. DOI : 10.3892 / ijmm.1.5.797 . PMID 9852298 . 
  10. ^ Стейблер С.М., Ostrowski Л.Л., Яницкий С.М., Монтейро MJ (июнь 1999). «Миристоилированный кальций-связывающий белок, который предпочтительно взаимодействует с белком пресенилин 2, вызываемым болезнью Альцгеймера» . J. Cell Biol . 145 (6): 1277–92. DOI : 10,1083 / jcb.145.6.1277 . PMC 2133148 . PMID 10366599 .  
  11. ^ Баксб JD, Choi EK, Л Y, Lilliehook C, Crowley AC, Merriam DE, Wasco W (октябрь 1998). «Кальсенилин: кальций-связывающий белок, который взаимодействует с пресенилинами и регулирует уровни фрагмента пресенилина». Nat. Med . 4 (10): 1177–81. DOI : 10,1038 / 2673 . PMID 9771752 . S2CID 10799492 .  
  12. ↑ Choi EK, Zaidi NF, Miller JS, Crowley AC, Merriam DE, Lilliehook C, Buxbaum JD, Wasco W (июнь 2001 г.). «Кальсенилин является субстратом для каспазы-3, которая предпочтительно взаимодействует с С-концевым фрагментом пресенилина 2, связанным с семейной болезнью Альцгеймера» . J. Biol. Chem . 276 (22): 19197–204. DOI : 10.1074 / jbc.M008597200 . PMID 11278424 . 
  13. ^ Танахаши H, Tabira T (сентябрь 2000). «Связанный с болезнью Альцгеймера пресенилин 2 взаимодействует с DRAL, белком LIM-домена» . Гм. Мол. Genet . 9 (15): 2281–9. DOI : 10.1093 / oxfordjournals.hmg.a018919 . PMID 11001931 . 
  14. ^ Zhang W, Хан SW, McKeel DW, Goate А, У JY (февраль 1998). «Взаимодействие пресенилинов с филаминовым семейством актин-связывающих белков» . J. Neurosci . 18 (3): 914–22. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.18-03-00914.1998 . PMC 2042137 . PMID 9437013 .  
  15. ^ Морохаш Y, Хатан N, S Ohya, Такикав Р, Т Watabiki, Такасуги N, Имайдзая Y, Томит Т, Iwatsubo Т (апрель 2002 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика CALP / KChIP4, нового белка EF-hand, взаимодействующего с пресенилином 2 и субъединицей потенциалзависимого калиевого канала Kv4» . J. Biol. Chem . 277 (17): 14965–75. DOI : 10.1074 / jbc.M200897200 . PMID 11847232 . 
  16. Перейти ↑ Lee SF, Shah S, Li H, Yu C, Han W, Yu G (ноябрь 2002 г.). «APH-1 млекопитающих взаимодействует с пресенилином и никастрином и необходим для внутримембранного протеолиза белка-предшественника бета-амилоида и Notch» . J. Biol. Chem . 277 (47): 45013–9. DOI : 10.1074 / jbc.M208164200 . PMID 12297508 . 
  17. ^ Yu G, Nishimura M, Arawaka S, Levitan D, Zhang L, Tandon A, Song YQ, Rogaeva E, Chen F, Kawarai T, Supala A, Levesque L, Yu H, Yang DS, Holmes E, Milman P, Liang Y, Zhang DM, Xu DH, Sato C, Rogaev E, Smith M, Janus C, Zhang Y, Aebersold R, Farrer LS, Sorbi S, Bruni A, Fraser P, St George-Hyslop P (сентябрь 2000 г.). «Никастрин модулирует опосредованную пресенилином передачу сигнала notch / glp-1 и процессинг бетаAPP». Природа . 407 (6800): 48–54. Bibcode : 2000Natur.407 ... 48Y . DOI : 10.1038 / 35024009 . PMID 10993067 . S2CID 4339220 .  
  18. ↑ Mah AL, Perry G, Smith MA, Monteiro MJ (ноябрь 2000 г.). «Идентификация убиквилина, нового пресенилинового интерактора, который увеличивает накопление пресенилинового белка» . J. Cell Biol . 151 (4): 847–62. DOI : 10,1083 / jcb.151.4.847 . PMC 2169435 . PMID 11076969 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Cruts M, Ван Broeckhoven C (1998). «Мутации пресенилина при болезни Альцгеймера». Гм. Мутат . 11 (3): 183–190. DOI : 10.1002 / (SICI) 1098-1004 (1998) 11: 3 <183 :: AID-HUMU1> 3.0.CO; 2-J . PMID  9521418 .
  • МакГир П.Л., Кавамата Т., МакГир Э.Г. (1998). «Локализация и возможные функции пресенилинов в мозге». Обзоры в неврологии . 9 (1): 1–15. DOI : 10.1515 / REVNEURO.1998.9.1.1 . PMID  9683324 . S2CID  22791458 .
  • Нисимура М., Ю. Г., Сент-Джордж-Хислоп PH (1999). «Биология пресенилинов как молекул, вызывающих болезнь Альцгеймера». Clin. Genet . 55 (4): 219–225. DOI : 10.1034 / j.1399-0004.1999.550401.x . PMID  10361981 . S2CID  35128500 .
  • да Коста, Калифорния (2006). «Недавние исследования проапоптотического фенотипа, вызванного пресенилином 2 и его каспазой и фрагментами, производными пресенилиназы». Текущее исследование болезни Альцгеймера . 2 (5): 507–514. DOI : 10.2174 / 156720505774932278 . PMID  16375654 .
  • Вулф MS (2007). «Когда потеря - это прибыль: снижение протеолитической функции пресенилина приводит к увеличению Abeta42 / Abeta40. Тема для разговора о роли мутаций пресенилина в болезни Альцгеймера» . EMBO Rep . 8 (2): 136–140. DOI : 10.1038 / sj.embor.7400896 . PMC  1796780 . PMID  17268504 .
  • Де Струпер Б. (2007). «Мутации пресенилина с потерей функции при болезни Альцгеймера. Обсуждение роли мутаций пресенилина в болезни Альцгеймера» . EMBO Rep . 8 (2): 141–146. DOI : 10.1038 / sj.embor.7400897 . PMC  1796779 . PMID  17268505 .

Внешние ссылки [ править ]

  • GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о семейной болезни Альцгеймера с ранним началом