Полимераза I и фактор высвобождения транскрипта , также известный как Cavin1 , Cavin1 или ПСРФ , является белком , который в организме человека кодируется ПСРФ ген . [5] [6]
CAVIN1 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | CAVIN1 , CAVIN, CGL4, cavin-1, FKSG13, PTRF, полимераза I и фактор высвобождения транскрипта, белок 1, связанный с кавеолами | ||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | OMIM : 603198 MGI : 1277968 HomoloGene : 7499 GeneCards : CAVIN1 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||||||||||
Разновидность | Человек | Мышь | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ансамбль |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (белок) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Расположение (UCSC) | Chr 17: 42,4 - 42,42 Мб | Chr 11: 100.96 - 100.97 Мб | |||||||||||||||||||||||
PubMed поиск | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||
|
Функция
PTRF (Cavin1), как было показано, имеет решающее значение для образования и функционирования кавеол . [7]
Прерывание транскрипции, катализируемой РНК-полимеразой I, представляет собой двухэтапный процесс, который включает приостановку элонгации транскрипции и высвобождение как прерибосомной РНК, так и Pol I из матрицы ДНК . Пауза опосредуется TTF1 и PTRF. [8] [9]
PTRF представляет собой растворимый белок, содержащий предполагаемую лейциновую застежку-молнию , сигнал ядерной локализации и домены PEST . [10]
Взаимодействия
PTRF (Cavin1) образует тримеры с Cavin2 и Cavin3 при образовании кавеол и, как было показано, взаимодействует с другими ассоциированными с мембранами белками, такими как EHD2 и кавеолины . [11]
Было показано, что PTRF взаимодействует с ZNF148 . [12]
Рекомендации
- ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000177469 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004044 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ген Entrez: полимераза I PTRF и фактор высвобождения транскрипта» .
- ^ "Отчет по символам CAVIN1 | Комитет по номенклатуре генов HUGO" . www.genenames.org . Проверено 30 мая 2017 .
- ^ Hill MM, Bastiani M, Luetterforst R, Kirkham M, Kirkham A, Nixon SJ, Walser P, Abankwa D, Oorschot VM, Martin S, Hancock JF, Parton RG (январь 2008 г.). «PTRF-Cavin, консервативный цитоплазматический белок, необходимый для образования и функционирования кавеолы» . Cell . 132 (1): 113–24. DOI : 10.1016 / j.cell.2007.11.042 . PMC 2265257 . PMID 18191225 .
- ^ Мейсон С.В., Сандер Е.Е., Груммт I (январь 1997 г.). «Идентификация активности высвобождения транскрипта, действующей на тройные транскрипционные комплексы, содержащие мышиную РНК-полимеразу I» . Журнал EMBO . 16 (1): 163–72. DOI : 10.1093 / emboj / 16.1.163 . PMC 1169623 . PMID 9009277 .
- ^ Янса П., Мейсон С.В., Hoffmann-Rohrer U, Grummt I (май 1998 г.). «Клонирование и функциональная характеристика PTRF, нового белка, который вызывает диссоциацию приостановленных комплексов тройной транскрипции» . Журнал EMBO . 17 (10): 2855–64. DOI : 10.1093 / emboj / 17.10.2855 . PMC 1170626 . PMID 9582279 .
- ^ Абулайх Н., Вайнонен Дж. П., Стролфорс П., Венер А. В. (октябрь 2004 г.). «Векторная протеомика выявляет нацеливание, фосфорилирование и специфическую фрагментацию полимеразы I и фактора высвобождения транскрипта (PTRF) на поверхности кавеол в адипоцитах человека» . Биохимический журнал . 383 (Pt 2): 237–48. DOI : 10.1042 / BJ20040647 . PMC 1134064 . PMID 15242332 .
- ^ Ковтун О., Тиллу В.А., Ариотти Н., Партон Р.Г., Коллинз Б.М. (апрель 2015 г.). «Белки семейства кавинов и сборка кавеол» . Журнал клеточной науки . 128 (7): 1269–78. DOI : 10,1242 / jcs.167866 . PMC 4379724 . PMID 25829513 .
- ^ Хасэгава Т., Такеучи А., Мияиси О, Сяо Х., Мао Дж., Исобэ К. (апрель 2000 г.). «PTRF (полимераза I и фактор высвобождения транскрипта) является тканеспецифичным и взаимодействует с фактором транскрипции цинковых пальцев BFCOL1 (фактор связывания промотора коллагена типа I), который связывается с двумя промоторами гена коллагена типа I мыши» . Биохимический журнал . 347 Pt 1 (Pt 1): 55–9. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3470055 . PMC 1220930 . PMID 10727401 .
дальнейшее чтение
- Янса П., Мейсон С.В., Hoffmann-Rohrer U, Grummt I (май 1998 г.). «Клонирование и функциональная характеристика PTRF, нового белка, который вызывает диссоциацию приостановленных комплексов тройной транскрипции» . Журнал EMBO . 17 (10): 2855–64. DOI : 10.1093 / emboj / 17.10.2855 . PMC 1170626 . PMID 9582279 .
- Хасэгава Т., Такеучи А., Мияиси О, Сяо Х., Мао Дж., Исобэ К. (апрель 2000 г.). «PTRF (полимераза I и фактор высвобождения транскрипта) является тканеспецифичным и взаимодействует с фактором транскрипции цинковых пальцев BFCOL1 (фактор связывания промотора коллагена типа I), который связывается с двумя промоторами гена коллагена типа I мыши» . Биохимический журнал . 347 Pt 1 (Pt 1): 55–9. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3470055 . PMC 1220930 . PMID 10727401 .
- Абулайх Н., Вайнонен Дж. П., Стролфорс П., Венер А. В. (октябрь 2004 г.). «Векторная протеомика выявляет нацеливание, фосфорилирование и специфическую фрагментацию полимеразы I и фактора высвобождения транскрипта (PTRF) на поверхности кавеол в адипоцитах человека» . Биохимический журнал . 383 (Pt 2): 237–48. DOI : 10.1042 / BJ20040647 . PMC 1134064 . PMID 15242332 .
- Раш Дж., Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Дж., Чжан Х., Чжа Х.М., Полакевич Р.Д., Гребень М.Дж. (январь 2005 г.). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Природа Биотехнологии . 23 (1): 94–101. DOI : 10.1038 / nbt1046 . PMID 15592455 . S2CID 7200157 .
- Чжан Ю., Вольф-Ядлин А., Росс П.Л., Паппин Д.Д., Раш Дж., Лауффенбургер Д.А., White FM (сентябрь 2005 г.). «Масс-спектрометрия с временным разрешением сайтов фосфорилирования тирозина в сигнальной сети рецептора эпидермального фактора роста выявляет динамические модули» . Молекулярная и клеточная протеомика . 4 (9): 1240–50. DOI : 10.1074 / mcp.M500089-MCP200 . PMID 15951569 .
- Aboulaich N, Ortegren U, Vener AV, Strålfors P (ноябрь 2006 г.). «Ассоциация и регулируемая инсулином транслокация гормон-чувствительной липазы с PTRF». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 350 (3): 657–61. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2006.09.094 . PMID 17026959 .
- Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635–48. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .