• активность гомодимеризации белка • связывание рецептора интерлейкина-6 • связывание рецептора BMP • связывание с белком GO: 0001948 • идентичное связывание с белком • связывание с ферментом • активность эндопептидазы цистеинового типа, участвующая в апоптотическом процессе • связывание домена пирина • активность активатора эндопептидазы цистеинового типа, участвующего в процесс апоптоза • миозина я связывание • тропомиозин связывание • Протеаза связывания • ионного канала связывания • белок димеризация активность • цистеин типа эндопептидазной активности
Сотовый компонент
• цитоплазма • NLRP3 инфламмасома комплекс • nlrp1 инфламмасома комплекс • AIM2 инфламмасома комплекс • ядрышко • эндоплазматического ретикулум • митохондрия • IkappaB киназа • ядро клетка • секреторная гранула ого • азурофильной гранула лй • внеклеточная область • цитозоль • макромолекулярный комплекс • нейронные клетки тело • Гольджи мембрана • аппарат Гольджи • мембрана
Биологический процесс
• положительная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа • регуляция процесса апоптоза • внутренний путь передачи сигналов апоптоза в ответ на повреждение ДНК медиатором класса p53 • регуляция внутреннего пути передачи сигналов апоптоза • внутренний путь передачи сигналов апоптоза медиатором класса p53 • положительная регуляция адаптивного иммунитета ответ • защитный ответ на грамотрицательные бактерии • процесс иммунной системы • клеточный ответ на фактор некроза опухоли • регуляция сигнального пути, опосредованного фактором некроза опухоли • положительная регуляция активности специфичного для последовательности ДНК связывающего фактора транскрипции • сигнальный путь, опосредованный фактором некроза опухоли • позитивная регуляция каскада JNK • негативная регуляция продукции интерферона-бета • негативная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB • миелоидные дендритные клетки активация • позитивная регуляция активации Т-клеток • защитный ответ на вирус • клеточный ответ на интерлейкин-1 • позитивная регуляция апоптотического процесса • позитивная регуляция продукции фактора некроза опухоли • положительное регулирование высвобождения цитохрома с из митохондрий • негативной регуляции белки серин / треонин киназа • положительного регулирования внешних апоптические сигнальный путь • воспалительная реакция • клеточный ответ на липополисахарид • отрицательное регулирование NF-kappaB фактор транскрипции активности • трансдукция сигнала • апоптические процесс • врожденная иммунная система • дегрануляция нейтрофилов • положительная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB • активация врожденного иммунного ответа • активация миелоидных дендритных клеток, участвующих в иммунном ответе • позитивная регуляция процессинга антигена и презентация пептидного антигена через MHC класса II • активация активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • позитивная регуляция полимеризации актиновых филаментов • регуляция стабильности протеина • позитивная регуляция продукции интерферона-гамма • положительная регуляция продукции интерлейкина-6 • позитивная регуляция пролиферации активированных Т-клеток • позитивная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • макропиноцитоз • позитивная регуляция фагоцитоза • позитивная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • позитивная регуляция миграции Т-клеток • позитивная регуляция защитного ответа на вирус со стороны хозяина • внутренний апоптотический сигнальный путь в ответ на повреждение ДНК • ответ на бактерию • регуляция аутофагии • интерлейкин- Продукция 1 бета • GO: 0043087, GO: 0032313, GO: 0032319, GO: 0032314, GO: 0043088 регуляция активности GTPase • регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • регуляция воспалительного ответа • гомоолигомеризация белков • активация активности эндопептидазы цистеинового типа • негативная регуляция продукции цитокинов, участвующих в воспалительной реакции • протеолиз • позитивная регуляция выработки интерлейкина-1 бета
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
29108
66824
Ансамбль
ENSG00000103490
ENSMUSG00000030793
UniProt
Q9ULZ3
Q9EPB4
RefSeq (мРНК)
NM_145183 NM_013258 NM_145182
NM_023258
RefSeq (белок)
NP_037390 NP_660183
NP_075747
Расположение (UCSC)
Chr 16: 31,2 - 31,2 Мб
Chr 7: 127,99 - 127,99 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
PYCARD, часто упоминается как ASC (Апоптоз-ассоциированный пятнышка-подобный белок , содержащий CARD), представляет собой белок , который у человека кодируется PYCARD гена . [5] Это локализовано преимущественно в ядре из моноцитов и макрофагов . Однако в случае патогенной инфекции он быстро перемещается в цитоплазму , перинуклеарное пространство, эндоплазматический ретикулум и митохондрии и является ключевым адаптерным белком в активации инфламмасомы . [6]
Структура ЯМР полноразмерного ASC: PDB ID 2KN6 [1] [7]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Функция
2 взаимодействия
3 ссылки
4 Дальнейшее чтение
Функция [ править ]
Этот ген кодирует адаптерный белок, который состоит из двух доменов межбелкового взаимодействия: N-концевого домена PYRIN-PAAD-DAPIN ( PYD ) и C-концевого домена рекрутирования каспаз ( CARD ). Домены PYD и CARD являются членами суперсемейства шестиспиральных доменов гибели, которое опосредует сборку больших сигнальных комплексов в воспалительных и апоптотических сигнальных путях посредством активации каспазы . В нормальных клетках этот белок локализован в цитоплазме ; однако в клетках, подвергающихся апоптозу, он образует шарообразные агрегаты вблизи периферии ядра.
PYCARD может существовать в четырех различных изоформах . Изоформа 1, часто называемая канонической PYCARD, и изоформа 2 являются активирующими изоформами. Они совместно локализуются с рецепторами, подобными домену олигомеризации нуклеотидов (NLR) и каспазой-1 . В отличие от изоформы 1, изоформа 2 участвует в прямой регуляции процессинга IL-1β . Изоформа 3 является ингибирующей изоформой, поэтому она локализуется только совместно с каспазой-1, но не с NLR. Изоформа 4 не способна действовать как адаптерный белок в передаче сигналов NLR, и ее роль остается неясной. [6]
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что PYCARD взаимодействует с MEFV . [8]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000103490 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030793 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Entrez Gene: PYCARD PYD и домен CARD, содержащий" . Проверено 18 сентября 2010 года .
^ а б Данн, JH; Фудзита, М. (2015). «PYCARD (PYD и CARD, содержащие домен)» . Атлас генетики и цитогенетики в онкологии и гематологии (4). DOI : 10.4267 / 2042/56440 . ЛВП : 2042/56440 . ISSN 1768-3262 .
^ Альба, Ева де (2009-11-20). "Структура и междоменная динамика связанного с апоптозом Speck-подобного белка, содержащего CARD (ASC)" . Журнал биологической химии . 284 (47): 32932–32941. DOI : 10.1074 / jbc.M109.024273 . ISSN 0021-9258 . PMC 2781708 . PMID 19759015 .
^ Ричардс Н, Schaner Р, Диас А, Стаки Дж, Shelden Е, Вадхва А, Gumucio DL (октябрь 2001 г.). «Взаимодействие между пирином и апоптотическим белком пятен (ASC) модулирует индуцированный ASC апоптоз» . J. Biol. Chem . 276 (42): 39320–9. DOI : 10.1074 / jbc.M104730200 . PMID 11498534 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Масумото Дж., Танигучи С., Аюкава К., Сарвотам Х., Кишино Т., Ниикава Н., Хидака Е., Кацуяма Т., Хигучи Т., Сагара Дж. (1999). «ASC, новый белок массой 22 кДа, агрегируется во время апоптоза клеток HL-60 промиелоцитарного лейкоза человека» . J. Biol. Chem . 274 (48): 33835–8. DOI : 10.1074 / jbc.274.48.33835 . PMID 10567338 .
Ли СК, На Си, Юнг Си, Чой Дж. Э., Джун Б. Х., Чеонг Дж., Мельцер П. С., Ли Ю. С., Ли Дж. «Активация белка-1, ядерного фактора-каппаВ и фактора ответа сыворотки как новых молекул-мишеней для коактиватора транскрипции, усиленного раком, ASC-2» . Мол. Эндокринол . 14 (6): 915–25. DOI : 10.1210 / mend.14.6.0471 . PMID 10847592 .
Конвей KE, МакКоннелл BB, Bowring CE, Donald CD, Warren ST, Vertino PM (2000). «TMS1, новый проапоптотический белок домена рекрутирования каспаз, является мишенью для индуцированного метилированием сайленсинга генов при раке груди человека». Cancer Res . 60 (22): 6236–42. PMID 11103776 .
МакКоннелл BB, Вертино PM (2000). «Активация каспазо-9-опосредованного апоптотического пути путем субклеточного перераспределения нового белка домена рекрутирования каспазы TMS1». Cancer Res . 60 (22): 6243–7. PMID 11103777 .
Мартинон Ф., Хофманн К., Чопп Дж. (2001). «Пириновый домен: возможный член семейства складчатых доменов смерти, вовлеченный в апоптоз и воспаление». Curr. Биол . 11 (4): R118-20. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (01) 00056-2 . PMID 11250163 . S2CID 18564343 .
Geddes BJ, Wang L, Huang WJ, Lavellee M, Manji GA, Brown M, Jurman M, Cao J, Morgenstern J, Merriam S, Glucksmann MA, DiStefano PS, Bertin J (2001). «Human CARD12 - новый член семейства CED4 / Apaf-1, который вызывает апоптоз». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 284 (1): 77–82. DOI : 10.1006 / bbrc.2001.4928 . PMID 11374873 .
Ричардс Н., Сханер П., Диаз А., Стаки Дж., Шелден Е., Вадхва А., Гумусио Д. Л. (2001). «Взаимодействие между пирином и апоптотическим белком пятен (ASC) модулирует индуцированный ASC апоптоз» . J. Biol. Chem . 276 (42): 39320–9. DOI : 10.1074 / jbc.M104730200 . PMID 11498534 .
Стимсон К.М., Вертино П.М. (2002). «Опосредованное метилированием молчание TMS1 / ASC сопровождается гипоацетилированием гистонов и локализованными на островках CpG изменениями в архитектуре хроматина» . J. Biol. Chem . 277 (7): 4951–8. DOI : 10.1074 / jbc.M109809200 . PMID 11733524 .
Манджи Г.А., Ван Л., Геддес Б.Дж., Браун М., Мерриам С., Аль-Гарави А., Мак С., Лора Дж. М., Брискин М., Джурман М., Цао Дж., ДиСтефано П.С., Бертин Дж. (2002). «PYPAF1, PYRIN-содержащий Apaf1-подобный белок, который собирается с ASC и регулирует активацию NF-каппа B» . J. Biol. Chem . 277 (13): 11570–5. DOI : 10.1074 / jbc.M112208200 . PMID 11786556 .
Шринивасула С.М., Пойет Дж.Л., Размара М., Датта П., Чжан З., Алнемри Е.С. (2002). «Белок ASC PYRIN-CARD представляет собой активирующий адаптер для каспазы-1» . J. Biol. Chem . 277 (24): 21119–22. DOI : 10.1074 / jbc.C200179200 . PMID 11967258 .
Ван Л., Манджи Г. А., Гренье Дж. М., Аль-Гарави А., Мерриам С., Лора Дж. М., Геддес Б. Дж., Брискин М., ДиСтефано П. С., Бертин Дж. (2002). «PYPAF7, новый PYRIN-содержащий Apaf1-подобный белок, который регулирует активацию NF-каппа B и процессинг цитокинов, зависимый от каспазы-1» . J. Biol. Chem . 277 (33): 29874–80. DOI : 10.1074 / jbc.M203915200 . PMID 12019269 .
Шиохара М., Танигучи С., Масумото Дж., Ясуи К., Койке К., Комияма А., Сагара Дж. (2002). «ASC, который состоит из PYD и CARD, активируется воспалением и апоптозом нейтрофилов человека». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 293 (5): 1314–8. DOI : 10.1016 / S0006-291X (02) 00384-4 . PMID 12054656 .
Мартинон Ф., Бернс К., Чопп Дж. (2002). «Инфламмасома: молекулярная платформа, запускающая активацию воспалительных каспаз и процессинг proIL-бета». Мол. Cell . 10 (2): 417–26. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (02) 00599-3 . PMID 12191486 .
Stehlik C, Fiorentino L, Dorfleutner A, Bruey JM, Ariza EM, Sagara J, Reed JC (2002). «Белок ASC семейства PAAD / PYRIN является двойным регулятором консервативной стадии в путях активации ядерного фактора kappaB» . J. Exp. Med . 196 (12): 1605–15. DOI : 10.1084 / jem.20021552 . PMC 2196065 . PMID 12486103 .
Мориаи Р., Цудзи Н., Кобаяси Д., Ягихаши А., Намики И., Такахаши Н., Ватанабэ Н. (2003). «Проапоптотический ген белка рекрутирующего каспазного домена, TMS1, гиперметилирован при раке груди и желудка человека». Anticancer Res . 22 (6C): 4163–8. PMID 12553049 .
Масумото Дж., Даудс Т.А., Шанер П., Чен Ф.Ф., Огура Й, Ли М., Чжу Л., Кацуяма Т., Сагара Дж., Танигучи С., Гумусио Д.Л., Нуньес Г., Инохара Н. (2003). «ASC - это активирующий адаптер для NF-каппа B и каспазо-8-зависимого апоптоза». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 303 (1): 69–73. DOI : 10.1016 / S0006-291X (03) 00309-7 . PMID 12646168 .
Stehlik C, Krajewska M, Welsh K, Krajewski S, Godzik A, Reed JC (2003). «PAAD / PYRIN-only белок POP1 / ASC2 является модулятором регуляции ASC-опосредованного ядерного фактора-каппа B и прокаспазы-1» . Биохим. Дж . 373 (Pt 1): 101–13. DOI : 10.1042 / BJ20030304 . PMC 1223462 . PMID 12656673 .
Левин Дж. Дж., Стимсон-Крайдер К. М., Вертино П. М. (2003). «Влияние метилирования на экспрессию TMS1 / ASC в клетках рака груди человека» . Онкоген . 22 (22): 3475–88. DOI : 10.1038 / sj.onc.1206430 . PMID 12776200 .
vтеPDB галерея
1ucp : ЯМР-структура домена PYRIN ASC человека.
Эта статья о гене в хромосоме 16 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .
