Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
PDC
Белок PDC PDB 2trc.png
Идентификаторы
ПсевдонимыPDC , MEKA, PHD, PhLOP, PhLP, фосдуцин
Внешние идентификаторыOMIM : 171490 MGI : 98090 HomoloGene : 1950 GeneCards : PDC
Расположение гена ( человек )
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человека) [1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение PDC
Геномное расположение PDC
Группа1q31.1Начинать186 443 566 п.н. [1]
Конец186 461 114 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 1 (мышь)
Chr.Хромосома 1 (мышь) [2]
Хромосома 1 (мышь)
Геномное расположение PDC
Геномное расположение PDC
Группа1 G1 | 1 63,84 смНачинать150 319 417 п.н. [2]
Конец150 333 906 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE PDC 211496 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• фосфолипазы ингибитор активности
• queuine тРНК-ribosyltransferase деятельность
Сотовый компонент• внутренний сегмент фоторецептора
• цитоплазма
• цитозоль
• внешний сегмент фоторецептора
• проекция клетки
• ресничка
• ядро клетки
Биологический процесс• процесс биосинтеза квевозина
• сигнальный путь рецептора, связанный с G-белком
• ответ на стимул
• зрительное восприятие
• фототрансдукция
• GO: 0048553 отрицательная регуляция каталитической активности
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

5132

20028

Ансамбль

ENSG00000116703

ENSMUSG00000006007

UniProt

P20941
Q52LP8

Q9QW08

RefSeq (мРНК)

NM_002597
NM_022576
NM_022577

NM_001159730
NM_024458

RefSeq (белок)

NP_002588
NP_072098
NP_002588.3

NP_001153202
NP_077778

Расположение (UCSC)Chr 1: 186.44 - 186.46 МбChr 1: 150.32 - 150.33 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фосдуцин , также известный как PDC , является человеческим белком и геном . [5] Он принадлежит к семейству белков фосфуцинов .

Этот ген кодирует фосфопротеин, который находится во внешнем и внутреннем сегментах стержневых клеток сетчатки . Этот белок может участвовать в регуляции зрительной фототрансдукции или в интеграции метаболизма фоторецепторов. Он модулирует каскад фототрансдукции, взаимодействуя с бета- и гамма-субъединицами трансдуцина G-белка сетчатки. Связываясь только с этими субъединицами, альфа-субъединица трансдуцина будет оставаться активной дольше. Это увеличит время визуального возбуждения.

Этот ген является потенциальным геном-кандидатом в пигментный ретинит и синдром Ушера типа II . Были идентифицированы альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие разные изоформы. [5]

См. Также [ править ]

  • Семья Фосдуцинов

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000116703 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000006007 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ а б «Ген Энтреса: PDC фосдуцин» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Абэ Т., Накабаяши Х., Тамада Х. и др. (1990). «Анализ 33 кДа белков и кДНК человека, крупного рогатого скота и крысы в ​​сетчатке и шишковидной железе» . Джин . 91 (2): 209–15. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (90) 90090-E . PMID  2210381 .
  • Ватанабе Ю., Кавасаки К., Мики Н., Куо С.Х. (1990). «Выделение и анализ человеческого гена MEKA, кодирующего белок, специфичный для сетчатки». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 170 (2): 951–6. DOI : 10.1016 / 0006-291X (90) 92183-Z . PMID  2383274 .
  • Ли Р.Х., Браун Б.М., Лолли Р.Н. (1990). «Протеинкиназа А фосфорилирует фосфуцин сетчатки по серину 73 in situ» . J. Biol. Chem . 265 (26): 15860–6. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (18) 55478-8 . PMID  2394752 .
  • Hawes BE, Touhara K, Kurose H, et al. (1994). «Определение G-бета-гамма-связывающего домена фосдуцина. Регулируемый модулятор передачи сигналов G-бета-гамма» . J. Biol. Chem . 269 (47): 29825–30. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (18) 43955-5 . PMID  7961975 .
  • Абэ Т., Кикучи Т., Шинохара Т. (1994). «Последовательность гена фосфдуцина человека (PDC) и его 5'-фланкирующая область» . Геномика . 19 (2): 369–72. DOI : 10.1006 / geno.1994.1072 . PMID  8188267 .
  • Спаркс Р.С., Ли Р.Х., Шинохара Т. и др. (1994). «Присвоение гена фосдуцина (PDC) хромосоме человека 1q25-1q32.1 путем гибридизации соматических клеток и гибридизации in situ». Геномика . 18 (2): 426–8. DOI : 10.1006 / geno.1993.1490 . PMID  8288249 .
  • Динг С., Ли Х, Гриффин К.А. и др. (1994). «Ген человеческого фосдуцина (PDC), растворимого белка, который связывает бета-гамма-димеры G-белка, соответствует 1q25-q31.1». Геномика . 18 (2): 457–9. DOI : 10.1006 / geno.1993.1501 . PMID  8288259 .
  • Бекхофф И., Тухара К., Даннер С. и др. (1997). «Фосдуцин, потенциальная роль в модуляции обонятельной передачи сигналов» . J. Biol. Chem . 272 (7): 4606–12. DOI : 10.1074 / jbc.272.7.4606 . PMID  9020189 .
  • Бархайт С., Тибо С., Майлз М.Ф. (1998). «Фосдуцин-подобный белок (PhLP), регулятор гамма-функции G-бета, взаимодействует с протеасомным белком SUG1». Биохим. Биофиз. Acta . 1402 (1): 95–101. DOI : 10.1016 / S0167-4889 (97) 00141-9 . PMID  9551090 .
  • Чжу X, Ремесло CM (1998). «Взаимодействие изоформ фосфдуцина и фосфуцина с 26S протеасомной субъединицей, SUG1». Мол. Vis . 4 : 13. PMID  9701609 .
  • Craft CM, Xu J, Slepak VZ, et al. (1998). «PhLPs и PhLOPs в семействе фосдуцинов G-бета-гамма-связывающих белков». Биохимия . 37 (45): 15758–72. DOI : 10.1021 / bi980921a . PMID  9843381 .
  • Карптен Дж. Д., Макаловска И., Роббинс С. М. и др. (2000). «Физическая карта и карта транскрипции с высоким разрешением размером 6 Мб, охватывающая область наследственного рака простаты 1 (HPC1)» . Геномика . 64 (1): 1–14. DOI : 10.1006 / geno.1999.6051 . PMID  10708513 .
  • Чжу X, Ремесло CM (2000). «Карбоксильный концевой домен фосдуцина функционирует как активатор транскрипции» . Биохим. Биофиз. Res. Commun . 270 (2): 504–9. DOI : 10.1006 / bbrc.2000.2414 . PMID  10753654 .
  • Чжу X, Ремесло CM (2000). «Модуляция активности трансактивации CRX изоформами фосдуцина» . Мол. Клетка. Биол . 20 (14): 5216–26. DOI : 10.1128 / MCB.20.14.5216-5226.2000 . PMC  85970 . PMID  10866677 .
  • Руис-Гомес А., Хумрих Дж., Мурга С. и др. (2000). «Фосфорилирование фосфуцина и фосдуцин-подобного белка с помощью G-протеин-связанной рецепторной киназы 2» . J. Biol. Chem . 275 (38): 29724–30. DOI : 10.1074 / jbc.M001864200 . PMID  10884381 .
  • Накано К., Чен Дж., Тарр Г.Э. и др. (2001). «Переосмысление роли фосдуцина: регулируемое светом связывание фосдуцина с 14-3-3 во внутренних сегментах палочек» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 98 (8): 4693–8. Bibcode : 2001PNAS ... 98.4693N . DOI : 10.1073 / pnas.071067198 . PMC  31896 . PMID  11287646 .
  • Тулин С.Д., Сэвидж Дж. Р., Маклафлин Дж. Н. и др. (2001). «Модуляция фосдуцина, регулирующего белок G, посредством фосфорилирования Са2 + / кальмодулин-зависимой протеинкиназы II и связывания с белком 14-3-3» . J. Biol. Chem . 276 (26): 23805–15. DOI : 10.1074 / jbc.M101482200 . PMID  11331285 .
  • Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK и др. (2002). «Анализ экспрессируемой последовательности меток сетчатки глаза человека для проекта NEIBank: ретбиндин, обильная новая кДНК сетчатки и альтернативный сплайсинг других транскриптов гена, предпочтительных для сетчатки». Мол. Vis . 8 : 196–204. PMID  12107411 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Маргулис А., Данг Л., Пулукури С. и др. (2002). «Присутствие фосдуцина в ядрах клеток сетчатки крупного рогатого скота». Мол. Vis . 8 : 477–82. PMID  12500174 .
  • v
  • т
  • е