Фосфокетолаза

Идентификаторы

ЕС нет.

4.1.2.9

№ CAS

9031-75-8

Базы данных

IntEnz

BRENDA

ExPASy

КЕГГ

MetaCyc

ПРИАМ

Структуры PDB

Генная онтология

Поиск
ЧВК	статьи
PubMed	статьи
NCBI	белки

В энзимологии , phosphoketolase представляет собой фермент , который катализирует в химические реакции

D-ксилулоза-5-фосфат + фосфат- ацетилфосфат + D-глицеральдегид-3-фосфат + H ₂ O ( EC 4.1.2.9 ) ^[1]

{\ displaystyle \ rightleftharpoons}

D-фруктозо-6-фосфат + фосфат- ацетилфосфат + D-эритрозо-4-фосфат + H ₂ O ( EC 4.1.2.22 ) ^[2]

{\ displaystyle \ rightleftharpoons}

D-седогептулоза-7-фосфат + фосфат- ацетилфосфат + D-рибозо-5-фосфат + H ₂ O ^[3]

{\ displaystyle \ rightleftharpoons}

Фосфокетолаза считается беспорядочным ферментом, потому что было продемонстрировано использование 3 различных сахарных фосфатов в качестве субстратов. В недавнем генетическом исследовании более 150 предполагаемых генов фосфокетолаз, проявляющих различные каталитические свойства, были обнаружены в 650 проанализированных бактериальных геномах. ^[4]

Этот фермент принадлежит к семейству лиаз , а именно к альдегидлиазам, которые расщепляют углерод-углеродные связи. Он участвует в 3 метаболических путях : пентозофосфатном пути , метаболизме метана и фиксации углерода . В нем используется один кофактор - дифосфат тиамина . Фосфокетолаза ранее использовалась в биотехнологических целях ^[5]^[6]^[7], поскольку она позволяет создавать синтетические пути, которые позволяют полностью сохранить углерод без выработки уменьшающей энергии . ^[8]

Ссылки [ править ]

^ Гленн, Кэти; Смит, Керри С. (2015-01-20). «Аллостерическая регуляция Lactobacillus plantarum Xylulose 5-Phosphate / Fructose 6-Phosphate Phosphoketolase (Xfp)» . Журнал бактериологии . 197 (7): 1157–1163. DOI : 10.1128 / jb.02380-14 . ISSN 0021-9193 . PMC 4352667 . PMID 25605308 .
^ Racker, Е. (1962), [29d] фруктоза-6-фосфат phosphoketolase из Acetobacter xylinum , Методы в энзимологии, 5 , Elsevier, стр. 276-280, DOI : 10.1016 / s0076-6879 (62) 05219-2 , ISBN 9780121818050
^ Krüsemann, Ян Л .; Lindner, Steffen N .; Демпфл, Мэриан; Видмер, Джулиан; Арриво, Стефани; Дебакер, Марин; Он, Хай; Кубис, Армин; Чайот, Ромен (2018). «Возникновение искусственного пути в центральном метаболизме из трех рекурсивных фосфокетолазных реакций» . Журнал FEBS . 285 (23): 4367–4377. DOI : 10.1111 / febs.14682 . ISSN 1742-4658 . PMID 30347514 .
^ Санчес, Борха; Суньига, Мануэль; Гонсалес-Канделас, Фернандо; де лос Рейес-Гавилан, Клара Дж .; Марголлес, Абелардо (2010). «Бактериальные и эукариотические фосфокетолазы: филогения, распространение и эволюция». Журнал молекулярной микробиологии и биотехнологии . 18 (1): 37–51. DOI : 10.1159 / 000274310 . ISSN 1464-1801 .
^ Sonderegger, M .; Шумперли, М .; Зауэр, У. (2004-05-01). "Метаболическая инженерия пути фосфокетолазы для пентозного катаболизма в Saccharomyces cerevisiae" . Прикладная и экологическая микробиология . 70 (5): 2892–2897. DOI : 10.1128 / aem.70.5.2892-2897.2004 . ISSN 0099-2240 . PMC 404438 . PMID 15128548 .
^ Анфельт, Жозефина; Качмаржик, Данута; Шабестары, Киян; Ренберг, Бьорн; Рокберг, Йохан; Нильсен, Йенс; Улен, Матиас; Хадсон, Элтон П. (2015-10-16). «Генетическая и питательная модуляция уровней ацетил-КоА в Synechocystis для производства н-бутанола» . Фабрики микробных клеток . 14 (1): 167. DOI : 10,1186 / s12934-015-0355-9 . ISSN 1475-2859 . PMC 4609045 . PMID 26474754 .
↑ Meadows, Adam L .; Хокинс, Кристи М .; Цегайе, Йосеф; Антипов, Евгений; Ким, Ённюн; Раец, Лорен; Даль, Роберт Х .; Тай, Анна; Махатдейкул-Медоуз, Тина (сентябрь 2016 г.). «Переписывание метаболизма центрального углерода дрожжей для промышленного производства изопреноидов». Природа . 537 (7622): 694–697. DOI : 10,1038 / природа19769 . ISSN 0028-0836 . PMID 27654918 .
^ Богорад, Игорь В .; Линь Цзы-Шянь; Ляо, Джеймс К. (29 сентября 2013 г.). «Синтетический неокислительный гликолиз обеспечивает полное сохранение углерода». Природа . 502 (7473): 693–697. DOI : 10,1038 / природа12575 . ISSN 0028-0836 . PMID 24077099 .

HEATH EC, HURWITZ J, HORECKER BL, GINSBURG A (1958). «Пентозная ферментация Lactobacillus plantarum. I. Расщепление ксилулозо-5-фосфата фосфокетолазой». J. Biol. Chem . 231 (2): 1009–29. PMID 13539033 .
Шрамм М., Клибас В., Ракер Э. (1958). «Фосфолитическое расщепление фруктозо-6-фосфата фруктозо-6-фосфатфосфокетолазой из Acetobacter xylinum». J. Biol. Chem . 233 : 1283–1288.

Эта статья о ферменте EC 4.1 является незавершенной . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] Гленн, Кэти; Смит, Керри С. (2015-01-20). «Аллостерическая регуляция Lactobacillus plantarum Xylulose 5-Phosphate / Fructose 6-Phosphate Phosphoketolase (Xfp)» . Журнал бактериологии . 197 (7): 1157–1163. DOI : 10.1128 / jb.02380-14 . ISSN 0021-9193 . PMC 4352667 . PMID 25605308 .

[2] Racker, Е. (1962), [29d] фруктоза-6-фосфат phosphoketolase из Acetobacter xylinum , Методы в энзимологии, 5 , Elsevier, стр. 276-280, DOI : 10.1016 / s0076-6879 (62) 05219-2 , ISBN 9780121818050

[3] Krüsemann, Ян Л .; Lindner, Steffen N .; Демпфл, Мэриан; Видмер, Джулиан; Арриво, Стефани; Дебакер, Марин; Он, Хай; Кубис, Армин; Чайот, Ромен (2018). «Возникновение искусственного пути в центральном метаболизме из трех рекурсивных фосфокетолазных реакций» . Журнал FEBS . 285 (23): 4367–4377. DOI : 10.1111 / febs.14682 . ISSN 1742-4658 . PMID 30347514 .

[4] Санчес, Борха; Суньига, Мануэль; Гонсалес-Канделас, Фернандо; де лос Рейес-Гавилан, Клара Дж .; Марголлес, Абелардо (2010). «Бактериальные и эукариотические фосфокетолазы: филогения, распространение и эволюция». Журнал молекулярной микробиологии и биотехнологии . 18 (1): 37–51. DOI : 10.1159 / 000274310 . ISSN 1464-1801 .

[5] Sonderegger, M .; Шумперли, М .; Зауэр, У. (2004-05-01). "Метаболическая инженерия пути фосфокетолазы для пентозного катаболизма в Saccharomyces cerevisiae" . Прикладная и экологическая микробиология . 70 (5): 2892–2897. DOI : 10.1128 / aem.70.5.2892-2897.2004 . ISSN 0099-2240 . PMC 404438 . PMID 15128548 .

[6] Анфельт, Жозефина; Качмаржик, Данута; Шабестары, Киян; Ренберг, Бьорн; Рокберг, Йохан; Нильсен, Йенс; Улен, Матиас; Хадсон, Элтон П. (2015-10-16). «Генетическая и питательная модуляция уровней ацетил-КоА в Synechocystis для производства н-бутанола» . Фабрики микробных клеток . 14 (1): 167. DOI : 10,1186 / s12934-015-0355-9 . ISSN 1475-2859 . PMC 4609045 . PMID 26474754 .

[7] Meadows, Adam L .; Хокинс, Кристи М .; Цегайе, Йосеф; Антипов, Евгений; Ким, Ённюн; Раец, Лорен; Даль, Роберт Х .; Тай, Анна; Махатдейкул-Медоуз, Тина (сентябрь 2016 г.). «Переписывание метаболизма центрального углерода дрожжей для промышленного производства изопреноидов». Природа . 537 (7622): 694–697. DOI : 10,1038 / природа19769 . ISSN 0028-0836 . PMID 27654918 .

[8] Богорад, Игорь В .; Линь Цзы-Шянь; Ляо, Джеймс К. (29 сентября 2013 г.). «Синтетический неокислительный гликолиз обеспечивает полное сохранение углерода». Природа . 502 (7473): 693–697. DOI : 10,1038 / природа12575 . ISSN 0028-0836 . PMID 24077099 .

[1]

vтеУглерод-углеродные лиазы ( EC 4.1)
4.1.1 : Карбоксилиазы	Ацетоацетат декарбоксилаза Аденозилметионинкарбоксилаза Аргинин декарбоксилаза Ароматическая декарбоксилаза L-аминокислот Глутамат декарбоксилаза Гистидин декарбоксилаза Лизин декарбоксилаза Малонил-КоА декарбоксилаза Орнитин декарбоксилаза Оксалоацетат декарбоксилаза Фосфоенолпируваткарбоксикиназа Фосфоенолпируваткарбоксилаза Фосфорибозиламиноимидазолкарбоксилаза Пирофосфомевалонат декарбоксилаза Пируват декарбоксилаза RuBisCO Уридинмонофосфатсинтетаза / Оротидин-5'-фосфатдекарбоксилаза Уропорфириноген III декарбоксилаза
4.1.2 : Альдегид- лиазы	Фруктозо-бисфосфат альдолаза Альдолаза А Альдолаза B Альдолаза С 2-гидроксифитаноил-КоА лиаза Треонин альдолаза
4.1.3 : Оксо-кислотные -лиазы	Изоцитратлиаза 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА лиаза
4.1.99 : Другое	Триптофаназа Фотолиаза CPD лиаза Споровый фотопродукт лиаза

vтеФерменты
Мероприятия	Активный сайт Связывающий сайт Каталитическая триада Оксианионная дыра Ферментная неразборчивость Каталитически совершенный фермент Коэнзим Кофактор Ферментный катализ
Регулирование	Аллостерическая регуляция Сотрудничество Ингибитор ферментов Активатор ферментов
Классификация	Номер ЕС Ферментное суперсемейство Семейство ферментов Список ферментов
Кинетика	Кинетика ферментов Диаграмма Иди – Хофсти Заговор Ханеса – Вульфа Заговор Лайнуивера – Берка Кинетика Михаэлиса – Ментен
Типы	EC1 Оксидоредуктазы ( список ) EC2 Трансферазы ( список ) EC3 Гидролазы ( список ) EC4 Lyases ( список ) EC5 Изомеразы ( список ) Лигазы EC6 ( список ) EC7 Translocases ( список )