Блок Прибнова (также известный как блок Прибноу-Шаллера ) представляет собой последовательность TATAAT из шести нуклеотидов ( тимин , аденин , тимин и т. Д.), Которая является важной частью промоторного сайта ДНК для транскрипции в бактериях . [1] [2] Это идеализированная или консенсусная последовательность, то есть она показывает наиболее часто встречающееся основание в каждом положении во многих проанализированных промоторах; отдельные промоторы часто расходятся с консенсусом по одной или нескольким позициям. Его также обычно называют-10 , потому что она центрирована примерно на десять пар оснований выше сайта инициации транскрипции.
Блок Pribnow имеет функцию, аналогичную блоку TATA, который встречается в промоторах у эукариот и архей : он распознается и связывается субъединицей РНК-полимеразы во время инициации транскрипции. [3] Эта область ДНК также является первым местом, где пары оснований разделяются во время прокариотической транскрипции, чтобы обеспечить доступ к цепи матрицы. Богатство АТ важно для такого разделения, поскольку аденин и тимин легче разрушаются (не только из-за меньшего количества водородных связей, но также из-за более слабого эффекта укладки оснований ). [4]
Он назван в честь Дэвида Прибнова и Хайнца Шаллера . [ необходима ссылка ] [1] [2]
Вероятность появления каждого нуклеотида в E. coli [ править ]
| Т | А | Т | А | А | Т |
|---|---|---|---|---|---|
| 82% | 89% | 52% | 59% | 49% | 89% |
См. Также [ править ]
Ссылки [ править ]
- ^ a b Прибнов, Дэвид (март 1975 г.). «Нуклеотидная последовательность сайта связывания РНК-полимеразы на раннем промоторе Т7» . PNAS . 72 (3): 784–788. DOI : 10.1073 / pnas.72.3.784 . ISSN 1091-6490 . PMC 432404 . PMID 1093168 .
- ^ а б Шаллер, Хайнц; Грей, Кристофер; Херрман, Карин (февраль 1975 г.). «Нуклеотидная последовательность сайта связывания РНК-полимеразы ДНК бактериофага fd» . PNAS . 72 (2): 737–741. DOI : 10.1073 / pnas.72.2.737 . ISSN 1091-6490 . PMC 432391 . PMID 1054851 .
- ^ Феклистов, Андрей; Дарст, Сет (2011). «Структурная основа для распознавания промотора -10 элемента σ-субъединицей бактериальной РНК-полимеразы» . Cell . 147 (6): 1257–69. DOI : 10.1016 / j.cell.2011.10.041 . PMC 3245737 . PMID 22136875 .
- ^ Яковчук, Питер; Протозанова, Екатерина; Франк-Каменецкий, Максим Д. (январь 2006 г.). «Вклады укладки оснований и спаривания оснований в термостабильность двойной спирали ДНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (2): 564–574. DOI : 10.1093 / NAR / gkj454 . ISSN 0305-1048 . PMC 1360284 . PMID 16449200 .
- ^ Харли, Кальвин Б .; Рейнольдс, Роберт П. (март 1987 г.). «Анализ промоторных последовательностей E. coli » (PDF, 0,9 МБ) . Исследования нуклеиновых кислот . 15 (5): 2343–2361. DOI : 10.1093 / NAR / 15.5.2343 . ISSN 0305-1048 . PMC 340638 . PMID 3550697 .
| Эта статья о генетике - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |
