Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
ПОДГОТОВКА
Протеин PREP PDB 1e5t.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

3DDU

Идентификаторы
ПсевдонимыPREP , PE, PEP, пролилэндопептидаза
Внешние идентификаторыOMIM : 600400 MGI : 1270863 HomoloGene : 2042 GeneCards : ПОДГОТОВИТЕЛЬНЫЕ
Расположение гена ( человек )
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человека) [1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное местоположение для PREP
Геномное местоположение для PREP
Группа6q21Начинать105 273 218 п.н. [1]
Конец105 454 062 п.н. [1]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE PREP 37950 в формате fs.png

PBB GE PREP 204117 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• активность экзопептидазы серинового типа
• активность пептидазы
• активность пептидазы серинового типа
• активность эндопептидазы серинового типа
• связывание с белком GO: 0001948
• активность гидролазы
• активность эндопептидазы
• активность олигопептидазы
Сотовый компонент• мембрана
• ядро клетки
• цитоплазма
• цитозоль
Биологический процесс• протеолиз
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

5550

19072

Ансамбль

ENSG00000085377

ENSMUSG00000019849

UniProt

P48147

Q9QUR6

RefSeq (мРНК)

NM_002726

NM_011156

RefSeq (белок)

NP_002717

NP_035286

Расположение (UCSC)Chr 6: 105,27 - 105,45 Мбн / д
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Пролили эндопептидазы (ПЭ) , также известный как пролилолигопептидазы или пост-пролин раскалывания фермент представляет собой фермент , который у человека кодируется PREP ген . [4] [5]

Функция [ править ]

пролилолигопептидаза
Идентификаторы
ЕС нет.3.4.21.26
№ CAS72162-84-6
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
BRENDABRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
Структуры PDB RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтологияAmigo / QuickGO
Поиск
ЧВКстатьи
PubMedстатьи
NCBIбелки

Пролилэндопептидаза - это большой цитозольный фермент, который принадлежит к особому классу сериновых пептидаз. Впервые он был описан в цитозоле мозга кролика как олигопептидаза , которая расщепляет нонапептид брадикинин по связи Pro-Phe. [6] Фермент участвует в созревании и деградации пептидных гормонов и нейропептидов, таких как альфа-меланоцит-стимулирующий гормон , лютеинизирующий гормон-рилизинг-гормон (LH-RH), тиреотропин-рилизинг-гормон , ангиотензин , нейротензин , окситоцин ,вещество Р и вазопрессин . PREP расщепляет пептидные связи , на С-концевой стороне пролина остатков. Его активность ограничивается действием на олигопептиды менее 10 кДа, и он абсолютно необходим для транс-конфигурации пептидной связи, предшествующей пролину.

Пролилэндопептидазы участвуют в созревании и деградации пептидных гормонов и нейропептидов . [5]

Структура [ править ]

Пролилэндопептидаза представляет собой цитозольную пролилэндопептидазу, которая расщепляет пептидные связи на С-конце пролиловых остатков в пептидах, длина которых составляет примерно до 30 аминокислот . Только короткие белковые остатки способны проникать в активный сайт пролилэндопептидазы из-за отдельной области бета-пропеллера, которая действует как механизм стробирующего фильтра. [7] [8]

Клиническое значение [ править ]

Измененная активность PREP может быть связана с расстройствами аутистического спектра и различными психологическими заболеваниями, такими как шизофрения , мания и клиническая депрессия . [9]

Однако существует противоречивая информация относительно точной роли, которую пролилэндопептидаза играет в патофизиологии депрессии, причем более ранние исследования документально подтверждают снижение активности фермента у пациентов с депрессией, но более поздние исследования демонстрируют, что ингибирование того же фермента на самом деле приводит к облегчению состояния. депрессивных симптомов. [10] [11]

Некоторые типы пролилэндопептидазы использовались в исследованиях для снижения склонности содержащих глютен продуктов из пшеницы к обострению целиакии . [12] Однако ферменты, вводимые перорально, потенциально подвержены инактивации в желудочно-кишечном тракте. [13]

Ингибиторы [ править ]

Известно несколько ингибиторов пролилэндопептидазы [14] [15], которые были предложены в качестве возможных ноотропных и антидепрессантов . [16] [17] Известные соединения включают

  • Прамирацетам [18]
  • Байкалин [19]
  • JTP-4819 [20]
  • KYP-2047 [21]
  • S-17092 [22]
  • Берберин

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000085377 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ Vanhoof G, Гуссенс F, Хендрикс L, De Meester I, Хендрикс D, Vriend G, Ван Broeckhoven C, Scharpe S (декабрь 1994). «Клонирование и анализ последовательности гена, кодирующего пролилэндопептидазу лимфоцитов человека». Джин . 149 (2): 363–6. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90177-5 . PMID 7959018 . 
  5. ^ a b «Ген Entrez: PREP пролилэндопептидаза» .
  6. ↑ Oliveira EB, Martins AR, Camargo AC (май 1976 г.). «Выделение эндопептидаз головного мозга: влияние размера и последовательности субстратов, структурно связанных с брадикинином». Биохимия . 15 (9): 1967–74. DOI : 10.1021 / bi00654a026 . PMID 5120 . 
  7. ^ Фюлоп В, Böcskei Z, Полгар л (июль 1998 года). «Пролилолигопептидаза: необычный бета-пропеллерный домен регулирует протеолиз». Cell . 94 (2): 161–70. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81416-6 . PMID 9695945 . S2CID 17074611 .  
  8. ^ Фюлоп В, Szeltner Z, Полгар л (сентябрь 2000 г.). «Катализ сериновых олигопептидаз контролируется механизмом стробирующего фильтра» . EMBO Rep . 1 (3): 277–81. DOI : 10.1093 / embo-reports / kvd048 . PMC 1083722 . PMID 11256612 .  
  9. ^ Момени N, Нордстрём БМ, Хорстман В, Avarseji Н, Sivberg Б. В. (2005). «Изменение активности пролилэндопептидазы в плазме крови у детей с расстройствами аутистического спектра» . BMC Psychiatry . 5 : 27. DOI : 10,1186 / 1471-244X-5-27 . PMC 1190193 . PMID 15932649 .  
  10. ^ Маэс М, Гуссенс Ж, Scharpé S, Калабрезе J, Desnyder R, Мелцер ГИ (1995). «Изменения активности пролилэндопептидазы плазмы при депрессии, мании и шизофрении: эффекты антидепрессантов, стабилизаторов настроения и антипсихотических препаратов». Psychiatry Res . 58 (3): 217–25. DOI : 10.1016 / 0165-1781 (95) 02698-V . PMID 8570777 . S2CID 42691937 .  
  11. ↑ Хлебникова Н.Н., Крупина Н.А., Кушнарева Е.Ю., Золотов Н.Н., Крыжановский Г.Н. (2012). «Влияние имипрамина и ингибитора пролилэндопептидазы бензилоксикарбонилметионил-2 (S) -цианопирролидина на активность пролинспецифических пептидаз в головном мозге крыс с экспериментальным тревожно-депрессивным синдромом». Bull Exp Biol Med . 152 (4): 409–12. DOI : 10.1007 / s10517-012-1540-Z . PMID 22803098 . S2CID 15088734 .  
  12. ^ Степняк D, Spaenij-Dekking л, Mitea С. и др. (Октябрь 2006 г.). «Высокоэффективное расщепление глютена с помощью недавно идентифицированной пролилэндопротеазы: последствия для целиакии». Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol . 291 (4): G621–9. DOI : 10,1152 / ajpgi.00034.2006 . PMID 16690904 . 
  13. ^ Фурманн G, Лера JC (май 2011). «Флуоресцентная визуализация in vivo активности экзогенных ферментов в желудочно-кишечном тракте» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 108 (22): 9032–7. Bibcode : 2011PNAS..108.9032F . DOI : 10.1073 / pnas.1100285108 . PMC 3107327 . PMID 21576491 .  
  14. ^ Ярхо Е.М., Веняляйнен Дж. И., Путиайнен С. и др. (Март 2007 г.). «2 (S) - (Циклоалк-1-енкарбонил) -1- (4-фенилбутаноил) пирролидины и 2 (S) - (ароил) -1- (4-фенилбутаноил) пирролидины в качестве ингибиторов пролилолигопептидазы». Биоорг. Med. Chem . 15 (5): 2024–2031. DOI : 10.1016 / j.bmc.2006.12.036 . PMID 17215128 . 
  15. ^ Kánai K, Arányi P, Böcskei Z и др. (Декабрь 2008 г.). «Ингибирование пролилолигопептидазы молекулами N-ацилпропирролидинового типа». J. Med. Chem . 51 (23): 7514–22. DOI : 10.1021 / jm800944x . PMID 19006380 . 
  16. ^ Морене P, Boeijinga PH, Demazières A, De Nanteuil G, Luthringer R (2007). «Психотропный профиль S 17092, ингибитора пролилэндопептидазы, с использованием количественной ЭЭГ у молодых здоровых добровольцев». Нейропсихобиология . 55 (3–4): 176–83. DOI : 10.1159 / 000107070 . PMID 17700042 . S2CID 27856130 .  
  17. ↑ Хлебникова Н.Н., Крупина Н.А., Богданова Н.Г., Золотов Н.Н., Крыжановский Г.Н. (январь 2009 г.). «Влияние ингибитора пролилендопептидазы бензилоксикарбонил-метионил-2 (S) -цианопирролидина на развитие экспериментального депрессивного синдрома у крыс». Бык. Exp. Биол. Med . 147 (1): 26–30. DOI : 10.1007 / s10517-009-0458-6 . PMID 19526123 . S2CID 25448235 .  
  18. ↑ Yoshimoto T, Kado K, Matsubara F, Koriyama N, Kaneto H, Tsura D (декабрь 1987 г.). «Специфические ингибиторы пролилэндопептидазы и их антиамнестический эффект» . J. Pharmacobio-Dyn . 10 (12): 730–5. DOI : 10.1248 / bpb1978.10.730 . PMID 3330562 . 
  19. ^ Таррагу Т, Кичик Н, Клаасен В, Прадес R, Teixidó М, Giralt Е (август 2008 г.). «Байкалин, пролекарство, способное достигать ЦНС, является ингибитором пролилолигопептидазы». Биоорг. Med. Chem . 16 (15): 7516–24. DOI : 10.1016 / j.bmc.2008.04.067 . PMID 18650094 . 
  20. ^ Toide K, M Shinoda, Miyazaki A (1998). «Новый ингибитор пролилэндопептидазы, JTP-4819 - его поведенческие и нейрохимические свойства для лечения болезни Альцгеймера». Rev Neurosci . 9 (1): 17–29. DOI : 10,1515 / revneuro.1998.9.1.17 . PMID 9683325 . S2CID 24450362 .  
  21. ^ Ялканен AJ, Путтонен К.А., Venäläinen Ю.И., Sinervä V, Mannila A, S Руотсалайнен, Jarho Е.М., Wallén Е.А., Männistö PT (февраль 2007). «Благоприятный эффект ингибирования пролилолигопептидазы на пространственную память у молодых, но не у старых крыс, получавших скополамин» . Basic Clin. Pharmacol. Toxicol . 100 (2): 132–8. DOI : 10.1111 / j.1742-7843.2006.00021.x . PMID 17244263 . 
  22. ^ Морене P, P Lestage, De Nanteuil G, Jochemsen R, Робин JL, Guez D, Бойер PA (2002). «S 17092: ингибитор пролилэндопептидазы как потенциальное терапевтическое средство при нарушении памяти. Доклинические и клинические исследования» . CNS Drug Rev . 8 (1): 31–52. DOI : 10.1111 / j.1527-3458.2002.tb00214.x . PMC 6741683 . PMID 12070525 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • пролил + эндопептидаза, + человек в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
  • Запись о пролилэндопептидазе в Национальном центре биотехнологической информации
  • PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для пролилэндопептидазы человека.