Из Википедии, свободной энциклопедии
  (Перенаправлено с вируса Pseudoalteromonas PM2 )
Перейти к навигации Перейти к поиску

Кортиковирус
2w0c capsid.png
Собранный капсид состоит из белков P2 и P3. [1]
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Царство :Вариднавирия
Царство:Bamfordvirae
Тип:Preplasmiviricota
Приказ:Винавиралес
Семья:Corticoviridae
Род:Кортиковирус
Типовой вид
Вирус псевдоальтеромонады PM2

Кортиковирус - это род вирусов семейства Corticoviridae . [2] Кортиковирусы - бактериофаги ; то есть их естественными хозяевами являются бактерии . Род включает два вида, включая типовой вид Pseudoalteromonas virus PM2 (также известный как фаг Pseudoalteromonas PM2 или бактериофаг PM2 ). [2] [3] Название происходит от латинского cortex , corticis (что означает «корка» или «кора»). Однако профагитесно связанные с PM2, в изобилии присутствуют в геномах водных бактерий, что позволяет предположить, что экологическое значение кортиковирусов может быть недооценено. [4] Бактериофаг PM2 был впервые описан в 1968 году после выделения из морской воды, взятой у побережья Чили . [5]

Таксономия [ править ]

Группа: dsDNA

Заказ: Vinavirales

[2]

Вирусология [ править ]

Вироны состоят из круглого икосаэдрического капсида без оболочки диаметром 60 нм и внутренней липидной мембраны, расположенной между внешней и внутренней оболочкой белка . [6] Раковины состоят из трех слоев, на поверхности которых виден узор с отличительными особенностями [7], включая шипы, похожие на кусты, выступающие из двенадцати вершин . [8]

Икосаэдрический капсид (T = 21) имеет диаметр 56 нанометров (нм) и состоит из 1200 белков P1 (шип) и 60 белков P2 (капсид). Шипы связывания пентамерного рецептора выступают из 12 осей пятого порядка. Капсид включает внутреннее липидное ядро, содержащее структурные белки от P3 до P10.

Геном [ править ]

Геном не сегментирован, составляет 13% от веса вируса и содержит одну молекулу круговой, суперскрученной , двухцепочечной ДНК из 10 кило оснований в длину. В геноме содержание g + c составляет 43%. [9] Он кодирует ~ 21 белок.

Транскрипция состоит из трех оперонов.

Репликация генома происходит по механизму катящегося круга, инициированному кодируемой вирусом эндонуклеазой P12.

РодСоставСимметрияКапсидГеномное расположениеГеномная сегментация
КортиковирусМногогранникТ = 21Без оболочкиКруговойОдночастный

Жизненный цикл [ править ]

Репликация вируса происходит в цитоплазме. Проникновение в клетку-хозяин достигается путем адсорбции на поверхности клетки-хозяина с последующим слиянием вирусной мембраны с внешней мембраной клетки-хозяина и последующей доставкой генома внутрь клетки. [10] ДНК-шаблонная транскрипция - это метод транскрипции. Бактерии рода Pseudoalteromonas служат естественным хозяином. Кортиковирус PM2 является литическим вирусом и в конце цикла инфицирования разрушает клетку-хозяин, используя уникальную систему лизиса, состоящую из кодируемых фагом белков P17 и P18, а также неидентифицированного автолизина хозяина. [11]Однако идентификация PM2-подобных провирусов в бактериальных геномах указывает на то, что другие члены этого семейства могут быть вирусами умеренного климата. Пути передачи - пассивное распространение. [3]

РодДетали хостаТканевый тропизмДетали входаДетали выпускаСайт репликацииСайт сборкиПередача инфекции
КортиковирусБактерииНиктоИнъекцияЛизисЦитоплазмаЦитоплазмаПассивная диффузия

Ссылки [ править ]

  1. ^ Abrescia, Никола GA; Граймс, Джонатан М .; Кивеля, Ханна М .; Ассенберг, Рене; Саттон, Джефф Ч .; Мясник, Сара Дж .; Bamford, Jaana KH; Bamford, Dennis H .; Стюарт, Дэвид I. (сентябрь 2008 г.). «Понимание эволюции вирусов и биогенеза мембран на основе структуры морского липид-содержащего бактериофага PM2». Молекулярная клетка . 31 (5): 749–761. DOI : 10.1016 / j.molcel.2008.06.026 . PMID  18775333 .
  2. ^ a b c «Corticoviridae» . Отчет ICTV Online (10-й) .
  3. ^ a b «Вирусная зона» . ExPASy . Проверено 15 июня 2015 года .
  4. ^ Krupovic M, Бэмфорд DH (2007). «Предполагаемые профаги, связанные с литическим бесхвостым морским фагом дцДНК PM2, широко распространены в геномах водных бактерий» (PDF) . BMC Genomics . 8 : 236. DOI : 10.1186 / 1471-2164-8-236 . PMC 1950889 . PMID 17634101 .   
  5. ^ Эспехо, Ромилио Т .; Канело, Элиана С. (апрель 1968 г.). «Свойства бактериофага PM2: липидсодержащий бактериальный вирус». Вирусология . 34 (4): 738–747. DOI : 10.1016 / 0042-6822 (68) 90094-9 .
  6. ^ Kiveld, HM, Kalkkinen, Н. и Бэмфорд, DH (2002). Бактериофаг PM2 имеет белковый капсид, окружающий сферическое липид-белковое ядро ​​» J. Virol. 76, 8169-8178.
  7. ^ Kiveld, НМ, Männistö, RH, Kalkkinen, Н. и Бэмфорд, DH (1999). Очистка и белковый состав PM2, первого изолированноголипидсодержащегобактериального вируса » Virology 262, 364-374.
  8. Перейти ↑ Harrison, SC, Caspar, DL, Camerini-Otero, RD и Franklin, RM (1971). Расположение липидов и белков в бактериофаге PM2. Nat. Новая биол., 229, 197-201.
  9. ^ Männistö, RH, Кивель, НМ, Паулины, Л., Бэмфорд, DH и Бэмфорд, JKH (1999). Полная последовательность генома PM2, первого выделенного липидсодержащего бактериального вируса » Virology 262, 355-363.
  10. ^ Cvirkaite-Krupovic В, Krupovic М, Daugelavicius R, Бэмфорд DH (2010). «Зависимое от ионов кальция проникновение мембраносодержащего бактериофага PM2 в его хозяина Pseudoalteromonas». Вирусология . 405 (1): 120–128. DOI : 10.1016 / j.virol.2010.05.021 . PMID 20646729 . 
  11. ^ Krupovic M, Daugelavicius R, Бэмфорд DH (2007). «Новая система лизиса PM2, липидсодержащего морского двухцепочечного ДНК-бактериофага» . Mol Microbiol . 64 (6): 1635–48. DOI : 10.1111 / j.1365-2958.2007.05769.x . PMID 17555443 . 

Внешние ссылки [ править ]

  • Отчет ICTV Online (10-й): Corticoviridae
  • Вирусная зона : кортиковирус