Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
QDPR
Белок QDPR PDB 1dhr.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1HDR

Идентификаторы
ПсевдонимыQDPR , DHPR, PKU2, SDR33C1, хиноид дигидроптеридинредуктаза, HDHPR
Внешние идентификаторыOMIM : 612676 MGI : 97836 HomoloGene : 271 GeneCard : QDPR
Расположение гена ( человек )
Хромосома 4 (человек)
Chr.Хромосома 4 (человека) [1]
Хромосома 4 (человек)
Геномное расположение QDPR
Геномное расположение QDPR
Группа4п15.32Начинать17 460 261 п.н. [1]
Конец17 512 206 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 5 (мышь)
Chr.Хромосома 5 (мышь) [2]
Хромосома 5 (мышь)
Геномное расположение QDPR
Геномное расположение QDPR
Группа5 B3 | 5 24,9 смНачинать45 434 021 п.н. [2]
Конец45 450 236 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE QDPR 209123 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• белок гомодимеризации активность
• 6,7-dihydropteridine редуктазы
• НАДФНО связывание
• связывание НАДНО
• перенос электроны активность
• оксидоредуктаза активность
Сотовый компонент• цитоплазма
• цитозоль
• митохондрия
• проекция нейрона
• внеклеточная экзосома
Биологический процесс• ответ на глюкагон
• клеточный процесс метаболизма аминокислот
• катаболический процесс L-фенилаланина
• метаболический процесс дигидробиоптерина
• клеточный ответ на лекарство
• ответ на ион свинца
• ответ на ион алюминия
• процесс биосинтеза тетрагидробиоптерина
• развитие печени
• окислительно-восстановительный процесс
• транспорт электронов цепь
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

5860

110391

Ансамбль

ENSG00000151552

ENSMUSG00000015806

UniProt

P09417

Q8BVI4

RefSeq (мРНК)

NM_000320
NM_001306140

NM_024236

RefSeq (белок)

NP_000311
NP_001293069

NP_077198

Расположение (UCSC)Chr 4: 17.46 - 17.51 ​​МбChr 5: 45.43 - 45.45 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

QDPR ( хиноид дигидроптеридинредуктаза ) - это человеческий ген, который продуцирует фермент хиноид дигидроптеридинредуктазу . Этот фермент является частью пути, который перерабатывает вещество, называемое тетрагидробиоптерином , также известным как BH4. Тетрагидробиоптерин работает с ферментом, называемым фенилаланингидроксилазой, для обработки вещества, называемого фенилаланином . Фенилаланин - это аминокислота (строительный блок белков), получаемая с пищей; он содержится во всех белках и в некоторых искусственных подсластителях. Когда тетрагидробиоптерин взаимодействует с фенилаланингидроксилазой, тетрагидробиоптерин изменяется и должен быть переработан в пригодную для использования форму. Регенерация этого вещества имеет решающее значение для правильной обработки некоторых других аминокислот в организме. Тетрагидробиоптерин также помогает производить в мозге определенные химические вещества, называемые нейротрансмиттерами , которые передают сигналы между нервными клетками.

Ген QDPR расположен на коротком (p) плече хромосомы 4 в положении 15.31, от пары оснований 17 164 291 до пары оснований 17 189 981.

В меланоцитарных клетках экспрессия гена QDPR может регулироваться MITF . [5]

Связанные условия [ править ]

Мутации в гене QDPR - частая причина дефицита тетрагидробиоптерина . Было идентифицировано более 30 мутаций, вызывающих нарушение в этом гене, включая аберрантный сплайсинг, аминокислотные замены, вставки или преждевременные окончания. Эти мутации полностью или почти полностью инактивируют хиноид дигидроптеридинредуктазу, которая препятствует нормальному рециклированию тетрагидробиоптерина. В отсутствие пригодного для использования тетрагидробиоптерина организм не может правильно обрабатывать фенилаланин. В результате фенилаланин из рациона накапливается в кровотоке и других тканях и может привести к повреждению мозга. Нейротрансмиттеры в головном мозге также страдают, что приводит к задержке развития, судорогам, двигательным расстройствам и другим симптомам.

Кроме того, снижение активности хиноидной дигидроптеридинредуктазы может вызвать аномальное накопление кальция в определенных частях мозга, что приведет к повреждению нервных клеток.

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000151552 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015806 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Хук К.С., Шлегель Н.С., Эйххофф О.М. и др. (2008). «Новые мишени MITF идентифицированы с использованием двухэтапной стратегии ДНК-микрочипов» . Pigment Cell Melanoma Res . 21 (6): 665–76. DOI : 10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x . PMID 19067971 . S2CID 24698373 .  

Источники [ править ]

  • Romstad A, Kalkanoglu HS, Coskun T., Demirkol M, Tokatli A, Dursun A, Baykal T, Ozalp I, Guldberg P, Guttler F (2000). «Молекулярный анализ 16 турецких семей с дефицитом DHPR с использованием денатурирующего градиентного гель-электрофореза (DGGE)». Hum Genet . 107 (6): 546–53. DOI : 10.1007 / s004390000407 . PMID  11153907 . S2CID  22889048 .
  • Синтаку Х (2002). «Нарушения обмена тетрагидробиоптеринов и их лечение». Curr Drug Metab . 3 (2): 123–31. DOI : 10.2174 / 1389200024605145 . PMID  12003346 .
  • Тони Б., Ауэрбах Г., Блау Н. (2000). «Биосинтез, регенерация и функции тетрагидробиоптерина» . Biochem J . 347 (1): 1–16. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3470001 . PMC  1220924 . PMID  10727395 .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Смукер П.М., Коттон Р.Г. (1995). «Молекулярные основы дефицита дигидроптеридинредуктазы». Гм. Мутат . 5 (4): 279–84. DOI : 10.1002 / humu.1380050402 . PMID  7627180 . S2CID  37519191 .
  • Кауфман С., Хольцман Н.А., Мильстиен С. и др. (1975). «Фенилкетонурия из-за дефицита дигидроптеридинредуктазы». N. Engl. J. Med . 293 (16): 785–90. DOI : 10.1056 / NEJM197510162931601 . PMID  1160969 .
  • Хауэллс Д.В., Форрест С.М., Даль Х.Х., Коттон Р.Г. (1990). «Введение дополнительного кодона для треонина является причиной дефицита дигидроптеридинредуктазы» . Являюсь. J. Hum. Genet . 47 (2): 279–85. PMC  1683733 . PMID  2116088 .
  • Суми С., Исикава Т., Ито Ю. и др. (1990). «Вероятное отнесение гена дигидроптеридинредуктазы к 4p15.31» . Tohoku J. Exp. Med . 160 (1): 93–4. DOI : 10.1620 / tjem.160.93 . PMID  2330583 .
  • Даль Х. Х., Хатчисон В., Макадам В. и др. (1987). «Дигидроптеридинредуктаза человека: характеристика клона кДНК и ее использование в анализе пациентов с дефицитом дигидроптеридинредуктазы» . Nucleic Acids Res . 15 (5): 1921–32. DOI : 10.1093 / NAR / 15.5.1921 . PMC  340608 . PMID  3031582 .
  • Lockyer J, Cook RG, Milstien S, et al. (1987). «Структура и экспрессия дигидроптеридинредуктазы человека» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 84 (10): 3329–33. Bibcode : 1987PNAS ... 84.3329L . DOI : 10.1073 / pnas.84.10.3329 . PMC  304863 . PMID  3033643 .
  • Альтманн П., Аль-Салихи Ф., Баттер К. и др. (1987). «Уровни алюминия в сыворотке и активность дигидроптеридинредуктазы эритроцитов у пациентов, находящихся на гемодиализе». N. Engl. J. Med . 317 (2): 80–4. DOI : 10.1056 / NEJM198707093170204 . PMID  3587329 .
  • Браун Р. М., Даль Х. Х. (1987). «Локализация гена дигидроптеридинредуктазы человека в полосе p15.3 хромосомы 4 путем гибридизации in situ». Геномика . 1 (1): 67–70. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (87) 90106-6 . PMID  3666748 .
  • Наканиши Н., Хасегава Х, Ямада С., Акино М. (1986). «Очистка и физико-химические свойства НАДФН-специфической дигидроптеридинредуктазы из печени крупного рогатого скота и человека». J. Biochem . 99 (3): 635–44. DOI : 10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a135522 . PMID  3711039 .
  • Армарего В.Л., Охниши А., Тагучи Х. (1986). «Новые птеридиновые субстраты для дигидроптеридинредуктазы и пероксидазы хрена» . Биохим. Дж . 234 (2): 335–42. DOI : 10.1042 / bj2340335 . PMC  1146570 . PMID  3718470 .
  • Шен Р.С., Смит Р.В., Дэвис П.Дж., Абелл К.В. (1984). «Ингибирование дигидроптеридинредуктазы из синаптосом полосатого тела человека и печени человека апоморфином и его аналогами». J. Biol. Chem . 259 (14): 8994–9000. PMID  6746636 .
  • Фиргайра Ф.А., Чу К.Х., Коттон Р.Г., Дэнкс Д.М. (1982). «Молекулярное и иммунологическое сравнение дигидроптеридинредуктазы человека в печени, культивируемых фибробластах и ​​непрерывных лимфоидных клетках» . Биохим. Дж . 197 (1): 45–53. DOI : 10.1042 / bj1970045 . PMC  1163053 . PMID  6797415 .
  • Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
  • Като С., Суэока Т., Ямамото Ю., Такахаши С.И. (1994). «Фосфорилирование Ca2 + / кальмодулин-зависимой протеинкиназой II и протеинкиназой C сепиаптеринредуктазы, конечного фермента в пути биосинтеза тетрагидробиоптерина». FEBS Lett . 341 (2–3): 227–32. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (94) 80462-1 . PMID  8137944 . S2CID  35666601 .
  • Су И, Варугезе К.И., Сюонг Н.Х. и др. (1994). «Кристаллографическая структура бинарного комплекса дигидроптеридинредуктазы человека NADH, экспрессируемого в Escherichia coli с помощью кДНК, построенной из его гомолога крысы». J. Biol. Chem . 268 (36): 26836–41. DOI : 10,2210 / pdb1hdr / PDB . PMID  8262916 .
  • Dianzani I, Howells DW, Ponzone A, et al. (1993). «Две новые мутации в гене дигидроптеридинредуктазы у пациентов с дефицитом тетрагидробиоптерина» . J. Med. Genet . 30 (6): 465–9. DOI : 10.1136 / jmg.30.6.465 . PMC  1016417 . PMID  8326489 .
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID  9373149 .
  • Lin CM, Tan Y, Lee YM и др. (1998). «Выражение активности фенилаланингидроксилазы человека в Т-лимфоцитах детей с классической фенилкетонурией с помощью ретровирусного переноса генов». J. Inherit. Метаб. Дис . 20 (6): 742–54. DOI : 10,1023 / A: 1005303331218 . PMID  9427141 . S2CID  22653168 .
  • Дианзани И., де Санктис Л., Смукер П.М. и др. (1998). «Дефицит дигидроптеридинредуктазы: физическая структура гена QDPR, идентификация двух новых мутаций и корреляции генотип-фенотип». Гм. Мутат . 12 (4): 267–73. DOI : 10.1002 / (SICI) 1098-1004 (1998) 12: 4 <267 :: AID-HUMU8> 3.0.CO; 2-C . PMID  9744478 .

Внешние ссылки [ править ]

  • GeneCard для QDPR
  • Тетрагидробиоптерин Домашняя страница