Рекомбинация сигнал связывание белка для иммуноглобулина каппы J области является белком , который в организме человека кодируется RBPJ ген . [5] [6] [7]
RBPJ [8], также известный как CBF1, является человеческим гомологом супрессора гена лысого у дрозофилы . Его промоторная область обычно используется для демонстрации передачи сигналов Notch1 . [9]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Взаимодействие
2 ссылки
3 Дальнейшее чтение
4 Внешние ссылки
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что RBPJ взаимодействует с:
NOTCH1 [10] [11]
NCOR2 , [12] [13]
PCAF , [14]
SND1 , [15] [16] и
SNW1 . [15] [17]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000168214 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039191 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Amakawa R, Цзин Вт, Озав К, Мацуны Н, Хамагучи Y, Мацуд Ж, Kawaichi М, Хондзё Т (август 1993 г.). «Ген белка связывания сигнала рекомбинации Jk человека (IGKJRB): сравнение с его гомологом мыши». Геномика . 17 (2): 306–15. DOI : 10.1006 / geno.1993.1326 . PMID 8406481 .
↑ Тан X, Сайто-Охара Ф, Сонг Дж, Кога С, Угай Х, Мураками Х, Икеучи Т, Йокояма К.К. (июнь 1997 г.). «Присвоение человеческого гена KBF2 / RBP-Jk хромосомам 9p12-13 и 9q13 путем флуоресцентной гибридизации in situ» . Японский журнал генетики человека . 42 (2): 337–41. DOI : 10.1007 / BF02766956 . PMID 9290259 .
^ "Ген NCBI: белок связывания сигнала рекомбинации RBPJ для иммуноглобулиновой области каппа J" .
^ "HGNC: Отчет по символам RBPJ" .
^ Се JJ, Хенкель Т, Р лосося, Роби Е, Петерсон М.Г., Hayward SD (март 1996). «Усеченный Notch1 млекопитающих активирует гены, репрессированные CBF1 / RBPJk, по механизму, напоминающему механизм EBNA2 вируса Эпштейна-Барра» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (3): 952–9. DOI : 10.1128 / mcb.16.3.952 . PMC 231077 . PMID 8622698 .
^ Nam Y, Вэн AP, Aster JC, Blacklow SC (июнь 2003). «Структурные требования для сборки CSL.intracellular Notch1.Mastermind-like 1 комплекса транскрипционной активации» . Журнал биологической химии . 278 (23): 21232–9. DOI : 10.1074 / jbc.M301567200 . PMID 12644465 .
^ Астры JC, Робертсон Е.С., Hasserjian РП, Тернер JR, КлеГГ Е, Склар J (апрель 1997 г.). «Онкогенные формы NOTCH1, лишенные первичного сайта связывания для RBP-Jkappa или последовательностей ядерной локализации, сохраняют способность связываться с RBP-Jkappa и активировать транскрипцию» . Журнал биологической химии . 272 (17): 11336–43. DOI : 10.1074 / jbc.272.17.11336 . PMID 9111040 .
^ Beatus Р, Лундквист Дж, Оберг С, Педерсен К, Lendahl U (июнь 2001). «Происхождение области анкиринового повтора во внутриклеточных доменах Notch имеет решающее значение для регуляции активности промотора HES». Механизмы развития . 104 (1-2): 3-20. DOI : 10.1016 / s0925-4773 (01) 00373-2 . PMID 11404076 . S2CID 9526831 .
↑ Zhou S, Hayward SD (сентябрь 2001 г.). «Ядерная локализация CBF1 регулируется взаимодействиями с корепрессорным комплексом SMRT» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (18): 6222–32. DOI : 10.1128 / mcb.21.18.6222-6232.2001 . PMC 87339 . PMID 11509665 .
^ Kurooka Н, Хондзё Т (июнь 2000). «Функциональное взаимодействие между внутриклеточной областью notch1 мыши и гистоновыми ацетилтрансферазами PCAF и GCN5» . Журнал биологической химии . 275 (22): 17211–20. DOI : 10.1074 / jbc.M000909200 . PMID 10747963 .
^ а б Чжоу С., Фудзимуро М., Се Дж. Дж., Чен Л., Хейворд С. Д. (февраль 2000 г.). «Роль SKIP в активации EBNA2 CBF1-репрессированных промоторов» . Журнал вирусологии . 74 (4): 1939–47. DOI : 10.1128 / jvi.74.4.1939-1947.2000 . PMC 111672 . PMID 10644367 .
^ Се JJ, Чжоу S, Chen L, Young DB, Hayward SD (январь 1999). «CIR, корепрессор, связывающий фактор связывания ДНК CBF1 с гистондеацетилазным комплексом» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (1): 23–8. Bibcode : 1999PNAS ... 96 ... 23H . DOI : 10.1073 / pnas.96.1.23 . PMC 15086 . PMID 9874765 .
^ Чжоу S, Fujimuro М, Се JJ, Чен л, Миямото А, Weinmaster G, Hayward SD (апрель 2000 г.). «SKIP, CBF1-ассоциированный белок, взаимодействует с доменом анкириновых повторов NotchIC для облегчения функции NotchIC» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (7): 2400–10. DOI : 10.1128 / mcb.20.7.2400-2410.2000 . PMC 85419 . PMID 10713164 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Ока С., Кавайчи М. (1995). «V (D) J-рекомбинация генов иммуноглобулинов». Успехи биофизики . 31 : 163–80. DOI : 10.1016 / 0065-227X (95) 99390-B . PMID 7625272 .
Мацунами Н., Хамагучи Ю., Ямамото Ю., Кузе К., Кангава К., Мацуо Н., Кавайчи М., Хондзё Т. (1990). «Белок, связывающийся с последовательностью рекомбинации J каппа генов иммуноглобулинов, содержит последовательность, родственную мотиву интегразы». Природа . 342 (6252): 934–7. DOI : 10.1038 / 342934a0 . PMID 2556644 . S2CID 4370462 .
Тонг X, Драпкин Р., Яламанчили Р., Мосиалос Г., Кифф Е. (сентябрь 1995 г.). «Кислый домен ядерного белка 2 вируса Эпштейна-Барра образует комплекс с новым клеточным коактиватором, который может взаимодействовать с TFIIE» . Молекулярная и клеточная биология . 15 (9): 4735–44. DOI : 10.1128 / mcb.15.9.4735 . PMC 230717 . PMID 7651391 .
Чжао Б., Маршалл Д. Р., Образец CE (июль 1996 г.). «Консервативный домен ядерных антигенов вируса Эпштейна-Барра 3A и 3C связывается с дискретным доменом Jkappa» . Журнал вирусологии . 70 (7): 4228–36. DOI : 10,1128 / JVI.70.7.4228-4236.1996 . PMC 190353 . PMID 8676443 .
Тамура К., Танигучи Ю., Миногути С., Сакаи Т., Тун Т., Фурукава Т., Хондзё Т. (декабрь 1995 г.). «Физическое взаимодействие между новым доменом рецептора Notch и фактором транскрипции RBP-J kappa / Su (H)». Текущая биология . 5 (12): 1416–23. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (95) 00279-X . hdl : 2433/202204 . PMID 8749394 . S2CID 18442572 .
Gress TM, Müller-Pillasch F, Geng M, Zimmerhackl F, Zehetner G, Friess H, Büchler M, Adler G, Lehrach H (октябрь 1996 г.). «Профиль экспрессии, специфичный для рака поджелудочной железы». Онкоген . 13 (8): 1819–30. PMID 8895530 .
Hsieh JJ, Nofziger DE, Weinmaster G, Hayward SD (март 1997 г.). «Иммортализация вируса Эпштейна-Барра: Notch2 взаимодействует с CBF1 и блокирует дифференцировку» . Журнал вирусологии . 71 (3): 1938–45. DOI : 10,1128 / JVI.71.3.1938-1945.1997 . PMC 191274 . PMID 9032325 .
Астер Дж. К., Робертсон Е. С., Хассерджян Р. П., Тернер Дж. Р., Кифф Е., Склар Дж. (Апрель 1997 г.). «Онкогенные формы NOTCH1, лишенные либо первичного сайта связывания для RBP-Jkappa, либо последовательностей ядерной локализации, сохраняют способность связываться с RBP-Jkappa и активировать транскрипцию» . Журнал биологической химии . 272 (17): 11336–43. DOI : 10.1074 / jbc.272.17.11336 . PMID 9111040 .
Као Х.Й., Ордентлих П., Кояно-Накагава Н., Тан З., Даунс М., Кинтнер С.Р., Эванс Р.М., Кадеш Т. (август 1998 г.). «Корепрессорный комплекс гистоновой деацетилазы регулирует путь передачи сигнала Notch» . Гены и развитие . 12 (15): 2269–77. DOI : 10.1101 / gad.12.15.2269 . PMC 317043 . PMID 9694793 .
Се Дж. Дж., Чжоу С., Чен Л., Янг Д. Б., Хейворд С. Д. (январь 1999 г.) «CIR, корепрессор, связывающий фактор связывания ДНК CBF1 с гистондеацетилазным комплексом» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (1): 23–8. Bibcode : 1999PNAS ... 96 ... 23H . DOI : 10.1073 / pnas.96.1.23 . PMC 15086 . PMID 9874765 .
Scanlan MJ, Gordan JD, Williamson B., Stockert E, Bander NH, Jongeneel V, Gure AO, Jäger D, Jager E, Knuth A, Chen YT, Old LJ (ноябрь 1999 г.). «Антигены, распознаваемые аутологичными антителами у пациентов с почечно-клеточной карциномой» . Международный журнал рака . 83 (4): 456–64. DOI : 10.1002 / (SICI) 1097-0215 (19991112) 83: 4 <456 :: AID-IJC4> 3.0.CO; 2-5 . PMID 10508479 .
Каллахан Дж., Астер Дж., Склар Дж., Кифф Э., Робертсон Э.С. (январь 2000 г.). «Внутриклеточные формы человеческого NOTCH1 на совершенно разных уровнях взаимодействуют с RBP-jkappa в человеческих В- и Т-клетках» . Лейкоз . 14 (1): 84–92. DOI : 10.1038 / sj.leu.2401630 . PMID 10637481 .
Смит П.Р., де Хесус О., Тернер Д., Холлиоук М., Карстегл К.Э., Гриффин Б.Е., Карран Л., Ван Й., Хейворд С.Д., Фаррелл П.Дж. (апрель 2000 г.). «Структура и кодирующее содержание РНК семейства CST (BART) вируса Эпштейна-Барра» . Журнал вирусологии . 74 (7): 3082–92. DOI : 10,1128 / JVI.74.7.3082-3092.2000 . PMC 111807 . PMID 10708423 .
Чжоу С., Фуджимуро М., Се Дж.Дж., Чен Л., Миямото А., Вайнмастер Г., Хейворд С.Д. (апрель 2000 г.). «SKIP, CBF1-ассоциированный белок, взаимодействует с доменом анкириновых повторов NotchIC для облегчения функции NotchIC» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (7): 2400–10. DOI : 10.1128 / MCB.20.7.2400-2410.2000 . PMC 85419 . PMID 10713164 .
Куроока Х., Хондзё Т. (июнь 2000 г.). «Функциональное взаимодействие между внутриклеточной областью notch1 мыши и гистоновыми ацетилтрансферазами PCAF и GCN5» . Журнал биологической химии . 275 (22): 17211–20. DOI : 10.1074 / jbc.M000909200 . PMID 10747963 .
Беатус П., Лундквист Дж., Оберг С., Педерсен К., Лендаль Ю. (июнь 2001 г.). «Происхождение области анкиринового повтора во внутриклеточных доменах Notch имеет решающее значение для регуляции активности промотора HES». Механизмы развития . 104 (1-2): 3-20. DOI : 10.1016 / S0925-4773 (01) 00373-2 . PMID 11404076 . S2CID 9526831 .
Чжоу С., Хейворд С.Д. (сентябрь 2001 г.). «Ядерная локализация CBF1 регулируется взаимодействиями с корепрессорным комплексом SMRT» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (18): 6222–32. DOI : 10.1128 / MCB.21.18.6222-6232.2001 . PMC 87339 . PMID 11509665 .
Внешние ссылки [ править ]
RBPJ + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
vтеPDB галерея
2f8x : Кристаллическая структура активированных Notch, CSL и MAML на последовательности ДНК промотора HES-1.
vтеФакторы транскрипции и внутриклеточные рецепторы
(1) Базовые домены
(1.1) Базовая лейциновая молния ( bZIP )
Активирующий фактор транскрипции
AATF
1
2
3
4
5
6
7
АП-1
c-Fos
FOSB
FOSL1
FOSL2
JDP2
с-июн
JUNB
JunD
БАХ
1
2
BATF
BLZF1
C / EBP
α
β
γ
δ
ε
ζ
CREB
1
3
L1
CREM
ДАД
DDIT3
ГАБПА
GCN4
HLF
MAF
B
F
грамм
K
NFE
2
L1
L2
L3
NFIL3
NRL
NRF
1
2
3
XBP1
(1.2) Базовая спираль-петля-спираль ( bHLH )
Группа А
AS-C
ASCL1
ASCL2
ATOH1
РУКА
1
2
MESP2
Миогенные регуляторные факторы
MyoD
Миогенин
MYF5
MYF6
NeuroD
1
2
Нейрогенины
1
2
3
ОЛИГ
1
2
Paraxis
TCF15
Склераксис
SLC
LYL1
TAL
1
2
Крутить
Группа B
FIGLA
Мой с
c-Myc
l-Myc
n-Myc
MXD4
TCF4
Группа C bHLH- PAS
AhR
AHRR
ARNT
ARNTL
ARNTL2
ЧАСЫ
HIF
1А
EPAS1
3А
NPAS
1
2
3
SIM
1
2
Группа D
BHLH
2
3
9
Pho4
Я БЫ
1
2
3
4
Группа E
HES
1
2
3
4
5
6
7
ПРИВЕТ
1
2
L
Группа F bHLH-COE
EBF1
(1.3) bHLH-ZIP
АП-4
МАКСИМУМ
MXD1
MXD3
MITF
MNT
MLX
MLXIPL
MXI1
Мой с
SREBP
1
2
USF1
(1.4) НФ-1
NFI
А
B
C
Икс
SMAD
R-SMAD
1
2
3
5
9
I-SMAD
6
7
4 )
(1.5) RF-X
RFX
1
2
3
4
5
6
АНК
(1.6) Базовая спираль-пролет-спираль (bHSH)
АП-2
α
β
γ
δ
ε
(2) ДНК-связывающие домены цинкового пальца
(2.1) Ядерный рецептор (Cys 4 )
подсемейство 1
Гормон щитовидной железы
α
β
МАШИНА
FXR
LXR
α
β
PPAR
α
β / δ
γ
PXR
RAR
α
β
γ
ROR
α
β
γ
Rev-ErbA
α
β
VDR
подсемейство 2
КУП-ТФ
( Я
II
Ухо-2
HNF4
α
γ
PNR
RXR
α
β
γ
Рецептор яичка
2
4
TLX
подсемейство 3
Стероидный гормон
Андроген
Эстроген
α
β
Глюкокортикоид
Минералокортикоид
Прогестерон
Связанный с эстрогеном
α
β
γ
подсемейство 4
NUR
NGFIB
NOR1
NURR1
подсемейство 5
LRH-1
SF1
подсемейство 6
GCNF
подсемейство 0
DAX1
SHP
(2.2) Другой Cys 4
GATA
1
2
3
4
5
6
MTA
1
2
3
TRPS1
(2.3) Cys 2 His 2
Общие факторы транскрипции
TFIIA
TFIIB
TFIID
TFIIE
1
2
ТФИИФ
1
2
TFIIH
1
2
4
2I
3А
3C1
3C2
ATBF1
BCL
6
11А
11B
CTCF
E4F1
EGR
1
2
3
4
ERV3
GFI1
GLI- Kruppel семьи
1
2
3
ОТДЫХ
S1
S2
YY1
ИК
1
2
HIVEP
1
2
3
IKZF
1
2
3
ILF
2
3
KLF
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
ПРОДАЖА
1
2
3
4
SP
1
2
4
7
8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
7А
7B
ZBTB
11
16
17
20
32
33
40
цинковый палец
3
7
9
10
19
22
24
33B
34
35 год
41 год
43 год
44 год
51
74
143
146
148
165
202
217
219
238
239
259
267
268
281
295
300
318
330
346
350
365
366
384
423
451
452
471
593
638
644
649
655
804A
(2.4) Cys 6
HIVEP1
(2.5) Чередующийся состав
AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
1
2
4
ДЖАРИД
1А
1B
1С
1D
2
JMJD1B
(2.6) WRKY
WRKY
(3) Домены спираль-поворот-спираль
(3.1) Гомеодомен
Antennapedia класс Antp
protoHOX Hox-подобный
ParaHox
GSX
1
2
Xlox
PDX1
Cdx
1
2
4
расширенный Hox: Evx1
Evx2
MEOX1
MEOX2
Homeobox
A1
A2
A3
A4
A5
A7
A9
A10
A11
A13
B1
Би 2
B3
B4
B5
B6
B7
B8
B9
B13
C4
C5
C6
C8
C9
C10
C11
C12
C13
D1
D3
D4
D8
D9
D10
D11
D12
D13
GBX1
GBX2
MNX1
metaHOX NK-подобный
BARHL1
BARHL2
BARX1
BARX2
BSX
DBX
1
2
DLX
1
2
3
4
5
6
EMX
1
2
EN
1
2
HHEX
HLX
LBX1
LBX2
MSX
1
2
NANOG
NKX
2-1
2-2
2-3
2-5
3-1
3-2
HMX1
HMX2
HMX3
6-1
6-2
НАТО
TLX1
TLX2
TLX3
VAX1
VAX2
Другие
ARX
CRX
CUTL1
FHL
1
2
3
HESX1
HOPX
LMX
1А
1B
NOBOX
СКАЗКА
IRX
1
2
3
4
5
6
MKX
Я ЕСТЬ
1
2
АТС
1
2
3
PKNOX
1
2
ШЕСТЬ
1
2
3
4
5
PHF
1
3
6
8
10
16
17
20
21А
POU домен
PIT-1
БРН-3 : А
B
C
Фактор транскрипции октамера : 1
2
3/4
6
7
11
SATB2
ZEB
1
2
(3.2) Парная коробка
PAX
1
2
3
4
5
6
7
8
9
PRRX
1
2
PROP1
ФОКС
2А
2B
RAX
SHOX
SHOX2
VSX1
VSX2
Бикоид
GSC
BICD2
OTX
1
2
PITX
1
2
3
(3.3) Головка вилки / крылатая спираль
E2F
1
2
3
4
5
FOX белки
A1
A2
A3
C1
C2
D3
D4
E1
E3
F1
G1
H1
I1
J1
J2
K1
K2
L2
M1
N1
N3
O1
O3
O4
P1
P2
P3
P4
(3.4) Факторы теплового удара
HSF
1
2
4
(3.5) Кластеры триптофана
ELF
2
4
5
EGF
ELK
1
3
4
ERF
ETS
1
2
ЭРГ
СПИБ
ETV
1
4
5
6
FLI1
Факторы регуляции интерферона
1
2
3
4
5
6
7
8
MYB
MYBL2
(3.6) Домен TEA
фактор усиления транскрипции
1
2
3
4
(4) Факторы β-каркаса с малыми контактами канавок
(4.1) Область гомологии Rel
NF-κB
NFKB1
NFKB2
REL
РЕЛА
RELB
NFAT
C1
C2
C3
C4
5
(4.2) СТАТИСТИКА
СТАТИСТИКА
1
2
3
4
5
6
(4.3) p53-подобный
p53 p63 семья p73
p53
TP63
стр. 73
TBX
1
2
3
5
19
21 год
22
TBR1
TBR2
TFT
MYRF
(4.4) Коробка MADS
Mef2
А
B
C
D
SRF
(4.6) ТАТА-связывающие белки
TBP
TBPL1
(4.7) Высокомобильная группа
BBX
HMGB
1
2
3
4
HMGN
1
2
3
4
HNF
1А
1B
SOX
1
2
3
4
5
6
8
9
10
11
12
13
14
15
18
21 год
SRY
SSRP1
TCF / LEF
TCF
1
3
4
LEF1
ТОКС
1
2
3
4
(4.9) Зернистая голова
TFCP2
(4.10) Область холодного удара
CSDA
YBX1
(4.11) Runt
CBF
CBFA2T2
CBFA2T3
RUNX1
RUNX2
RUNX3
RUNX1T1
(0) Другие факторы транскрипции
(0.2) HMGI (Y)
HMGA
1
2
HBP1
(0.3) Карманный домен
Руб.
RBL1
RBL2
(0.5) Факторы, связанные с AP-2 / EREBP
Апетала 2
EREBP
B3
(0.6) Разное
ARID
1А
1B
2
3А
3B
4А
ШАПКА
ЕСЛИ Я
16
35 год
MLL
2
3
Т1
MNDA
NFY
А
B
C
Ро / Сигма
см. также дефицит фактора транскрипции / корегулятора
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .