Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
RBX1
Белок RBX1 PDB 1ldj.png
Доступные конструкции
PDBПоиск человеческого UniProt: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1LDJ , 1LDK , 1U6G , 2HYE , 2LGV , 3DPL , 3DQV , 3RTR , 4F52 , 4P5O

Идентификаторы
ПсевдонимыRBX1 , BA554C12.1, RNF75, ROC1, кольцевая коробка 1
Внешние идентификаторыOMIM : 603814 MGI : 3710517 HomoloGene : 6872 GeneCards : RBX1
Расположение гена ( человек )
Хромосома 22 (человек)
Chr.Хромосома 22 (человека) [1]
Хромосома 22 (человек)
Геномное расположение RBX1
Геномное расположение RBX1
Группа22q13.2Начинать40 951 347 п.н. [1]
Конец40 973 309 п.н. [1]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE RBX1 218117 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• Связывание с белками семейства каллинов
• GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 - активность убиквитин-протеинлигазы
• связывание с ионами цинка
• связывание с ионами металлов
• активность убиквитин-убиквитинлигазы
• связывание с белками GO: 0001948
• связывание с убиквитин-протеин-лигазой
• активность убиквитин- протеинтрансферазы
• активность трансферазы NEDD8
• связывание фактора транскрипции
• активность трансферазы
• связывание макромолекулярного комплекса GO: 0032403
Сотовый компонент• цитоплазма
• Cullin-RING убиквитинлигазов комплекс
• цитозоля
• SCF убиквитинлигазы комплекс
• VCB комплекс
• Cul2-RING убиквитинлигазов комплекса
• куллин 3-RING убиквитинлигазов комплекса
• куллин 5-RING убиквитинлигазов комплекса
• куллин 7-RING убиквитинлигазы комплекса
• Cul4A- RING E3 убиквитин- лигазный комплекс
• Cul4B-RING E3 убиквитин-лигазный комплекс
• клеточное ядро
• нуклеоплазма
• ядерный SCF убиквитин- лигазный комплекс
• Cul4-RING E3 убиквитин-лигазный комплекс
Биологический процесс• эксцизионная репарация нуклеотидов, распознавание повреждений ДНК
• моноубиквитинирование белков
• каскад MAPK
• клеточный ответ на стимул повреждения ДНК
• неддилирование белка
• глобальная эксцизионная репарация генома
• катаболический процесс белка
• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II в ответ на гипоксию
• связанная с транскрипцией эксцизионная репарация нуклеотидов
• эксцизионная репарация нуклеотидов, разрез ДНК
• негативная регуляция канонического сигнального пути Wnt
• реакция на повреждение ДНК, обнаружение повреждения ДНК
• нуклеотидно-эксцизионная репарация, стабилизация комплекса до разреза
• Репарация ДНК
• Вирусный процесс GO: 0022415
• полиубиквитинирование белка
• эксцизионная репарация нуклеотидов, сборка комплекса до разреза
• эксцизионная репарация нуклеотидов, разрез ДНК, 5'-к поражению
• Путь передачи сигналов Wnt
• комплекс SCF сборка
• негативная регуляция перехода G2 / M митотического клеточного цикла
• посттрансляционная модификация
• позитивная регуляция протеасомного убиквитин-зависимого белкового катаболического процесса
• опосредованный интерлейкином-1 сигнальный путь
• убиквитинирование протеина
• СКФ-зависимая протеасома убиквитин-зависимого процесса катаболического белка
• протеасома-опосредованная убиквитин-зависимого белок процесс катаболического
• убиквитин-зависимого белок процесса катаболического
• ремонт нуклеотид-иссечение, ДНК - дуплекс , разматывании
• нуклеотида-эксцизионная репарация ДНК надрез, 3'-на поражение
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

9978

100043674

Ансамбль

ENSG00000100387

н / д

UniProt

P62877

н / д

RefSeq (мРНК)

NM_014248

XM_006525232
XM_006536722
XM_006537452

RefSeq (белок)

NP_055063

н / д

Расположение (UCSC)Chr 22: 40.95 - 40.97 Мбн / д
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

КОЛЬЦО-бокс белок 1 представляет собой белок , который у человека кодируется RBX1 гена . [4] [5]

Функция [ править ]

Этот ген кодирует эволюционно консервативный белок, который взаимодействует с кулинами . Белок играет уникальную роль в реакции убиквитинирования, гетеродимеризуясь с кулином-1, чтобы катализировать полимеризацию убиквитина. Он также может участвовать в регуляции белкового обмена. [6]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что RBX1 взаимодействует с:

  • CAND1 , [7] [8]
  • CUL1 , [5] [9] [7] [8] [10] [11]
  • CUL2 , [5] [9]
  • CUL4A , [5] [9] [12]
  • CUL5 [5] [13]
  • CUL7 , [9]
  • DCUN1D1 , [8] и
  • P70-S6 Киназа 1 . [14]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000100387 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ Kamura T, Koepp DM, Conrad MN, Skowyra D, Морленд RJ, Илиопулос O, Lane WS, Келин WG, Elledge SJ, Conaway RC, Harper JW, Conaway JW (апрель 1999). «Rbx1, компонент комплекса супрессора опухолей VHL и убиквитинлигазы SCF». Наука . 284 (5414): 657–61. DOI : 10.1126 / science.284.5414.657 . PMID 10213691 . 
  5. ^ a b c d e Ohta T, Мишель JJ, Schottelius AJ, Xiong Y (апрель 1999 г.). «ROC1, гомолог APC11, представляет собой семейство партнеров кулина с ассоциированной активностью убиквитинлигазы». Молекулярная клетка . 3 (4): 535–41. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (00) 80482-7 . PMID 10230407 . 
  6. ^ "Entrez Gene: кольцо кольца RBX1 1" .
  7. ↑ a b Min KW, Hwang JW, Lee JS, Park Y, Tamura TA, Yoon JB (май 2003 г.). «TIP120A связывается с кулинами и модулирует активность убиквитинлигазы» . Журнал биологической химии . 278 (18): 15905–10. DOI : 10.1074 / jbc.M213070200 . PMID 12609982 . 
  8. ^ a b c Ким AY, Bommeljé CC, Lee BE, Yonekawa Y, Choi L, Morris LG, Huang G, Kaufman A, Ryan RJ, Hao B, Ramanathan Y, Singh B (ноябрь 2008 г.). «SCCRO (DCUN1D1) является важным компонентом комплекса E3 для неддилирования» . Журнал биологической химии . 283 (48): 33211–20. DOI : 10.1074 / jbc.M804440200 . PMC 2586271 . PMID 18826954 .  
  9. ^ a b c d Диас, округ Колумбия, Dolios G, Ван Р., Пан ZQ (декабрь 2002 г.). «CUL7: Cullin, содержащий домен DOC, избирательно связывает Skp1.Fbx29 с образованием SCF-подобного комплекса» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (26): 16601–6. DOI : 10.1073 / pnas.252646399 . PMC 139190 . PMID 12481031 .  
  10. ↑ Kim J, Kim JH, Lee SH, Kim DH, Kang HY, Bae SH, Pan ZQ, Seo YS (июль 2002 г.). «Новая ДНК-геликаза человека hFBH1 представляет собой белок F-бокса» . Журнал биологической химии . 277 (27): 24530–7. DOI : 10.1074 / jbc.M201612200 . PMID 11956208 . 
  11. ↑ Zheng N, Schulman BA, Song L, Miller JJ, Jeffrey PD, Wang P, Chu C, Koepp DM, Elledge SJ, Pagano M, Conaway RC, Conaway JW, Harper JW, Pavletich NP (апрель 2002 г.). «Структура комплекса убиквитинлигазы Cul1-Rbx1-Skp1-F boxSkp2 SCF». Природа . 416 (6882): 703–9. DOI : 10.1038 / 416703a . PMID 11961546 . 
  12. ^ Герреро-Санторо Дж, Капетанаки М., Се CL, Gorbachinsky я, Левин А.С., Rapić-Otrin В (июль 2008). «На основе cullin 4B поврежденная УФ-излучением ДНК-связывающая протеин-лигаза связывается с поврежденным УФ-излучением хроматином и убиквитинирует гистон H2A» . Исследования рака . 68 (13): 5014–22. DOI : 10.1158 / 0008-5472.CAN-07-6162 . PMID 18593899 . 
  13. Перейти ↑ Duda DM, Borg LA, Scott DC, Hunt HW, Hammel M, Schulman BA (сентябрь 2008 г.). «Структурное понимание активации NEDD8 лигаз cullin-RING: конформационный контроль конъюгации» . Cell . 134 (6): 995–1006. DOI : 10.1016 / j.cell.2008.07.022 . PMC 2628631 . PMID 18805092 .  
  14. ^ Панасюк Г, Немазаный Я, Филоненко В, Подагра I (май 2008 г.). «Рибосомный протеин S6 киназа 1 взаимодействует и убиквитинируется убиквитинлигазой ROC1». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 369 (2): 339–43. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2008.02.016 . PMID 18279656 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Skowyra D, Koepp DM, Kamura T., Conrad MN, Conaway RC, Conaway JW, Elledge SJ, Harper JW (апрель 1999 г.). «Восстановление убиквитинирования G1 циклина комплексами, содержащими SCFGrr1 и Rbx1». Наука . 284 (5414): 662–5. DOI : 10.1126 / science.284.5414.662 . PMID  10213692 .
  • Тан П., Фукс С.И., Чен А., Ву К., Гомес С., Ронаи З., Пан З.К. (апрель 1999 г.). «Рекрутирование убиквитинлигазы ROC1-CUL1 с помощью Skp1 и HOS, чтобы катализировать убиквитинирование I каппа B альфа» . Молекулярная клетка . 3 (4): 527–33. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (00) 80481-5 . PMID  10230406 .
  • Winston JT, Koepp DM, Zhu C, Elledge SJ, Harper JW (октябрь 1999 г.). «Семейство белков F-бокса млекопитающих». Текущая биология . 9 (20): 1180–2. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (00) 80021-4 . PMID  10531037 .
  • Камура Т., Конрад М.Н., Ян К., Конавей Р.С., Конавей Д.В. (ноябрь 1999 г.). «Субъединица Rbx1 SCF и VHL E3 убиквитинлигазы активирует Rub1 модификацию культинов Cdc53 и Cul2» . Гены и развитие . 13 (22): 2928–33. DOI : 10,1101 / gad.13.22.2928 . PMC  317157 . PMID  10579999 .
  • Данхэм И., Шимидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж. Э., Брускевич Р., Беар Д.М., Зажим М., Сминк Л.Дж., Эйнскау Р., Алмейда Дж. П., Бэббидж А., Баггулей С., Бейли Дж., Барлоу К., Бейтс К.Н. , Бисли О., Берд С.П., Блейки С., Бриджман А.М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл В.Д., О'Брайен КП (декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека» . Природа . 402 (6761): 489–95. DOI : 10.1038 / 990031 . PMID  10591208 .
  • Seddiqi N, Charbonnier F, Goudou D, Belkadi L, Rieger F, Alliel PM (декабрь 1999 г.). «Геномная организация и экспрессия белка, ассоциированного с убиквитин-протеасомным комплексом Rbx1 / ROC1 / Hrt1». Клеточная и молекулярная биология . 45 (8): 1131–7. PMID  10643962 .
  • Read MA, Brownell JE, Gladysheva TB, Hottelet M, Parent LA, Coggins MB, Pierce JW, Podust VN, Luo RS, Chau V, Palombella VJ (апрель 2000 г.). «Nedd8-модификация cul-1 активирует SCF (бета (TrCP)) - зависимое убиквитинирование IkappaBalpha» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (7): 2326–33. DOI : 10.1128 / MCB.20.7.2326-2333.2000 . PMC  85397 . PMID  10713156 .
  • Furukawa M, Zhang Y, McCarville J, Ohta T, Xiong Y (ноябрь 2000 г.). «C-концевая последовательность CUL1 и ROC1 необходимы для эффективного накопления в ядре, модификации NEDD8 и активности убиквитинлигазы CUL1» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (21): 8185–97. DOI : 10.1128 / MCB.20.21.8185-8197.2000 . PMC  86428 . PMID  11027288 .
  • Маэда I, Охта Т., Коидзуми Х., Фукуда М. (апрель 2001 г.). «Убиквитинирование циклина D1 in vitro с помощью ROC1-CUL1 и ROC1-CUL3» . Письма FEBS . 494 (3): 181–5. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (01) 02343-2 . PMID  11311237 .
  • Ляпина С., Коуп Г., Шевченко А., Серино Г., Цуге Т., Чжоу С., Вольф Д.А., Вей Н., Шевченко А., Дешайес Р.Дж. (май 2001 г.). «Содействие расщеплению конъюгата NEDD-CUL1 сигнаносомой COP9». Наука . 292 (5520): 1382–5. DOI : 10.1126 / science.1059780 . PMID  11337588 .
  • Фукути М., Имамура Т., Чиба Т., Эбисава Т., Кавабата М., Танака К., Миядзоно К. (май 2001 г.). «Лиганд-зависимая деградация Smad3 убиквитинлигазным комплексом ROC1 и связанных белков» . Молекулярная биология клетки . 12 (5): 1431–43. DOI : 10.1091 / mbc.12.5.1431 . PMC  34595 . PMID  11359933 .
  • Камура Т., Буриан Д., Ян К., Шмидт С.Л., Лейн В.С., Керидо Е., Брантон П.Е., Шилатифард А., Конавей Р.К., Конавей Д.В. (август 2001 г.). «Muf1, новый белок с лейцином-повтором, взаимодействующий с Elongin BC, который может собираться с Cul5 и Rbx1 для восстановления убиквитинлигазы» . Журнал биологической химии . 276 (32): 29748–53. DOI : 10.1074 / jbc.M103093200 . PMID  11384984 .
  • Ву К., Чен А., Тан П, Пан З. К. (январь 2002 г.). «Nedd8-конъюгированная с ядром ROC1-CUL1 убиквитинлигаза использует заряженные поверхностные остатки Nedd8 для эффективной сборки полиубиквитиновой цепи, катализируемой Cdc34» . Журнал биологической химии . 277 (1): 516–27. DOI : 10.1074 / jbc.M108008200 . PMID  11675391 .
  • Гомес, доктор медицины, Лекер С.Х., Джагое Р.Т., Навон А., Голдберг А.Л. (декабрь 2001 г.). «Атрогин-1, мышечно-специфический белок F-бокса, высоко экспрессируемый во время мышечной атрофии» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (25): 14440–5. DOI : 10.1073 / pnas.251541198 . PMC  64700 . PMID  11717410 .
  • Kim J, Kim JH, Lee SH, Kim DH, Kang HY, Bae SH, Pan ZQ, Seo YS (июль 2002 г.). «Новая ДНК-геликаза человека hFBH1 представляет собой белок F-бокса» . Журнал биологической химии . 277 (27): 24530–7. DOI : 10.1074 / jbc.M201612200 . PMID  11956208 .
  • Чжэн Н., Шульман Б.А., Сонг Л., Миллер Дж. Дж., Джеффри П. Д., Ван П., Чу С., Кепп Д. М., Элледж С. Дж., Пагано М., Конавей Р. К., Конавей Дж. В., Харпер Дж. В., Павлетич Н. П. (апрель 2002 г.). «Структура комплекса убиквитинлигазы Cul1-Rbx1-Skp1-F boxSkp2 SCF». Природа . 416 (6882): 703–9. DOI : 10.1038 / 416703a . PMID  11961546 .
  • Yoshida Y, Chiba T, Tokunaga F, Kawasaki H, Iwai K, Suzuki T, Ito Y, Matsuoka K, Yoshida M, Tanaka K, Tai T (июль 2002 г.). «Убиквитинлигаза E3, распознающая сахарные цепи». Природа . 418 (6896): 438–42. DOI : 10,1038 / природа00890 . PMID  12140560 .
  • Брауэр С.С., Сато С., Томомори-Сато С., Камура Т., Пауза А., Стирман Р., Клауснер Р.Д., Малик С., Лейн В.С., Сорокина И., Редер Р., Конавей Дж. У., Конавей Р.С. (август 2002 г.). «Медиаторная субъединица млекопитающих mMED8 представляет собой белок, взаимодействующий с элонгином BC, который может собираться с Cul2 и Rbx1 для восстановления убиквитинлигазы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (16): 10353–8. DOI : 10.1073 / pnas.162424199 . PMC  124918 . PMID  12149480 .