Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
RFC3
Идентификаторы
ПсевдонимыRFC3 , RFC38, субъединица 3 фактора репликации C
Внешние идентификаторыOMIM : 600405 MGI : 1916513 HomoloGene : 2188 GeneCards : RFC3
Расположение гена ( человек )
Хромосома 13 (человек)
Chr.Хромосома 13 (человека) [1]
Хромосома 13 (человек)
Геномное расположение RFC3
Геномное расположение RFC3
Группа13q13.2Начинать33 818 069 п.н. [1]
Конец33 966 558 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 5 (мышь)
Chr.Хромосома 5 (мышь) [2]
Хромосома 5 (мышь)
Геномное расположение RFC3
Геномное расположение RFC3
Группа5 | 5 G3Начинать151 642 756 п.н. [2]
Конец151 651 242 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE RFC3 204127 в формате fs.png

PBB GE RFC3 204128 s на fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов
Молекулярная функция• ГО: 0043142 одноцепочечной ДНК хеликаз активность
• Активность АТФаза
• ГО: связывание белка 0001948
• связывание ДНК
• Зажим загрузчик ДНК активность
Сотовый компонент• RFC-подобный комплекс Ctf18
• нуклеоплазма
• комплекс фактора репликации ДНК C
• ядро клетки
Биологический процесс• ответ повреждения ДНК, обнаружение повреждений ДНК
• ремонт нуклеотид-эксцизионного, ДНК заполнения зазора
• синтез ДНК , участвующая в репарации ДНК
• синтез безошибочной translesion
• цепи ДНК удлинения , участвующие в репликации ДНК
• подверженных ошибки синтез translesion
• положительного регулирование ДНК -directed ДНК - полимеразная активность
• ответ на фосфорорганический
• translesion синтез
• транскрипция в сочетании нуклеотида-эксцизионная репарация
• ремонт нуклеотида-иссечение, рассечение ДНК
• репликация ДНК
• ремонт нуклеотида-иссечение, ДНК надрез, 5'-к поражению
• поддержание теломер посредством полуконсервативной репликации
• ДНК-зависимая репликация ДНК
• регуляция передачи сигнала медиатором класса p53
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

5983

69263

Ансамбль

ENSG00000133119

ENSMUSG00000033970

UniProt

P40938

Q8R323

RefSeq (мРНК)

NM_002915
NM_181558

NM_027009

RefSeq (белок)

NP_002906
NP_853536

NP_081285

Расположение (UCSC)Chr 13: 33,82 - 33,97 МбChr 5: 151.64 - 151.65 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Коэффициент репликации С субъединица 3 представляет собой белок , который у человека кодируется RFC3 гена . [5] [6]

Функция [ править ]

Для удлинения примированных ДНК-матриц с помощью ДНК-полимеразы дельта и ДНК-полимеразы эпсилон требуются дополнительные белки, ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA) и фактор репликации C (RFC). RFC, также называемый активатором 1, представляет собой белковый комплекс, состоящий из пяти отдельных субъединиц 140, 40, 38, 37 и 36 кДа. Этот ген кодирует субъединицу 38 кДа. Эта субъединица важна для взаимодействия между субъединицей 140 кДа и основным комплексом, который состоит из субъединиц 36, 37 и 40 кДа. Описаны альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы. [6]

Взаимодействия [ править ]

RFC3 взаимодействует с:

  • BRD4 , [7]
  • CHTF18 , [8] [9]
  • PCNA , [9] [10]
  • RFC1 , [11] [12] [13] и
  • RFC4 . [11] [12]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000133119 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033970 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Окумура К, Ноги М, Тагучи Н, декан FB, Чен М, пан ZQ, гурвицева Дж, Сираторьте А, Мураки Y, Озава К (январь 1995). «Присвоение генов субъединиц 36,5 кД (RFC5), 37 кД (RFC4), 38 кД (RFC3) и 40 кДа (RFC2) человеческого фактора репликации C полосам хромосом 12q24.2-q24.3, 3q27, 13q12.3-q13 и 7q11.23 ". Геномика . 25 (1): 274–8. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (95) 80135-9 . PMID 7774928 . 
  6. ^ a b «Ген Entrez: фактор репликации RFC3 C (активатор 1) 3, 38 кДа» .
  7. ↑ Маруяма Т., Фарина А., Дей А., Чонг Дж., Бермудес В.П., Тамура Т., Скиортино С., Шуман Дж., Гурвиц Дж., Озато К. (сентябрь 2002 г.). «Белок бромодомена млекопитающих, brd4, взаимодействует с фактором репликации C и ингибирует переход к S-фазе» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (18): 6509–20. DOI : 10.1128 / mcb.22.18.6509-6520.2002 . PMC 135621 . PMID 12192049 .  
  8. ^ Бермудез В.П., МАНИВА Y, Таппин я, Ozato К, Yokomori К, J Гурвица (сентябрь 2003). «Альтернативный комплекс Ctf18-Dcc1-Ctf8-фактор репликации C, необходимый для когезии сестринских хроматид, загружает ядерный антиген пролиферирующих клеток на ДНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (18): 10237–42. DOI : 10.1073 / pnas.1434308100 . PMC 193545 . PMID 12930902 .  
  9. ^ a b Меркл CJ, Карниц LM, Генри-Санчес JT, Чен J (август 2003). «Клонирование и характеристика hCTF18, hCTF8 и hDCC1. Человеческие гомологи комплекса Saccharomyces cerevisiae, участвующие в установлении когезии сестринских хроматид» . Журнал биологической химии . 278 (32): 30051–6. DOI : 10.1074 / jbc.M211591200 . PMID 12766176 . 
  10. ↑ Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (октябрь 2002 г.). «Протеомический подход к идентификации белков, связывающих ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA), в лизатах клеток человека. Идентификация человеческого комплекса CHL12 / RFCs2-5 как нового белка, связывающего PCNA» . Журнал биологической химии . 277 (43): 40362–7. DOI : 10.1074 / jbc.M206194200 . PMID 12171929 . 
  11. ↑ a b Ellison V, Stillman B (март 1998). «Восстановление рекомбинантного человеческого фактора репликации C (RFC) и идентификация субкомплекса RFC, обладающего ДНК-зависимой активностью АТФазы» . Журнал биологической химии . 273 (10): 5979–87. DOI : 10.1074 / jbc.273.10.5979 . PMID 9488738 . 
  12. ^ a b Ульманн Ф., Цай Дж., Флорес-Розас Х., Дин Ф. Б., Финкельштейн Дж., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (июнь 1996 г.). «Восстановление человеческого фактора репликации С из его пяти субъединиц in vitro» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (13): 6521–6. DOI : 10.1073 / pnas.93.13.6521 . PMC 39056 . PMID 8692848 .  
  13. ^ Tomida Дж, Масуда Y, Хироаки Н, Ишикава Т, песни I, Tsurimoto Т, Tateishi S, Shiomi Т, Камеи У, Ким Дж, Камия К, Р.Вазири С, Ohmori Н, Todo Т (апрель 2008 г.). «Убиквитилирование субъединицы RFC2 комплекса фактора репликации С, вызванное повреждением ДНК» . Журнал биологической химии . 283 (14): 9071–9. DOI : 10.1074 / jbc.M709835200 . PMC 2431014 . PMID 18245774 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
  • О'Доннелл М., Онраст Р., Дин Ф. Б., Чен М., Гурвиц Дж. (Январь 1993 г.). «Гомология дополнительных белков репликативных полимераз - E. coli для человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 21 (1): 1–3. DOI : 10.1093 / nar / 21.1.1 . PMC  309057 . PMID  8441605 .
  • Ульманн Ф., Цай Дж., Флорес-Розас Х., Дин Ф. Б., Финкельштейн Дж., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Июнь 1996 г.). «Восстановление человеческого фактора репликации С из его пяти субъединиц in vitro» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (13): 6521–6. DOI : 10.1073 / pnas.93.13.6521 . PMC  39056 . PMID  8692848 .
  • Ульманн Ф., Цай Дж., Гиббс Э., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Апрель 1997 г.). «Делеционный анализ большой субъединицы p140 в человеческом факторе репликации C выявляет области, необходимые для комплексообразования и репликационной активности» . Журнал биологической химии . 272 (15): 10058–64. DOI : 10.1074 / jbc.272.15.10058 . PMID  9092549 .
  • Куек Т.П., Чо Х., Мальдонадо Э., Мейер Дж., Рейнберг Д., Петерлин Б.М. (апрель 1997 г.). «Трансактиватор вируса иммунодефицита человека Tat взаимодействует с холоферментом РНК-полимеразы II» . Молекулярная и клеточная биология . 17 (4): 1817–23. DOI : 10,1128 / MCB.17.4.1817 . PMC  232028 . PMID  9121429 .
  • Цай Дж., Гиббс Э., Ульманн Ф., Филлипс Б., Яо Н., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Июль 1997 г.). «Комплекс, состоящий из субъединиц человеческого фактора репликации C p40, p37 и p36, является ДНК-зависимой АТФазой и промежуточным звеном в сборке холофермента» . Журнал биологической химии . 272 (30): 18974–81. DOI : 10.1074 / jbc.272.30.18974 . PMID  9228079 .
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID  9373149 .
  • Эллисон В., Стиллман Б. (март 1998 г.). «Восстановление рекомбинантного человеческого фактора репликации C (RFC) и идентификация субкомплекса RFC, обладающего ДНК-зависимой активностью АТФазы» . Журнал биологической химии . 273 (10): 5979–87. DOI : 10.1074 / jbc.273.10.5979 . PMID  9488738 .
  • Чжан Г., Гиббс Э., Кельман З., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Март 1999 г.). «Исследования взаимодействий между фактором репликации С человека и ядерным антигеном пролиферирующих клеток человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (5): 1869–74. DOI : 10.1073 / pnas.96.5.1869 . PMC  26703 . PMID  10051561 .
  • Рауэн М., Буртелоу М.А., Дюфа В.М., Карниц Л.М. (сентябрь 2000 г.). «Белок контрольной точки человека hRad17 взаимодействует с PCNA-подобными белками hRad1, hHus1 и hRad9» . Журнал биологической химии . 275 (38): 29767–71. DOI : 10.1074 / jbc.M005782200 . PMID  10884395 .
  • Линдси-Больц Л.А., Бермудес В.П., Гурвиц Дж., Санкар А. (сентябрь 2001 г.). «Очистка и характеристика комплексов Rad в контрольной точке повреждения ДНК человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (20): 11236–41. DOI : 10.1073 / pnas.201373498 . PMC  58713 . PMID  11572977 .
  • Гриффит Дж. Д., Линдси-Больц Л. А., Санкар А. (май 2002 г.). «Структуры человеческого Rad17-фактор репликации C и контрольных точек Rad 9-1-1, визуализированные с помощью глицеринового спрея / низковольтной микроскопии» . Журнал биологической химии . 277 (18): 15233–6. DOI : 10.1074 / jbc.C200129200 . PMID  11907025 .
  • Охта С., Сиоми Ю., Сугимото К., Обусе С., Цуримото Т. (октябрь 2002 г.). «Протеомический подход к идентификации белков, связывающих ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA), в лизатах клеток человека. Идентификация человеческого комплекса CHL12 / RFCs2-5 как нового белка, связывающего PCNA» . Журнал биологической химии . 277 (43): 40362–7. DOI : 10.1074 / jbc.M206194200 . PMID  12171929 .
  • Маруяма Т., Фарина А., Дей А., Чеонг Дж., Бермудес В.П., Тамура Т., Шортино С., Шуман Дж., Гурвиц Дж., Озато К. (сентябрь 2002 г.). «Белок бромодомена млекопитающих, brd4, взаимодействует с фактором репликации C и ингибирует переход к S-фазе» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (18): 6509–20. DOI : 10.1128 / MCB.22.18.6509-6520.2002 . PMC  135621 . PMID  12192049 .
  • Меркл С.Дж., Карниц Л.М., Генри-Санчес Д.Т., Чен Дж. (Август 2003 г.). «Клонирование и характеристика hCTF18, hCTF8 и hDCC1. Человеческие гомологи комплекса Saccharomyces cerevisiae, участвующие в установлении когезии сестринских хроматид» . Журнал биологической химии . 278 (32): 30051–6. DOI : 10.1074 / jbc.M211591200 . PMID  12766176 .
  • Бермудес В.П., Манива Ю., Таппин И., Озато К., Йокомори К., Гурвиц Дж. (Сентябрь 2003 г.). «Альтернативный комплекс Ctf18-Dcc1-Ctf8-фактор репликации C, необходимый для когезии сестринских хроматид, загружает ядерный антиген пролиферирующих клеток на ДНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (18): 10237–42. DOI : 10.1073 / pnas.1434308100 . PMC  193545 . PMID  12930902 .
  • Цзоу Л., Лю Д., Элледж С.Дж. (ноябрь 2003 г.). «Репликация белка А-опосредованного рекрутирования и активации комплексов Rad17» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (24): 13827–32. DOI : 10.1073 / pnas.2336100100 . PMC  283506 . PMID  14605214 .