Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
RXRB
Белок RXRB PDB 1by4.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1Х9У , 1УХЛ , 5ХДЖП , 5И4В

Идентификаторы
ПсевдонимыRXRB , DAUDI6, H-2RIIBP, NR2B2, RCoR-1, ретиноидный рецептор X бета
Внешние идентификаторыOMIM: 180246 MGI: 98215 HomoloGene: 7923 Генные карты : RXRB
Расположение гена (человек)
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человека) [1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение RXRB
Геномное расположение RXRB
Группа6п21.32Начинать33 193 588 п.н. [1]
Конец33 200 688 п.н. [1]
Расположение гена (Мышь)
Хромосома 17 (мышь)
Chr.Хромосома 17 (мышь) [2]
Хромосома 17 (мышь)
Геномное расположение RXRB
Геномное расположение RXRB
Группа17 B1 | 17 17,98 смНачинать34 031 812 п.н. [2]
Конец34 038 399 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE RXRB 209148 в формате fs.png

PBB GE RXRB 215099 s в формате fs.png

PBB GE RXRB 215098 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• связывания ДНК
• последовательность-специфической ДНК связывания
• РНК - полимеразы регуляторной области ДНК последовательности специфических II связывания
• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 ДНК-связывающий фактор активности транскрипции
• ГО: 0001077, ГО: 0001212 , GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 ДНК-связывающая активность активатора транскрипции, специфическая
для РНК-полимеразы II • Коактиватор транскрипции GO: 0001105
• Связывание с ионами цинка
• Связывание с ионами металлов
• Активность рецептора стероидных гормонов
• GO: 0038050, GO : 0004886, GO: 0038051 активность ядерного рецептора
• Связывание с белком GO: 0001948
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II
Сотовый компонент• нуклеоплазма
• ядро клетки
Биологический процесс• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• транскрипция, ДНК-шаблон
• сигнальный путь рецептора ретиноевой кислоты
• инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• опосредованный стероидным гормоном сигнальный путь
• внутриклеточный сигнальный путь рецептора
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

6257

20182

Ансамбль
ENSG00000235712
ENSG00000231321
ENSG00000227322
ENSG00000204231
ENSG00000206289

ENSG00000228333

ENSMUSG00000039656

UniProt

P28702
Q5STP9

P28704

RefSeq (мРНК)

NM_001270401
NM_001291989
NM_021976

NM_001205214
NM_001205215
NM_001205216
NM_011306

RefSeq (белок)

NP_001257330
NP_001278918
NP_068811
NP_068811.1

NP_001192143
NP_001192144
NP_001192145
NP_035436

Расположение (UCSC)Chr 6: 33.19 - 33,2 МбChr 17: 34.03 - 34.04 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Бета-рецептор ретиноида X ( RXR-бета ), также известный как NR2B2 (подсемейство ядерных рецепторов 2, группа B, член 2), представляет собой ядерный рецептор, который у человека кодируется геном RXRB . [5] [6]

Этот ген кодирует член семейства ядерных рецепторов ретиноидных рецепторов X (RXR), которые участвуют в опосредовании эффектов ретиноевой кислоты (RA). Этот рецептор образует гетеродимеры с рецепторами ретиноевой кислоты , гормона щитовидной железы и витамина D , увеличивая как связывание ДНК, так и функцию транскрипции на их соответствующих ответных элементах. Ген находится в районе класса II главного комплекса гистосовместимости (MHC) на хромосоме 6. Описан альтернативно сплайсированный вариант транскрипта, но его полноразмерная последовательность не определена. [6]

Интерактивная карта проезда [ править ]

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи. [§ 1]

  1. ^ Интерактивную карту путей можно отредактировать на WikiPathways: "VitaminDSynthesis_WP1531" .

См. Также [ править ]

  • Ретиноидный рецептор X

Ссылки [ править ]

  1. ^ Б с ENSG00000231321, ENSG00000227322, ENSG00000204231, ENSG00000206289, ENSG00000228333 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000235712, ENSG00000231321, ENSG00000227322, ENSG00000204231, ENSG00000206289, ENSG00000228333 - Ensembl , май 2017
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039656 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Фицгиббон Дж, Джиллетты GT, Вудворд КДж, Бойл Ю.М., Вольф Дж, Поуви S (июль 1993). «Отображение RXRB на хромосоме человека 6p21.3». Анналы генетики человека . 57 (Pt 3): 203–9. DOI : 10.1111 / j.1469-1809.1993.tb01596.x . PMID 8257090 . S2CID 26964941 .  
  6. ^ a b «Ген Энтреза: рецептор ретиноида X RXRB, бета» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Санто А., Наркар В., Шен К., Урай И. П., Дэвис П. Дж., Надь Л. (декабрь 2004 г.). «Ретиноидные X-рецепторы: X-проявляют свои (пато) физиологические функции» . Гибель клеток и дифференциация . 11 Приложение 2: S126–43. DOI : 10.1038 / sj.cdd.4401533 . PMID  15608692 .
  • Лейд М., Кастнер П., Лайонс Р., Накшатри Х., Сондерс М., Захаревски Т., Чен Дж.Й., Стауб А., Гарнье Дж. М., Мадер С. (январь 1992 г.). «Очистка, клонирование и идентичность RXR клеточного фактора HeLa, с которым RAR или TR гетеродимеризуются для эффективного связывания целевых последовательностей». Cell . 68 (2): 377–95. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (92) 90478-U . PMID  1310259 . S2CID  40617478 .
  • Fleischhauer K, Park JH, DiSanto JP, Marks M, Ozato K, Yang SY (апрель 1992 г.). «Выделение полноразмерного клона кДНК, кодирующего N-концевую вариантную форму бета-рецептора ретиноида X человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 20 (7): 1801 DOI : 10,1093 / NAR / 20.7.1801 . PMC  312273 . PMID  1315958 .
  • Берродин Т.Дж., Маркс М.С., Озато К., Линни Э., Лазар М.А. (сентябрь 1992 г.). «Гетеродимеризация рецептора тироидного гормона, рецептора ретиноевой кислоты, ретиноидного рецептора X, фактора транскрипции вышестоящего промотора куриного овальбумина и эндогенного белка печени». Молекулярная эндокринология . 6 (9): 1468–78. DOI : 10,1210 / me.6.9.1468 . PMID  1331778 .
  • Эпплен С., Эпплен Дж. Т. (1992). «Последовательность кДНК человека, гомологичная гену белка, связывающего промотор МНС класса I мыши, содержит четыре дополнительных кодона в лимфоцитах». Геном млекопитающих . 3 (8): 472–5. DOI : 10.1007 / BF00356161 . PMID  1514958 . S2CID  1278904 .
  • Yu VC, Delsert C, Andersen B, Holloway JM, Devary OV, Näär AM, Kim SY, Boutin JM, Glass CK, Rosenfeld MG (декабрь 1991 г.). «RXR beta: корегулятор, который усиливает связывание ретиноевой кислоты, гормона щитовидной железы и рецепторов витамина D с их родственными ответными элементами». Cell . 67 (6): 1251–66. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (91) 90301-E . PMID  1662118 . S2CID  10354699 .
  • Оньяте С.А., Цай С.Ю., Цай М.Дж., О'Мэлли Б.В. (ноябрь 1995 г.). «Последовательность и характеристика коактиватора суперсемейства рецепторов стероидных гормонов». Наука . 270 (5240): 1354–7. Bibcode : 1995Sci ... 270.1354O . DOI : 10.1126 / science.270.5240.1354 . PMID  7481822 . S2CID  28749162 .
  • Kooistra T, Lansink M, Arts J, Sitter T, Toet K (сентябрь 1995 г.). «Вовлечение рецептора ретиноевой кислоты альфа в стимуляцию экспрессии гена активатора плазминогена тканевого типа в эндотелиальных клетках человека». Европейский журнал биохимии / FEBS . 232 (2): 425–32. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1995.425zz.x . PMID  7556191 .
  • Перлманн Т., Янссон Л. (апрель 1995 г.). «Новый путь передачи сигналов витамина А, опосредованный гетеродимеризацией RXR с NGFI-B и NURR1» . Гены и развитие . 9 (7): 769–82. DOI : 10,1101 / gad.9.7.769 . PMID  7705655 .
  • Форман Б.М., Умесоно К., Чен Дж., Эванс Р.М. (май 1995 г.). «Уникальные пути ответа устанавливаются аллостерическими взаимодействиями между рецепторами ядерных гормонов». Cell . 81 (4): 541–50. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (95) 90075-6 . PMID  7758108 . S2CID  3203590 .
  • Занария Э., Мускателли Ф., Бардони Б., Стром Т.М., Гуйоли С., Го В., Лалли Э., Мозер С., Уокер А.П., МакКейб Е.Р. (декабрь 1994 г.). «Необычный член суперсемейства ядерных гормональных рецепторов, ответственный за врожденную Х-сцепленную гипоплазию надпочечников». Природа . 372 (6507): 635–41. Bibcode : 1994Natur.372..635Z . DOI : 10.1038 / 372635a0 . PMID  7990953 . S2CID  4363344 .
  • Алмасан А., Мангельсдорф Д. Д., Онг Э. С., Валь Г. М., Эванс Р. М. (апрель 1994 г.). «Хромосомная локализация рецепторов ретиноида X человека». Геномика . 20 (3): 397–403. DOI : 10.1006 / geno.1994.1193 . PMID  8034312 .
  • Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
  • Флейшхауэр К., Макбрайд О.В., ДиСанто Дж. П., Озато К., Ян С.Ю. (январь 1993 г.). «Клонирование и картирование хромосом человеческого ретиноидного рецептора X бета: селективное сохранение аминокислотной последовательности рецептора ядерного гормона у млекопитающих». Генетика человека . 90 (5): 505–10. DOI : 10.1007 / BF00217449 . PMID  8381386 . S2CID  26472949 .
  • May M, Mengus G, Lavigne AC, Chambon P, Davidson I (июнь 1996 г.). «Человеческий TAF (II28) способствует стимуляции транскрипции за счет активации функции 2 ретиноидных рецепторов X» . Журнал EMBO . 15 (12): 3093–104. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00672.x . PMC  450252 . PMID  8670810 .
  • Боналду М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. DOI : 10.1101 / gr.6.9.791 . PMID  8889548 .
  • Joyeux A, Cavaillès V, Balaguer P, Nicolas JC (февраль 1997 г.). «RIP 140 усиливает зависимую от ядерного рецептора транскрипцию in vivo у дрожжей» . Молекулярная эндокринология . 11 (2): 193–202. DOI : 10,1210 / me.11.2.193 . PMID  9013766 .
  • Xu XC, Sozzi G, Lee JS, Lee JJ, Pastorino U, Pilotti S, Kurie JM, Hong WK, Lotan R (май 1997 г.). «Подавление бета рецептора ретиноевой кислоты при немелкоклеточном раке легкого in vivo: последствия для развития рака легкого» . Журнал Национального института рака . 89 (9): 624–9. DOI : 10.1093 / JNCI / 89.9.624 . PMID  9150186 .
  • Чен Х., Лин Р.Дж., Шильц Р.Л., Чакраварти Д., Нэш А., Надь Л., Привальский М.Л., Накатани Ю., Эванс Р.М. (август 1997 г.). «Коактиватор ядерного рецептора ACTR представляет собой новую гистонацетилтрансферазу и образует мультимерный активационный комплекс с P / CAF и CBP / p300». Cell . 90 (3): 569–80. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80516-4 . PMID  9267036 . S2CID  15284825 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , находящийся в открытом доступе .