• рецептора ретиноевой кислоты сигнального пути • регуляцию транскрипции ДНК-шаблонных • положительное регуляция транскрипции с РНК - полимеразы II промотор • белок homotetramerization • положительное регуляция транскрипции с РНК - полимеразы II промотор , участвующих в клеточном ответе на химический стимул • транскрипции ДНК-шаблонных • сигнальный путь, опосредованный стероидными гормонами • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
6258
20183
Ансамбль
ENSG00000143171
ENSMUSG00000015843
UniProt
P48443
P28705
RefSeq (мРНК)
NM_001256570 NM_001256571 NM_006917
NM_001159731 NM_009107
RefSeq (белок)
NP_001243499 NP_001243500 NP_008848
NP_001153203 NP_033133
Расположение (UCSC)
Chr 1: 165.4 - 165.45 Мб
Chr 1: 167,6 - 167,64 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Ретиноид Х - рецептор гамма ( RXR-гамма ), также известная как NR2B3 (подсемейство рецепторов 2 ядерных, группы В, элементе 3) представляет собой ядерный рецептор , который в организме человека кодируется RXRG ген . [5] [6]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Функция
2 См. Также
3 взаимодействия
4 ссылки
5 Дальнейшее чтение
Функция [ править ]
Этот ген кодирует член семейства ядерных рецепторов ретиноидных рецепторов X (RXR), которые участвуют в опосредовании антипролиферативных эффектов ретиноевой кислоты (RA). Этот рецептор образует гетеродимеры с рецепторами ретиноевой кислоты , гормона щитовидной железы и витамина D , увеличивая как связывание ДНК, так и функцию транскрипции на их соответствующих ответных элементах. Этот ген экспрессируется на значительно более низких уровнях в клетках немелкоклеточного рака легкого. Были охарактеризованы альтернативные варианты транскрипционного сплайсинга , кодирующие разные изоформы . [6]
См. Также [ править ]
Ретиноидный рецептор X
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что гамма-рецептор ретиноида X взаимодействует с ITGB3BP . [7]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000143171 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015843 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Almasan A, Mangelsdorf DJ, Ong ES, Wahl GM, Эванс RM (апрель 1994). «Хромосомная локализация рецепторов ретиноида X человека». Геномика . 20 (3): 397–403. DOI : 10.1006 / geno.1994.1193 . PMID 8034312 .
^ a b «Ген Entrez: RXRG ретиноидный рецептор X, гамма» .
↑ Li D, Wang F, Samuels HH (декабрь 2001 г.). «Доменная структура корегуляторов семейства NRIF3 предполагает потенциальную двойную роль в регуляции транскрипции» . Мол. Клетка. Биол . 21 (24): 8371–84. DOI : 10.1128 / MCB.21.24.8371-8384.2001 . PMC 100002 . PMID 11713274 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Сзанто А., Наркар В., Шен К., Урай И. П., Дэвис П. Дж., Надь Л. (2005). «Ретиноидные X-рецепторы: X-проявляют свои (пато) физиологические функции» . Смерть клетки отличается . 11 Приложение 2: S126–43. DOI : 10.1038 / sj.cdd.4401533 . PMID 15608692 .
Лейд М., Кастнер П., Лайонс Р., Накшатри Х., Сондерс М., Захаровски Т., Чен Дж.Й., Штауб А., Гарнье Дж. М., Мадер С. (1992). «Очистка, клонирование и идентичность RXR клеточного фактора HeLa, с которым RAR или TR гетеродимеризуются для эффективного связывания целевых последовательностей». Cell . 68 (2): 377–95. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (92) 90478-U . PMID 1310259 . S2CID 40617478 .
Mangelsdorf DJ, Borgmeyer U, Heyman RA, Zhou JY, Ong ES, Oro AE, Kakizuka A, Evans RM (1992). «Характеристика трех генов RXR, которые опосредуют действие 9-цис-ретиноевой кислоты» . Genes Dev . 6 (3): 329–44. DOI : 10,1101 / gad.6.3.329 . PMID 1312497 .
Нагата Т., Вайс Э.Х., Абе К., Китагава К., Андо А., Яра-Кикути Ю., Селдин М.Ф., Озато К., Иноко Х., Такето М. (1995). «Физическое картирование гена ретиноидного X рецептора B у мышей и людей». Иммуногенетика . 41 (2–3): 83–90. DOI : 10.1007 / BF00182317 . PMID 7806300 . S2CID 29455544 .
Muscat GE, Mynett-Johnson L, Dowhan D, Downes M, Griggs R (1994). «Активация транскрипции гена myoD 3,5,3'-трийод-L-тиронином: прямая роль гормона щитовидной железы и рецепторов ретиноидов X» . Nucleic Acids Res . 22 (4): 583–91. DOI : 10.1093 / NAR / 22.4.583 . PMC 307847 . PMID 8127707 .
Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов» . Genome Res . 6 (9): 791–806. DOI : 10.1101 / gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
Санно Н., Сугавара А., Терамото А., Абэ Й., Йен П.М., Чин В.В., Осамура Р.Й. (1997). «Иммуногистохимическая экспрессия изоформ ретиноидных рецепторов X в гипофизе человека и аденомах гипофиза». Нейроэндокринология . 65 (4): 299–306. DOI : 10.1159 / 000127188 . PMID 9143002 .
Сюй XC, Соцци Дж., Ли Дж. С., Ли Дж. Дж., Пасторино Ю., Пилотти С., Кури Дж. М., Хонг В. К., Лотан Р. (1997). «Подавление рецептора ретиноевой кислоты бета при немелкоклеточном раке легкого in vivo: последствия для развития рака легкого» . J. Natl. Cancer Inst . 89 (9): 624–9. DOI : 10.1093 / JNCI / 89.9.624 . PMID 9150186 .
Юста Б., Аларид Е.Т., Гордон Д.Ф., Риджуэй ЕС, Меллон П.Л. (1998). «Ген бета-субъединицы тиреотропина репрессируется гормоном щитовидной железы в новой линии тиреотропных клеток, T alphaT1-клетках мыши» . Эндокринология . 139 (11): 4476–82. DOI : 10.1210 / en.139.11.4476 . PMID 9794455 .
Ито К., Сузуки Т., Мория Т., Уцуномия Х., Сугавара А., Конно Р., Сато С., Сасано Х. (2001). «Ретиноидные рецепторы в эндометрии человека и его нарушения: возможный модулятор 17-бета-гидроксистероиддегидрогеназы». J. Clin. Эндокринол. Метаб . 86 (6): 2721–7. DOI : 10,1210 / jc.86.6.2721 . PMID 11397877 .
Ким С.В., Ким Х.Дж., Чон DJ, Ли СК, Ким Ю.С., Ким Дж.Х., Ким Т.С., Ли Дж.В. (2001). «Ретиноид-зависимый антагонизм трансактивации сывороточного фактора ответа, опосредованный белками-коактиваторами транскрипции». Онкоген . 20 (45): 6638–42. DOI : 10.1038 / sj.onc.1204695 . PMID 11641790 . S2CID 7377737 .
Брабендер Дж, Даненберг К.Д., Мецгер Р., Шнайдер П.М., Лорд Р.В., Грошен С., Цао-Вей Д.Д., Парк Дж., Салонга Д., Хёльшер А.Х., Даненберг П.В. (2002). «Роль экспрессии матричной РНК рецептора ретиноида X в лечении немелкоклеточного рака легкого после резекции». Clin. Cancer Res . 8 (2): 438–43. PMID 11839661 .
Ванса К.Д., Харрис Дж.М., Маскат Г.Е. (2002). «Домен функции активации-1 Nur77 / NR4A1 опосредует трансактивацию, клеточную специфичность и рекрутинг коактиватора» . J. Biol. Chem . 277 (36): 33001–11. DOI : 10.1074 / jbc.M203572200 . PMID 12082103 .
Ван Кью, Фуджи Х, Книпп Г.Т. (2003). «Экспрессия изоформ PPAR и RXR в развивающейся плаценте крысы и человека». Плацента . 23 (8–9): 661–71. DOI : 10,1053 / plac.2002.0855 . PMID 12361685 .
Кимура Ю., Сузуки Т., Канеко С., Дарнел А.Д., Мория Т., Сузуки С., Ханда М., Эбина М., Нукива Т., Сасано Х. (2003). «Ретиноидные рецепторы в развивающемся легком человека». Clin. Sci . 103 (6): 613–21. DOI : 10,1042 / cs1030613 . PMID 12444914 .
Альфаро JM, Fraile B, Lobo MV, Royuela M, Paniagua R, Arenas MI (2003). «Иммуногистохимическое обнаружение ретиноидных рецепторов X альфа, бета и гамма в простате человека». Дж. Андрол . 24 (1): 113–9. PMID 12514092 .
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .
vтеPDB галерея
1by4 : СТРУКТУРА И МЕХАНИЗМ ГОМОДИМЕРНОЙ АССАМБЛЕИ RXR НА ДНК
1dsz : СТРУКТУРА ГЕТЕРОДИМЕРА ДНК-СВЯЗЫВАЮЩЕГО ДОМЕНА RXR / RAR В КОМПЛЕКСЕ С ЭЛЕМЕНТОМ ОТВЕТСТВЕННОСТИ НА РЕТИНОВУЮ КИСЛОТУ DR1
1r0n : Кристаллическая структура ДНК-связывающего комплекса гетеродимерного рецептора экдсиона
1rxr : СТРУКТУРА ВЫСОКОГО РАЗРЕШЕНИЯ РЕЦЕПТОРА РЕТИНОИДА Х ДНК-СВЯЗЫВАЮЩЕГО ДОМЕНА, ЯМР, 20 СТРУКТУРА
2gl8 : RXR-гамма-лиганд-связывающий домен рецептора ретиноевой кислоты человека
2nll : РЕТИНОИД Х-РЕЦЕПТОР-ТИРЕОИДНЫЙ ГОРМОН-РЕЦЕПТОР, ДНК-СВЯЗЫВАЮЩИЙ ГЕТЕРОДИМЕР ДОМЕНА, СВЯЗАННЫЙ С ДНК ЭЛЕМЕНТА ТИРЕОИДНОГО ОТВЕТА
vтеФакторы транскрипции и внутриклеточные рецепторы
(1) Базовые домены
(1.1) Базовая лейциновая молния ( bZIP )
Активирующий фактор транскрипции
AATF
1
2
3
4
5
6
7
АП-1
c-Fos
FOSB
FOSL1
FOSL2
JDP2
с-июн
JUNB
JunD
БАХ
1
2
BATF
BLZF1
C / EBP
α
β
γ
δ
ε
ζ
CREB
1
3
L1
CREM
ДАД
DDIT3
ГАБПА
GCN4
HLF
MAF
B
F
грамм
K
NFE
2
L1
L2
L3
NFIL3
NRL
NRF
1
2
3
XBP1
(1.2) Базовая спираль-петля-спираль ( bHLH )
Группа А
AS-C
ASCL1
ASCL2
ATOH1
РУКА
1
2
MESP2
Миогенные регуляторные факторы
MyoD
Миогенин
MYF5
MYF6
NeuroD
1
2
Нейрогенины
1
2
3
ОЛИГ
1
2
Paraxis
TCF15
Склераксис
SLC
LYL1
TAL
1
2
Крутить
Группа B
FIGLA
Мой с
c-Myc
l-Myc
n-Myc
MXD4
TCF4
Группа C bHLH- PAS
AhR
AHRR
ARNT
ARNTL
ARNTL2
ЧАСЫ
HIF
1А
EPAS1
3А
NPAS
1
2
3
SIM
1
2
Группа D
BHLH
2
3
9
Pho4
Я БЫ
1
2
3
4
Группа E
HES
1
2
3
4
5
6
7
ПРИВЕТ
1
2
L
Группа F bHLH-COE
EBF1
(1.3) bHLH-ZIP
АП-4
МАКСИМУМ
MXD1
MXD3
MITF
MNT
MLX
MLXIPL
MXI1
Мой с
SREBP
1
2
USF1
(1.4) НФ-1
NFI
А
B
C
Икс
SMAD
R-SMAD
1
2
3
5
9
I-SMAD
6
7
4 )
(1.5) RF-X
RFX
1
2
3
4
5
6
АНК
(1.6) Базовая спираль-пролет-спираль (bHSH)
АП-2
α
β
γ
δ
ε
(2) ДНК-связывающие домены цинкового пальца
(2.1) Ядерный рецептор (Cys 4 )
подсемейство 1
Гормон щитовидной железы
α
β
МАШИНА
FXR
LXR
α
β
PPAR
α
β / δ
γ
PXR
RAR
α
β
γ
ROR
α
β
γ
Rev-ErbA
α
β
VDR
подсемейство 2
КУП-ТФ
( Я
II
Ухо-2
HNF4
α
γ
PNR
RXR
α
β
γ
Рецептор яичка
2
4
TLX
подсемейство 3
Стероидный гормон
Андроген
Эстроген
α
β
Глюкокортикоид
Минералокортикоид
Прогестерон
Связанный с эстрогеном
α
β
γ
подсемейство 4
NUR
NGFIB
NOR1
NURR1
подсемейство 5
LRH-1
SF1
подсемейство 6
GCNF
подсемейство 0
DAX1
SHP
(2.2) Другой Cys 4
GATA
1
2
3
4
5
6
MTA
1
2
3
TRPS1
(2.3) Cys 2 His 2
Общие факторы транскрипции
TFIIA
TFIIB
TFIID
TFIIE
1
2
ТФИИФ
1
2
TFIIH
1
2
4
2I
3А
3C1
3C2
ATBF1
BCL
6
11А
11B
CTCF
E4F1
EGR
1
2
3
4
ERV3
GFI1
GLI- Kruppel семьи
1
2
3
ОТДЫХ
S1
S2
YY1
ИК
1
2
HIVEP
1
2
3
IKZF
1
2
3
ILF
2
3
KLF
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
ПРОДАЖА
1
2
3
4
SP
1
2
4
7
8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
7А
7B
ZBTB
11
16
17
20
32
33
40
цинковый палец
3
7
9
10
19
22
24
33B
34
35 год
41 год
43 год
44 год
51
74
143
146
148
165
202
217
219
238
239
259
267
268
281
295
300
318
330
346
350
365
366
384
423
451
452
471
593
638
644
649
655
804A
(2.4) Cys 6
HIVEP1
(2.5) Чередующийся состав
AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
1
2
4
ДЖАРИД
1А
1B
1С
1D
2
JMJD1B
(2.6) WRKY
WRKY
(3) Домены спираль-поворот-спираль
(3.1) Гомеодомен
Antennapedia класс Antp
protoHOX Hox-подобный
ParaHox
GSX
1
2
Xlox
PDX1
Cdx
1
2
4
расширенный Hox: Evx1
Evx2
MEOX1
MEOX2
Homeobox
A1
A2
A3
A4
A5
A7
A9
A10
A11
A13
B1
Би 2
B3
B4
B5
B6
B7
B8
B9
B13
C4
C5
C6
C8
C9
C10
C11
C12
C13
D1
D3
D4
D8
D9
D10
D11
D12
D13
GBX1
GBX2
MNX1
metaHOX NK-подобный
BARHL1
BARHL2
BARX1
BARX2
BSX
DBX
1
2
DLX
1
2
3
4
5
6
EMX
1
2
EN
1
2
HHEX
HLX
LBX1
LBX2
MSX
1
2
NANOG
NKX
2-1
2-2
2-3
2-5
3-1
3-2
HMX1
HMX2
HMX3
6-1
6-2
НАТО
TLX1
TLX2
TLX3
VAX1
VAX2
Другой
ARX
CRX
CUTL1
FHL
1
2
3
HESX1
HOPX
LMX
1А
1B
NOBOX
СКАЗКА
IRX
1
2
3
4
5
6
MKX
Я ЕСТЬ
1
2
АТС
1
2
3
PKNOX
1
2
ШЕСТЬ
1
2
3
4
5
PHF
1
3
6
8
10
16
17
20
21А
POU домен
PIT-1
БРН-3 : А
B
C
Фактор транскрипции октамера : 1
2
3/4
6
7
11
SATB2
ZEB
1
2
(3.2) Парная коробка
PAX
1
2
3
4
5
6
7
8
9
PRRX
1
2
PROP1
ФОКС
2А
2B
RAX
SHOX
SHOX2
VSX1
VSX2
Бикоид
GSC
BICD2
OTX
1
2
PITX
1
2
3
(3.3) Головка вилки / крылатая спираль
E2F
1
2
3
4
5
FOX белки
A1
A2
A3
C1
C2
D3
D4
E1
E3
F1
G1
H1
I1
J1
J2
K1
K2
L2
M1
N1
N3
O1
O3
O4
P1
P2
P3
P4
(3.4) Факторы теплового удара
HSF
1
2
4
(3.5) Кластеры триптофана
ELF
2
4
5
EGF
ELK
1
3
4
ERF
ETS
1
2
ЭРГ
СПИБ
ETV
1
4
5
6
FLI1
Факторы регуляции интерферона
1
2
3
4
5
6
7
8
MYB
MYBL2
(3.6) Домен TEA
фактор усиления транскрипции
1
2
3
4
(4) Факторы β-каркаса с малыми контактами канавок
(4.1) Область гомологии Rel
NF-κB
NFKB1
NFKB2
REL
РЕЛА
RELB
NFAT
C1
C2
C3
C4
5
(4.2) СТАТИСТИКА
СТАТИСТИКА
1
2
3
4
5
6
(4.3) p53-подобный
p53 p63 семья p73
p53
TP63
стр. 73
TBX
1
2
3
5
19
21 год
22
TBR1
TBR2
TFT
MYRF
(4.4) Коробка MADS
Mef2
А
B
C
D
SRF
(4.6) ТАТА-связывающие белки
TBP
TBPL1
(4.7) Высокомобильная группа
BBX
HMGB
1
2
3
4
HMGN
1
2
3
4
HNF
1А
1B
SOX
1
2
3
4
5
6
8
9
10
11
12
13
14
15
18
21 год
SRY
SSRP1
TCF / LEF
TCF
1
3
4
LEF1
ТОКС
1
2
3
4
(4.9) Зернистая голова
TFCP2
(4.10) Область холодного удара
CSDA
YBX1
(4.11) Runt
CBF
CBFA2T2
CBFA2T3
RUNX1
RUNX2
RUNX3
RUNX1T1
(0) Другие факторы транскрипции
(0.2) HMGI (Y)
HMGA
1
2
HBP1
(0.3) Карманный домен
Руб.
RBL1
RBL2
(0.5) Факторы, связанные с AP-2 / EREBP
Апетала 2
EREBP
B3
(0.6) Разное
ARID
1А
1B
2
3А
3B
4А
КОЛПАЧОК
ЕСЛИ Я
16
35 год
MLL
2
3
Т1
MNDA
NFY
А
B
C
Ро / Сигма
см. также недостаточность фактора транскрипции / корегулятора