S100A8

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
1MR8 , 1XK4 , 4GGF , 4XJK , 5HLO , 5HLV

Идентификаторы

Псевдонимы

S100A8 , 60B8AG, CAGA, CFAG, CGLA, CP-10, L1Ag, MA387, MIF, MRP8, NIF, P8, S100 кальций-связывающий белок A8

Внешние идентификаторы

OMIM : 123885 MGI : 88244 HomoloGene : 2225 GeneCards : S100A8

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 1 (человека) ^[1]

Группа	1q21.3	Начинать	153 390 032 п.н. ^[1]
Группа	1q21.3	Конец	153 391 073 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 3 (мышь) ^[2]

Группа	3 F1 \| 3 39,9 см	Начинать	90 668 978 п.н. ^[2]
Группа	3 F1 \| 3 39,9 см	Конец	90 670 035 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• Toll-подобный рецептор 4 связывания • рецептора RAGE связывания • микротрубочек связывания • GO: связывание белка 0001948 • ион кальция связывания • арахидоновой кислоты связывания • иона цинка связывания • связывание иона металла
Сотовый компонент	• ядро клетки • цитоскелет • цитозоль • внеклеточная экзосома • мембрана • клеточная мембрана • цитоплазма • внеклеточный • просвет секреторной гранулы • цитоскелет промежуточных филаментов • внеклеточная область • внеклеточный матрикс, содержащий коллаген
Биологический процесс	• регуляция воспалительного ответа • активация активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующая в процессе апоптоза • процесс в иммунной системе • положительная регуляция воспалительного ответа • хемотаксис нейтрофилов • положительная регуляция внутреннего апоптотического сигнального пути • защитный ответ на грибок • ответ на этанол • выработка хемокинов • ответ на ион цинка • острый воспалительный ответ • защитный ответ на бактерии • миграция лейкоцитов, участвующих в воспалительной реакции • S-нитрозилирование пептидил-цистеина • секвестирование иона цинка • агрегация нейтрофилов • реакция на липополисахарид • хемотаксис • положительное регулирование секреции пептидов • хроническое воспаление • развитие астроцитов • заживление ран • апоптотический процесс • положительное регулирование роста клеток • аутофагия • воспалительный ответ • регуляция организации цитоскелета • продукция цитокинов • положительная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB • врожденная иммунная система • сигнальный путь толл-подобных рецепторов • антимикробный гуморальный ответ • дегрануляция нейтрофилов • аутокринная передача сигналов
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


6279


20201

Ансамбль


ENSG00000143546


ENSMUSG00000056054

UniProt


P05109


P27005

RefSeq (мРНК)


NM_002964 NM_001319196 NM_001319197 NM_001319198 NM_001319201


NM_013650

RefSeq (белок)


NP_001306125 NP_001306126 NP_001306127 NP_001306130 NP_002955


NP_038678

Расположение (UCSC)

Chr 1: 153.39 - 153.39 Мб

Chr 3: 90.67 - 90.67 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

S100 кальций-связывающий белок A8 ( S100A8 ) представляет собой белок , который у человека кодируется S100A8 гена . ^[5] Он также известен как кальгранулин А.

Белки S100A8 и S100A9 образуют гетеродимер, называемый кальпротектином .

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков S100, содержащего 2 кальций-связывающих мотива EF-hand. Белки S100 локализованы в цитоплазме и / или ядре широкого круга клеток и участвуют в регуляции ряда клеточных процессов, таких как прогрессия и дифференцировка клеточного цикла. Гены S100 включают по крайней мере 13 членов, которые расположены в виде кластера на хромосоме 1q21. Этот белок может действовать при ингибировании казеинкиназы и как цитокин. Измененная экспрессия этого белка связана с заболеванием муковисцидоз. ^[5]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000143546 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000056054 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ a b «Ген Entrez: S100A8 S100 кальций-связывающий белок A8» .

Дальнейшее чтение [ править ]

Шефер Б.В., Хейцманн С.В. (1996). «Семейство S100 кальций-связывающих белков EF-hand: функции и патология». Trends Biochem. Sci . 21 (4): 134–40. DOI : 10.1016 / S0968-0004 (96) 80167-8 . PMID 8701470 .
Керкхофф К., Клемпт М., Сорг С. (1999). «Новое понимание структуры и функций MRP8 (S100A8) и MRP14 (S100A9)». Биохим. Биофиз. Acta . 1448 (2): 200–11. DOI : 10.1016 / S0167-4889 (98) 00144-X . PMID 9920411 .
Накен В., Рот Дж, Сорг С., Керкхофф С. (2003). «S100A9 / S100A8: миелоидные представители семейства белков S100 как важные участники врожденного иммунитета». Microsc. Res. Tech . 60 (6): 569–80. DOI : 10.1002 / jemt.10299 . PMID 12645005 . S2CID 10145841 .
Рот Дж, Фогл Т., Сорг С., Сандеркёттер С. (2004). «Фагоцит-специфические белки S100: новая группа провоспалительных молекул». Trends Immunol . 24 (4): 155–8. DOI : 10.1016 / S1471-4906 (03) 00062-0 . PMID 12697438 .
Расмуссен Х. Х., Ван Дамм Дж., Пуйпе М. и др. (1993). «Микропоследовательности 145 белков, записанные в двумерной базе данных гелевых белков нормальных эпидермальных кератиноцитов человека». Электрофорез . 13 (12): 960–9. DOI : 10.1002 / elps.11501301199 . PMID 1286667 . S2CID 41855774 .
Lemarchand P, Vaglio M, Mauël J, Markert M (1992). «Транслокация небольшого цитозольного кальцийсвязывающего белка (MRP-8) на плазматическую мембрану коррелирует с активацией нейтрофилов человека» . J. Biol. Chem . 267 (27): 19379–82. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (18) 41786-3 . PMID 1326551 .
Шефер Т., Заксе Г.Е., Гассен Х.Г. (1991). «Кальций-связывающий белок MRP-8 продуцируется опухолевыми клетками легких человека». Биол. Chem. Хоппе-Зейлер . 372 (1): 1–4. DOI : 10.1515 / bchm3.1991.372.1.1 . PMID 2039599 .
Дорин Дж. Р., Эмсли Э, ван Хейнинген В. (1991). «Родственные кальций-связывающие белки отображаются в одной и той же субрегионе хромосомы 1q и в расширенной области синтении на хромосоме 3 мыши». Геномика . 8 (3): 420–6. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (90) 90027-R . PMID 2149559 .
Уилкинсон М.М., Бусуттил А., Хейворд С. и др. (1989). «Паттерн экспрессии двух связанных кальций-связывающих белков, связанных с кистозным фиброзом, в нормальных и аномальных тканях». J. Cell Sci . 91 (2): 221–30. PMID 3267695 .
Odink K, Cerletti N, Brüggen J и др. (1987). «Два кальций-связывающих белка в макрофагах инфильтрата ревматоидного артрита». Природа . 330 (6143): 80–2. Bibcode : 1987Natur.330 ... 80O . DOI : 10.1038 / 330080a0 . PMID 3313057 . S2CID 4366579 .
Лагассе Э., Клерк Р.Г. (1988). «Клонирование и экспрессия двух человеческих генов, кодирующих кальций-связывающие белки, которые регулируются во время миелоидной дифференцировки» . Мол. Клетка. Биол . 8 (6): 2402–10. DOI : 10.1128 / mcb.8.6.2402 . PMC 363438 . PMID 3405210 .
Дорин Дж. Р., Новак М., Хилл Р. Э. и др. (1987). «Ключ к основному дефекту муковисцидоза от клонирования гена антигена CF». Природа . 326 (6113): 614–7. Bibcode : 1987Natur.326..614D . DOI : 10.1038 / 326614a0 . PMID 3561500 . S2CID 4242084 .
Шефер Б.В., Вики Р., Энгелькамп Д. и др. (1995). «Выделение клона YAC, покрывающего кластер из девяти генов S100 на хромосоме 1q21 человека: обоснование новой номенклатуры семейства кальций-связывающих белков S100». Геномика . 25 (3): 638–43. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (95) 80005-7 . PMID 7759097 .
Умекава Т., Курита Т. (1995). «Кальпротектин-подобный белок связан с растворимой органической матрицей в мочевом камне из оксалата кальция». Биохим. Мол. Биол. Int . 34 (2): 309–13. PMID 7849642 .
Энгелькамп Д., Шефер Б.В., Маттей М.Г. и др. (1993). «Шесть генов S100 сгруппированы на хромосоме 1q21 человека: идентификация двух генов, кодирующих два ранее неизвестных кальций-связывающих белка S100D и S100E» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 90 (14): 6547–51. Bibcode : 1993PNAS ... 90.6547E . DOI : 10.1073 / pnas.90.14.6547 . PMC 46969 . PMID 8341667 .
Рот Дж., Бурвинкель Ф., ван ден Бос С. и др. (1993). «MRP8 и MRP14, S-100-подобные белки, связанные с миелоидной дифференцировкой, перемещаются к плазматической мембране и промежуточным филаментам кальций-зависимым образом» . Кровь . 82 (6): 1875–83. DOI : 10.1182 / blood.V82.6.1875.1875 . PMID 8400238 .
Миясаки К.Т., Бодо А.Л., Мурти А.Р., Лерер Р.И. (1993). «Противомикробная активность in vitro цитозольного белкового комплекса S-100 нейтрофилов человека, кальпротектина, против Capnocytophaga sputigena». J. Dent. Res . 72 (2): 517–23. DOI : 10.1177 / 00220345930720020801 . PMID 8423249 . S2CID 8311930 .
Марти Т., Эрттманн К.Д., Галлин М.Ю. (1996). «Взаимодействие паразита и хозяина при онхоцеркозе человека: идентификация и анализ последовательности нового кальгранулина человека». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 221 (2): 454–8. DOI : 10.1006 / bbrc.1996.0616 . PMID 8619876 .

Эта статья о гене на хромосоме 1 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000143546 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000056054 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Ген Entrez: S100A8 S100 кальций-связывающий белок A8» .

[1]