• тело PML • центросома • ядерное тело • ядро клетки • нуклеоплазма • комплекс регулятора транскрипции • цитоплазма • комплекс репрессора транскрипции • макромолекулярный комплекс
Биологический процесс
• развитие неба • дифференцировка миотрубок • передача сигнала белка SMAD • поддержание популяции соматических стволовых клеток • морфогенез носа • подвижность клеток • морфогенез костей • негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • негативная регуляция сигнального пути бета-рецептора трансформирующего фактора роста • передача сигналов BMP путь • негативная регуляция дифференцировки остеобластов • миелинизация в периферической нервной системе • гомотримеризация белков • негативная регуляция сигнального пути BMP • позитивная регуляция сигнального пути Wnt • негативная регуляция сигнального пути рецептора активина • закрытие нервной трубки • морфогенез хрусталика в глазе камерного типа • эмбриональный морфогенез конечности • развитие волокон скелетных мышц • развитие сетчатки в глазу камерного типа • развитие глаз по типу камеры • позитивная регуляция связывания ДНК • развитие обонятельной луковицы • клеточная пролиферация • спецификация передней / задней оси • негативная регуляция пролиферации фибробластов • лицо морфогенез • морфогенез камера типа глаз • негативная регуляция пролиферации Шванновских клеток • негативная регуляция клеточной пролиферации • положительная регуляция транскрипции с РНК - полимеразой II промотора • транскрипции ДНК-шаблонный • отрицательного регулированием гистона деацетилирования • развития нейрона • трансформирующим рост сигнальный путь рецептора фактора бета • отрицательная регуляция дифференцировки клеток
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
6497
20481
Ансамбль
ENSG00000157933
ENSMUSG00000029050
UniProt
P12755
Q60698
RefSeq (мРНК)
NM_003036
NM_011385 NM_001357191
RefSeq (белок)
NP_003027
н / д
Расположение (UCSC)
Chr 1: 2.23 - 2.31 Мб
Chr 4: 155.15 - 155.22 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Белок SKI является ядерным протоонкогеном , который связан с опухолями при высоких клеточных концентрациях. [5] Было показано, что SKI мешает нормальному функционированию клеток, как напрямую препятствуя экспрессии определенных генов внутри ядра клетки, так и нарушая сигнальные белки, которые активируют гены. [6]
SKI негативно регулирует трансформирующий фактор роста-бета ( TGF-бета ), напрямую взаимодействуя с Smads и подавляя транскрипцию генов, чувствительных к TGF-бета. [7] Это было связано с раком из-за большого количества ролей, которые пептидные факторы роста, к подсемейству которых относится TGF-бета, играют в регуляции клеточных функций, таких как пролиферация клеток , апоптоз , спецификация и судьба развития . [8]
Название SKI происходит от Института Слоуна-Кеттеринга, где этот белок был первоначально открыт.
СОДЕРЖАНИЕ
1 Структура
1.1 Ген
1.2 Белок
2 Функция
3 Связанные исследования
4 взаимодействия
5 ссылки
6 Дальнейшее чтение
Структура [ править ]
Джин [ править ]
Протоонкоген SKI расположен в области, близкой к гену- супрессору опухоли p73 в локусе 1p36.3 гена, что предполагает аналогичную функцию гена p73. [9]
Белок [ править ]
Кристаллическая структура домена гомологии таксы SKI человека. [10]
Белок SKI имеет 728 аминокислотную последовательность с множеством доменов . Выражается как внутри, так и вне ядра. [9] Он принадлежит к тому же семейству, что и белок SnoN . Различные домены имеют разные функции, причем первичные домены взаимодействуют с белками Smad. Белок имеет мотив спираль-поворот-спираль , область, богатую цистеином и гистидином, которая дает начало мотиву цинкового пальца , области основной аминокислоты и лейциновой молнии . Все эти домены, включая пролинбогатая область, согласуются с тем фактом, что белок должен иметь домены, которые позволяют ему взаимодействовать с другими белками. [9] Белок также имеет гидрофобные участки, которые вступают в контакт с белками Smad, богатыми аминокислотными участками лейцина и фенилаланина . [11] Недавние исследования предложили домен, похожий на белок таксы . Домен гомологии SKI-Dachshund (SKI-DHD) содержит домены спирали витка спирали белка и мотивы поворота бета-альфа-бета. [7]
Функция [ править ]
Онкоген SKI присутствует во всех клетках и обычно активен во время развития. В частности, птичьи фибробласты зависят от белка SKI как от корегулятора транскрипции, индуцирующего трансформацию. [9] Вышеупомянутый участок DHD специально используется для белок-белковых взаимодействий, в то время как С-конец из 191 аминокислоты опосредует олигомеризацию . [7] Недавние исследования показывают, что белок SKI в раковых клетках действует как супрессор, подавляя передачу сигналов трансформирующего фактора роста β (TGF-β) . TGF-β - это белок, регулирующий рост клеток.. Передача сигналов регулируется семейством белков, называемых белками Smad. SKI присутствует во всех взрослых и эмбриональных клетках на низких уровнях, однако избыточная экспрессия белка характерна для опухолевых клеток. [11] Считается, что высокие уровни белка SKI инактивируют подавление опухоли за счет замещения других белков и вмешательства в сигнальный путь TGF-β. [9] Белок SKI и белок CPB конкурируют за связывание с белками Smad, специфически конкурируя с взаимодействиями белков, связывающих Smad-3 и CReB . SKI также напрямую взаимодействует с R-Smad ∙ Smad-4.комплекс, который напрямую подавляет нормальную транскрипцию генов, отвечающих за TGF-β, инактивируя способность клетки останавливать рост и деление, создавая раковые клетки. [11]
SKI был связан с различными видами рака, включая меланомы человека , плоскоклеточный рак пищевода, рак шейки матки и процесс прогрессирования опухоли. Связь SKI с меланомой человека была наиболее изученной областью связи белка с раком. В настоящее время считается, что белок SKI предотвращает ответ на уровни TFG-β, вызывая образование опухоли. [9]
Связанное исследование [ править ]
Другое исследование выявило белки, похожие на лыжи. SnoN белок был идентифицирован как аналогичный белок и часто обсуждается в конъюгации с белком лыж в публикациях. Недавние исследования показывают, что роль SnoN может быть несколько иной и потенциально даже может играть антагонистическую роль. [12]
Другие недавние исследования определили, что Fussel-15 и Fussel-18 гомологичны семейству белков Ski / Sno. Было обнаружено, что Fussel-15 играет во многом ту же роль, что и белки Ski / Sno, однако его экспрессия не так распространена, как белки Ski / Sno. Было обнаружено, что Fussel-18 играет ингибирующую роль в передаче сигналов TGF-бета. [13]
Такса и SKIDA1 также относятся к семейству Ski / Sno / Dac. [14]
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что белок SKI взаимодействует с:
HIPK2 , [15]
MECP2 , [16]
Матери против декапентаплегического гомолога 1 [15] и
Матери против декапентаплегического гомолога 2 , [15] [17]
Матери против декапентаплегического гомолога 3 , [15] [18]
NFIX , [19]
Белок промиелоцитарного лейкоза , [20]
SKIL , [21] и
SNW1 . [22] [23] [24]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000157933 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029050 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Vignais ML (февраль 2000). «[Ski и SnoN: антагонистические белки передачи сигналов TGFbeta]». Бычий рак (на французском). 87 (2): 135–7. PMID 10705283 .
↑ Cell 2002; 111: 1-20.
^ a b c Уилсон Дж. Дж., Малахова М., Чжан Р., Иоахимиак А., Хегде Р. С. (май 2004 г.). «Кристаллическая структура домена гомологии таксы SKI человека». Структура . 12 (5): 785–92. DOI : 10.1016 / j.str.2004.02.035 . PMID 15130471 .
↑ Whitman M (август 1998 г.). «Smads и ранняя передача сигналов от суперсемейства TGFbeta» . Genes Dev . 12 (16): 2445–62. DOI : 10.1101 / gad.12.16.2445 . PMID 9716398 .
^ Б с д е е Рида JA, Lin Q, Chen D, Миан IS, Медрано EE (июнь 2005 г.). «SKI пути, вызывающие прогрессирование меланомы человека». Рак Метастазы Rev . 24 (2): 265–72. DOI : 10.1007 / s10555-005-1576-х . PMID 15986136 . S2CID 23664913 .
^ PDB : 1SBX ; Уилсон Дж. Дж., Малахова М., Чжан Р., Иоахимиак А., Хегде Р. С. (май 2004 г.). «Кристаллическая структура домена гомологии таксы SKI человека». Структура . 12 (5): 785–92. DOI : 10.1016 / j.str.2004.02.035 . PMID 15130471 .
^ a b c Чен В., Лам С.С., Сринат Х, Шиффер Калифорния, Ройер В.Е., Лин К. (апрель 2007 г.). «Конкуренция между Ski и CREB-связывающим белком за связывание с белками Smad в трансформации передачи сигналов фактора роста-бета» . J. Biol. Chem . 282 (15): 11365–76. DOI : 10.1074 / jbc.M700186200 . PMID 17283070 .
^ Ramel MC, Эмери CM, Эмери CS, Foulger R, Goberdhan DC, ван ден Хойвель M, Wilson C (апрель 2007). «Drosophila SnoN модулирует рост и формирование паттерна, подавляя передачу сигналов TGF-бета». Мех. Dev . 124 (4): 304–17. DOI : 10.1016 / j.mod.2006.12.006 . PMID 17289352 . S2CID 14867669 .
↑ Arndt S, Poser I, Moser M, Bosserhoff AK (апрель 2007 г.). «Fussel-15, новый белок-гомолог Ski / Sno, противодействует передаче сигналов BMP». Мол. Клетка. Neurosci . 34 (4): 603–11. DOI : 10.1016 / j.mcn.2007.01.002 . PMID 17292623 . S2CID 22992983 .
^ «Консервированный домен белка Ski_Sno» . NCBI .
^ а б в г Харада Дж, Кокура К., Каней-Исии К., Номура Т., Хан М.М., Ким Й., Исии С. (октябрь 2003 г.). «Необходимость корепрессорной гомеодомен-взаимодействующей протеинкиназы 2 для опосредованного лыжами ингибирования транскрипционной активации, индуцированной морфогенетическим белком кости» . J. Biol. Chem . 278 (40): 38998–9005. DOI : 10.1074 / jbc.M307112200 . PMID 12874272 .
↑ Kokura K, Kaul SC, Wadhwa R, Nomura T, Khan MM, Shinagawa T., Yasukawa T., Colmenares C, Ishii S (сентябрь 2001 г.). «Семейство белков Ski требуется для репрессии транскрипции, опосредованной MeCP2» . J. Biol. Chem . 276 (36): 34115–21. DOI : 10.1074 / jbc.M105747200 . PMID 11441023 .
↑ Луо К., Строшейн С.Л., Ван В., Чен Д., Мартенс Е., Чжоу С., Чжоу К. (сентябрь 1999 г.). «Онкопротеин Ski взаимодействует с белками Smad, подавляя передачу сигналов TGFbeta» . Genes Dev . 13 (17): 2196–206. DOI : 10.1101 / gad.13.17.2196 . PMC 316985 . PMID 10485843 .
^ Ueki N, Хейман MJ (август 2003). «Прямое взаимодействие Ski со Smad3 или Smad4 необходимо и достаточно для Ski-опосредованной репрессии передачи сигналов трансформирующего фактора роста-бета» . J. Biol. Chem . 278 (35): 32489–92. DOI : 10.1074 / jbc.C300276200 . PMID 12857746 .
^ Tarapore Р, Ричмонд С, Чжэн G, Коэн С. Б., Келдер В, Kopchick Дж, Kruse U, Sippel А.Е., Колменарес С, Stavnezer Е (октябрь 1997 г.). «Связывание ДНК и активация транскрипции онкобелком Ski, опосредованная взаимодействием с NFI» . Nucleic Acids Res . 25 (19): 3895–903. DOI : 10.1093 / NAR / 25.19.3895 . PMC 146989 . PMID 9380514 .
^ Хан М.М., Номура Т., Ким Х., Каул С.К., Вадхва Р., Синагава Т., Итикава-Ивата Э, Чжун С., Пандольфи П.П., Исии С. (июнь 2001 г.). «Роль PML и PML-RARalpha в Mad-опосредованной репрессии транскрипции». Мол. Cell . 7 (6): 1233–43. DOI : 10.1016 / s1097-2765 (01) 00257-X . PMID 11430826 .
^ Коэн С. Б., Чжэн G, Хейман HC, Stavnezer E (февраль 1999). «Гетеродимеры онкопротеинов SnoN и Ski образуются преимущественно по сравнению с гомодимерами и являются более мощными трансформирующими агентами» . Nucleic Acids Res . 27 (4): 1006–14. DOI : 10.1093 / NAR / 27.4.1006 . PMC 148280 . PMID 9927733 .
^ Prathapam Т, Кюне С, Хеймен М, Банки л (сентябрь 2001 г.). «Ski взаимодействует с эволюционно законсервированным доменом SNW Skip» . Nucleic Acids Res . 29 (17): 3469–76. DOI : 10.1093 / NAR / 29.17.3469 . PMC 55893 . PMID 11522815 .
Перейти ↑ Dahl R, Wani B, Hayman MJ (март 1998 г.). «Онкопротеин Ski взаимодействует со Skip, человеческим гомологом Drosophila Bx42» . Онкоген . 16 (12): 1579–86. DOI : 10.1038 / sj.onc.1201687 . PMID 9569025 .
^ Леонг GM, Субраманьям N, Фигероа J, Фланаган JL, Хейман MJ, Eisman JA, Kouzmenko AP (май 2001). «Взаимодействующий с лыжами белок взаимодействует с белками Smad, усиливая трансформирующую бета-зависимую транскрипцию фактора роста» . J. Biol. Chem . 276 (21): 18243–8. DOI : 10.1074 / jbc.M010815200 . PMID 11278756 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Medrano EE (2003). «Подавление передачи сигналов TGF-бета онкогенным белком SKI в меланомах человека: последствия для пролиферации, выживания и метастазирования» . Онкоген . 22 (20): 3123–9. DOI : 10.1038 / sj.onc.1206452 . PMID 12793438 .
Номура Н., Сасамото С., Исии С., Дате Т., Мацуи М., Ишизаки Р. (1989). «Выделение клонов кДНК человека лыж и гена, связанного с лыжами, sno» . Nucleic Acids Res . 17 (14): 5489–500. DOI : 10.1093 / NAR / 17.14.5489 . PMC 318172 . PMID 2762147 .
Чаганти Р.С., Балаш И., Джанвар С.К., Мурти В.В., Кодуру П.Р., Гжещик К.Х., Ставнезер Э. (1987). «Клеточный гомолог трансформирующего гена птичьего ретровируса SKV отображается в области хромосомы человека 1q22 ---- q24». Cytogenet. Cell Genet . 43 (3–4): 181–6. DOI : 10.1159 / 000132318 . PMID 3026737 .
Пирсон-Уайт S (1993). «SnoI, новая альтернативно сплайсированная изоформа гомолога протоонкогена лыж, sno» . Nucleic Acids Res . 21 (19): 4632–8. DOI : 10.1093 / NAR / 21.19.4632 . PMC 311202 . PMID 8233802 .
Нагасе Т., Номура Н., Исии С. (1993). «Комплексное образование между белками, кодируемыми семейством лыжных генов» . J. Biol. Chem . 268 (18): 13710–6. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (18) 86915-0 . PMID 8514802 .
Тарапор П., Ричмонд С., Чжэн Дж., Коэн С.Б., Келдер Б., Копчик Дж., Круз У., Сиппель А.Э., Кольменарес С., Ставнезер Э. (1997). «Связывание ДНК и активация транскрипции онкобелком Ski, опосредованная взаимодействием с NFI» . Nucleic Acids Res . 25 (19): 3895–903. DOI : 10.1093 / NAR / 25.19.3895 . PMC 146989 . PMID 9380514 .
Даль Р., Вани Б., Хейман М.Дж. (1998). «Онкопротеин Ski взаимодействует со Skip, человеческим гомологом Drosophila Bx42» . Онкоген . 16 (12): 1579–86. DOI : 10.1038 / sj.onc.1201687 . PMID 9569025 .
Коэн С.Б., Чжэн Г., Хейман Х.С., Ставнезер Э. (1999). «Гетеродимеры онкопротеинов SnoN и Ski образуются преимущественно по сравнению с гомодимерами и являются более мощными трансформирующими агентами» . Nucleic Acids Res . 27 (4): 1006–14. DOI : 10.1093 / NAR / 27.4.1006 . PMC 148280 . PMID 9927733 .
Луо К., Строшейн С.Л., Ван В., Чен Д., Мартенс Э., Чжоу С., Чжоу К. (1999). «Онкопротеин Ski взаимодействует с белками Smad, подавляя передачу сигналов TGFbeta» . Genes Dev . 13 (17): 2196–206. DOI : 10.1101 / gad.13.17.2196 . PMC 316985 . PMID 10485843 .
Сунь Y, Лю X, Eaton EN, Lane WS, Lodish HF, Weinberg RA (1999). «Взаимодействие онкопротеина Ski со Smad3 регулирует передачу сигналов TGF-бета». Мол. Cell . 4 (4): 499–509. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (00) 80201-4 . PMID 10549282 .
Акиёси С., Иноуэ Х, Ханай Дж, Кусанаги К., Немото Н., Миядзоно К., Кавабата М. (2000). «c-Ski действует как транскрипционный ко-репрессор в трансформации передачи сигналов фактора роста-бета посредством взаимодействия с smads» . J. Biol. Chem . 274 (49): 35269–77. DOI : 10.1074 / jbc.274.49.35269 . PMID 10575014 .
Стеффан Дж. С., Казанцев А., Спасич-Боскович О., Гринвальд М., Жу Ю. З., Гохлер Х., Ванкер Э. Э., Бейтс Г. П., Хаусман Д. Е., Томпсон Л. М. (2000). «Белок болезни Хантингтона взаимодействует с p53 и CREB-связывающим белком и подавляет транскрипцию» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 97 (12): 6763–8. Bibcode : 2000PNAS ... 97.6763S . DOI : 10.1073 / pnas.100110097 . PMC 18731 . PMID 10823891 .
Хан М.М., Номура Т., Ким Х., Каул С.К., Вадхва Р., Синагава Т., Итикава-Ивата Э., Чжун С., Пандольфи П.П., Исии С. (2001). «Роль PML и PML-RARalpha в Mad-опосредованной репрессии транскрипции». Мол. Cell . 7 (6): 1233–43. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (01) 00257-X . PMID 11430826 .
Кокура К., Каул С.К., Вадхва Р., Номура Т., Хан М.М., Синагава Т., Ясукава Т., Кольменарес К., Исии С. (2001). «Семейство белков Ski требуется для репрессии транскрипции, опосредованной MeCP2» . J. Biol. Chem . 276 (36): 34115–21. DOI : 10.1074 / jbc.M105747200 . PMID 11441023 .
Пратапам Т., Кюне С., Хейман М., Бэнкс Л. (2001). «Ski взаимодействует с эволюционно законсервированным доменом SNW Skip» . Nucleic Acids Res . 29 (17): 3469–76. DOI : 10.1093 / NAR / 29.17.3469 . PMC 55893 . PMID 11522815 .
Рид Дж.А., Бейлс Э., Сюй В., Окан Н.А., Бандйопадхьяй Д., Медрано Э. «Цитоплазматическая локализация онкогенного белка Ski в меланомах кожи человека in vivo: функциональные последствия для трансформации передачи сигналов бета фактора роста». Cancer Res . 61 (22): 8074–8. PMID 11719430 .
Песса М., Марэ Дж., Прунье С., Ферран Н., Лаллеманд Ф., Мовьель А., Атфи А. (2002). «c-Jun связывается с онкопротеином Ski и подавляет транскрипционную активность Smad2» . J. Biol. Chem . 277 (32): 29094–100. DOI : 10.1074 / jbc.M202831200 . PMID 12034730 .
Wu JW, Krawitz AR, Chai J, Li W, Zhang F, Luo K, Shi Y (2002). «Структурный механизм распознавания Smad4 ядерным онкопротеином Ski: понимание Ski-опосредованной репрессии передачи сигналов TGF-бета». Cell . 111 (3): 357–67. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (02) 01006-1 . PMID 12419246 . S2CID 10390985 .
Дай П., Синагава Т., Номура Т., Харада Дж., Каул С.К., Вадхва Р., Хан М.М., Акимару Х., Сасаки Х., Кольменарес С., Исии С. (2002). «Ski участвует в регуляции транскрипции с помощью репрессора и полноразмерных форм Gli3» . Genes Dev . 16 (22): 2843–8. DOI : 10,1101 / gad.1017302 . PMC 187484 . PMID 12435627 .
Хе Дж, Теген С.Б., Кравиц А.Р., Мартин Г.С., Луо К. (2003). «Трансформирующая активность Ski и SnoN зависит от их способности подавлять активность белков Smad» . J. Biol. Chem . 278 (33): 30540–7. DOI : 10.1074 / jbc.M304016200 . PMID 12764135 .
vтеPDB галерея
1mr1 : Кристаллическая структура комплекса Smad4-Ski
1sbx : Кристаллическая структура домена гомологии таксы SKI человека.
