Из Википедии, свободной энциклопедии
  (Перенаправлено с SLC3A2 )
Перейти к навигации Перейти к поиску

SLC3A2
Белок SLC3A2 PDB 2dh2.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

2DH2 , 2DH3

Идентификаторы
ПсевдонимыSLC3A2 , 4F2, 4F2HC, 4T2HC, CD98, CD98HC, MDU1, NACAE, семейство носителей растворенного вещества 3, член 2
Внешние идентификаторыOMIM : 158070 MGI : 96955 HomoloGene : 1795 GeneCards : SLC3A2
Расположение гена ( человек )
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человека) [1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение SLC3A2
Геномное расположение SLC3A2
Группа11q12.3Начинать62 856 004 п.н. [1]
Конец62 888 880 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 19 (мышь)
Chr.Хромосома 19 (мышь) [2]
Хромосома 19 (мышь)
Геномное расположение SLC3A2
Геномное расположение SLC3A2
Группа19 А | 19 5,44 смНачинать8 706 882 п.н. [2]
Конец8 723 369 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE SLC3A2 200924 s на fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• кальций: натрий антипортер активность
• нейтральной аминокислота трансмембранного переносчика активность
• каталитической активность
• ГО: связывание белка 0001948
• связывание двухцепочечного РНКА
• связывание РНК
• кадгерин связывания
Сотовый компонент• составной компонент мембраны
• мембрана
• меланосома
• клеточная мембрана
• поверхность клетки
• апикальная плазматическая мембрана
• внеклеточная экзосома
• ядро клетки
• цитозоль
Биологический процесс• ответ на экзогенный дцРНК
• рост клеток
• аминокислотного транспорт
• миграция лейкоциты
• ионы кальция транспорт
• триптофан транспорт
• ионы натрий трансмембранного транспорт
• L-альфа-аминокислота трансмембранного транспорт
• транспорт
• углеводный процесс обмена веществ
• L-лейцин импорта через плазматическую мембрану
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

6520

17254

Ансамбль

ENSG00000168003

ENSMUSG00000010095

UniProt

P08195

P10852

RefSeq (мРНК)
NM_001012661
NM_001012662
NM_001012663
NM_001012664
NM_001013251

NM_002394

NM_001161413
NM_008577

RefSeq (белок)

NP_001012680
NP_001012682
NP_001013269
NP_002385

NP_001154885
NP_032603

Расположение (UCSC)Chr 11: 62,86 - 62,89 МбChr 19: 8.71 - 8.72 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

4F2 клеточной поверхности антиген тяжелой цепи представляет собой белок , который у человека кодируется SLC3A2 (растворенное вещество - носитель семьи 3 члена 2) гена . [5] [6]

SLC3A2 включает тяжелую субъединицу большого переносчика нейтральных аминокислот ( LAT1 ), также известного как CD98 (кластер дифференцировки 98). [7] [8]

Функция [ править ]

SLC3A2 является членом семейства растворенных носителей и кодирует трансмембранный белок клеточной поверхности с альфа-амилазным доменом. Белок существует как тяжелая цепь гетеродимера, ковалентно связанная дисульфидными связями с одной из нескольких возможных легких цепей. Он связывается с интегринами и опосредует интегрин-зависимую передачу сигналов, связанных с нормальным ростом клеток и онкогенезом. Были охарактеризованы альтернативные варианты транскрипционного сплайсинга, кодирующие разные изоформы. [6]

LAT1 представляет собой гетеродимерный мембранный транспортный белок, который преимущественно переносит нейтральные разветвленные ( валин , лейцин , изолейцин ) и ароматические ( триптофан , тирозин ) аминокислоты . [9] LAT высоко экспрессируется в капиллярах головного мозга (которые образуют гематоэнцефалический барьер ) по сравнению с другими тканями. [9]

Функциональный транспортер LAT1 состоит из двух белков, кодируемых двумя разными генами:

  • Белок тяжелой субъединицы 4F2hc / CD98, кодируемый геном SLC3A2 (этот ген) [10]
  • CD98 света субъединица белка , кодируемого SLC7A5 гена [11]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что SLC3A2 взаимодействует с SLC7A7 . [12]

Кроме того, SLC3A2 является составным членом системы xc-цистин / глутаматный антипортер, образуя комплекс с SLC7A11.

См. Также [ править ]

  • Переносчик гетеродимерных аминокислот

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000168003 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000010095 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. Перейти ↑ Teixeira S, Di Grandi S, Kühn LC (август 1987). «Первичная структура тяжелой цепи человеческого антигена 4F2 предсказывает наличие трансмембранного белка с цитоплазматическим NH2-концом». J Biol Chem . 262 (20): 9574–80. PMID 3036867 . 
  6. ^ a b «Ген Entrez: семейство 3 носителей растворенных веществ SLC3A2 (активаторы транспорта двухосновных и нейтральных аминокислот), член 2» .
  7. ^ Kucharzik Т, Lugering А, Ян Y, Дрис А, Шаррье л, Sitaraman S, Мерлин D (2005). «Активация эпителиального гликопротеина CD98 увековечивает воспаление толстой кишки» . Лаборатория. Инвестируйте . 85 (7): 932–41. DOI : 10.1038 / labinvest.3700289 . PMID 15880135 . 
  8. ^ Леметр G, Гонне Р, Р Vaigot, гидрология Х, Мартин МТ, Tortajada Дж, Ваксман G (2005). «CD98, новый маркер временного усиления кератиноцитов человека». Протеомика . 5 (14): 3637–45. DOI : 10.1002 / pmic.200401224 . PMID 16097038 . S2CID 31954787 .  
  9. ^ a b Боадо Р.Дж., Ли Дж.Й., Нагая М., Чжан С., Пардридж В.М. (1999). «Селективная экспрессия большого переносчика нейтральных аминокислот на гематоэнцефалическом барьере» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 96 (21): 12079–84. DOI : 10.1073 / pnas.96.21.12079 . PMC 18415 . PMID 10518579 .  
  10. ^ Palacín M, Kanai Y (2004). «Вспомогательные белки HAT: семейство переносчиков аминокислот SLC3». Pflügers Arch . 447 (5): 490–494. DOI : 10.1007 / s00424-003-1062-7 . PMID 14770309 . S2CID 25808108 .  
  11. ^ Verrey F, Клосс Е.И., Вагнер СА, Palacin М, Endou Н, Канеи Y (2004). «CATs и HATs: семейство переносчиков аминокислот SLC7» (PDF) . Pflügers Arch . 447 (5): 532–542. DOI : 10.1007 / s00424-003-1086-Z . PMID 14770310 . S2CID 11670040 .   
  12. ^ Пфайфер R, G Росье, Шпиндлер В, С Мейер, Кюн л, Verrey F (январь 1999 г.). «Аминокислотный транспорт y + L-типа гетеродимерами 4F2hc / CD98 и членами семейства гликопротеин-ассоциированных переносчиков аминокислот» . EMBO J . 18 (1): 49–57. DOI : 10.1093 / emboj / 18.1.49 . PMC 1171101 . PMID 9878049 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Рошель Дж. М., Уотсон М. Л., Оки Р. Дж., Селдин М. Ф. (1992). «Карта сцепления хромосомы 19 мыши: определение сравнительного картирования отношений с хромосомами 10 и 11 человека, включая локус MEN1». Геномика . 14 (1): 26–31. DOI : 10.1016 / S0888-7543 (05) 80278-2 . PMID  1358795 .
  • Михалак M, Quackenbush EJ, Letarte M (1986). «Ингибирование активности обменника Na + / Ca2 + в сарколеммальных везикулах сердечных и скелетных мышц моноклональным антителом 44D7». J. Biol. Chem . 261 (1): 92–5. PMID  2416754 .
  • Gottesdiener KM, Karpinski BA, Lindsten T, Strominger JL, Jones NH, Thompson CB, Leiden JM (1989). «Выделение и структурная характеристика гена тяжелой цепи 4F2 человека, индуцибельного гена, участвующего в активации Т-лимфоцитов» . Мол. Клетка. Биол . 8 (9): 3809–19. DOI : 10.1128 / mcb.8.9.3809 . PMC  365439 . PMID  3265470 .
  • Линдстен Т., июнь CH, Томпсон CB, Лейден JM (1989). «Регуляция экспрессии гена тяжелой цепи 4F2 во время нормальной активации Т-клеток человека может быть опосредована множеством различных молекулярных механизмов» . Мол. Клетка. Биол . 8 (9): 3820–6. DOI : 10.1128 / mcb.8.9.3820 . PMC  365440 . PMID  3265471 .
  • Quackenbush E, Clabby M, Gottesdiener KM, Barbosa J, Jones NH, Strominger JL, Speck S, Leiden JM (1987). «Молекулярное клонирование комплементарных ДНК, кодирующих тяжелую цепь антигена клеточной поверхности человека 4F2: мембранный гликопротеин типа II, участвующий в росте нормальных и неопластических клеток» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 84 (18): 6526–30. DOI : 10.1073 / pnas.84.18.6526 . PMC  299110 . PMID  3476959 .
  • Lumadue JA, Glick AB, Ruddle FH (1988). «Клонирование, анализ последовательности и экспрессия большой субъединицы антигена активации лимфоцитов человека 4F2» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 84 (24): 9204–8. DOI : 10.1073 / pnas.84.24.9204 . PMC  299721 . PMID  3480538 .
  • Posillico JT, Srikanta S, Eisenbarth G, Quaranta V, Kajiji S, Brown EM (1987). «Связывание моноклонального антитела (4F2) с его антигеном на клеточной поверхности на диспергированных аденоматозных паратироидных клетках повышает содержание кальция в цитозоле и подавляет секрецию паратироидного гормона». J. Clin. Эндокринол. Метаб . 64 (1): 43–50. DOI : 10,1210 / jcem-64-1-43 . PMID  3782435 .
  • Хемлер М.Э., Стромингер Дж.Л. (1982). «Характеристика антигена, распознаваемого моноклональным антителом (4F2): различные молекулярные формы на линиях Т- и В-лимфобластоидных клеток». J. Immunol . 129 (2): 623–8. PMID  6177771 .
  • Петерс П.Г., Камарк М.Э., Хемлер М.Э., Строминджер Д.Л., Раддл Ф.Х. (1983). «Генетическая и биохимическая характеристика детерминанты человеческой поверхности на гибридах соматических клеток: антиген 4F2». Somatic Cell Genet . 8 (6): 825–34. DOI : 10.1007 / BF01543022 . PMID  6187076 . S2CID  19788137 .
  • Francke U, Foellmer BE, Haynes BF (1983). «Хромосомное картирование молекул поверхности клетки человека: моноклональные антитела против лимфоцитов человека 4F2, A3D8 и A1G3 определяют антигены, контролируемые различными участками хромосомы 11». Somatic Cell Genet . 9 (3): 333–44. DOI : 10.1007 / BF01539142 . PMID  6190235 . S2CID  22972681 .
  • Haynes BF, Hemler ME, Mann DL, Eisenbarth GS, Shelhamer J, Mostowski HS, Thomas CA, Strominger JL, Fauci AS (1981). «Характеристика моноклонального антитела (4F2), которое связывается с человеческими моноцитами и с подмножеством активированных лимфоцитов». J. Immunol . 126 (4): 1409–14. PMID  7204970 .
  • Огимото С., Табата Н., Суга С., Нишио М., Охта Х, Цурудоме М., Комада Х, Кавано М., Ватанабе Н., Ито Й. (1995). «Молекулярная характеристика слитого регуляторного белка-1 (FRP-1), который индуцирует образование многоядерных гигантских клеток из моноцитов и слияния клеток, опосредованного gp160 ВИЧ. FRP-1 и 4F2 / CD98 являются идентичными молекулами». J. Immunol . 155 (7): 3585–92. PMID  7561057 .
  • Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
  • Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Ю.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим . 236 (1): 107–13. DOI : 10.1006 / abio.1996.0138 . PMID  8619474 .
  • Огимото С., Табата Н., Суга С., Цурудомэ М., Кавано М., Нишио М., Окамото К., Комада Х., Ватанабе Н., Ито Й. (1996). "Регулирование слияния клеток, опосредованного gp160 вируса иммунодефицита человека, антителами против регуляторного белка 1 слияния" . J. Gen. Virol . 77 (11): 2747–56. DOI : 10.1099 / 0022-1317-77-11-2747 . PMID  8922468 .
  • Courseaux A, Grosgeorge J, Gaudray P, Pannett AA, Forbes SA, Williamson C, Bassett D, Thakker RV, Teh BT, Farnebo F, Shepherd J, Skogseid B, Larsson C, Giraud S, Zhang CX, Salandre J, Calender A (1997). «Определение минимальной области-кандидата MEN1 на основе 5-мегабайтной интегрированной карты проксимального участка 11q13. Европейский консорциум по Men1, (GENEM 1; Groupe d'Etude des Néoplasies Endocriniennes Multiples de type 1)». Геномика . 37 (3): 354–65. DOI : 10.1006 / geno.1996.0570 . PMID  8938448 .
  • Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. К., Музни Д. М., Дин Й., Лю В., Рикафренте Д. Ю., Вентланд М. А., Леннон Г., Гиббс Р. А. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК» . Genome Res . 7 (4): 353–8. DOI : 10.1101 / gr.7.4.353 . PMC  139146 . PMID  9110174 .
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID  9373149 .
  • Табата Н., Идо М., Суга С., Огимото С., Цурудомэ М., Кавано М., Нишио М., Ватанабэ Н., Окамото К., Комада Х., Сакураи М., Ито Y (1998). «Активация протеинтирозинкиназы обеспечивает ранний и обязательный сигнал в индуцированном моноклональным антителом анти-FRP-1 / CD98 / 4F2 слиянии клеток, опосредованном gp160 ВИЧ». Med. Microbiol. Иммунол . 186 (2–3): 115–23. DOI : 10.1007 / s004300050053 . PMID  9403839 . S2CID  7693336 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Large + Neutral + Amino + Acid-Transporter + 1 в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
  • Amino + Acid + Transport + System + L в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .