Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
SOD3
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

2JLP

Идентификаторы
ПсевдонимыSOD3 , EC-SOD, супероксиддисмутаза 3, внеклеточная, супероксиддисмутаза 3
Внешние идентификаторыOMIM : 185490 MGI : 103181 HomoloGene : 2334 GeneCards : супероксиддисмутаза 3
Расположение гена ( человек )
Хромосома 4 (человек)
Chr.Хромосома 4 (человек) [1]
Хромосома 4 (человек)
Геномное расположение SOD3
Геномное расположение SOD3
Группа4п15.2Начинать24 789 912 п.н. [1]
Конец24 800 842 п.н. [1]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE SOD3 205236 x в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• гепаринсвязывающего
• ион цинк связывание
• ион металл связывание
• антиоксидантный активности
• GO: связывание белка 0001948
• оксидоредуктаза активность
• ион меди связывание
• активности супероксиддисмутазы
• супероксиддисмутазы медь шаперон активность
Сотовый компонент• цитоплазма
• внеклеточный матрикс
• просвет Гольджи
• внеклеточная экзосома
• ядро клетки
• внеклеточная
• внеклеточная область
• внеклеточный матрикс, содержащий коллаген
Биологический процесс• реакция на гипоксию
• ответ на ион меди
• ответ на окислительный стресс
• окислительно-восстановительный процесс
• процесс метаболизма супероксида
• клеточный ответ на окислительный стресс
• удаление супероксидных радикалов
• детоксикация клеточного окислителя
• GO: 0048554 положительное регулирование каталитической активности
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

6649

20657

Ансамбль

ENSG00000109610

ENSMUSG00000072941

UniProt

P08294

O09164

RefSeq (мРНК)

NM_003102

NM_011435

RefSeq (белок)

NP_003093

NP_035565

Расположение (UCSC)Chr 4: 24,79 - 24,8 Мбн / д
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Внеклеточные супероксиддисмутазы [Cu-Zn] представляет собой фермент , который в организме человека кодируется супероксиддисмутаз 3 гена .

Этот ген кодирует член семейства белков супероксиддисмутазы (SOD). Содс являются антиокислительными ферментами , которые катализируют в дисмутация двух супероксидных радикалов в перекись водорода и кислород . Считается, что продукт этого гена защищает мозг , легкие и другие ткани от окислительного стресса . Белок секретируется во внеклеточное пространство и образует гликозилированный гомотетрамер, который закреплен на внеклеточном матриксе.(ЕСМ) и клеточные поверхности за счет взаимодействия с гепарансульфат протеогликаном и коллагеном . Фракция белка расщепляется около С-конца перед секрецией с образованием циркулирующих тетрамеров, которые не взаимодействуют с ЕСМ. [4]

У черных садовых муравьев ( Lasius niger ) продолжительность жизни маток на порядок больше, чем у рабочих, несмотря на отсутствие систематических различий в нуклеотидной последовательности между ними. [5] Ген SOD3 оказался наиболее дифференциально сверхэкспрессируемым геном в мозге королевы и рабочих муравьев. Это открытие повышает вероятность того, что антиоксидантная активность SOD3 играет ключевую роль в поразительном долголетии социальных маток насекомых. [5]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000109610 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Entrez Gene: SOD3 супероксиддисмутаза 3, внеклеточный" .
  5. ^ a b Lucas ER, Keller L. Повышенная экспрессия генов старения и иммунитета у королев черных садовых муравьев. Exp Gerontol. 15 июля 2018 г .; 108: 92-98. DOI: 10.1016 / j.exger.2018.03.020. Epub 2018 3 апреля. PMID: 29625209

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Зелко И.Н., Мариани Т.Дж., Фольц Р.Дж. (август 2002 г.). «Мультигенное семейство супероксиддисмутазы: сравнение структур, эволюции и экспрессии генов CuZn-SOD (SOD1), Mn-SOD (SOD2) и EC-SOD (SOD3)». Свободная радикальная биология и медицина . 33 (3): 337–49. DOI : 10.1016 / S0891-5849 (02) 00905-X . PMID  12126755 .
  • Фарачи FM, Дидион SP (август 2004 г.). «Защита сосудов: изоформы супероксиддисмутазы в стенке сосуда» . Артериосклероз, тромбоз и биология сосудов . 24 (8): 1367–73. DOI : 10.1161 / 01.ATV.0000133604.20182.cf . PMID  15166009 .
  • Адачи Т., Охта Х, Ямада Х, Футенма А, Като К., Хирано К. (ноябрь 1992 г.). «Количественный анализ внеклеточной супероксиддисмутазы в сыворотке и моче с помощью ELISA с моноклональными антителами». Clinica Chimica Acta; Международный журнал клинической химии . 212 (3): 89–102. DOI : 10.1016 / 0009-8981 (92) 90176-Q . PMID  1477980 .
  • Адачи Т., Охта Х, Хаяши К., Хирано К., Марклунд С.Л. (сентябрь 1992 г.). «Сайт неферментативного гликирования внеклеточной супероксиддисмутазы человека in vitro». Свободная радикальная биология и медицина . 13 (3): 205–10. DOI : 10.1016 / 0891-5849 (92) 90016-A . PMID  1505778 .
  • Марклунд С.Л. (февраль 1990 г.). «Экспрессия внеклеточной супероксиддисмутазы линиями клеток человека» . Биохимический журнал . 266 (1): 213–9. DOI : 10.1042 / bj2660213 . PMC  1131117 . PMID  2106874 .
  • Хендриксон DJ, Фишер JH, Джонс C, Хо YS (декабрь 1990). «Региональная локализация гена внеклеточной супероксиддисмутазы человека на 4pter-q21». Геномика . 8 (4): 736–8. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (90) 90264-U . PMID  2276747 .
  • Hjalmarsson K, Marklund SL, Engström A, Edlund T (сентябрь 1987 г.). «Выделение и последовательность комплементарной ДНК, кодирующей внеклеточную супероксиддисмутазу человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 84 (18): 6340–4. DOI : 10.1073 / pnas.84.18.6340 . PMC  299071 . PMID  3476950 .
  • Марклунд С.Л. (октябрь 1984 г.). «Внеклеточная супероксиддисмутаза в тканях человека и линиях клеток человека» . Журнал клинических исследований . 74 (4): 1398–403. DOI : 10.1172 / JCI111550 . PMC  425307 . PMID  6541229 .
  • Ямада Х., Ямада Й., Адачи Т., Гото Х., Огасавара Н., Футенма А., Китано М., Хирано К., Като К. (июнь 1995 г.). «Молекулярный анализ гена внеклеточной супероксиддисмутазы, связанный с высоким уровнем в сыворотке» . Японский журнал генетики человека . 40 (2): 177–84. DOI : 10.1007 / BF01883574 . PMID  7662997 .
  • Фольц Р. Дж., Крапо Д. Д. (июль 1994 г.). «Внеклеточная супероксиддисмутаза (SOD3): тканеспецифическая экспрессия, геномная характеристика и компьютерный анализ последовательности гена EC SOD человека». Геномика . 22 (1): 162–71. DOI : 10.1006 / geno.1994.1357 . PMID  7959763 .
  • Сандстрём Дж., Нильссон П., Карлссон К., Марклунд С.Л. (июль 1994 г.). «10-кратное увеличение содержания внеклеточной супероксиддисмутазы в плазме человека, вызванное мутацией в гепарин-связывающем домене». Журнал биологической химии . 269 (29): 19163–6. PMID  8034674 .
  • Адачи Т., Ямада Х., Ямада И., Морихара Н., Ямадзаки Н., Мураками Т., Футенма А., Като К., Хирано К. (январь 1996 г.). «Замена глицина на аргинин-213 во внеклеточной супероксиддисмутазе снижает сродство к гепарину и поверхности эндотелиальных клеток» . Биохимический журнал . 313 (Pt 1) (1): 235–9. DOI : 10.1042 / bj3130235 . PMC  1216888 . PMID  8546689 .
  • Ури Т.Д., Крапо Дж. Д., Вальникова З., Энгильд Дж. Дж. (Июль 1996 г.). «Внеклеточная супероксиддисмутаза человека представляет собой тетрамер, состоящий из двух связанных дисульфидными связями димеров: упрощенная высокопроизводительная очистка внеклеточной супероксиддисмутазы» . Биохимический журнал . 317 (Pt 1) (1): 51–7. DOI : 10.1042 / bj3170051 . PMC  1217485 . PMID  8694786 .
  • Адачи Т., Морихара Н., Ямазаки Н., Ямада Х., Футенма А., Като К., Хирано К. (июль 1996 г.). «Мутация аргинина-213 в глицин во внеклеточной супероксиддисмутазе человека снижает восприимчивость к трипсиноподобным протеиназам». Журнал биохимии . 120 (1): 184–8. DOI : 10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a021383 . PMID  8864862 .
  • Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. DOI : 10.1101 / gr.6.9.791 . PMID  8889548 .
  • Энгильд Дж. Дж., Тогерсен И. Б., Ури Т. Д., Вальникова З., Хойруп П., Крапо Дж. Д. (май 1999 г.). «Гепарин-связывающий домен внеклеточной супероксиддисмутазы протеолитически процессируется внутриклеточно во время биосинтеза» . Журнал биологической химии . 274 (21): 14818–22. DOI : 10.1074 / jbc.274.21.14818 . PMID  10329680 .
  • Bowler RP, Nicks M, Olsen DA, Thøgersen IB, Valnickova Z, Højrup P, Franzusoff A, Enghild JJ, Crapo JD (май 2002 г.). «Фурин протеолитически обрабатывает гепарин-связывающую область внеклеточной супероксиддисмутазы» . Журнал биологической химии . 277 (19): 16505–11. DOI : 10.1074 / jbc.M105409200 . PMID  11861638 .
  • Ямамото М., Хара Х, Адачи Т. (август 2002 г.). «Экспрессия внеклеточной супероксиддисмутазы увеличивается под действием лизофосфатидилхолина в человеческих моноцитарных клетках U937». Атеросклероз . 163 (2): 223–8. DOI : 10.1016 / S0021-9150 (02) 00007-2 . PMID  12052468 .
  • Серра В., фон Зглиницки Т., Лоренц М., Сарецки Г. (февраль 2003 г.). «Внеклеточная супероксиддисмутаза является основным антиоксидантом в фибробластах человека и замедляет укорочение теломер» . Журнал биологической химии . 278 (9): 6824–30. DOI : 10.1074 / jbc.M207939200 . PMID  12475988 .
  • v
  • т
  • е