ArgBP2 белок , называемый также Sorbin и SH3 домен , содержащий белок 2 представляет собой белок , который у человека кодируется SORBS2 гена . [5] [6] ArgBP2 принадлежит к небольшому семейству адаптерных белков, имеющих домены гомологии сорбина (SOHO). ArgBP2 очень распространен в клетках сердечной мышцы в структурах саркомерного Z-диска и экспрессируется в других клетках в актиновых стрессовых волокнах и ядре .
СОДЕРЖАНИЕ
1 Структура
2 Функция
3 Клиническая значимость
4 взаимодействия
5 ссылки
6 Дальнейшее чтение
Структура [ править ]
ArgBP2 может существовать в виде 9 уникальных изоформ в диапазоне от 52 кДа до 117 кДа (от 492 до 1100 аминокислот). [6] ArgBP2 принадлежит к небольшому семейству адаптерных белков, имеющих домены гомологии сорбина (SOHO) и три домена SH3 , которые регулируют клеточную адгезию, организацию цитоскелета и передачу сигналов фактора роста; другие члены включают CAP / понсин и винексин . [7] Три домена SH3 являются С-концевыми , домен, богатый серин-треонином [8], находится в середине, а домен гомологии сорбина (SoHo) является N-концевым . Домены SH3 взаимодействуют с Arg / Abl, винкулином. [7]Домен SOHO взаимодействует с флотилином, обнаруженным в липидных рафтах. [9]
Функция [ править ]
Субклеточная локализация этого белка в клетках эпителия и сердечной мышцы предполагает, что ArgBP2 функционирует как адаптерный белок для сборки сигнальных комплексов в стрессовых волокнах и что он является потенциальным связующим звеном между киназами семейства Abl и актиновым цитоскелетом. ArgBP2 содержит несколько потенциальных сайтов фосфорилирования Abl; [8] Arg и c-Abl представляют собой представителей семейства нерецепторных протеин-тирозинкиназ у млекопитающих. В немышечных клетках ArgBP2 предлагает Cbl, который усиливает деградацию c-Abl ; [10], а также Pyk2, который способствует ремоделированию цитоскелета. [11] Связывание ArgBP2 с флотилином.на липидных рафтах может указывать на роль ArgBP2 в переносе пузырьков и передаче сигналов. flotillin в клетках скелетных мышц обнаруживает полосатый рисунок [12], предполагая локализацию в Т-канальцах или саркоплазматических ретикулярных цистернах, хотя точная роль в клетках сердца не определена . В клетках сердечной мышцы, ниспадающие эксперименты обнаружили ArgBP2 в комплексе с альфа актинина-2 , винкулиной , спектриной , паксиллином , Pyk2 и flotillin , предполагая , что ArgBP2 может быть вовлечен в миофибриллысборка и передача сигналов Z-диапазона в кардиомиоцитах [13], хотя функциональные исследования необходимы для выяснения специфических механизмов. ArgBP2 был связан с hyertrophic сигнализации, как мощный паракринная действия молекула РНК индуцируют гипертрофию сердца у мышей, микроРНК-21, действует на обоих ArgBP2 и PDLIM5 , чтобы вызвать гипертрофический ответ. [14]
Клиническое значение [ править ]
Повышенные уровни сывороточного ArgBP2 и согласованное снижение ArgBP2 в ткани миокарда были обнаружены на очень ранней стадии у пациентов, перенесших инфаркт миокарда, которые умерли в течение 7 часов после инсульта. [15] Перицентрическая инверсия хромосомы 4 наблюдалась у 10 пациентов с ассоциированными сердечными дефектами, связанными с терминальными делециями 4q35.1, которые могут влиять на SORBS2 . [16]
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что ArgBP2 взаимодействует с:
ABL , [5] [17]
ABL2 , [5]
ACTC1 , [13] [18]
CBL , [17] [19]
FLOT1 , [20]
ПТК2Б , [19]
PLDN , [21] и
VCL . [13] [22]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000154556 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031626 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ a b c Wang B, Golemis EA, Kruh GD (июль 1997 г.). «ArgBP2, Arg / Abl-взаимодействующий белок, содержащий домен с множественной гомологией Src 3, фосфорилируется в v-Abl-трансформированных клетках и локализуется в стрессовых волокнах и Z-дисках кардиоцитов» . Журнал биологической химии . 272 (28): 17542–50. DOI : 10.1074 / jbc.272.28.17542 . PMID 9211900 .
^ a b «Ген Entrez: сорбин SORBS2 и домен SH3, содержащий 2» .
^ a b Киока Н., Уэда К., Амачи Т. (февраль 2002 г.). «Винексин, CAP / ponsin, ArgBP2: новое семейство адаптерных белков, регулирующих организацию цитоскелета и передачу сигналов» . Структура и функции клеток . 27 (1): 1–7. DOI : 10.1247 / csf.27.1 . PMID 11937713 .
^ a b Wang B, Golemis EA, Kruh GD (июль 1997 г.). «ArgBP2, Arg / Abl-взаимодействующий белок, содержащий домен с множественной гомологией Src 3, фосфорилируется в v-Abl-трансформированных клетках и локализуется в стрессовых волокнах и Z-дисках кардиоцитов» . Журнал биологической химии . 272 (28): 17542–50. DOI : 10.1074 / jbc.272.28.17542 . PMID 9211900 .
↑ Kimura A, Baumann CA, Chiang SH, Saltiel AR (июль 2001 г.). «Домен гомологии сорбина: мотив для нацеливания белков на липидные рафты» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (16): 9098–103. DOI : 10.1073 / pnas.151252898 . PMC 55379 . PMID 11481476 .
^ Soubeyran P, Barac A, Szymkiewicz I, Dikic I (февраль 2003). «Комплекс Cbl-ArgBP2 опосредует убиквитинирование и деградацию c-Abl» . Биохимический журнал . 370 (Pt 1): 29–34. DOI : 10.1042 / BJ20021539 . PMC 1223168 . PMID 12475393 .
Перейти ↑ Haglund K, Ivankovic-Dikic I, Shimokawa N, Kruh GD, Dikic I (май 2004 г.). «Рекрутирование Pyk2 и Cbl на липидные рафты опосредует сигналы, важные для реорганизации актина в растущих нейритах» . Журнал клеточной науки . 117 (Pt 12): 2557–68. DOI : 10,1242 / jcs.01148 . PMID 15128873 .
^ Voldstedlund МЫ, Винтен Дж, Tranum-Йенсен J (ноябрь 2001 г.). «Экспрессия cav-p60 в мышечных тканях крысы. Распределение кавеолярных белков». Клеточные и тканевые исследования . 306 (2): 265–76. DOI : 10.1007 / s004410100439 . PMID 11702238 . S2CID 7420385 .
^ a b c Сангер Дж. М., Ван Дж., Глисон Л. М., Чоураши П., Дубе Д. К., Миттал Б., Жукарева В., Сангер Дж. В. (декабрь 2010 г.). «Arg / Abl-связывающий белок, белок Z-тела и Z-полосы, связывает саркомерные, костамерные и сигнальные молекулы» . Цитоскелет . 67 (12): 808–23. DOI : 10.1002 / cm.20490 . PMC 3019100 . PMID 20886612 .
^ Взрыва С, Batkai S, Dangwal S, Гупта С. К., Foinquinos А, Хольцманн А, Just A, Remke J, Zimmer К, Zeug А, Ponimaskin Е, Schmiedl А, Инь Х, Майр М, Гальдер R, Фишер А, Энджелхардт С, Вэй Й, Шобер А., Фидлер Дж., Тум Т. (май 2014 г.). «Экзосомы, полученные из кардиальных фибробластов, обогащенные пассажирской цепью, опосредуют гипертрофию кардиомиоцитов» . Журнал клинических исследований . 124 (5): 2136–46. DOI : 10.1172 / JCI70577 . PMC 4001534 . PMID 24743145 .
^ Kakimoto Y, Ит S, Абир Н, Котань Н, Озэки М, Тамаки К, Tsuruyama Т (2013). «Сорбин и SH3-домен-содержащий белок 2 высвобождается из инфаркта сердца на очень ранней стадии: протеомный анализ сердечных тканей пациентов» . Журнал Американской кардиологической ассоциации . 2 (6): e000565. DOI : 10,1161 / JAHA.113.000565 . PMC 3886759 . PMID 24342996 .
^ Maurin ML, Лабрюном P, Бриссе S, Le Lorc'h M, Pineau D, Castel C, S Romana, Tachdjian G (февраль 2009). «Молекулярно-цитогенетическая характеристика дупликации 4p15.1-pter и делеции 4q35.1-qter в рекомбинанте перицентрической инверсии хромосомы 4». Американский журнал медицинской генетики Часть А . 149A (2): 226–31. DOI : 10.1002 / ajmg.a.32603 . PMID 19161154 . S2CID 205310317 .
^ a b Soubeyran P, Barac A, Szymkiewicz I, Dikic I (февраль 2003 г.). «Комплекс Cbl-ArgBP2 опосредует убиквитинирование и деградацию c-Abl» . Биохим. Дж . 370 (Pt 1): 29–34. DOI : 10.1042 / BJ20021539 . PMC 1223168 . PMID 12475393 .
^ a b Haglund K, Ivankovic-Dikic I, Shimokawa N, Kruh GD, Dikic I (май 2004 г.). «Рекрутирование Pyk2 и Cbl на липидные рафты опосредует сигналы, важные для реорганизации актина в растущих нейритах» . J. Cell Sci . 117 (Pt 12): 2557–68. DOI : 10,1242 / jcs.01148 . PMID 15128873 .
↑ Kimura A, Baumann CA, Chiang SH, Saltiel AR (июль 2001 г.). «Домен гомологии сорбина: мотив для нацеливания белков на липидные рафты» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 98 (16): 9098–103. DOI : 10.1073 / pnas.151252898 . PMC 55379 . PMID 11481476 .
^ Rönty М, Taivainen А, Moza М, Kruh Г.Д., Ehler Е, Carpen О (октябрь 2005). «Вовлечение палладина и альфа-актинина в нацеливание адаптера киназы Abl / Arg ArgBP2 на актиновый цитоскелет». Exp. Cell Res . 310 (1): 88–98. DOI : 10.1016 / j.yexcr.2005.06.026 . PMID 16125169 .
^ Kioka N, Ueda K, Amachi T (февраль 2002). «Винексин, CAP / ponsin, ArgBP2: новое семейство адаптерных белков, регулирующих организацию цитоскелета и передачу сигналов» . Сотовая структура. Функц . 27 (1): 1–7. DOI : 10.1247 / csf.27.1 . PMID 11937713 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Kioka N (ноябрь 2002 г.). «[Новое семейство адаптерных белков, регулирующих организацию цитоскелета и передачу сигналов - винексин, CAP / ponsin, ArgBP2]». Сэйкагаку. Журнал Японского биохимического общества . 74 (11): 1356–60. PMID 12510380 .
Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Hillier LD, Lennon G, Becker M, Bonaldo MF, Chiapelli B, Chissoe S, Dietrich N, DuBuque T, Favello A, Gish W, Hawkins M, Hultman M, Kucaba T, Lacy M, Le M, Le N, Mardis E , Мур Б., Моррис М., Парсонс Дж., Прейндж С., Рифкин Л., Рольфинг Т., Шелленберг К., Бенто Соарес М., Тан Ф, Тьерри-Мег Дж., Треваскис Э., Андервуд К., Уолдман П., Уотерстон Р., Уилсон Р., Марра M (сентябрь 1996 г.). «Создание и анализ 280 000 тегов последовательности, экспрессируемых человеком» . Геномные исследования . 6 (9): 807–28. DOI : 10.1101 / gr.6.9.807 . PMID 8889549 .
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Кавабе Х., Хата Й, Такеучи М, Иде Н., Мидзогути А, Такай Й (октябрь 1999 г.). «nArgBP2, новый нервный член семейства понсин / ArgBP2 / винексин, который взаимодействует с синапс-ассоциированным белком 90 / постсинаптическим белком-95-ассоциированным белком (SAPAP)» . Журнал биологической химии . 274 (43): 30914–8. DOI : 10.1074 / jbc.274.43.30914 . PMID 10521485 .
Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. DOI : 10.1101 / gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (март 2001 г.). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Геномные исследования . 11 (3): 422–35. DOI : 10.1101 / гр . GR1547R . PMC 311072 . PMID 11230166 .
Zucconi A, Dente L, Santonico E, Castagnoli L, Cesareni G (апрель 2001 г.). «Выбор лигандов путем панорамирования библиотек доменов, отображаемых на фаге лямбда, открывает новых потенциальных партнеров синаптоянина 1». Журнал молекулярной биологии . 307 (5): 1329–39. DOI : 10.1006 / jmbi.2001.4572 . PMID 11292345 .
Kimura A, Baumann CA, Chiang SH, Saltiel AR (июль 2001 г.). «Домен гомологии сорбина: мотив для нацеливания белков на липидные рафты» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (16): 9098–103. DOI : 10.1073 / pnas.151252898 . PMC 55379 . PMID 11481476 .
Xu YC, Wu RF, Gu Y, Yang YS, Yang MC, Nwariaku FE, Terada LS (август 2002 г.). «Участие TRAF4 в окислительной активации N-концевой киназы c-Jun» . Журнал биологической химии . 277 (31): 28051–7. DOI : 10.1074 / jbc.M202665200 . PMID 12023963 .
Накаяма М., Кикуно Р., Охара О. (ноябрь 2002 г.). «Белковые взаимодействия между большими белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК» . Геномные исследования . 12 (11): 1773–84. DOI : 10.1101 / gr.406902 . PMC 187542 . PMID 12421765 .
Субейран П., Барак А., Шимкевич И., Дикич И. (февраль 2003 г.). «Комплекс Cbl-ArgBP2 опосредует убиквитинирование и деградацию c-Abl» . Биохимический журнал . 370 (Pt 1): 29–34. DOI : 10.1042 / BJ20021539 . PMC 1223168 . PMID 12475393 .
Хаглунд К., Иванкович-Дикич И., Шимокава Н., Крух Г.Д., Дикич И. (май 2004 г.). «Рекрутирование Pyk2 и Cbl на липидные рафты опосредует сигналы, важные для реорганизации актина в растущих нейритах» . Журнал клеточной науки . 117 (Pt 12): 2557–68. DOI : 10,1242 / jcs.01148 . PMID 15128873 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кантли Л.С., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130–5. DOI : 10.1073 / pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
Wiemann S, Arlt D, Huber W., Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геномные исследования . 14 (10B): 2136–44. DOI : 10.1101 / gr.2576704 . PMC 528930 . PMID 15489336 .
