• активность димеризации белков • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 ДНК-связывающая транскрипция активаторная активность, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0000983 РНК-полимераза II, общая активность фактора инициации транскрипции • Связывание первичной миРНК • связывание фактора транскрипции • Связывание ДНК с цис-регуляторной областью GO: 0000980 РНК-полимеразы II, специфичное для последовательности • Активность гомодимеризации белков • сыворотка связывание ответного элемента • связывание с хроматином • связывание с белком GO: 0001948 • Связывание ДНК • Связывание с ДНК, специфичное для последовательности • Активность фактора транскрипции, связывание с дистальным энхансером РНК-полимеразы II, специфичное для последовательности • Связывание с хроматином ДНК • Активность фактора транскрипции, Связывание с проксимальной областью корового промотора РНК-полимеразы II, специфичное для последовательности • Проксимальный коровой промотор GO: 0001158 Связывание ДНК, специфичное для последовательности участка • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ДНК-связывающий фактор транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • Связывание фактора транскрипции РНК-полимеразы II • Связывание гистондеацетилазы • Связывание ДНК-специфической последовательности РНК-полимеразы II связывание фактора транскрипции
Сотовый компонент
• цитоплазма • ядро клетки • ядерный хроматин • нуклеоплазма
Биологический процесс
• спинная аорта морфогенез • бронха хрящ развитие • мышечных клеток клеточный гомеостаз • легких сглаживать развитие мышц • регулирование потери воды через кожу • транскрипции от РНК - полимеразы II , промотор • стресс волокна сборки • миграцию клеток , участвующих в прорастание кровеносных сосудов • активация тромбоцитов • сердечной миофибрилла сборки • петля сердца • клеточное старение • развитие лица • регуляция клеточной адгезии • длительная синаптическая депрессия • развитие проекции нейронов • морфогенез эпителиального слоя • позитивная регуляция сборки филоподий • образование примитивных полос • клеточный ответ на стимул глюкозы • негативная регуляция клеточной пролиферации • ответ на цитокин • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • образование сердечных трабекул • актиновый филамент организация • развитие тимуса • ангиогенез, участвующий в заживлении ран • образование тромбоцитов • развитие нейронов • внутриутробное эмбриональное развитие • транскрипция, ДНК-шаблон • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • развитие сердца • позитивная регуляция дифференцировки клеток • ветвление, участвующее в морфогенезе кровеносных сосудов • позитивная регуляция удлинения аксонов • позитивная регуляция сокращения гладких мышц • развитие хряща трахеи • реакция на токсическое вещество • позитивная регуляция транскрипции pri-miRNA с промотора РНК-полимеразы II • позитивная регуляция транскрипции глюкозой • регуляция дифференцировки гладкомышечных клеток • поддержание структуры эпителия • ассоциативное обучение • морфогенез кожи • позитивная регуляция активности специфичного для последовательности ДНК-связывающего фактора транскрипции • адгезия эпителиальных клеток к клеткам • миграция нейронов • позитивная регуляция инициации транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • развитие век у камерного глаза • развитие щитовидной железы • негативная регуляция клиренса бета-амилоида • негативная регуляция миграции клеток • рост в процессе развития • дифференцировка гемопоэтических стволовых клеток • гаструляция • trophectodermal дифференцировки клеток • положительный тимуса выбора Т - клеток • реакция на гормон • клетка-матрица адгезии • саркомера организации • актина цитоскелета организации • развитие мегакариоцитов • ответ на гипоксию • положительное регулирование транскрипции с помощью элемента ответа сыворотки связывания • морфогенеза легких • формирование мезодермы • дифференцировка гладкомышечных клеток сердечных сосудов • транскрипция мРНК с промотора РНК-полимеразы II • развитие многоклеточного организма • тангенциальная миграция из субвентрикулярной зоны в обонятельную луковицу • позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II, участвующего в дифференцировке клеток-предшественников миокарда • долговременная память • узел сократительного пучка актиновых нитей • узел двухклеточного плотного соединения • дифференцировка лейкоцитов • развитие гиппокампа • положительный результат регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • развитие эритроцитов • негативная регуляция транскрипции pri-miRNA с промотора РНК-полимеразы II • развитие переднего мозга • межклеточная адгезия
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
6722
20807
Ансамбль
ENSG00000112658
ENSMUSG00000015605
UniProt
P11831
Q9JM73
RefSeq (мРНК)
NM_003131 NM_001292001
NM_020493
RefSeq (белок)
NP_001278930 NP_003122 NP_003122.1
NP_065239
Расположение (UCSC)
Chr 6: 43.17 - 43.18 Мб
Chr 17: 46,55 - 46,56 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Фактор сывороточного ответа , также известный как SRF , представляет собой белок фактора транскрипции . [5]
Содержание
1 Функция
2 Клиническое значение
3 взаимодействия
4 ссылки
5 Внешние ссылки
Функция [ править ]
Сывороточный фактор ответа является членом суперсемейства факторов транскрипции боксов MADS ( M CM1, A gamous, D eficiens и S RF). [6] Этот белок связывается с элементом ответа сыворотки (SRE) в промоторной области генов-мишеней. Этот белок регулирует активность многих непосредственных ранних генов , например c-fos , и тем самым участвует в регуляции клеточного цикла , апоптозе , росте и дифференцировке клеток . Этот ген является мишенью для многих путей; например, митоген-активированная протеинкиназапуть (MAPK), который действует через тройные комплексные факторы (TCF). [7] [8]
SRF важен во время развития эмбриона, поскольку он связан с формированием мезодермы . [9] [10] У полностью развитых млекопитающих SRF имеет решающее значение для роста скелетных мышц. [11] Взаимодействие SRF с другими белками, такими как рецепторы стероидных гормонов , может способствовать регуляции роста мышц с помощью стероидов . [12] Взаимодействие SRF с другими белками, такими как миокардин или Elk-1, может усиливать или подавлять экспрессию генов, важных для роста гладких мышц сосудов.
Клиническое значение [ править ]
Отсутствие кожного SRF связано с псориазом и другими кожными заболеваниями. [13]
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что фактор ответа сыворотки взаимодействует с:
ASCC3 , [14]
ATF6 , [15]
CEBPB , [16] [17]
CREB-связывающий белок , [18]
ELK4 , [15] [19]
GATA4 , [20] [21]
GTF2F1 , [22] [23]
GTF2I , [24] [25]
Миогенин , [26] [27]
НФЯ , [28]
Корепрессор ядерного рецептора 2 , [29]
Белок промиелоцитарного лейкоза [18] и
Src , [30] и
TEAD1 . [31]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000112658 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: Версия Ensembl 89: ENSMUSG00000015605 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Norman C, M Runswick Поллок R, R Трейсман (декабрь 1988). «Выделение и свойства клонов кДНК, кодирующих SRF, фактор транскрипции, который связывается с элементом ответа сыворотки c-fos». Cell . 55 (6): 989–1003. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (88) 90244-9 . PMID 3203386 . S2CID 20004673 .
↑ Shore P, Sharrocks AD (апрель 1995 г.). «Семейство транскрипционных факторов MADS-box». Евро. J. Biochem . 229 (1): 1–13. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1995.0001l.x . PMID 7744019 .
Перейти ↑ Dalton S, Marais R, Wynne J, Treisman R (июнь 1993 г.). «Выделение и характеристика дополнительных белков SRF». Филос. Пер. R. Soc. Лондон. B Biol. Sci . 340 (1293): 325–32. Bibcode : 1993RSPTB.340..325D . DOI : 10.1098 / rstb.1993.0074 . PMID 8103935 .
^ "Фактор ответа сыворотки SRF" . Entrez Gene . Национальный центр биотехнологической информации, Национальные институты здравоохранения.
^ Сепульведа JL, Vlahopoulos S, Iyer D, Belaguli N, Schwartz RJ (июль 2002 г.). «Комбинаторная экспрессия GATA4, Nkx2-5 и сывороточного фактора ответа направляет активность ранних сердечных генов» . J. Biol. Chem . 277 (28): 25775–82. DOI : 10.1074 / jbc.M203122200 . PMID 11983708 .
^ Barron MR, Belaguli NS, Zhang SX, Trinh M, Iyer D, Merlo X, Lough JW, Parmacek MS, Bruneau BG, Schwartz RJ (март 2005 г.). «Сывороточный фактор ответа, обогащенный обязательный фактор сердечной мезодермы, является нижестоящей генной мишенью для генов Tbx» . J. Biol. Chem . 280 (12): 11816–28. DOI : 10.1074 / jbc.M412408200 . PMID 15591049 .
^ Ли S, Czubryt МП, McAnally Дж, Бассель-Дубы R, Ричардсон JA, Wiebel FF, Нордгейм А, Олсон RU (январь 2005 г.). «Потребность в сывороточном факторе ответа для роста и созревания скелетных мышц, выявленная делецией тканеспецифического гена у мышей» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 102 (4): 1082–7. Bibcode : 2005PNAS..102.1082L . DOI : 10.1073 / pnas.0409103102 . PMC 545866 . PMID 15647354 .
^ Koegel Н, фон Тобель л, Шефер М, Альберти S, Kremmer Е, Мош С, D Hohl, Ван XJ, Пиво HD, Блох Вт, Нордгейм А, Вернер S (апрель 2009 г.). «Потеря сывороточного фактора ответа в кератиноцитах приводит к гиперпролиферативному заболеванию кожи у мышей» . J. Clin. Инвестируйте . 119 (4): 899–910. DOI : 10.1172 / JCI37771 . PMC 2662566 . PMID 19307725 .
↑ Jung DJ, Sung HS, Goo YW, Lee HM, Park OK, Jung SY, Lim J, Kim HJ, Lee SK, Kim TS, Lee JW, Lee YC (июль 2002 г.). «Новый комплекс коактиватора транскрипции, содержащий коинтегратор 1 активирующего сигнала» . Мол. Клетка. Биол . 22 (14): 5203–11. DOI : 10.1128 / mcb.22.14.5203-5211.2002 . PMC 139772 . PMID 12077347 .
^ а б Чжу С., Йохансен Ф. Э., Приуэс Р. (сентябрь 1997 г.). «Взаимодействие ATF6 и сывороточного фактора ответа» . Мол. Клетка. Биол . 17 (9): 4957–66. DOI : 10,1128 / MCB.17.9.4957 . PMC 232347 . PMID 9271374 .
Перейти ↑ Hanlon M, Sealy L (май 1999). «Ras регулирует ассоциацию сывороточного фактора ответа и CCAAT / связывающий энхансер белок бета» . J. Biol. Chem . 274 (20): 14224–8. DOI : 10.1074 / jbc.274.20.14224 . PMID 10318842 .
Перейти ↑ Sealy L, Malone D, Pawlak M (март 1997 г.). «Регулирование элемента ответа сыворотки cfos с помощью C / EBPbeta» . Мол. Клетка. Биол . 17 (3): 1744–55. DOI : 10.1128 / mcb.17.3.1744 . PMC 231899 . PMID 9032301 .
^ a b Мацузаки К., Минами Т., Тодзё М, Хонда Й, Сайто Н., Нагахиро С., Сая Х, Накао М. (март 2003 г.). «PML-ядерные тельца участвуют в клеточном сывороточном ответе». Гены клеток . 8 (3): 275–86. DOI : 10.1046 / j.1365-2443.2003.00632.x . PMID 12622724 . S2CID 9697837 .
Перейти ↑ Hassler M, Richmond TJ (июнь 2001). «B-бокс доминирует во взаимодействиях SAP-1-SRF в структуре тройного комплекса» . EMBO J . 20 (12): 3018–28. DOI : 10.1093 / emboj / 20.12.3018 . PMC 150215 . PMID 11406578 .
Перейти ↑ Morin S, Paradis P, Aries A, Nemer M (февраль 2001 г.). «Сывороточный фактор ответа-GATA тройной комплекс, необходимый для ядерной передачи сигналов рецептором, сопряженным с G-белком» . Мол. Клетка. Биол . 21 (4): 1036–44. DOI : 10.1128 / MCB.21.4.1036-1044.2001 . PMC 99558 . PMID 11158291 .
^ Жолио В, Demma М, Привес Р (февраль 1995). «Взаимодействие с субъединицей RAP74 TFIIF необходимо для активации транскрипции фактором ответа сыворотки». Природа . 373 (6515): 632–5. Bibcode : 1995Natur.373..632J . DOI : 10.1038 / 373632a0 . PMID 7854423 . S2CID 47196160 .
^ Чжу Н, Жолио В, Привес R (февраль 1994 г.). «Роль фактора транскрипции TFIIF в транскрипции, активируемой фактором ответа сыворотки». J. Biol. Chem . 269 (5): 3489–97. PMID 8106390 .
^ Грюнеберг Д.А., Генри RW, Брауэра А, Novina компакт - диск, Cheriyath В, Рой Л., Джилмэн М (октябрь 1997 г.). «Многофункциональный ДНК-связывающий белок, который способствует образованию комплексов сывороточный фактор ответа / гомеодомен: идентичность TFII-I» . Genes Dev . 11 (19): 2482–93. DOI : 10,1101 / gad.11.19.2482 . PMC 316568 . PMID 9334314 .
^ Ким DW, Cheriyath V, Roy AL, BH Cochran (июнь 1998). «TFII-I усиливает активацию промотора c-fos за счет взаимодействия с вышестоящими элементами» . Мол. Клетка. Биол . 18 (6): 3310–20. DOI : 10.1128 / mcb.18.6.3310 . PMC 108912 . PMID 9584171 .
^ Гройсман R, Masutani Н, Лейбович МП, Робин Р, Soudant я, Trouche D, Харель-Беллан А (март 1996 года). «Физическое взаимодействие между митоген-чувствительным сывороточным фактором ответа и миогенными белками основной спирали, петли, спирали» . J. Biol. Chem . 271 (9): 5258–64. DOI : 10.1074 / jbc.271.9.5258 . PMID 8617811 .
^ Biesiada Е, Hamamori Y, КЕДЕС л, Sartorelli В (апрель 1999 г.). «Миогенные основные белки спираль-петля-спираль и Sp1 взаимодействуют как компоненты мультибелкового транскрипционного комплекса, необходимого для активности промотора сердечного альфа-актина человека» . Мол. Клетка. Биол . 19 (4): 2577–84. DOI : 10,1128 / MCB.19.4.2577 . PMC 84050 . PMID 10082523 .
↑ Yamada K, Osawa H, Granner DK (октябрь 1999 г.). «Идентификация белков, взаимодействующих с NF-YA» . FEBS Lett . 460 (1): 41–5. DOI : 10.1016 / s0014-5793 (99) 01311-3 . PMID 10571058 . S2CID 28576187 .
Перейти ↑ Lee SK, Kim JH, Lee YC, Cheong J, Lee JW (апрель 2000 г.). «Медиатор подавления рецепторов ретиноевой кислоты и гормонов щитовидной железы, как новая транскрипционная молекула-корепрессор, активирующая белок-1, ядерный фактор-каппаВ и фактор ответа сыворотки» . J. Biol. Chem . 275 (17): 12470–4. DOI : 10.1074 / jbc.275.17.12470 . PMID 10777532 .
^ Ким HJ, Ким JH, Ли JW (октябрь 1998). «Коактиватор-1 стероидного рецептора взаимодействует с сывороточным фактором ответа и коактивирует трансактивацию, опосредованную сывороточным элементом ответа» . J. Biol. Chem . 273 (44): 28564–7. DOI : 10.1074 / jbc.273.44.28564 . PMID 9786846 .
^ Гупта М, Когут P, Davis FJ, Belaguli Н.С., Шварц RJ, Гупта MP (март 2001). «Физическое взаимодействие между MADS-боксом сывороточного фактора ответа и ДНК-связывающим доменом TEA / ATTS фактора-1 усилителя транскрипции» . J. Biol. Chem . 276 (13): 10413–22. DOI : 10.1074 / jbc.M008625200 . PMID 11136726 .
Внешние ссылки [ править ]
Сыворотка + реакция + фактор по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
FactorBook SRF
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США ( [1] ), который находится в общественном достоянии .
vтеPDB галерея
1hbx : ТРОЙНОЙ КОМПЛЕКС SAP-1 И SRF СО СПЕЦИАЛЬНОЙ ДНК SRE