S-фаза киназа-ассоциированный белок 1 представляет собой фермент , который у человека кодируется SKP1 геном . [5] [6] [7]
SKP1 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | SKP1 , EMC19, OCP-II, OCP2, SKP1A, TCEB1L, p19A, белок 1, связанный с киназой S-фазы, белок 1, связанный с киназой S-фазы | ||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | OMIM : 601434 MGI : 103575 HomoloGene : 38775 GeneCards : SKP1 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||||||||||
Разновидность | Человек | Мышь | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ансамбль |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (белок) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Расположение (UCSC) | Chr 5: 134,15 - 134,18 Мб | Chr 11: 52.23 - 52.25 Мб | |||||||||||||||||||||||
PubMed поиск | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||
|
Этот ген кодирует белок , входящий в состав белкового комплекса убиквитинлигазы SCF . Он связывается с белками F-бокса (белками, содержащими мотив F-бокса), такими как циклин F, белок 2 , связанный с киназой S-фазы , и другими регуляторными белками, участвующими в убиквитин- зависимом протеолизе. [8] Кодируемый белок также взаимодействует с сетью белков для контроля уровня бета-катенина и влияет на уровень активности зависимых от бета-катенина факторов транскрипции TCF. Исследования также охарактеризовали белок как фактор элонгации РНК-полимеразы II. Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к двум вариантам транскрипта. Родственный псевдоген был идентифицирован на хромосоме 7.
Взаимодействия
Было показано, что SKP1A взаимодействует с:
- BTRC , [9] [10] [11] [12] [13]
- CACYBP , [14]
- CDCA3 , [15]
- CDK9 , [16]
- CUL1 , [10] [17] [18] [19] [20]
- FBXL3 , [9]
- FBXO4 , [9] [21]
- FBXO5 , [9]
- FBXO7 , [9]
- FBXW2 , [9]
- FBXW7 , [17] [22] и
- SKP2 . [9] [10] [11] [23] [24] [25]
Рекомендации
- ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000113558 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036309 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Чжан Х., Кобаяши Р., Галактионов К., Пляж D (октябрь 1995 г.). «p19Skp1 и p45Skp2 являются важными элементами киназы S-фазы циклин A-CDK2». Cell . 82 (6): 915–25. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (95) 90271-6 . PMID 7553852 . S2CID 16325791 .
- ^ Деметрик ди-джей, Чжан Х., Beach DH (июль 1996 г.). «Хромосомное картирование генов человеческих CDK2 / cyclin A-ассоциированных белков p19 (SKP1A и SKP1B) и p45 (SKP2)». Cytogenet Cell Genet . 73 (1–2): 104–7. DOI : 10.1159 / 000134318 . PMID 8646875 .
- ^ «Ген Entrez: белок 1A, связанный с S-фазой киназы SKP1A (p19A)» .
- ^ Бай К., Сен П., Хофманн К., Ма Л., Гёбл М., Харпер Дж. У., Элледж С. Дж. (1996). «SKP1 соединяет регуляторы клеточного цикла с механизмом протеолиза убиквитина через новый мотив, F-бокс». Cell . 86 (2): 263–74. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80098-7 . PMID 8706131 . S2CID 18387009 .
- ^ Б с д е е г Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (октябрь 1999 г.). «Идентификация семейства белков человеческого F-бокса». Curr. Биол . 9 (20): 1177–9. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (00) 80020-2 . PMID 10531035 . S2CID 7467493 .
- ^ а б в Мин К.В., Хван Дж. У., Ли Дж. С., Пак Й., Тамура Т. А., Юн Дж. Б. (май 2003 г.). «TIP120A связывается с кулинами и модулирует активность убиквитинлигазы» . J. Biol. Chem . 278 (18): 15905–10. DOI : 10.1074 / jbc.M213070200 . PMID 12609982 .
- ^ а б Strack P, Caligiuri M, Pelletier M, Boisclair M, Theodoras A, Beer-Romero P, Glass S, Parsons T., Copeland RA, Auger KR, Benfield P, Brizuela L, Rolfe M (июль 2000 г.). «SCF (бета-TRCP) и зависимое от фосфорилирования убиквитинирование I каппа B альфа, катализируемое Ubc3 и Ubc4» . Онкоген . 19 (31): 3529–36. DOI : 10.1038 / sj.onc.1203647 . PMID 10918611 .
- ^ Suzuki H, Chiba T, Suzuki T, Fujita T, Ikenoue T, Omata M, Furuichi K, Shikama H, Tanaka K (январь 2000 г.). «Гомодимер двух белков F-бокса betaTrCP1 или betaTrCP2 связывается с IkappaBalpha для сигнально-зависимого убиквитинирования» . J. Biol. Chem . 275 (4): 2877–84. DOI : 10.1074 / jbc.275.4.2877 . PMID 10644755 .
- ^ Марготтин Ф., Бур С.П., Дюран Х., Селиг Л., Бенишоу С., Ричард В., Томас Д., Стребель К., Бенарус Р. (март 1998 г.). «Новый человеческий белок WD, h-beta TrCp, который взаимодействует с Vpu ВИЧ-1, соединяет CD4 с путем деградации ER через мотив F-бокса». Мол. Cell . 1 (4): 565–74. DOI : 10.1016 / s1097-2765 (00) 80056-8 . PMID 9660940 .
- ^ Мацузава С.И., Рид Дж.С. (май 2001 г.). «Siah-1, SIP и Ebi сотрудничают в новом пути деградации бета-катенина, связанного с ответами p53». Мол. Cell . 7 (5): 915–26. DOI : 10.1016 / s1097-2765 (01) 00242-8 . PMID 11389839 .
- ^ Аяд Н.Г., Ранкин С., Мураками М., Джебанатираджа Дж., Гайги С., Киршнер М.В. (апрель 2003 г.). «Tome-1, триггер митотического входа, разрушается во время G1 через APC». Cell . 113 (1): 101–13. DOI : 10.1016 / s0092-8674 (03) 00232-0 . PMID 12679038 . S2CID 14962502 .
- ^ Кирнан Р. Э., Эмилиани С., Накаяма К., Кастро А., Лаббе Дж. К., Лорка Т., Накаяма Ки К., Бенкиран М. (декабрь 2001 г.). «Взаимодействие между циклином T1 и SCF (SKP2) нацелено на CDK9 для убиквитинирования и деградации протеасомой» . Мол. Клетка. Биол . 21 (23): 7956–70. DOI : 10.1128 / MCB.21.23.7956-7970.2001 . PMC 99964 . PMID 11689688 .
- ^ а б Старополи Дж. Ф., Макдермотт С., Мартинат С., Шульман Б., Демирева Е., Абелиович А. (март 2003 г.). «Паркин является компонентом SCF-подобного комплекса убиквитинлигазы и защищает постмитотические нейроны от каинатной эксайтотоксичности». Нейрон . 37 (5): 735–49. DOI : 10.1016 / s0896-6273 (03) 00084-9 . PMID 12628165 . S2CID 17024826 .
- ^ Листван Дж., Марти А., Суттерлюти Х., Гштайгер М., Вирбелауэр С., Крек В. (январь 1998 г.). «Ассоциация человеческого CUL-1 и убиквитин-конъюгированного фермента CDC34 с F-бокс-белком p45 (SKP2): свидетельство эволюционной консервации в составе субъединиц пути CDC34-SCF» . EMBO J . 17 (2): 368–83. DOI : 10.1093 / emboj / 17.2.368 . PMC 1170388 . PMID 9430629 .
- ^ Чжэн Н., Шульман Б.А., Сонг Л., Миллер Дж. Дж., Джеффри П.Д., Ван П., Чу С., Кепп Д.М., Элледж С.Дж., Пагано М., Конавей Р.С., Конавей Дж. У., Харпер Дж. В., Павлетич Н. «Структура комплекса убиквитинлигазы Cul1-Rbx1-Skp1-F boxSkp2 SCF». Природа . 416 (6882): 703–9. DOI : 10.1038 / 416703a . PMID 11961546 . S2CID 4423882 .
- ^ Охта Т., Мишель Дж. Дж., Шоттелиус А. Дж., Сюн Ю. (апрель 1999 г.). «ROC1, гомолог APC11, представляет собой семейство партнеров кулина с ассоциированной активностью убиквитинлигазы». Мол. Cell . 3 (4): 535–41. DOI : 10.1016 / s1097-2765 (00) 80482-7 . PMID 10230407 .
- ^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., МакБрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнатский О., Бухман Ю. В., Этье М., Шенг Й., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж. П., Дьювель Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К, Колвилл К., Глэдвиш К., Маскат Б., Кинах Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии» . Мол. Syst. Биол . 3 : 89. DOI : 10.1038 / msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .
- ^ Ву Г., Ляпина С., Дас И., Ли Дж., Герни М., Поли А., Чуй И., Деше Р. Дж., Китаевски Дж. (Ноябрь 2001 г.). «SEL-10 является ингибитором передачи сигналов notch, который нацелен на notch для убиквитин-опосредованной деградации белка» . Мол. Клетка. Биол . 21 (21): 7403–15. DOI : 10.1128 / MCB.21.21.7403-7415.2001 . PMC 99913 . PMID 11585921 .
- ^ Ng RW, Arooz T, Yam CH, Chan IW, Lau AW, Poon RY (ноябрь 1998 г.). «Характеристика кулина и белка-партнера F-бокса Skp1» . FEBS Lett . 438 (3): 183–9. DOI : 10.1016 / s0014-5793 (98) 01299-X . PMID 9827542 . S2CID 40950881 .
- ^ Шульман Б.А., Каррано А.С., Джеффри П.Д., Боуэн З., Киннукан Э.Р., Финнин М.С., Элледж С.Дж., Харпер Дж.В., Пагано М., Павлетич Н.П. (ноябрь 2000 г.). «Понимание SCF ubiquitin ligases из структуры комплекса Skp1-Skp2». Природа . 408 (6810): 381–6. DOI : 10.1038 / 35042620 . PMID 11099048 . S2CID 4300503 .
- ^ Марти А., Вирбелауэр С., Шеффнер М., Крек В. (май 1999 г.). «Взаимодействие между убиквитин-протеинлигазой SCFSKP2 и E2F-1 лежит в основе регуляции деградации E2F-1». Nat. Cell Biol . 1 (1): 14–9. DOI : 10,1038 / 8984 . PMID 10559858 . S2CID 8884226 .
дальнейшее чтение
- Чен Х, Тальманн I, Адамс Дж. К., Авраам К.Б., Коупленд Н.Г., Дженкинс Н.А., Байер Д.Р., Кори Д.П., Тальманн Р., Дуйк Г.М. (1995). «Клонирование кДНК, распределение в тканях и хромосомная локализация Ocp2, гена, кодирующего предполагаемый фактор, связанный с транскрипцией, преимущественно экспрессируемый в органах слуха». Геномика . 27 (3): 389–98. DOI : 10.1006 / geno.1995.1068 . PMID 7558018 .
- Соуден Дж, Моррисон К., Скофилд Дж, Патт В., Эдвардс Y (1996). «Новая кДНК с гомологией фактора элонгации РНК-полимеразы II отображается на хромосоме 5q31 человека (TCEB1L) и хромосоме 11 мыши (Tceb1l)». Геномика . 29 (1): 145–51. DOI : 10.1006 / geno.1995.1225 . PMID 8530064 .
- Бай К., Сен П., Хофманн К., Ма Л., Гёбл М., Харпер Дж. У., Элледж С. Дж. (1996). «SKP1 соединяет регуляторы клеточного цикла с механизмом протеолиза убиквитина через новый мотив, F-бокс». Cell . 86 (2): 263–74. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80098-7 . PMID 8706131 . S2CID 18387009 .
- Браун К.А., Лик Дж.П., Ленч Нью-Джерси, Мойнихан Л.М., Маркхэм А.Ф., Мюллер Р.Ф. (1996). «Человеческие последовательности, гомологичные гену улиткового белка Ocp-II, не отображаются на известные в настоящее время несиндромальные локусы потери слуха». Аня. Гм. Genet . 60 (Pt 5): 385–9. DOI : 10.1111 / j.1469-1809.1996.tb00436.x . PMID 8912791 . S2CID 7687393 .
- Лян И., Чен Х, Ашер Дж. Х., Чанг СС, Фридман ТБ (1997). «КДНК OCP2 внутреннего уха человека отображается на 5q22-5q35.2 со связанными последовательностями на хромосомах 4p16.2-4p14, 5p13-5q22, 7pter-q22, 10 и 12p13-12qter». Джин . 184 (2): 163–7. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (96) 00590-2 . PMID 9031623 .
- Листван Дж, Марти А., Суттерлюти Х, Гштайгер М, Вирбелауэр С., Крек В. (1998). «Ассоциация человеческого CUL-1 и убиквитин-конъюгированного фермента CDC34 с F-бокс-белком p45 (SKP2): свидетельство эволюционной консервации в составе субъединиц пути CDC34-SCF» . EMBO J . 17 (2): 368–83. DOI : 10.1093 / emboj / 17.2.368 . PMC 1170388 . PMID 9430629 .
- Ng RW, Arooz T, Yam CH, Chan IW, Lau AW, Poon RY (1998). «Характеристика кулина и белка-партнера F-бокса Skp1» . FEBS Lett . 438 (3): 183–9. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (98) 01299-X . PMID 9827542 . S2CID 40950881 .
- Yam CH, Ng RW, Siu WY, Lau AW, Poon RY (1999). «Регулирование циклина A-Cdk2 с помощью компонента SCF Skp1 и белка F-бокса Skp2» . Мол. Клетка. Биол . 19 (1): 635–45. DOI : 10.1128 / mcb.19.1.635 . PMC 83921 . PMID 9858587 .
- Henzl MT, Thalmann I, Thalmann R (1999). «OCP2 существует в виде димера в кортиевом органе». Слышать. Res . 126 (1–2): 37–46. DOI : 10.1016 / S0378-5955 (98) 00148-8 . PMID 9872132 . S2CID 20953392 .
- Уинстон Дж. Т., Страк П., Бир-Ромеро П., Чу С. Ю., Элледж С. Дж., Харпер Дж. У. (1999). «Комплекс SCFbeta-TRCP-убиквитинлигаза специфически связывается с фосфорилированными мотивами деструкции в IkappaBalpha и бета-катенине и стимулирует убиквитинирование IkappaBalpha in vitro» . Genes Dev . 13 (3): 270–83. DOI : 10,1101 / gad.13.3.270 . PMC 316433 . PMID 9990852 .
- Ильин Г.П., Риалланд М., Глез Д., Гуген-Гийозо С. (1999). «Идентификация нового Skp2-подобного белка млекопитающего, содержащего F-бокс и богатые лейцином повторы». FEBS Lett . 459 (1): 75–9. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (99) 01211-9 . PMID 10508920 . S2CID 22945082 .
- Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (1999). «Идентификация семейства белков человеческого F-бокса». Curr. Биол . 9 (20): 1177–9. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (00) 80020-2 . PMID 10531035 . S2CID 7467493 .
- Уинстон Дж. Т., Кепп Д. М., Чжу С., Элледж С. Дж., Харпер Дж. В. (1999). «Семейство белков F-бокса млекопитающих». Curr. Биол . 9 (20): 1180–2. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (00) 80021-4 . PMID 10531037 . S2CID 14341845 .
- Сузуки Х, Тиба Т, Сузуки Т, Фудзита Т, Икеноуэ Т, Омата М, Фуруичи К., Шикама Х, Танака К. (2000). «Гомодимер двух белков F-бокса betaTrCP1 или betaTrCP2 связывается с IkappaBalpha для сигнально-зависимого убиквитинирования» . J. Biol. Chem . 275 (4): 2877–84. DOI : 10.1074 / jbc.275.4.2877 . PMID 10644755 .
- Рид М.А., Браунелл Дж. Э., Гладышева Т.Б., Хоттелет М., Родитель Л.А., Коггинс М.Б., Пирс Дж. В., Подуст В. Н., Луо Р. С., Чау В., Паломбелла В. Дж. (2000). «Nedd8-модификация cul-1 активирует SCF (бета (TrCP)) - зависимое убиквитинирование IkappaBalpha» . Мол. Клетка. Биол . 20 (7): 2326–33. DOI : 10.1128 / MCB.20.7.2326-2333.2000 . PMC 85397 . PMID 10713156 .
- Шульман Б.А., Каррано А.С., Джеффри П.Д., Боуэн З., Киннукан Э.Р., Финнин М.С., Элледж С.Дж., Харпер Дж.В., Пагано М., Павлетич Н.П. (2000). «Понимание SCF ubiquitin ligases из структуры комплекса Skp1-Skp2». Природа . 408 (6810): 381–6. DOI : 10.1038 / 35042620 . PMID 11099048 . S2CID 4300503 .
- Ляпина С., Коуп Г., Шевченко А., Серино Г., Цуге Т., Чжоу С., Вольф Д.А., Вей Н., Шевченко А., Дешайс Р.Дж. (2001). «Содействие расщеплению конъюгата NEDD-CUL1 сигнаносомой COP9». Наука . 292 (5520): 1382–5. DOI : 10.1126 / science.1059780 . PMID 11337588 . S2CID 14224920 .
- Фукути М., Имамура Т., Чиба Т., Эбисава Т., Кавабата М., Танака К., Миядзоно К. (2001). «Лиганд-зависимая деградация Smad3 убиквитинлигазным комплексом ROC1 и связанных белков» . Мол. Биол. Cell . 12 (5): 1431–43. DOI : 10.1091 / mbc.12.5.1431 . PMC 34595 . PMID 11359933 .
Внешние ссылки
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P63208 (белок 1, связанный с киназой S-фазы) в PDBe-KB .