SOX2

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
1O4X , 2LE4

Идентификаторы

Псевдонимы

SOX2 , ANOP3, MCOPS3, SRY-box 2, Sox2, фактор транскрипции SRY-box 2

Внешние идентификаторы

OMIM : 184429 MGI : 98364 HomoloGene : 68298 GeneCard : SOX2

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 3 (человек) ^[1]

Группа	3q26.33	Начинать	181 711 925 п.н. ^[1]
Группа	3q26.33	Конец	181 714 436 п.н. ^[1]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• связывания ДНК • последовательность ДНК-специфическое связывание • микроРНК связывания • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 ДНК-связывающий фактор активности транскрипции • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211 , GO: 0001205 ДНК-связывающая активность активатора транскрипции, РНК-полимераза II-специфическая • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области транскрипции • Связывание с белком GO: 0001948 • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ДНК-связывающий фактор транскрипции, активность, РНК-полимераза II-специфическая
Сотовый компонент	• цитоплазма • цитозоль • комплекс регуляторов транскрипции • нуклеоплазма • ядро клетки
Биологический процесс	• развитие глаз • Гипофиз развитие • регуляция транскрипции ДНК-шаблонных • отрицательное регулирование нейрон дифференциации • соматическая стволовых клеток обслуживания населения • спецификации эндодермы клетки судьба • положительное регуляции межклеточной адгезии • регенерации тканей • негативной регуляции транскрипции из РНК промотор полимеразы II • организация хроматина • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в процессе апоптоза • развитие аденогипофиза • транскрипция, ДНК-шаблон • поддержание популяции нейрональных стволовых клеток • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • развитие многоклеточного организма • обязательство судьбы глиальных клеток • ответ на ранение • остановка клеточного цикла • дифференцировка остеобластов • позитивная регуляция дифференцировки клеток • негативная регуляция пролиферации эпителиальных клеток • регуляция экспрессии генов • развитие внутреннего уха • развитие переднего мозга • ответ на фактор роста • отрицательное регулирование канонической Wnt - сигнального пути • положительное регулирование MAPK каскада • положительное регуляция транскрипции с РНК - полимеразы II промотора • цитокин-опосредованного сигнального пути • дифференцировки клеток • клеточная судьба приверженность • центральной нервной системы развития • нейронов дифференциации
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


6657


20674

Ансамбль


ENSG00000181449


ENSMUSG00000074637

UniProt


P48431


P48432

RefSeq (мРНК)


NM_003106


NM_011443

RefSeq (белок)


NP_003097


NP_035573

Расположение (UCSC)

Chr 3: 181.71 - 181.71 Мб

н / д

PubMed поиск

^[2]

^[3]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

SRY (область Y, определяющая пол) -box 2 , также известный как SOX2 , является фактором транскрипции, который необходим для поддержания самообновления или плюрипотентности недифференцированных эмбриональных стволовых клеток . Sox2 играет критическую роль в поддержании эмбриональных и нервных стволовых клеток. ^[4]

Sox2 является членом Сокс семьи из транскрипционных факторов , которые , как было показано , играют ключевую роль во многих этапах млекопитающих развития. Это семейство белков разделяет высококонсервативные ДНК- связывающие домены, известные как бокс-домены HMG (группа высокой мобильности ), содержащие примерно 80 аминокислот . ^[4]

Sox2 имеет большие перспективы в исследованиях, связанных с индуцированной плюрипотентностью, новой и очень многообещающей областью регенеративной медицины. ^[5]

Функция [ править ]

Плюрипотентность стволовых клеток [ править ]

Передача сигналов LIF ( фактора ингибирования лейкемии ), которая поддерживает плюрипотентность в эмбриональных стволовых клетках мыши, активирует Sox2 ниже сигнального пути JAK-STAT и последующую активацию Klf4 (члена семейства факторов, подобных Kruppel ). Oct-4 , Sox2 и Nanog положительно регулируют транскрипцию всех белков схемы плюрипотентности в пути LIF. ^[6]

NPM1 , регулятор транскрипции, участвующий в пролиферации клеток, индивидуально образует комплексы с Sox2, Oct4 и Nanog в эмбриональных стволовых клетках. ^[7] Эти три фактора плюрипотентности вносят вклад в сложную молекулярную сеть, которая регулирует ряд генов, контролирующих плюрипотентность. Sox2 связывается с ДНК совместно с Oct4 в непалиндромных последовательностях, чтобы активировать транскрипцию ключевых факторов плюрипотентности. ^[8]Неожиданно регуляция энхансеров Oct4-Sox2 может происходить без Sox2, вероятно, из-за экспрессии других белков Sox. Однако группа исследователей пришла к выводу, что основная роль Sox2 в эмбриональных стволовых клетках контролирует экспрессию Oct4, и они оба сохраняют свою собственную экспрессию при одновременной экспрессии. ^[9]

В эксперименте с участием эмбриональных стволовых клеток мыши было обнаружено, что Sox2 в сочетании с Oct4, c-Myc и Klf4 были достаточными для получения индуцированных плюрипотентных стволовых клеток . ^[10] Открытие того, что для индукции плюрипотентности необходима экспрессия только четырех факторов транскрипции, позволило провести в будущем исследования регенеративной медицины с учетом незначительных манипуляций.

Потеря плюрипотентности регулируется гиперметилированием некоторых сайтов связывания Sox2 и Oct4 в мужских половых клетках ^[11] и посттранскрипционной супрессией Sox2 с помощью miR134. ^[12]

Различные уровни Sox2 влияют на судьбу дифференцировки эмбриональных стволовых клеток. Sox2 ингибирует дифференцировку в зародышевый листок мезэндодермы и способствует дифференцировке в зародышевый лист нервной эктодермы . ^[13] Комплексы Npm1 / Sox2 поддерживаются, когда дифференцировка индуцируется вдоль эктодермального клона, подчеркивая важную функциональную роль Sox2 в эктодермальной дифференцировке. ^[7]

Исследование , проведенное в Милане, Италия показала, через развитие нокаута модели, что дефицит результатов Sox2 в нейронных malformities и в конечном итоге смерть плода, дополнительно подчеркивая важную роль Sox2 в в эмбриональном развитии. ^[14]

Нервные стволовые клетки [ править ]

В нейрогенезе Sox2 экспрессируется во всех развивающихся клетках нервной трубки, а также в пролиферирующих предшественниках центральной нервной системы . Однако Sox2 подавляется во время финального клеточного цикла предшественников во время дифференцировки, когда они становятся постмитотическими . ^[15] Клетки, экспрессирующие Sox2, способны продуцировать как клетки, идентичные им самим, так и дифференцированные типы нервных клеток, два необходимых признака стволовых клеток. Пролиферация нервных стволовых клеток Sox2 + может генерировать нервных предшественников, а также популяцию нервных стволовых клеток Sox2 +. ^[16]

Индуцированная плюрипотентность возможна с использованием взрослых нервных стволовых клеток, которые экспрессируют более высокие уровни Sox2 и c-Myc, чем эмбриональные стволовые клетки. Следовательно, только двух экзогенных факторов, одним из которых обязательно является Oct4, достаточно для индукции плюрипотентных клеток из нервных стволовых клеток, что снижает осложнения и риски, связанные с введением нескольких факторов для индукции плюрипотентности. ^[17]

Деформации глаз [ править ]

Мутации в этом гене связаны с двусторонней анофтальмией , серьезной структурной деформацией глаза. ^[18]

Рак [ править ]

В развитии легких Sox2 контролирует морфогенез ветвления бронхиального дерева и дифференцировку эпителия дыхательных путей. Сверхэкспрессия вызывает увеличение нейроэндокринных, желудочных / кишечных и базальных клеток. ^[19] В нормальных условиях Sox2 критически важен для поддержания самообновления и соответствующей пропорции базальных клеток в эпителии трахеи взрослых. Однако его сверхэкспрессия приводит к обширной эпителиальной гиперплазии и, в конечном итоге, к карциноме как в легких развивающихся, так и у взрослых мышей. ^[20]

При плоскоклеточной карциноме амплификации генов часто нацелены на область 3q26.3. Ген Sox2 находится в этой области, что эффективно характеризует Sox2 как онкоген . Sox2 является ключевым активным фактором плоскоклеточной карциномы легких, управляя многими генами, участвующими в прогрессировании опухоли. Сверхэкспрессия Sox2 взаимодействует с потерей экспрессии Lkb1, способствуя плоскоклеточному раку легких у мышей. ^[21] Его сверхэкспрессия также активирует клеточную миграцию и независимый от закрепления рост. ^[22]

Экспрессия Sox2 также обнаруживается при раке простаты высокой степени злокачественности и способствует росту устойчивого к кастрации рака простаты . ^[23]

Эктопическая экспрессия SOX2 может быть связана с аномальной дифференцировкой клеток колоректального рака . ^[24]

Было показано, что Sox2 играет важную роль в развитии устойчивости к тамоксифену при раке груди. ^[25]

В мультиформной глиобластоме Sox2 представляет собой хорошо зарекомендовавший себя фактор транскрипции стволовых клеток, необходимый для индукции и поддержания свойств стволовости раковых клеток глиобластомы. ^[26]^[27]

Регулирование гормоном щитовидной железы [ править ]

В области перед промотором Sox2 находятся три элемента ответа на гормоны щитовидной железы (TRE). Эта область известна как область энхансера. Исследования показали, что гормон щитовидной железы (Т3) контролирует экспрессию Sox2 через область энхансера. Экспрессия TRα1 (рецептора тироидного гормона) увеличивается в пролиферирующих и мигрирующих нервных стволовых клетках. Поэтому было высказано предположение, что репрессия транскрипции Sox2, опосредованная осью передачи сигналов тироидных гормонов, делает возможным фиксацию нервных стволовых клеток и миграцию из субвентрикулярной зоны. Дефицит гормона щитовидной железы, особенно в первом триместре, приведет к аномальному развитию центральной нервной системы. ^[28]Дополнительным подтверждением этого вывода является тот факт, что гипотиреоз во время внутриутробного развития плода может приводить к различным неврологическим нарушениям, включая кретинизм, характеризующийся задержкой физического развития и умственной отсталостью. ^[28]

Гипотиреоз может возникать по множеству причин и обычно лечится гормональными препаратами, такими как обычно применяемый левотироксин. ^[29]

Взаимодействия [ править ]

SOX2 взаимодействует с PAX6 , ^[30] NPM1, ^[6] и Oct4 . ^[8] SOX2, как было обнаружено, кооперативно регулирует Rex1 с Oct3 / 4 . ^[31]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000181449 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ а б "SOX2" . NCBI.
^ Rizzino A (2009). «Sox2 и Oct-3/4: универсальная пара главных регуляторов, которые управляют самообновлением и плюрипотентностью эмбриональных стволовых клеток» . Междисциплинарные обзоры Wiley: системная биология и медицина . 1 (2): 228–36. DOI : 10.1002 / wsbm.12 . PMC 2794141 . PMID 20016762 .
^ а б Нива Х, Огава К., Симосато Д., Адачи К. (июль 2009 г.). «Параллельная цепь сигнальных путей LIF поддерживает плюрипотентность ES-клеток мыши». Природа . 460 (7251): 118–22. Bibcode : 2009Natur.460..118N . DOI : 10,1038 / природа08113 . PMID 19571885 . S2CID 4382543 .
^ а б Йоханссон H, Симонссон S (ноябрь 2010 г.). «Основные факторы транскрипции Oct4, Sox2 и Nanog индивидуально образуют комплексы с нуклеофозмином (Npm1) для контроля определения судьбы эмбриональных стволовых (ES) клеток» . Старение . 2 (11): 815–22. DOI : 10.18632 / старение.100222 . PMC 3006024 . PMID 21076177 .
^ a b Chambers I, Tomlinson SR (июль 2009 г.). «Транскрипционная основа плюрипотентности» . Развитие . 136 (14): 2311–22. DOI : 10.1242 / dev.024398 . PMC 2729344 . PMID 19542351 .
^ Мазуи S, Nakatake Y, Toyooka Y, Shimosato D, R Яги, Такахаши К, Okochi Н, Окуда А, Матоба R, Шарова А.А., Ко М.С., Niwa Н (июнь 2007 г.). «Плюрипотентность, регулируемая Sox2 посредством регуляции экспрессии Oct3 / 4 в эмбриональных стволовых клетках мыши». Природа клеточной биологии . 9 (6): 625–35. DOI : 10.1038 / ncb1589 . PMID 17515932 . S2CID 24074525 .
Перейти ↑ Takahashi K, Yamanaka S (август 2006 г.). «Индукция плюрипотентных стволовых клеток из эмбриональных и взрослых культур фибробластов мыши с помощью определенных факторов». Cell . 126 (4): 663–76. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.07.024 . hdl : 2433/159777 . PMID 16904174 . S2CID 1565219 .
^ Имамура М, Миура К, Iwabuchi К, Ichisaka Т, М Накагава, Ли Дж, Kanatsu-Shinohara М, Т Shinohara, Яманака S (2006). «Репрессия транскрипции и гиперметилирование ДНК небольшого набора маркерных генов ES-клеток в стволовых клетках мужской зародышевой линии» . Биология развития BMC . 6 : 34. DOI : 10,1186 / 1471-213X-6-34 . PMC 1564388 . PMID 16859545 .
^ Tay Y, Zhang J, Thomson AM, Lim B, Rigoutsos I (октябрь 2008). «МикроРНК кодирующих областей Nanog, Oct4 и Sox2 модулируют дифференцировку эмбриональных стволовых клеток». Природа . 455 (7216): 1124–8. Bibcode : 2008Natur.455.1124T . DOI : 10,1038 / природа07299 . PMID 18806776 . S2CID 4330178 .
Перейти ↑ Thomson M, Liu SJ, Zou LN, Smith Z, Meissner A, Ramanathan S (июнь 2011 г.). «Факторы плюрипотентности в эмбриональных стволовых клетках регулируют дифференцировку в зародышевые листы» . Cell . 145 (6): 875–89. DOI : 10.1016 / j.cell.2011.05.017 . PMC 5603300 . PMID 21663792 .
^ Ферри А.Л., Кавалларо М., Брайда Д., Ди Кристофано А., Канта А., Веццани А., Оттоленги С., Пандольфи П. П., Сала М., ДеБиаси С., Николис СК (август 2004 г.). «Дефицит Sox2 вызывает нейродегенерацию и нарушение нейрогенеза в мозге взрослых мышей» . Развитие . 131 (15): 3805–19. DOI : 10.1242 / dev.01204 . PMID 15240551 .
^ Грэхэм В, Худяков Дж, Эллис Р, Pevny л (август 2003 г.). «SOX2 функционирует для поддержания идентичности нервных предшественников». Нейрон . 39 (5): 749–65. DOI : 10.1016 / S0896-6273 (03) 00497-5 . PMID 12948443 . S2CID 17162323 .
^ Suh Н, Консиглио А, Ray J, Савай Т, Д'Амур К.А., Гейдж ФХ (ноябрь 2007 г.). «Анализ судьбы in vivo выявляет мультипотентные и самообновляющиеся способности нейральных стволовых клеток Sox2 + в гиппокампе взрослых» . Стволовая клетка . 1 (5): 515–28. DOI : 10.1016 / j.stem.2007.09.002 . PMC 2185820 . PMID 18371391 .
^ Ким JB, Zaehres Н, У G, Джентиле л, Ко К, Себастиано В, Araúzo-Bravo МДж, Ruau D, Хан DW, Zenke М, Шёлер кадров (июль 2008 г.). «Плюрипотентные стволовые клетки, индуцированные из взрослых нервных стволовых клеток путем перепрограммирования двумя факторами». Природа . 454 (7204): 646–50. Bibcode : 2008Natur.454..646K . DOI : 10,1038 / природа07061 . PMID 18594515 . S2CID 4318637 .
^ "Entrez Gene: SOX2 SRY (пол, определяющий регион Y) -box 2" .
^ Gontan C, де Мунк A, Vermeij M, Grosveld F, Tibboel D, Ротье R (май 2008). «Sox2 важен для двух важных процессов в развитии легких: морфогенеза ветвления и дифференцировки эпителиальных клеток». Биология развития . 317 (1): 296–309. DOI : 10.1016 / j.ydbio.2008.02.035 . PMID 18374910 .
^ Lu Y, Futtner C, Рок JR, Сюй X, Витворт W, Hogan BL, Onaitis MW (2010). «Доказательства того, что сверхэкспрессия SOX2 является онкогенным в легких» . PLOS ONE . 5 (6): e11022. Bibcode : 2010PLoSO ... 511022L . DOI : 10.1371 / journal.pone.0011022 . PMC 2883553 . PMID 20548776 .
^ Mukhopadhyay A, Берретт KC, Кс U, Clair PM, Поп - SM, Карр SR, Witt BL, Оливер TG (июль 2014). «Sox2 взаимодействует с потерей Lkb1 в мышиной модели плоскоклеточного рака легкого» . Отчеты по ячейкам . 8 (1): 40–9. DOI : 10.1016 / j.celrep.2014.05.036 . PMC 4410849 . PMID 24953650 .
^ Hussenet T, Dali S, Exinger J, Monga B, Jost B, Dembelé D, Martinet N, Thibault C, Huelsken J, Brambilla E, du Manoir S (2010). «SOX2 - это онкоген, активируемый повторяющимися амплификациями 3q26.3 в плоскоклеточной карциноме легких человека» . PLOS ONE . 5 (1): e8960. Bibcode : 2010PLoSO ... 5.8960H . DOI : 10.1371 / journal.pone.0008960 . PMC 2813300 . PMID 20126410 .
^ Крегель S, Кирилюк KJ, Розен AM, Cai Y, Reyes EE, Отто KB, Том W, Paner GP, Szmulewitz RZ, Вандер Griend DJ (2013). «Sox2 - это ген, подавленный рецептором андрогенов, который способствует развитию устойчивого к кастрации рака простаты» . PLOS ONE . 8 (1): e53701. Bibcode : 2013PLoSO ... 853701K . DOI : 10.1371 / journal.pone.0053701 . PMC 3543364 . PMID 23326489 .
Перейти ↑ Tani Y, Akiyama Y, Fukamachi H, Yanagihara K, Yuasa Y (апрель 2007 г.). «Фактор транскрипции SOX2 активирует экспрессию специфичного для желудка пепсиногена А». Журнал исследований рака и клинической онкологии . 133 (4): 263–9. DOI : 10.1007 / s00432-006-0165-х . PMID 17136346 . S2CID 33410257 .
^ Пива М, G Доменики, Ириондо О, Rabano М, Симойнш БМ, Comaills В, Барредо я, Лопес-Руис JA, Zabalza I, Kypta R, Vivanco штат Мэриленд (январь 2014). «Sox2 способствует устойчивости к тамоксифену в клетках рака груди» . EMBO Молекулярная медицина . 6 (1): 66–79. DOI : 10.1002 / emmm.201303411 . PMC 3936493 . PMID 24178749 .
^ Миязоно, Кохей; Миядзава, Кейджи; Такахаши, Масамичи; Ино, Ясуши; Тодо, Томоки; Икусима, Хироаки (6 ноября 2009 г.). «Аутокринная передача сигналов TGF-β поддерживает онкогенность клеток, инициирующих глиому, посредством связанных с Sry факторов HMG-бокса» . Стволовая клетка . 5 (5): 504–514. DOI : 10.1016 / j.stem.2009.08.018 . ISSN 1934-5909 . PMID 19896441 .
^ Gangemi, Rosaria Мария Рита; Грифферо, Фабрицио; Марубби, Даниэла; Перера, Марция; Капра, Мария Кристина; Малатеста, Паоло; Раветти, Джан Луиджи; Зона, Джан Луиджи; Дага, Антонио (25 октября 2008 г.). «Подавление SOX2 в клетках, инициирующих опухоль глиобластомы, вызывает остановку пролиферации и потерю онкогенности» . Стволовые клетки . 27 (1): 40–48. DOI : 10.1634 / стволовые клетки.2008-0493 . ISSN 1549-4918 . PMID 18948646 . S2CID 19125999 .
^ a b Лопес-Хуарес А., Ремод С., Хассани З., Жоливет П., Пьер Симонс Дж., Зонтаг Т., Йошикава К., Прайс Дж., Морван-Дюбуа Г., Деменеикс Б.А. (май 2012 г.). «Передача сигналов гормона щитовидной железы действует как нейрогенный переключатель, подавляя Sox2 в нише взрослых нервных стволовых клеток» . Стволовая клетка . 10 (5): 531–43. DOI : 10.1016 / j.stem.2012.04.008 . PMID 22560077 .
^ Висс Б. Гипотиреоз: Медицинская энциклопедия MedlinePlus . Национальная медицинская библиотека США . Проверено 10 апреля 2014 года .
^ AOTA S, Nakajima N Сакамото R, Watanabe S, Ибараки N, Окадзаки K (май 2003). «Ауторегуляция Pax6, опосредованная прямым взаимодействием белка Pax6 с энхансером, специфичным для эктодермы поверхности головы, гена Pax6 мыши». Биология развития . 257 (1): 1–13. DOI : 10.1016 / S0012-1606 (03) 00058-7 . PMID 12710953 .
↑ Shi W, Wang H, Pan G, Geng Y, Guo Y, Pei D (август 2006 г.). «Регулирование маркера плюрипотентности Rex-1 с помощью Nanog и Sox2» . Журнал биологической химии . 281 (33): 23319–25. DOI : 10.1074 / jbc.M601811200 . PMID 16714766 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Камачи Ю., Утикава М., Кондо Х. (апрель 2000 г.). «Объединение SOX: с партнерами в регуляции эмбрионального развития». Тенденции в генетике . 16 (4): 182–7. DOI : 10.1016 / S0168-9525 (99) 01955-1 . PMID 10729834 .
Schepers GE, Teasdale RD, Koopman P (август 2002 г.). «Двадцать пар sox: степень, гомология и номенклатура семейств генов фактора транскрипции sox мыши и человека». Клетка развития . 3 (2): 167–70. DOI : 10.1016 / S1534-5807 (02) 00223-X . PMID 12194848 .
Хевер А.М., Уильямсон К.А., ван Хейнинген В. (июнь 2006 г.). «Пороки развития глаза: роль PAX6, SOX2 и OTX2». Клиническая генетика . 69 (6): 459–70. DOI : 10.1111 / j.1399-0004.2006.00619.x . PMID 16712695 . S2CID 5676139 .
Юань Х., Корби Н., Базилико С., Дейли Л. (ноябрь 1995 г.). «Специфическая для развития активность энхансера FGF-4 требует синергетического действия Sox2 и Oct-3» . Гены и развитие . 9 (21): 2635–45. DOI : 10,1101 / gad.9.21.2635 . PMID 7590241 .
Стеванович М., Зуффарди О., Коллиньон Дж., Ловелл-Бэдж Р., Гудфеллоу П. (октябрь 1994 г.). «Последовательность кДНК и расположение в хромосоме гена SOX2 человека». Геном млекопитающих . 5 (10): 640–2. DOI : 10.1007 / BF00411460 . PMID 7849401 . S2CID 10841620 .
Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. DOI : 10.1101 / gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
Хелланд Р., Берглунд Г. И., Отлевски Дж., Апостолук В., Андерсен О. А., Уиллассен Н. П., Смалас А. О. (январь 1999 г.). «Структуры высокого разрешения трех новых комплексов трипсин-сквош-ингибитор: подробное сравнение с другими трипсинами и их комплексами» . Acta Crystallographica Раздел D . 55 (Pt 1): 139–48. DOI : 10.1107 / S090744499801052X . PMID 10089404 .
Гюре А.О., Стокерт Э., Сканлан М.Дж., Керестес Р.С., Ягер Д., Алторки Н.К., Старый Ж.Ж., Чен Ю.Т. (апрель 2000 г.). «Серологическая идентификация эмбриональных нейральных белков как высокоиммуногенных опухолевых антигенов при мелкоклеточном раке легкого» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (8): 4198–203. Bibcode : 2000PNAS ... 97.4198G . DOI : 10.1073 / pnas.97.8.4198 . PMC 18195 . PMID 10760287 .
Амброзетти, округ Колумбия, Schöler HR, Dailey L, Basilico C (июль 2000 г.). «Модуляция активности множественных доменов активации транскрипции ДНК-связывающими доменами опосредует синергетическое действие Sox2 и Oct-3 на энхансер фактора роста фибробластов-4» . Журнал биологической химии . 275 (30): 23387–97. DOI : 10.1074 / jbc.M000932200 . PMID 10801796 .
Камачи Ю., Утикава М., Танучи А., Секидо Р., Кондо Х. (май 2001 г.). «Pax6 и SOX2 образуют комплекс партнера по связыванию совместной ДНК, который регулирует начало развития хрусталика» . Гены и развитие . 15 (10): 1272–86. DOI : 10,1101 / gad.887101 . PMC 313803 . PMID 11358870 .
Фантес Дж., Рагге Н.К., Линч С.А., Макгилл Н.И., Коллин Дж.Р., Ховард-Пиблз П.Н., Хейворд К., Вивиан А.Дж., Уильямсон К., ван Хейнинген В., ФитцПатрик Д.Р. (апрель 2003 г.). «Мутации в SOX2 вызывают анофтальмию» . Генетика природы . 33 (4): 461–3. DOI : 10.1038 / ng1120 . PMID 12612584 .
Wiebe MS, Nowling TK, Rizzino A (май 2003 г.). «Идентификация новых доменов в Sox-2 и Sox-11, участвующих в аутоингибировании связывания ДНК и специфичности партнерства» . Журнал биологической химии . 278 (20): 17901–11. DOI : 10.1074 / jbc.M212211200 . PMID 12637543 .
Аота С., Накадзима Н., Сакамото Р., Ватанабе С., Ибараки Н., Окадзаки К. (май 2003 г.). «Ауторегуляция Pax6, опосредованная прямым взаимодействием белка Pax6 с энхансером, специфичным для эктодермы поверхности головы, гена Pax6 мыши». Биология развития . 257 (1): 1–13. DOI : 10.1016 / S0012-1606 (03) 00058-7 . PMID 12710953 .
Schepers G, Wilson M, Wilhelm D, Koopman P (июль 2003 г.). «SOX8 экспрессируется во время дифференцировки семенников у мышей и действует синергетически с SF1 для активации промотора Amh in vitro» . Журнал биологической химии . 278 (30): 28101–8. DOI : 10.1074 / jbc.M304067200 . PMID 12732652 .
Ременьи А., Линс К., Ниссен Л.Дж., Рейнбольд Р., Шёлер Х.Р., Вильманнс М. (август 2003 г.). «Кристаллическая структура тройного комплекса POU / HMG / ДНК предполагает дифференциальную сборку Oct4 и Sox2 на двух энхансерах» . Гены и развитие . 17 (16): 2048–59. DOI : 10.1101 / gad.269303 . PMC 196258 . PMID 12923055 .
Уильямс, округ Колумбия, Цай М., Клор GM (январь 2004 г.). «Молекулярная основа синергетической транскрипционной активации Oct1 и Sox2, выявленная из структуры раствора 42-кДа Oct1.Sox2.Hoxb1-ДНК комплекса тройного фактора транскрипции» . Журнал биологической химии . 279 (2): 1449–57. DOI : 10.1074 / jbc.M309790200 . PMID 14559893 .
Цукамото Т., Инада К., Танака Х., Мидзошита Т., Михара М., Ушидзима Т., Ямамура Ю., Накамура С., Татэмацу М. (март 2004 г.). «Подавление фактора транскрипции желудка, Sox2, и эктопической экспрессии генов кишечного гомеобокса, Cdx1 и Cdx2: обратная корреляция во время прогрессирования от смешанной желудочно-кишечной до полной кишечной метаплазии». Журнал исследований рака и клинической онкологии . 130 (3): 135–45. DOI : 10.1007 / s00432-003-0519-6 . PMID 14655050 . S2CID 19831132 .

Внешние ссылки [ править ]

Схема регуляции транскрипции Young Lab- Core в эмбриональных стволовых клетках человека
GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о заболеваниях глаз, связанных с SOX2
Генерация iPS-клеток из MEFS посредством принудительной экспрессии Sox-2, Oct-4, c-Myc и Klf4 ( журнал визуализированных экспериментов )
GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись об анофтальмии / обзоре микрофтальмии
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P48431 (человеческий фактор транскрипции SOX-2) в PDBe-KB .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P48432 (фактор транскрипции мыши SOX-2) в PDBe-KB .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000181449 - Ensembl , май 2017 г.

[2] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[3] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[:0-4] а б "SOX2" . NCBI.

[pmid20016762-5] Rizzino A (2009). «Sox2 и Oct-3/4: универсальная пара главных регуляторов, которые управляют самообновлением и плюрипотентностью эмбриональных стволовых клеток» . Междисциплинарные обзоры Wiley: системная биология и медицина . 1 (2): 228–36. DOI : 10.1002 / wsbm.12 . PMC 2794141 . PMID 20016762 .

[pmid19571885-6] а б Нива Х, Огава К., Симосато Д., Адачи К. (июль 2009 г.). «Параллельная цепь сигнальных путей LIF поддерживает плюрипотентность ES-клеток мыши». Природа . 460 (7251): 118–22. Bibcode : 2009Natur.460..118N . DOI : 10,1038 / природа08113 . PMID 19571885 . S2CID 4382543 .

[pmid21076177-7] а б Йоханссон H, Симонссон S (ноябрь 2010 г.). «Основные факторы транскрипции Oct4, Sox2 и Nanog индивидуально образуют комплексы с нуклеофозмином (Npm1) для контроля определения судьбы эмбриональных стволовых (ES) клеток» . Старение . 2 (11): 815–22. DOI : 10.18632 / старение.100222 . PMC 3006024 . PMID 21076177 .

[Chambers_Tomlinson_2009-8] Chambers I, Tomlinson SR (июль 2009 г.). «Транскрипционная основа плюрипотентности» . Развитие . 136 (14): 2311–22. DOI : 10.1242 / dev.024398 . PMC 2729344 . PMID 19542351 .

[pmid17515932-9] Мазуи S, Nakatake Y, Toyooka Y, Shimosato D, R Яги, Такахаши К, Okochi Н, Окуда А, Матоба R, Шарова А.А., Ко М.С., Niwa Н (июнь 2007 г.). «Плюрипотентность, регулируемая Sox2 посредством регуляции экспрессии Oct3 / 4 в эмбриональных стволовых клетках мыши». Природа клеточной биологии . 9 (6): 625–35. DOI : 10.1038 / ncb1589 . PMID 17515932 . S2CID 24074525 .

[Takahashi_Yamanaka_2006-10] Перейти ↑ Takahashi K, Yamanaka S (август 2006 г.). «Индукция плюрипотентных стволовых клеток из эмбриональных и взрослых культур фибробластов мыши с помощью определенных факторов». Cell . 126 (4): 663–76. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.07.024 . hdl : 2433/159777 . PMID 16904174 . S2CID 1565219 .

[Imamura_2006-11] Имамура М, Миура К, Iwabuchi К, Ichisaka Т, М Накагава, Ли Дж, Kanatsu-Shinohara М, Т Shinohara, Яманака S (2006). «Репрессия транскрипции и гиперметилирование ДНК небольшого набора маркерных генов ES-клеток в стволовых клетках мужской зародышевой линии» . Биология развития BMC . 6 : 34. DOI : 10,1186 / 1471-213X-6-34 . PMC 1564388 . PMID 16859545 .

[Tay_2008-12] Tay Y, Zhang J, Thomson AM, Lim B, Rigoutsos I (октябрь 2008). «МикроРНК кодирующих областей Nanog, Oct4 и Sox2 модулируют дифференцировку эмбриональных стволовых клеток». Природа . 455 (7216): 1124–8. Bibcode : 2008Natur.455.1124T . DOI : 10,1038 / природа07299 . PMID 18806776 . S2CID 4330178 .

[Thomson_2011-13] Перейти ↑ Thomson M, Liu SJ, Zou LN, Smith Z, Meissner A, Ramanathan S (июнь 2011 г.). «Факторы плюрипотентности в эмбриональных стволовых клетках регулируют дифференцировку в зародышевые листы» . Cell . 145 (6): 875–89. DOI : 10.1016 / j.cell.2011.05.017 . PMC 5603300 . PMID 21663792 .

[Feri_et_al_2004-14] Ферри А.Л., Кавалларо М., Брайда Д., Ди Кристофано А., Канта А., Веццани А., Оттоленги С., Пандольфи П. П., Сала М., ДеБиаси С., Николис СК (август 2004 г.). «Дефицит Sox2 вызывает нейродегенерацию и нарушение нейрогенеза в мозге взрослых мышей» . Развитие . 131 (15): 3805–19. DOI : 10.1242 / dev.01204 . PMID 15240551 .

[Graham-15] Грэхэм В, Худяков Дж, Эллис Р, Pevny л (август 2003 г.). «SOX2 функционирует для поддержания идентичности нервных предшественников». Нейрон . 39 (5): 749–65. DOI : 10.1016 / S0896-6273 (03) 00497-5 . PMID 12948443 . S2CID 17162323 .

[Suh_2007-16] Suh Н, Консиглио А, Ray J, Савай Т, Д'Амур К.А., Гейдж ФХ (ноябрь 2007 г.). «Анализ судьбы in vivo выявляет мультипотентные и самообновляющиеся способности нейральных стволовых клеток Sox2 + в гиппокампе взрослых» . Стволовая клетка . 1 (5): 515–28. DOI : 10.1016 / j.stem.2007.09.002 . PMC 2185820 . PMID 18371391 .

[pmid18594515-17] Ким JB, Zaehres Н, У G, Джентиле л, Ко К, Себастиано В, Araúzo-Bravo МДж, Ruau D, Хан DW, Zenke М, Шёлер кадров (июль 2008 г.). «Плюрипотентные стволовые клетки, индуцированные из взрослых нервных стволовых клеток путем перепрограммирования двумя факторами». Природа . 454 (7204): 646–50. Bibcode : 2008Natur.454..646K . DOI : 10,1038 / природа07061 . PMID 18594515 . S2CID 4318637 .

[entrez-18] "Entrez Gene: SOX2 SRY (пол, определяющий регион Y) -box 2" .

[Gontan_2008-19] Gontan C, де Мунк A, Vermeij M, Grosveld F, Tibboel D, Ротье R (май 2008). «Sox2 важен для двух важных процессов в развитии легких: морфогенеза ветвления и дифференцировки эпителиальных клеток». Биология развития . 317 (1): 296–309. DOI : 10.1016 / j.ydbio.2008.02.035 . PMID 18374910 .

[Lu_2010-20] Lu Y, Futtner C, Рок JR, Сюй X, Витворт W, Hogan BL, Onaitis MW (2010). «Доказательства того, что сверхэкспрессия SOX2 является онкогенным в легких» . PLOS ONE . 5 (6): e11022. Bibcode : 2010PLoSO ... 511022L . DOI : 10.1371 / journal.pone.0011022 . PMC 2883553 . PMID 20548776 .

[21] Mukhopadhyay A, Берретт KC, Кс U, Clair PM, Поп - SM, Карр SR, Witt BL, Оливер TG (июль 2014). «Sox2 взаимодействует с потерей Lkb1 в мышиной модели плоскоклеточного рака легкого» . Отчеты по ячейкам . 8 (1): 40–9. DOI : 10.1016 / j.celrep.2014.05.036 . PMC 4410849 . PMID 24953650 .

[Hussenet_2010-22] Hussenet T, Dali S, Exinger J, Monga B, Jost B, Dembelé D, Martinet N, Thibault C, Huelsken J, Brambilla E, du Manoir S (2010). «SOX2 - это онкоген, активируемый повторяющимися амплификациями 3q26.3 в плоскоклеточной карциноме легких человека» . PLOS ONE . 5 (1): e8960. Bibcode : 2010PLoSO ... 5.8960H . DOI : 10.1371 / journal.pone.0008960 . PMC 2813300 . PMID 20126410 .

[Kregel_2013-23] Крегель S, Кирилюк KJ, Розен AM, Cai Y, Reyes EE, Отто KB, Том W, Paner GP, Szmulewitz RZ, Вандер Griend DJ (2013). «Sox2 - это ген, подавленный рецептором андрогенов, который способствует развитию устойчивого к кастрации рака простаты» . PLOS ONE . 8 (1): e53701. Bibcode : 2013PLoSO ... 853701K . DOI : 10.1371 / journal.pone.0053701 . PMC 3543364 . PMID 23326489 .

[pmid17136346-24] Перейти ↑ Tani Y, Akiyama Y, Fukamachi H, Yanagihara K, Yuasa Y (апрель 2007 г.). «Фактор транскрипции SOX2 активирует экспрессию специфичного для желудка пепсиногена А». Журнал исследований рака и клинической онкологии . 133 (4): 263–9. DOI : 10.1007 / s00432-006-0165-х . PMID 17136346 . S2CID 33410257 .

[25] Пива М, G Доменики, Ириондо О, Rabano М, Симойнш БМ, Comaills В, Барредо я, Лопес-Руис JA, Zabalza I, Kypta R, Vivanco штат Мэриленд (январь 2014). «Sox2 способствует устойчивости к тамоксифену в клетках рака груди» . EMBO Молекулярная медицина . 6 (1): 66–79. DOI : 10.1002 / emmm.201303411 . PMC 3936493 . PMID 24178749 .

[26] Миязоно, Кохей; Миядзава, Кейджи; Такахаши, Масамичи; Ино, Ясуши; Тодо, Томоки; Икусима, Хироаки (6 ноября 2009 г.). «Аутокринная передача сигналов TGF-β поддерживает онкогенность клеток, инициирующих глиому, посредством связанных с Sry факторов HMG-бокса» . Стволовая клетка . 5 (5): 504–514. DOI : 10.1016 / j.stem.2009.08.018 . ISSN 1934-5909 . PMID 19896441 .

[27] Gangemi, Rosaria Мария Рита; Грифферо, Фабрицио; Марубби, Даниэла; Перера, Марция; Капра, Мария Кристина; Малатеста, Паоло; Раветти, Джан Луиджи; Зона, Джан Луиджи; Дага, Антонио (25 октября 2008 г.). «Подавление SOX2 в клетках, инициирующих опухоль глиобластомы, вызывает остановку пролиферации и потерю онкогенности» . Стволовые клетки . 27 (1): 40–48. DOI : 10.1634 / стволовые клетки.2008-0493 . ISSN 1549-4918 . PMID 18948646 . S2CID 19125999 .

[pmid22560077-28] Лопес-Хуарес А., Ремод С., Хассани З., Жоливет П., Пьер Симонс Дж., Зонтаг Т., Йошикава К., Прайс Дж., Морван-Дюбуа Г., Деменеикс Б.А. (май 2012 г.). «Передача сигналов гормона щитовидной железы действует как нейрогенный переключатель, подавляя Sox2 в нише взрослых нервных стволовых клеток» . Стволовая клетка . 10 (5): 531–43. DOI : 10.1016 / j.stem.2012.04.008 . PMID 22560077 .

[Wisse_2013-29] Висс Б. Гипотиреоз: Медицинская энциклопедия MedlinePlus . Национальная медицинская библиотека США . Проверено 10 апреля 2014 года .

[pmid12710953-30] AOTA S, Nakajima N Сакамото R, Watanabe S, Ибараки N, Окадзаки K (май 2003). «Ауторегуляция Pax6, опосредованная прямым взаимодействием белка Pax6 с энхансером, специфичным для эктодермы поверхности головы, гена Pax6 мыши». Биология развития . 257 (1): 1–13. DOI : 10.1016 / S0012-1606 (03) 00058-7 . PMID 12710953 .

[pmid16714766-31] Shi W, Wang H, Pan G, Geng Y, Guo Y, Pei D (август 2006 г.). «Регулирование маркера плюрипотентности Rex-1 с помощью Nanog и Sox2» . Журнал биологической химии . 281 (33): 23319–25. DOI : 10.1074 / jbc.M601811200 . PMID 16714766 .

[1]