Фактор транскрипции Sp2

SP2

Идентификаторы

SP2 , Sp2, 4930480I16Rik, mKIAA0048, фактор транскрипции Sp2

Внешние идентификаторы

OMIM : 601801 MGI : 1926162 HomoloGene : 2340 GeneCards : SP2

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 17 (человека) ^[1]

Группа	17q21.32	Начинать	47 896 150 п.н. ^[1]
Группа	17q21.32	Конец	47 928 957 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 11 (мышь) ^[2]

Группа	11 \| 11 Д	Начинать	96 953 341 п.н. ^[2]
Группа	11 \| 11 Д	Конец	96 982 959 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• ДНК - связывающий • гистондеацетилазу связывания • GO: связывание 0001948 белок • связывание иона металла • нуклеиновой кислоты связывания • GO: 0000980 РНК - полимеразы II цис-регуляторной области ДНК последовательность-специфическое связывание • GO: 0001078, ГО: 0001214, ГО: 0001206 ДНК -связывающая активность репрессора транскрипции, специфическая к РНК-полимеразе II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфическая к РНК-полимеразе II
Сотовый компонент	• ядро
Биологический процесс	• регуляция транскрипции с помощью РНК-полимеразы II • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • иммунный ответ • транскрипция, ДНК-шаблон • рост многоклеточного организма • негативная регуляция транскрипции с помощью РНК-полимеразы II
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


6668


78912

Ансамбль


ENSG00000167182


ENSMUSG00000018678

UniProt


Q02086 Q9BRW5


Q9D2H6

RefSeq (мРНК)


NM_003110


NM_001080964 NM_030220 NM_001363225 NM_001363226

RefSeq (белок)


NP_003101


NP_001074433 NP_084496 NP_001350154 NP_001350155

Расположение (UCSC)

Chr 17: 47.9 - 47.93 Мб

Chr 11: 96.95 - 96.98 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции Sp2 является белком , который в организме человека кодируется SP2 геном . ^[5]^[6]^[7]

Функция [ править ]

Этот ген кодирует члена подсемейства Sp / XKLF факторов транскрипции. Белки семейства Sp представляют собой специфичные для последовательности ДНК-связывающие белки, характеризующиеся аминоконцевым доменом трансактивации и тремя карбоксиконцевыми мотивами цинковых пальцев. Этот белок содержит наименее консервативный ДНК-связывающий домен в подсемействе белков Sp, и его специфичность последовательности ДНК отличается от других белков Sp. Он локализуется в основном в субядерных фокусах, связанных с ядерным матриксом, и может активировать или в некоторых случаях репрессировать экспрессию с разных промоторов. ^[7]

Взаимодействия [ править ]

Фактор транскрипции Sp2 взаимодействует с E2F1 . ^[8]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000167182 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018678 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Кингсли C, Winoto A (октябрь 1992). «Клонирование GT-бокс-связывающих белков: новое мультигенное семейство Sp1, регулирующее экспрессию гена рецептора Т-клеток» . Mol Cell Biol . 12 (10): 4251–61. DOI : 10.1128 / mcb.12.10.4251 . PMC 360348 . PMID 1341900 .
^ Scohy S, Ван Vooren P, Szpirer C, Szpirer J (октябрь 1998). "Присвоение 1 генов Sp полосам хромосомы крысы 7q36 (Sp1), 10q31 → q32.1 (Sp2), 3q24 → q31 (Sp3) и 6q33 (Sp4) и гена SP2 полосам хромосомы человека 17q21.3 → q22 по in гибридизация на месте ". Cytogenet Cell Genet . 81 (3–4): 273–4. DOI : 10.1159 / 000015044 . PMID 9730617 . S2CID 46786094 .
^ a b «Ген Entrez: фактор транскрипции SP2 Sp2» .
^ Rotheneder Н, Geymayer S, Haidweger Е (ноябрь 1999 года). «Факторы транскрипции семейства Sp1: взаимодействие с E2F и регуляция промотора мышиной тимидинкиназы». J. Mol. Биол . 293 (5): 1005–15. DOI : 10.1006 / jmbi.1999.3213 . PMID 10547281 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Филипсен S, Suske G (1999). «История трех пальцев: семейство факторов транскрипции Sp / XKLF млекопитающих» . Nucleic Acids Res . 27 (15): 2991–3000. DOI : 10.1093 / NAR / 27.15.2991 . PMC 148522 . PMID 10454592 .
Номура Н., Нагасе Т., Миядзима Н., Сазука Т., Танака А., Сато С., Секи Н., Каварабаяси И., Исикава К., Табата С. (1995). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. II. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0041-KIAA0080), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1» . ДНК Res . 1 (5): 223–9. DOI : 10.1093 / dnares / 1.5.223 . PMID 7584044 .
Ротенедер Х, Геймайер С, Хайдвегер Э (2000). «Факторы транскрипции семейства Sp1: взаимодействие с E2F и регуляция промотора мышиной тимидинкиназы». J. Mol. Биол . 293 (5): 1005–15. DOI : 10.1006 / jmbi.1999.3213 . PMID 10547281 .
Мурфилд К.С., Фрай С.Дж., Горовиц Дж.М. (2004). «Активность связывания ДНК Sp2 и трансактивация негативно регулируются в клетках млекопитающих» . J. Biol. Chem . 279 (14): 13911–24. DOI : 10.1074 / jbc.M313589200 . PMID 14726517 .
Phan D, Cheng CJ, Galfione M, Vakar-Lopez F, Tunstead J, Thompson NE, Burgess RR, Najjar SM, Yu-Lee LY, Lin SH (2004). «Идентификация Sp2 как репрессора транскрипции карциноэмбриональной антиген-связанной клеточной адгезии молекулы 1 в онкогенезе» . Cancer Res . 64 (9): 3072–8. DOI : 10.1158 / 0008-5472.CAN-03-3730 . PMID 15126343 .
Филлипс Р.Дж., Тайсон-Кэппер Ни Поллард А.Дж., Бейли Дж., Робсон С.К., Европа-Финнер Дж. Н. (2005). «Регулирование экспрессии гена рецептора хорионического гонадотропина / лютеинизирующего гормона в миометрии человека: участие белка специфичности-1 (Sp1), Sp3, Sp4, Sp-подобных белков и гистоновых деацетилаз» . J. Clin. Эндокринол. Метаб . 90 (6): 3479–90. DOI : 10.1210 / jc.2004-1962 . PMID 15788387 .
Ли YC, Хигаши Y, Луу C, Симидзу C, Strott CA (2005). «Элементы Sp1 в промоторе SULT2B1b и 5'-нетранслируемой области мРНК: индукция и увеличение Sp1 / Sp2 путем ингибирования гистондеацетилазы». FEBS Lett . 579 (17): 3639–45. DOI : 10.1016 / j.febslet.2005.05.041 . PMID 15953604 . S2CID 22203267 .
Симмонс С.О., Горовиц Дж.М. (2006). «Nkx3.1 связывает и отрицательно регулирует транскрипционную активность членов семейства Sp в клетках, производных от простаты» . Биохим. Дж . 393 (Pt 1): 397–409. DOI : 10.1042 / BJ20051030 . PMC 1383699 . PMID 16201967 .
Мурфилд К.С., Инь Х., Николс Т.Д., Кэткарт К., Симмонс С.О., Горовиц Дж.М. (2006). «Sp2 локализуется в субядерных фокусах, связанных с ядерным матриксом» . Мол. Биол. Cell . 17 (4): 1711–22. DOI : 10,1091 / mbc.E05-11-1063 . PMC 1415311 . PMID 16467376 .
Дас А., Фернандес-Запико М.Э., Цао С., Яо Дж., Фиоруччи С., Хеббель Р.П., Уррутия Р., Шах В.Х. (2007). «Нарушение репрессивного комплекса SP2 / KLF6 с помощью SHP необходимо для миграции эндотелиальных клеток, индуцированной рецептором фарнезоида X» . J. Biol. Chem . 281 (51): 39105–13. DOI : 10.1074 / jbc.M607720200 . PMID 17071613 .

Внешние ссылки [ править ]

Sp2 + Transcription + Factor в медицинских предметных рубриках Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
FactorBook SP2

Эта статья о гене в 17-й хромосоме человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000167182 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018678 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1341900-5] Кингсли C, Winoto A (октябрь 1992). «Клонирование GT-бокс-связывающих белков: новое мультигенное семейство Sp1, регулирующее экспрессию гена рецептора Т-клеток» . Mol Cell Biol . 12 (10): 4251–61. DOI : 10.1128 / mcb.12.10.4251 . PMC 360348 . PMID 1341900 .

[pmid9730617-6] Scohy S, Ван Vooren P, Szpirer C, Szpirer J (октябрь 1998). "Присвоение 1 генов Sp полосам хромосомы крысы 7q36 (Sp1), 10q31 → q32.1 (Sp2), 3q24 → q31 (Sp3) и 6q33 (Sp4) и гена SP2 полосам хромосомы человека 17q21.3 → q22 по in гибридизация на месте ". Cytogenet Cell Genet . 81 (3–4): 273–4. DOI : 10.1159 / 000015044 . PMID 9730617 . S2CID 46786094 .

[entrez-7] «Ген Entrez: фактор транскрипции SP2 Sp2» .

[pmid10547281-8] Rotheneder Н, Geymayer S, Haidweger Е (ноябрь 1999 года). «Факторы транскрипции семейства Sp1: взаимодействие с E2F и регуляция промотора мышиной тимидинкиназы». J. Mol. Биол . 293 (5): 1005–15. DOI : 10.1006 / jmbi.1999.3213 . PMID 10547281 .

[1]