Фактор транскрипции Sp3

SP3

Идентификаторы

Фактор транскрипции SP3 , SPR2, Sp3

Внешние идентификаторы

OMIM : 601804 MGI : 1277166 HomoloGene : 7952 GeneCard : SP3

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 2 (человека) ^[1]

Группа	2q31.1	Начинать	173 880 850 п.н. ^[1]
Группа	2q31.1	Конец	173 965 702 б.п. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 2 (мышь) ^[2]

Группа	2 \| 2 C3	Начинать	72 936 427 п.н. ^[2]
Группа	2 \| 2 C3	Конец	72 980 446 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание ДНК • хроматин связывания • GO: связывание 0001158 ядра промотора проксимальной области последовательности специфических ДНК • иона металл связывание • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающий репрессор активность транскрипции, РНК - полимераза II-специфический • GO: 0001948 связывание с белками • связывание с нуклеиновой кислотой • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ДНК-связывающий фактор транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II • связывание двухцепочечной ДНК • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание ДНК с последовательностью регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II
Сотовый компонент	• Тело ПМЛ • комплекс репрессора транскрипции • ядро клетки • нуклеоплазма • комплекс белок-ДНК
Биологический процесс	• дифференцировка мегакариоцитов • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • оссификация • развитие легких • эмбриональное развитие плаценты • внутриутробное эмбриональное развитие • негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • дифференцировка моноцитов • сумоилирование белка • транскрипция, ДНК-шаблон • эмбриональный скелет развитие системы • положительная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • эмбриональный процесс, участвующий в беременности женщины • дифференцировка Т-клеток • дифференцировка гранулоцитов • эмбриональный глазной морфогенез камерного типа • дифференцировка трофэктодермальных клеток • дифференцировка энуклеатных эритроцитов • дифференцировка эритроцитов • дефинитивный гемопоэз • развитие печени • дифференцировка В-клеток • негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • естественная дифференцировка клеток-киллеров • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


6670


20687

Ансамбль


ENSG00000172845


ENSMUSG00000027109

UniProt


Q02447 Q86TP0


O70494

RefSeq (мРНК)


NM_003111 NM_001017371 NM_001172712


NM_001018042 NM_001098425 NM_011450

RefSeq (белок)


NP_001017371 NP_001166183 NP_003102 NP_003102.1


NP_001018052 NP_001091895

Расположение (UCSC)

Chr 2: 173,88 - 173,97 Мб

Chr 2: 72.94 - 72.98 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции Sp3 , также известный как SP3 , относится как к белку, так и к гену, которым он кодируется.

Этот ген принадлежит к семейству генов, родственных Sp1, которые кодируют факторы транскрипции, которые регулируют транскрипцию путем связывания с консенсусными регуляторными элементами GC- и GT-box в генах-мишенях. Этот белок содержит ДНК- связывающий домен цинкового пальца и несколько доменов трансактивации и, как сообщается, действует как бифункциональный фактор транскрипции, который либо стимулирует, либо репрессирует транскрипцию множества генов. Для этого гена были описаны варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы , и сообщалось, что один из них инициирует трансляцию со стартового кодона, отличного от AUG (AUA) . Также были отмечены дополнительные изоформы, возникающие в результате использования альтернативных сайтов инициации трансляции. ^[5]

Взаимодействия [ править ]

Фактор транскрипции Sp3 взаимодействует с гистондеацетилазой 2 , ^[6]^[7] PIAS1 , ^[8] E2F1 ^[9] и GABPA . ^[10]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000172845 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027109 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Энтрез Ген: фактор транскрипции SP3 Sp3» .
^ Вон, Jaejoon; Им Чжонбин; Ким Тэ Кук (октябрь 2002 г.). «Sp1 и Sp3 рекрутируют гистон-деацетилазу для подавления транскрипции промотора обратной транскриптазы теломеразы человека (hTERT) в нормальных соматических клетках человека» . J. Biol. Chem . 277 (41): 38230–8. DOI : 10.1074 / jbc.M206064200 . ISSN 0021-9258 . PMID 12151407 .
↑ Сун, Цзянь-Минь; Чен Хоу Ю; Монива Марико; Литчфилд Дэвид В; Сето Эдвард; Дэви Джеймс Р. (сентябрь 2002 г.). «Репрессор транскрипции Sp3 связан с CK2-фосфорилированной гистондеацетилазой 2» . J. Biol. Chem . 277 (39): 35783–6. DOI : 10.1074 / jbc.C200378200 . ISSN 0021-9258 . PMID 12176973 .
^ Сапечниг, Александра; Ришитор Григоре; Браун Харальд; Кукла Андреас; Шергаут Марион; Мельхиор Фрауке; Суске Гунтрам (октябрь 2002 г.). «Фактор транскрипции Sp3 подавляется посредством модификации SUMO с помощью PIAS1» . EMBO J . 21 (19): 5206–15. DOI : 10,1093 / emboj / cdf510 . ISSN 0261-4189 . PMC 129032 . PMID 12356736 .
^ Rotheneder, H; Геймайер С; Haidweger E (ноябрь 1999 г.). «Факторы транскрипции семейства Sp1: взаимодействие с E2F и регуляция промотора мышиной тимидинкиназы». J. Mol. Биол . 293 (5): 1005–15. DOI : 10.1006 / jmbi.1999.3213 . ISSN 0022-2836 . PMID 10547281 .
^ Galvagni, F; Capo S; Oliviero S (март 2001 г.). «Sp1 и Sp3 физически взаимодействуют и взаимодействуют с GABP для активации промотора утрофина» (PDF) . J. Mol. Биол . 306 (5): 985–96. DOI : 10.1006 / jmbi.2000.4335 . hdl : 2318/141203 . ISSN 0022-2836 . PMID 11237613 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Ценг Л., Гао Дж, Мазелла Дж и др. (1997). «Дифференцировочно-зависимая и клеточно-специфическая регуляция гена hIGFBP-1 в эндометрии человека». Аня. NY Acad. Sci . 828 (1): 27–37. Bibcode : 1997NYASA.828 ... 27T . DOI : 10.1111 / j.1749-6632.1997.tb48521.x . PMID 9329821 . S2CID 1601677 .
Чжан Ю., Дюфау М.Л. (2003). «Двойные механизмы регуляции транскрипции гена рецептора лютеинизирующего гормона ядерными орфанными рецепторами и комплексами гистондеацетилазы» . J. Steroid Biochem. Мол. Биол . 85 (2–5): 401–14. DOI : 10.1016 / S0960-0760 (03) 00230-9 . PMID 12943729 . S2CID 28512341 .

Эта статья о гене на хромосоме 2 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000172845 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027109 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[5] «Энтрез Ген: фактор транскрипции SP3 Sp3» .

[pmid12151407-6] Вон, Jaejoon; Им Чжонбин; Ким Тэ Кук (октябрь 2002 г.). «Sp1 и Sp3 рекрутируют гистон-деацетилазу для подавления транскрипции промотора обратной транскриптазы теломеразы человека (hTERT) в нормальных соматических клетках человека» . J. Biol. Chem . 277 (41): 38230–8. DOI : 10.1074 / jbc.M206064200 . ISSN 0021-9258 . PMID 12151407 .

[pmid12176973-7] Сун, Цзянь-Минь; Чен Хоу Ю; Монива Марико; Литчфилд Дэвид В; Сето Эдвард; Дэви Джеймс Р. (сентябрь 2002 г.). «Репрессор транскрипции Sp3 связан с CK2-фосфорилированной гистондеацетилазой 2» . J. Biol. Chem . 277 (39): 35783–6. DOI : 10.1074 / jbc.C200378200 . ISSN 0021-9258 . PMID 12176973 .

[pmid12356736-8] Сапечниг, Александра; Ришитор Григоре; Браун Харальд; Кукла Андреас; Шергаут Марион; Мельхиор Фрауке; Суске Гунтрам (октябрь 2002 г.). «Фактор транскрипции Sp3 подавляется посредством модификации SUMO с помощью PIAS1» . EMBO J . 21 (19): 5206–15. DOI : 10,1093 / emboj / cdf510 . ISSN 0261-4189 . PMC 129032 . PMID 12356736 .

[pmid10547281-9] Rotheneder, H; Геймайер С; Haidweger E (ноябрь 1999 г.). «Факторы транскрипции семейства Sp1: взаимодействие с E2F и регуляция промотора мышиной тимидинкиназы». J. Mol. Биол . 293 (5): 1005–15. DOI : 10.1006 / jmbi.1999.3213 . ISSN 0022-2836 . PMID 10547281 .

[pmid11237613-10] Galvagni, F; Capo S; Oliviero S (март 2001 г.). «Sp1 и Sp3 физически взаимодействуют и взаимодействуют с GABP для активации промотора утрофина» (PDF) . J. Mol. Биол . 306 (5): 985–96. DOI : 10.1006 / jmbi.2000.4335 . hdl : 2318/141203 . ISSN 0022-2836 . PMID 11237613 .

[1]