Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Белок выживания мотонейрона
Белок SMN1 PDB 1g5v.png
Домен Tudor из человеческого SMN. PDB 1g5v [1]
Идентификаторы
СимволSMN
PfamPF06003
Клан пфамCL0049
ИнтерПроIPR010304
SCOP21мн / СФЕРА / СУПФАМ
Доступные белковые структуры:
Pfam  структуры / ECOD  
PDBRCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumрезюме структуры

Выживающий мотонейрон или моторный нейрон выживания ( SMN ) - это белок, который у человека кодируется генами SMN1 и SMN2 .

SMN находится в цитоплазме всех клеток животных, а также в ядерных камнях . Он участвует в регуляции транскрипции , регенерации теломеразы и перемещении клеток . [2] Дефицит SMN, в первую очередь из-за мутаций в SMN1 , приводит к широко распространенным дефектам сплайсинга , особенно в моторных нейронах спинного мозга , и является одной из причин спинальной мышечной атрофии . Исследования также показали возможную роль SMN в миграции и / или дифференцировке нейронов . [3]

Функция [ править ]

Белок SMN содержит GEMIN2-связывающие домены , Tudor и YG-Box. [4] Он локализуется как в цитоплазме, так и в ядре . Внутри ядра белок локализуется в субъядерных телах, называемых драгоценными камнями, которые находятся рядом со свернутыми кольцами тел, содержащих высокие концентрации малых рибонуклеопротеидов (мяРНП). Этот белок образует гетеромерных комплексы с белками , такими как GEMIN2 и GEMIN4 , а также взаимодействует с несколькими белками , как известно, участвует в биогенезе из мяРНП , таких как белок hnRNP U и небольшой ядрышек РНК - связывающего белка. [5]

SMN комплекс [ править ]

Комплекс SMN относится ко всему мультибелковому комплексу, участвующему в сборке мяРНП , основных компонентов сплайсосомного аппарата . [6] В комплексе, помимо «правильного» выживания двигательных нейронов белка, включает в себя , по меньшей мере шесть других белков ( гем-ассоциированный белок 2 , 3 , 4 , 5 , 6 и 7 . [6]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что SMN взаимодействует с:

  • Bcl-2 , [7]
  • Койлин , [8] [9]
  • DDX20 , [10] [11] [12] [13]
  • DHX9 , [14]
  • FBL , [15]
  • FUBP1 , [16]
  • GAR1 , [15]
  • GEMIN2 , [10] [11] [17]
  • GEMIN4 , [10] [11]
  • GEMIN5 , [18]
  • GEMIN7 , [19] [20]
  • HNRNPR , [21] [22]
  • КПНБ1 , [23]
  • P53 , [24]
  • SNRPD1 , [11] [17] [25] и
  • SNRPD2 . [11]

Эволюционное сохранение [ править ]

SMN эволюционно консервативен в том числе грибов царства, хотя только грибковые организмы с большим числом интронов имеют SMN ген (или сплайсинг фактор SPF30 паралог ). Удивительно, но это нитчатые грибы, у которых есть мицелий , что наводит на мысль об аналогии с аксонами нейронов. [26]

См. Также [ править ]

  • Гидеон Дрейфус

Ссылки [ править ]

  1. ^ Selenko Р, Sprangers R, G Стиэр, Бюлер D, U Фишер, Сэттлер М (январь 2001). «Структура tudor домена SMN и ее взаимодействие с белками Sm». Структурная биология природы . 8 (1): 27–31. DOI : 10.1038 / 83014 . PMID  11135666 .
  2. ^ Singh NN, Shishimorova M, Cao LC, Gangwani L, Singh RN (2009). «Короткий антисмысловой олигонуклеотид, маскирующий уникальный интронный мотив, предотвращает пропуск критического экзона при спинальной мышечной атрофии» . Биология РНК . 6 (3): 341–50. DOI : 10,4161 / rna.6.3.8723 . PMC 2734876 . PMID 19430205 .  
  3. ^ Джавацци A, Setola V, Simonati A, Батталия G (март 2006). «Нейрон-специфические роли белка мотонейрона выживания: данные из паттернов экспрессии моторных нейронов выживания в развивающейся центральной нервной системе человека» . Журнал невропатологии и экспериментальной неврологии . 65 (3): 267–77. DOI : 10.1097 / 01.jnen.0000205144.54457.a3 . PMID 16651888 . 
  4. ^ Martin R, Gupta K, Нинан NS, Perry K, Van Duyne GD (ноябрь 2012). «Белок выживания моторных нейронов образует растворимые глициновые олигомеры застежки-молнии» . Структура . 20 (11): 1929–39. DOI : 10.1016 / j.str.2012.08.024 . PMC 3519385 . PMID 23022347 .  
  5. ^ «Энтрез Ген: выживаемость SMN1 мотонейрона 1, теломерный» .
  6. ^ a b Губиц А.К., Фенг В., Дрейфус Г. (май 2004 г.). «Комплекс SMN». Экспериментальные исследования клеток . 296 (1): 51–6. DOI : 10.1016 / j.yexcr.2004.03.022 . PMID 15120993 . 
  7. ^ Iwahashi Н, Эгучи Y, Yasuhara Н, Hanafusa Т, Мацузава Y, Y Цудзимото (ноябрь 1997 года). «Синергическая антиапоптотическая активность между Bcl-2 и SMN, вовлеченная в спинальную мышечную атрофию». Природа . 390 (6658): 413–7. DOI : 10.1038 / 37144 . PMID 9389483 . 
  8. ^ Эбер MD, Shpargel KB, Ospina JK, Tucker KE, Матера AG (сентябрь 2002). «Метилирование коилина регулирует формирование ядерного тела». Клетка развития . 3 (3): 329–37. DOI : 10.1016 / S1534-5807 (02) 00222-8 . PMID 12361597 . 
  9. ^ Эбер MD, Szymczyk PW, Shpargel KB, Матера AG (октябрь 2001). «Коилин образует мост между тельцами Кахаля и SMN, белком спинальной мышечной атрофии» . Гены и развитие . 15 (20): 2720–9. DOI : 10,1101 / gad.908401 . PMC 312817 . PMID 11641277 .  
  10. ^ a b c Карнеги Г.К., Слиман Дж. Э., Моррис Н., Хасти С. Джей, Пегги М. В., Филп А., Ламонд А. И., Коэн П. Т. (май 2003 г.). «Протеиновая фосфатаза 4 взаимодействует с комплексом выживания моторных нейронов и усиливает временную локализацию snRNP» . Журнал клеточной науки . 116 (Pt 10): 1905–13. DOI : 10,1242 / jcs.00409 . PMID 12668731 . 
  11. ^ a b c d e Meister G, Bühler D, Laggerbauer B, Zobawa M, Lottspeich F, Fischer U (август 2000 г.). «Характеристика ядерного 20S комплекса, содержащего белок выживания мотонейронов (SMN) и специфическую подгруппу сплайсосомных белков Sm» . Молекулярная генетика человека . 9 (13): 1977–86. DOI : 10.1093 / HMG / 9.13.1977 . PMID 10942426 . 
  12. ^ Mourelatos Z, Dostie J, Paushkin S, Шарма А, Charroux В, Абель л, Rappsilber Дж, Манн М, Дреифасс G (март 2002 г.). «miRNPs: новый класс рибонуклеопротеидов, содержащий множество микроРНК» . Гены и развитие . 16 (6): 720–8. DOI : 10,1101 / gad.974702 . PMC 155365 . PMID 11914277 .  
  13. ^ Charroux B, Pellizzoni L, Перкинсон Р.А., Шевченко, Mann М, Дрейфус G (декабрь 1999). «Gemin3: новый белок DEAD box, который взаимодействует с SMN, продуктом гена мышечной атрофии позвоночника, и является компонентом драгоценных камней» . Журнал клеточной биологии . 147 (6): 1181–94. DOI : 10.1083 / jcb.147.6.1181 . PMC 2168095 . PMID 10601333 .  
  14. ^ Pellizzoni л, Charroux В, Rappsilber Дж, Манны М, Дреифассы G (январь 2001). «Функциональное взаимодействие между комплексом выживания мотонейрона и РНК-полимеразой II» . Журнал клеточной биологии . 152 (1): 75–85. DOI : 10,1083 / jcb.152.1.75 . PMC 2193649 . PMID 11149922 .  
  15. ^ a b Pellizzoni L, Baccon J, Charroux B, Dreyfuss G (июль 2001 г.). «Белок выживания мотонейронов (SMN) взаимодействует с белками snoRNP фибрилларином и GAR1». Текущая биология . 11 (14): 1079–88. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (01) 00316-5 . PMID 11509230 . 
  16. Перейти ↑ Williams BY, Hamilton SL, Sarkar HK (март 2000). «Белок выживания мотонейрона взаимодействует с трансактиваторным связывающим белком FUSE из мозга плода человека». Письма FEBS . 470 (2): 207–10. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (00) 01320-X . PMID 10734235 . 
  17. ^ a b Лю Кью, Фишер У., Ван Ф., Дрейфус Г. (сентябрь 1997 г.). «Продукт гена мышечной атрофии позвоночника, SMN, и связанный с ним белок SIP1 находятся в комплексе со сплайсосомными белками snRNP». Cell . 90 (6): 1013–21. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80367-0 . PMID 9323129 . 
  18. ^ Gubitz А.К., Mourelatos Z, Абель L, Rappsilber J, M Mann, Дрейфус G (февраль 2002). «Gemin5, новый компонент белка с повтором WD в комплексе SMN, который связывает белки Sm» . Журнал биологической химии . 277 (7): 5631–6. DOI : 10.1074 / jbc.M109448200 . PMID 11714716 . 
  19. ^ Baccon J, L Pellizzoni, Rappsilber J, Mann M, Дрейфус G (август 2002). «Идентификация и характеристика Gemin7, нового компонента выживания комплекса двигательных нейронов» . Журнал биологической химии . 277 (35): 31957–62. DOI : 10.1074 / jbc.M203478200 . PMID 12065586 . 
  20. ^ Pellizzoni L, Baccon J, J Rappsilber, Mann М, Дрейфус G (март 2002). «Очистка естественного выживания комплексов мотонейронов и идентификация Gemin6 как нового компонента» . Журнал биологической химии . 277 (9): 7540–5. DOI : 10.1074 / jbc.M110141200 . PMID 11748230 . 
  21. ^ Mourelatos Z, Абель л, Ен - J, Катаок N, Дреифассы G (октябрь 2001 г.). «SMN взаимодействует с новым семейством hnRNP и сплайсосомных белков» . Журнал EMBO . 20 (19): 5443–52. DOI : 10.1093 / emboj / 20.19.5443 . PMC 125643 . PMID 11574476 .  
  22. ^ Rossoll W, Крёнинг А.К., Ohndorf UM, Steegborn C, Jablonka S, M Sendtner (январь 2002). «Специфическое взаимодействие Smn, продукта гена, определяющего мышечную атрофию позвоночника, с hnRNP-R и gry-rbp / hnRNP-Q: роль Smn в процессинге РНК в моторных аксонах?» . Молекулярная генетика человека . 11 (1): 93–105. DOI : 10.1093 / HMG / 11.1.93 . PMID 11773003 . 
  23. ↑ Narayanan U, Ospina JK, Frey MR, Hebert MD, Matera AG (июль 2002 г.). «SMN, белок спинальной мышечной атрофии, образует предимпортный комплекс snRNP со снурпортином1 и импортином бета» . Молекулярная генетика человека . 11 (15): 1785–95. DOI : 10.1093 / HMG / 11.15.1785 . PMC 1630493 . PMID 12095920 .  
  24. ^ Молодые PJ, День PM, Чжоу J, Androphy EJ, Моррис GE, Lorson CL (январь 2002). «Прямое взаимодействие между белком двигательного нейрона выживания и p53 и его связь с мышечной атрофией позвоночника» . Журнал биологической химии . 277 (4): 2852–9. DOI : 10.1074 / jbc.M108769200 . PMID 11704667 . 
  25. ↑ Friesen WJ, Dreyfuss G (август 2000 г.). «Конкретные последовательности Sm и Sm-подобных (Lsm) белков опосредуют их взаимодействие с продуктом гена мышечной атрофии позвоночника (SMN)» . Журнал биологической химии . 275 (34): 26370–5. DOI : 10.1074 / jbc.M003299200 . PMID 10851237 . 
  26. ^ Миер P, Перес-Pulido AJ (январь 2012). «Гомологи Smn и Spf30 грибов в основном присутствуют в мицелиальных грибах и геномах с большим количеством интронов: последствия для спинальной мышечной атрофии» (PDF) . Джин . 491 (2): 135–41. DOI : 10.1016 / j.gene.2011.10.006 . PMID 22020225 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • SMN + белок + (спинной + мышечный + атрофия) в Национальной медицинской библиотеке США по предметным заголовкам по медицинским предметам (MeSH)