TACK | |
---|---|
Сульфолобус | |
Научная классификация | |
Домен: | |
Королевство: | |
Суперфилум: | TACK Гай и Эттема 2011 |
Фила [1] | |
| |
Синонимы | |
|
TACK - это группа акронимов архей от Thaumarchaeota , Aigarchaeota , Crenarchaeota и Korarchaeota , первых обнаруженных групп. Они встречаются в различных средах, от ацидофильных термофилов до мезофилов и психрофилов, и с различными типами метаболизма , преимущественно анаэробными и хемосинтетическими. [2] TACK - это клад, которая близка к ветви, которая дала начало эукариотам . Было предложено классифицировать кладу TACK как Crenarchaeotaи чтобы традиционные «Crenarchaeota» были классифицированы как класс, называемый «Sulfolobia», вместе с другими типами с классовым рангом или порядком. [3]
Классификация [ править ]
- Crenarchaeota . Это самый известный край и самая многочисленная архея в морской экосистеме. Раньше они назывались сульфобактериями из-за их зависимости от серы и важны как фиксаторы углерода. В гидротермальных жерлах есть гипертермофилы, а другие группы наиболее многочисленны на глубинах менее 100 м.
- Aigarchaeota . Это тип, предложенный на основе генома вида-кандидата Caldiarchaeum subterraneum, обнаруженного глубоко в золотом руднике в Японии . Геномные последовательности этой группы также были обнаружены в геотермальных средах, как наземных, так и морских.
- Геоархея . Сюда входят термофильные организмы, живущие в кислой среде, восстанавливающие трехвалентное железо. В качестве альтернативы было высказано предположение, что эта и более ранние группы действительно принадлежат к типу Thaumarchaeota.
- Thaumarchaeota . Он включает мезофильные или психрофильные организмы (средние и низкие температуры), хемолитоавтотрофного метаболизма аммиака и окислителя (нитрификация) и которые могут играть важную роль в биохимических циклах, таких как циклы азота и углерода.
- Bathyarchaeota . Его много в донных отложениях при недостатке питательных веществ. По крайней мере, некоторые клоны развиваются посредством гомоацетогенеза, типа метаболизма, который до сих пор считался уникальным для бактерий.
- Корархеота . Они были обнаружены только в гидротермальных условиях и в небольшом количестве. Они кажутся разнообразными на разных филогенетических уровнях в зависимости от температуры, солености (пресная или морская вода) и географии.
Филогения [ править ]
Отношения примерно следующие:
McKay et al. 2019 [4] | AnnoTree и GTDB, выпуск 05-RS95 [5] [6] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
Ссылки [ править ]
- ^ Castelle CJ, Бэнфилд JF. (2018). «Основные новые группы микробов расширяют разнообразие и изменяют наше понимание Древа жизни» . Cell . 172 (6): 1181–1197. DOI : 10.1016 / j.cell.2018.02.016 . PMID 29522741 .CS1 maint: использует параметр авторов ( ссылка )
- ^ Guy & Ettema 2011, архейного «ТАСК» superphylum и происхождение эукариот. Trends Microbiol. 2011 декабрь; 19 (12): 580-7. DOI: 10.1016 / j.tim.2011.09.002. Epub 2011 20 октября.
- ^ Кавальер-Смит, Томас; Чао, Эма Е-Юнг (2020). «Многодоменные рибосомные белковые деревья и планктобактериальное происхождение неомура (эукариоты, архебактерии)» . Протоплазма . 257 (3): 621–753. DOI : 10.1007 / s00709-019-01442-7 . PMC 7203096 . PMID 31900730 .
- ^ Маккей, LJ, Dlakić, М., Поля, MWдр. Совместная геномная способность к анаэробному метаболизму метана и диссимиляционной серы обнаружена у корархей . Nat Microbiol 4, 614–622 (2019) doi: 10.1038 / s41564-019-0362-4
- ^ Мендлер, K; Чен, Н; Парки, DH; Hug, LA; Докси, AC (2019). «AnnoTree: визуализация и исследование функционально аннотированного микробного древа жизни» . Исследования нуклеиновых кислот . 47 (9): 4442–4448. DOI : 10.1093 / NAR / gkz246 . PMC 6511854 . PMID 31081040 .
- ^ "Выпуск GTDB 05-RS95" . База данных таксономии генома .