Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
TAL1
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

2YPA , 2YPB

Идентификаторы
ПсевдонимыTAL1 , SCL, TCL5, bHLHa17, tal-1, Т-клеточный острый лимфоцитарный лейкоз 1, TAL, фактор транскрипции bHLH 1, фактор дифференцировки эритроидов
Внешние идентификаторыOMIM: 187040 MGI: 98480 HomoloGene: 2400 GeneCard: TAL1
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человека) [1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение TAL1
Геномное расположение TAL1
Группа1п33Начинать47 216 290 п.н. [1]
Конец47 232 220 п.н. [1]
Расположение гена (Мышь)
Хромосома 4 (мышь)
Chr.Хромосома 4 (мышь) [2]
Хромосома 4 (мышь)
Геномное расположение TAL1
Геномное расположение TAL1
Группа4 D1 | 4 52,73 смНачинать115 056 426 п.н. [2]
Конец115 071 755 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE TAL1 206283 s в формате fs.png

PBB GE TAL1 216925 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• ГО: 0000980 РНК - полимераза область последовательности специфических ДНК - II , цис-регуляторных связывания
• ДНК связывания
• РНК - полимеразы II ДНК последовательность конкретных регуляторной области связывания
• белок димеризации активностью
• РНК - полимеразы II , фактора транскрипции связывания
• ГО: 0001131, ГО: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 ДНК-связывающий фактор транскрипции
• Связывание гистон-деацетилазы
• Связывание с хроматином
• Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области транскрипции
• Связывание с E-боксом
• Связывание с белком GO: 0001948
• активность гетеродимеризации белка
• связывание ферментов
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II
Сотовый компонент• комплекс гистондеацетилазы
• комплекс регулятора транскрипции
• ядерный хроматин
• комплекс Lsd1 / 2
• ядро клетки
• нуклеоплазма
• макромолекулярный комплекс
Биологический процесс• развитие мегакариоцитов
• мегакариоцит дифференциация
• миелоидная дифференцировка клеток
• клеточная судьба Приверженность
• дифференцировка клеток
• регуляция транскрипции ДНК-шаблонной
• регуляция дифференцировки тучных клеток
• спинной дифференцировка мозг ассоциация нейрон
• положительная регуляция белкового комплекса сборки
• двигательного поведение
• положительное регулирование дифференцировки эритроцитов
• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• регуляция поддержания популяции стволовых клеток
• образование тромбоцитов
• позитивная регуляция митотического клеточного цикла
• негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• транскрипция, ДНК-шаблон
• генерация нейронов
• дифференцировка базофилов
• позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• развитие многоклеточных организмов
• регуляция клеточной пролиферации
• дифференцировка гемопоэтических стволовых клеток
• обязательство судьбы астроцитов
• ангиогенез
• дифференцировка нейронов
• эмбриональный гемопоэз
• положительное регулирование хроматина сборки или разборки
• эритроциты дифференцировка
• окончательный гемопоэз
• регуляция миелоидной дифференцировки клеток
• положительной регуляции клеточного деления
• дифференциации гемангиобласт клеток
• положительной регуляция транскрипции с РНК - полимераза II промотор
• эритроцит созревание
• регуляции гемопоэтической дифференцировки стволовых клеток
• гемопоэз
• транскрипция с промотора РНК-полимеразы II
• негативная регуляция дифференцировки эритроцитов
• положительная регуляция активности протеинтирозинкиназы
• положительная регуляция активности рецепторов
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

6886

21349

Ансамбль

ENSG00000162367

ENSMUSG00000028717

UniProt

P17542

P22091

RefSeq (мРНК)
NM_001287347
NM_001290403
NM_001290404
NM_001290405
NM_001290406

NM_003189

NM_011527
NM_001287388

RefSeq (белок)
NP_001274276
NP_001277332
NP_001277333
NP_001277334
NP_001277335

NP_003180

NP_001274317
NP_035657

Расположение (UCSC)Chr 1: 47,22 - 47,23 МбChr 4: 115.06 - 115.07 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Т-клеточный острый лимфобластный лейкоз белок 1 (т.е. TAL1 , но также называемый стволовых клеток лейкемии / Т-клеточный острый лейкоз 1 [т.е. SCL / TAL1]) представляет собой белок , который у человека кодируется TAL1 гена . [5] [6]

Белок, кодируемый TAL1, является основным транскрипционным фактором спираль-петля-спираль .

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что TAL1 взаимодействует с:

  • CBFA2T3 , [7]
  • EP300 , [8]
  • GATA1 , [7] [9]
  • LDB1 , [7]
  • LMO1 , [10] [11]
  • LMO2 , [7] [9] [10] [11]
  • SIN3A , [12]
  • Фактор транскрипции Sp1 , [13] и
  • TCF3 . [7] [14]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000162367 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028717 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ↑ Finger LR, Kagan J, Christopher G, Kurtzberg J, Hershfield MS, Nowell PC, Croce CM (август 1989 г.). «Участие гена TCL5 на хромосоме 1 человека в Т-клеточном лейкозе и меланоме» . Proc Natl Acad Sci USA . 86 (13): 5039–43. Bibcode : 1989PNAS ... 86.5039F . DOI : 10.1073 / pnas.86.13.5039 . PMC 297552 . PMID 2740341 .  
  6. ^ "Ген Entrez: TAL1 T-клеточный острый лимфоцитарный лейкоз 1" .
  7. ^ a b c d e Goardon N, Lambert JA, Rodriguez P, Nissaire P, Herblot S, Thibault P, Dumenil D, Strouboulis J, Romeo PH, Hoang T (январь 2006 г.). «ETO2 координирует клеточную пролиферацию и дифференцировку во время эритропоэза» . EMBO J . 25 (2): 357–66. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7600934 . PMC 1383517 . PMID 16407974 .  
  8. Перейти ↑ Huang S, Qiu Y, Stein RW, Brandt SJ (сентябрь 1999 г.). «p300 функционирует как транскрипционный коактиватор онкобелка TAL1 / SCL» . Онкоген . 18 (35): 4958–67. DOI : 10.1038 / sj.onc.1202889 . PMID 10490830 . 
  9. ^ a b Osada H, Grutz G, Axelson H, Forster A, Rabbitts TH (октябрь 1995 г.). «Ассоциация факторов транскрипции эритроидов: комплексы с участием белка LIM RBTN2 и белка цинкового пальца GATA1» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 92 (21): 9585–9. Bibcode : 1995PNAS ... 92.9585O . DOI : 10.1073 / pnas.92.21.9585 . PMC 40846 . PMID 7568177 .  
  10. ^ a b Валге-Арчер В.Э., Осада Х., Уоррен А.Дж., Форстер А., Ли Дж., Баер Р., Кролик Т.Х. (август 1994 г.). «Белок LIM RBTN2 и основной белок спираль-петля-спираль TAL1 присутствуют в комплексе в эритроидных клетках» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 91 (18): 8617–21. Bibcode : 1994PNAS ... 91.8617V . DOI : 10.1073 / pnas.91.18.8617 . PMC 44657 . PMID 8078932 .  
  11. ^ a b Wadman I, Li J, Bash RO, Forster A, Osada H, Rabbitts TH, Baer R (октябрь 1994 г.). «Специфическая ассоциация in vivo между белками bHLH и LIM, участвующими в лейкемии Т-клеток человека» . EMBO J . 13 (20): 4831–9. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06809.x . PMC 395422 . PMID 7957052 .  
  12. ^ Хуанг S, Брандт SJ (март 2000). «mSin3A регулирует дифференцировку клеток мышиной эритролейкемии посредством ассоциации с фактором транскрипции TAL1 (или SCL)» . Мол. Клетка. Биол . 20 (6): 2248–59. DOI : 10.1128 / mcb.20.6.2248-2259.2000 . PMC 110841 . PMID 10688671 .  
  13. ^ Lécuyer E, Herblot S, Saint-Denis M, Martin R, Begley CG, Porcher C, Orkin SH, Hoang T (октябрь 2002 г.). «Комплекс SCL регулирует экспрессию c-kit в гематопоэтических клетках посредством функционального взаимодействия с Sp1» . Кровь . 100 (7): 2430–40. DOI : 10.1182 / кровь-2002-02-0568 . PMID 12239153 . 
  14. ^ Hsu HL, Wadman I, Baer R (апрель 1994). «Формирование in vivo комплексов между полипептидами TAL1 и E2A лейкозных Т-клеток» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 91 (8): 3181–5. Bibcode : 1994PNAS ... 91.3181H . DOI : 10.1073 / pnas.91.8.3181 . PMC 43539 . PMID 8159721 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Грин А.Р., Бегли К.Г. (1993). «SCL и родственные гемопоэтические факторы транскрипции спираль-петля-спираль». Int. J. Клонирование клеток . 10 (5): 269–76. DOI : 10.1002 / stem.5530100504 . PMID  1453013 .
  • Aplan PD, Lombardi DP, Reaman GH, Sather HN, Hammond GD, Kirsch IR (1992). «Вовлечение предполагаемого фактора транскрипции гемопоэза SCL в Т-клеточный острый лимфобластный лейкоз» . Кровь . 79 (5): 1327–33. DOI : 10.1182 / blood.V79.5.1327.1327 . PMID  1311214 .
  • Аплан П.Д., Накахара К., Оркин С.Х., Кирш И.Р. (1992). «Продукт гена SCL: положительный регулятор дифференцировки эритроидов» . EMBO J . 11 (11): 4073–81. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1992.tb05500.x . PMC  556917 . PMID  1396592 .
  • Гольдфарб А.Н., Гуэли С., Микельсон Д., Гринберг Дж. М. (1992). «Т-клеточный острый лимфобластный лейкоз - связанный ген SCL / tal кодирует 42-килодонный ядерный фосфопротеин» . Кровь . 80 (11): 2858–66. DOI : 10.1182 / blood.V80.11.2858.bloodjournal80112858 . PMID  1450410 .
  • Бернар О., Лекойнт Н., Жонво П., Суйри М., Мошоффе М., Бергер Р., Ларсен К.Дж., Матье-Махул Д. (1991). «Две сайт-специфические делеции и транслокация t (1; 14), ограниченная острыми лейкозами Т-клеток человека, нарушает 5'-часть гена tal-1». Онкоген . 6 (8): 1477–88. PMID  1886719 .
  • Бернар О, Гульельми П., Жонво П., Шериф Д., Гиссельбрехт С., Мошоф М., Бергер Р., Ларсен С.Дж., Матье-Махул Д. (1991). «Два различных механизма активации гена SCL при t (1; 14) транслокации Т-клеточных лейкозов». Гены Хромосомы Рак . 1 (3): 194–208. DOI : 10.1002 / gcc.2870010303 . PMID  1964581 . S2CID  2464453 .
  • Чен Кью, Ян CY, Цан Дж.Т., Ся Й, Рагаб А.Х., Пайпер С.К., Кэрролл А., Бэр Р. (1990). «Кодирующие последовательности гена tal-1 нарушены транслокацией хромосом при лейкемии Т-клеток человека» . J. Exp. Med . 172 (5): 1403–8. DOI : 10,1084 / jem.172.5.1403 . PMC  2188666 . PMID  2230650 .
  • Аплан П.Д., Бегли К.Г., Бертнесс В., Нуссмайер М., Эскерра А., Колиган Дж., Кирш И.Р. (1991). «Ген SCL образован из локуса транскрипционной сложности» . Мол. Клетка. Биол . 10 (12): 6426–35. DOI : 10.1128 / mcb.10.12.6426 . PMC  362919 . PMID  2247063 .
  • Чен К., Ченг Дж. Т., Таси Л. Х., Шнайдер Н., Бьюкенен Дж., Кэрролл А., Крист В., Озанн Б., Сицилиано М. Дж., Баер Р. (1990). «Ген tal подвергается хромосомной транслокации при Т-клеточном лейкозе и потенциально кодирует белок спираль-петля-спираль» . EMBO J . 9 (2): 415–24. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1990.tb08126.x . PMC  551682 . PMID  2303035 .
  • Бегли К.Г., Аплан П.Д., Деннинг С.М., Хейнс Б.Ф., Вальдманн Т.А., Кирш И.Р. (1990). «Ген SCL экспрессируется во время раннего гематопоэза и кодирует связанный с дифференцировкой ДНК-связывающий мотив» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 86 (24): 10128–32. DOI : 10.1073 / pnas.86.24.10128 . PMC  298658 . PMID  2602361 .
  • Osada H, Grutz G, Axelson H, Forster A, Rabbitts TH (1995). «Ассоциация факторов транскрипции эритроидов: комплексы с участием белка LIM RBTN2 и белка цинкового пальца GATA1» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 92 (21): 9585–9. Bibcode : 1995PNAS ... 92.9585O . DOI : 10.1073 / pnas.92.21.9585 . PMC  40846 . PMID  7568177 .
  • Pulford K, Lecointe N, Leroy-Viard K, Jones M, Mathieu-Mahul D, Mason DY (1995). «Экспрессия белков TAL-1 в тканях человека» . Кровь . 85 (3): 675–84. DOI : 10.1182 / blood.V85.3.675.bloodjournal853675 . PMID  7833471 .
  • Вадман И., Ли Дж., Баш Р.О., Форстер А., Осада Х., Кролик Т.Х., Баер Р. (1994). «Специфическая ассоциация in vivo между белками bHLH и LIM, участвующими в лейкемии Т-клеток человека» . EMBO J . 13 (20): 4831–9. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06809.x . PMC  395422 . PMID  7957052 .
  • Валге-Арчер В.Э., Осада Х., Уоррен А.Дж., Форстер А., Ли Дж., Баер Р., Кролик Т.Х. (1994). «Белок LIM RBTN2 и основной белок спираль-петля-спираль TAL1 присутствуют в комплексе в эритроидных клетках» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 91 (18): 8617–21. Bibcode : 1994PNAS ... 91.8617V . DOI : 10.1073 / pnas.91.18.8617 . PMC  44657 . PMID  8078932 .
  • Cross MA, Heyworth CM, Murrell AM, Bockamp EO, Dexter TM, Green AR (1994). «Экспрессия ограниченных по клонам факторов транскрипции предшествует клоноспецифической дифференцировке в мультипотентной линии гемопоэтических клеток-предшественников». Онкоген . 9 (10): 3013–6. PMID  8084606 .
  • Сюй Х.Л., Вадман И., Баер Р. (1994). «Формирование in vivo комплексов между полипептидами TAL1 и E2A лейкозных Т-клеток» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 91 (8): 3181–5. Bibcode : 1994PNAS ... 91.3181H . DOI : 10.1073 / pnas.91.8.3181 . PMC  43539 . PMID  8159721 .
  • Hwang LY, Siegelman M, Davis L, Oppenheimer-Marks N, Baer R (1993). «Экспрессия протоонкогена TAL1 в культивируемых эндотелиальных клетках и кровеносных сосудах селезенки». Онкоген . 8 (11): 3043–6. PMID  8414504 .
  • Ченг Дж. Т., Кобб М. Х., Баер Р. (1993). «Фосфорилирование онкопротеина TAL1 с помощью регулируемой внеклеточными сигналами протеинкиназы ERK1» . Мол. Клетка. Биол . 13 (2): 801–8. DOI : 10.1128 / mcb.13.2.801 . PMC  358963 . PMID  8423803 .

Внешние ссылки [ править ]

  • TAL1 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • FactorBook TAL1