Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

TBP
Белок TBP PDB 1c9b.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1TGH , 1C9B , 1JFI , 1NVP , 4ROC , 4ROE , 4ROD , 5IY9 , 5IYA , 5FUR , 5IYC , 5IYB , 5IY7 , 5IY8 , 5IYD , 5IY6

Идентификаторы
ПсевдонимыTBP , GTF2D, GTF2D1, HDL4, SCA17, TFIID, TATA-бокс-связывающий белок, TATA-связывающий белок
Внешние идентификаторыOMIM : 600075 MGI : 101838 HomoloGene : 2404 GeneCard : TBP
Расположение гена ( человек )
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человека) [1]
Хромосома 6 (человек)
Геномная локализация TBP
Геномная локализация TBP
Группа6q27Начинать170 554 302 п.н. [1]
Конец170 572 870 п.н. [1]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE TBP 203135 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• связывание ДНК
• ГО: 0001131, ГО: 0001151, ГО: 0001130, ГО: 0001204 ДНК-связывающий фактор активности транскрипции
• транскрипционный фактор связывания
• ГО: 0000980 РНК - полимераза область связывания ДНК последовательности специфических II цис-регуляторных
• ГО: 0001948 белок связывание
• РНК-полимераза II репрессирует связывание фактора транскрипции
• связывание фермента
• репрессирует связывание фактора транскрипции
• Связывание фактора транскрипции класса TFIIB
• Связывание с арилуглеводородным рецептором
• Связывание проксимальной области корового промотора GO: 0001158, специфичное для последовательности ДНК
• ГО: 0001200, ГО: 0001133, ГО: 0001201 ДНК-связывающий фактор активности транскрипции РНК - полимеразы II , специфичные
• транскрипционный фактор активности, ядро РНК - полимеразы III связывания
• ГО: 0000983 РНК - полимеразы II общей транскрипции фактор инициации активности
• РНК - полимеразы II ядро Связывание ДНК, специфичное для промоторной последовательности
• Связывание с ДНК регуляторной области РНК-полимеразы III
Сотовый компонент• цитоплазма
• ядерный эухроматин
• комплекс фактора транскрипции TFIID
• мужской пронуклеус
• женский пронуклеус
• нуклеоплазма
• комплекс фактора транскрипции TFIIA
• пронуклеус
• ядерный хроматин
• ядро клетки
• комплекс преинициации транскрипции
• макромолекулярный комплекс
• комплекс фактора транскрипции TFIIIB
• комплекс регулятора транскрипции
Биологический процесс• прекращение транскрипции РНК-полимеразы I
• позитивная регуляция экспрессии генов, эпигенетическая
• регуляция транскрипции, ДНК-темплейт
• инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы I
• транскрипция, ДНК-шаблон
• позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• сперматогенез
• ДНК - предполагаемая транскрипция, инициация
• инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• транскрипция мяРНК с промотора РНК-полимеразы II
• регуляция передачи сигнала медиатором класса p53
• вирусный процесс GO: 0022415
• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы III
• транскрипция с промотора РНК-полимеразы II
• транскрипция с промотора РНК-полимеразы III
• сборка транскрипционного комплекса преинициации РНК-полимеразы II
• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• сборка транскрипционного комплекса преинициации РНК-полимеразы III
• элонгация транскрипции от промотора РНК-полимеразы I
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

6908

21374

Ансамбль

ENSG00000112592

ENSMUSG00000014767

UniProt

P20226

P29037

RefSeq (мРНК)

NM_003194
NM_001172085

NM_013684

RefSeq (белок)

NP_001165556
NP_003185

NP_038712

Расположение (UCSC)Chr 6: 170,55 - 170,57 Мбн / д
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши
TBP
кристаллическая структура дрожжевого тройного комплекса brf1-tbp-dna
Идентификаторы
СимволTBP
PfamPF00352
Клан пфамCL0407
ИнтерПроIPR000814
PROSITEPDOC00303
SCOP21tbp / SCOPe / SUPFAM
Доступные белковые структуры:
Pfam  структуры / ECOD  
PDBRCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumрезюме структуры

ТАТА-связывающий белок ( ТВР ) представляет собой общий фактор транскрипции , который специфически связывается с ДНК - последовательностью называется ТАТА - бокс . Эта последовательность ДНК находится примерно в 30 парах оснований перед сайтом начала транскрипции в промоторах некоторых эукариотических генов . [4]

Семейство генов TBP [ править ]

TBP является членом небольшого семейства генов факторов, связанных с TBP. [5] Первый фактор, связанный с ТВР (TRF / TRF1), был идентифицирован у плодовой мухи Drosophila , но, по-видимому, специфичен для мух или насекомых. Впоследствии TBPL1 / TRF2 был обнаружен в геномах многих многоклеточных , тогда как геномы позвоночных кодируют третьего члена семейства позвоночных, TBPL2 / TRF3. В определенных типах клеток или на определенных промоторах TBP может быть заменен одним из этих связанных с TBP факторов, некоторые из которых взаимодействуют с боксом TATA аналогично TBP.

Роль как фактор транскрипции [ править ]

TBP является субъединицей общего транскрипционного фактора эукариот TFIID . TFIID первый белок для связывания с ДНК во время формирования транскрипции преиниационного комплекса из РНК - полимеразы II (РНК Pol II). [6] Являясь одним из немногих белков в преинициационном комплексе, который связывает ДНК специфическим для последовательности образом, он помогает расположить РНК-полимеразу II над сайтом начала транскрипции гена. Однако, по оценкам, только 10–20% промоторов человека имеют боксы ТАТА. Следовательно, TBP, вероятно, не единственный белок, участвующий в позиционировании РНК-полимеразы II. Большинство промоторов человека являются промоторами генов домашнего хозяйства без ТАТА. . Связывание TBP с этими промоторами облегчается регуляторами генов домашнего хозяйства. [7] [8] Интересно, что транскрипция инициируется в узкой области примерно на 30 п.н. ниже ТАТА-бокса на ТАТА-содержащих промоторах [9], в то время как сайты начала транскрипции промоторов без ТАТА рассредоточены в области 200 п.н. [10] [8]

Связывание TFIID с ТАТА-боксом в промоторной области гена инициирует рекрутирование других факторов, необходимых для того, чтобы РНК Pol II начала транскрипцию. Некоторые из других задействованных факторов транскрипции включают TFIIA , TFIIB и TFIIF . Каждый из этих факторов транскрипции содержит несколько белковых субъединиц.

TBP также важен для транскрипции РНК-полимеразой I и РНК-полимеразой III и, следовательно, участвует в инициации транскрипции всеми тремя РНК-полимеразами. [11]

TBP участвует в плавлении ДНК (разделение двух цепей), изгибая ДНК на 80 ° (последовательность, богатая AT, с которой он связывается, способствует легкому плавлению). TBP - необычный белок, который связывает малую бороздку с помощью β-листа.

Еще одна отличительная особенность ТВР - длинная цепочка глутаминов на N-конце белка. Эта область модулирует активность связывания ДНК на С-конце, а модуляция связывания ДНК влияет на скорость образования транскрипционных комплексов и инициацию транскрипции. Мутации, которые увеличивают количество CAG-повторов, кодирующих этот полиглутаминовый тракт , и, таким образом, увеличивают длину полиглутаминовой цепи, связаны со спиноцеребеллярной атаксией 17, нейродегенеративным заболеванием, классифицируемым как полиглутаминовое заболевание . [12]

ДНК-белковые взаимодействия [ править ]

Когда ТВР связывается с ТАТА-боксом внутри ДНК , он искажает ДНК, вставляя боковые цепи аминокислот между парами оснований, частично раскручивая спираль и дважды изгибая ее. Искажение достигается за счет большого количества поверхностного контакта между белком и ДНК. ТВР связывается с отрицательно заряженными фосфатами в основной цепи ДНК через положительно заряженные аминокислотные остатки лизина и аргинина . Резкий изгиб ДНК происходит за счет проецирования четырех объемных остатков фенилаланина в малую бороздку. По мере изгиба ДНК ее контакт с ТВР увеличивается, тем самым усиливая взаимодействие ДНК-белок.

Напряжение, наложенное на ДНК в результате этого взаимодействия, вызывает плавление или разделение цепей. Поскольку эта область ДНК богата остатками аденина и тимина , пары оснований которых связаны только двумя водородными связями , нити ДНК легче разделяются. Разделение двух цепей открывает основания и позволяет РНК-полимеразе II начать транскрипцию гена .

C-конец TBP имеет спиралевидную форму, которая (не полностью) дополняет область TATA ДНК. Эта неполнота позволяет ДНК пассивно склоняться к связыванию.

Для получения информации об использовании TBP в клетках см .: РНК-полимераза I , РНК-полимераза II и РНК-полимераза III .

Белковые взаимодействия [ править ]

Было показано, что ТАТА-связывающий белок взаимодействует с:

  • BRF1 , [13] [14]
  • BTAF1 , [15] [16]
  • C-Fos , [17]
  • C-июн , [18]
  • EDF1 , [19] [20] [21]
  • GTF2B (TFIIB), [22] [23]
  • GTF2A1 ( субъединица 1 TFIIA ), [22] [24] [25] [26]
  • GTF2F1 ( субъединица 1 TFIIF ) [15] [27] [28]
  • GTF2H4 ( субъединица 4 TFIIH ), [15]
  • Mdm2 , [29] [30]
  • MSX1 , [31] [32] [33]
  • NFYB , [34]
  • P53 , [35] [36]
  • PAX6 , [36]
  • POLR2A , [15]
  • ПОУ2Ф1 , [37]
  • РЕЛА , [38] [39]
  • NR2B1 , [40]
  • TAF1 , [34] [41] [42] [43]
  • TAF4 , [44]
  • TAF5 , [34] [42] [45]
  • TAF6 , [34] [42] [44]
  • TAF7 , [34] [44]
  • TAF9 . [34] [46]
  • TAF10 , [34] [42]
  • TAF11 , [34] [47] [48]
  • TAF13 , [47] и
  • TAF15 . [49]

Сложная сборка [ править ]

Белок, связывающий ТАТА-бокс (ТВР), необходим для инициации транскрипции РНК- полимеразами I, II и III с промоторов с ТАТА-боксом или без него. [50] [51] В присутствии промотора, не содержащего TATA, TBP связывается с помощью TBP-ассоциированных факторов (TAF). [52] [53] TBP связывается с множеством факторов, включая общие факторы транскрипции TFIIA, -B, -D, -E и -H, с образованием огромных многосубъединичных преинициативных комплексов на коровом промоторе . За счет ассоциации с различными факторами транскрипции TBP может инициировать транскрипциюиз разных РНК- полимераз . Существует несколько родственных TBP, включая TBP-подобные (TBPL) белки . [54]

Структура [ править ]

С-концевое ядро ​​ТВР (~ 180 остатков) является высококонсервативным и содержит два 88-аминокислотных повтора, которые образуют седловидную структуру , охватывающую ДНК; эта область связывается с ТАТА-боксом и взаимодействует с факторами транскрипции и регуляторными белками . [55] Напротив, N-концевой участок различается как по длине, так и по последовательности .

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000112592 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. Перейти ↑ Kornberg RD (2007). «Молекулярные основы эукариотической транскрипции» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 104 (32): 12955–61. Bibcode : 2007PNAS..10412955K . DOI : 10.1073 / pnas.0704138104 . PMC 1941834 . PMID 17670940 .  
  5. ↑ Akhtar W, Veenstra GJ (1 января 2011 г.). «Факторы, связанные с ТВР: парадигма разнообразия в инициации транскрипции» . Cell & Bioscience . 1 (1): 23. DOI : 10,1186 / 2045-3701-1-23 . PMC 3142196 . PMID 21711503 .  
  6. Перейти ↑ Lee TI, Young RA (2000). «Транскрипция генов, кодирующих эукариотические белки». Ежегодный обзор генетики . 34 : 77–137. DOI : 10.1146 / annurev.genet.34.1.77 . PMID 11092823 . 
  7. ^ Лам KC, Mühlpfordt F, Vaquerizas JM, Raja SJ, Holz H, Luscombe NM, Manke T, Akhtar A (2012). «Комплекс NSL регулирует гены домашнего хозяйства у дрозофилы» . PLOS Genetics . 8 (6): e1002736. DOI : 10.1371 / journal.pgen.1002736 . PMC 3375229 . PMID 22723752 .  
  8. ^ a b Лам К.С., Чунг Х.Р., Семплицио Г., Айер С.С., Гауб А, Бхардвадж В., Хольц Х., Георгиев П., Ахтар А. (февраль 2019 г.). «Нуклеосомный ландшафт, опосредованный комплексом NSL, необходим для поддержания точности транскрипции и подавления транскрипционного шума» . Гены и развитие . 33 (7–8): 452–465. DOI : 10,1101 / gad.321489.118 . PMC 6446542 . PMID 30819819 .  
  9. ^ Carninci Р, Санделин А, Lenhard В, С Катаяма, Симокава К, Ponjavic Дж, и др. (Июнь 2006 г.). «Полногеномный анализ архитектуры и эволюции промоторов млекопитающих». Генетика природы . 38 (6): 626–35. DOI : 10.1038 / ng1789 . PMID 16645617 . S2CID 22205897 .  
  10. ↑ Ni T, Corcoran DL, Rach EA, Song S, Spana EP, Gao Y, Ohler U, Zhu J (июль 2010 г.). «Стратегия парного секвенирования для картирования сложного ландшафта инициации транскрипции» . Природные методы . 7 (7): 521–7. DOI : 10.1038 / nmeth.1464 . PMC 3197272 . PMID 20495556 .  
  11. ^ Vannini A, Крамер P (февраль 2012). «Сохранение между механизмами инициации транскрипции РНК-полимеразы I, II и III» . Молекулярная клетка . 45 (4): 439–46. DOI : 10.1016 / j.molcel.2012.01.023 . PMID 22365827 . 
  12. ^ «Entrez Gene: TBP TATA бокс-связывающий белок» .
  13. Перейти ↑ McCulloch V, Hardin P, Peng W, Ruppert JM, Lobo-Ruppert SM (август 2000). «Альтернативно сплайсированные варианты hBRF функционируют на различных промоторах РНК-полимеразы III» . EMBO J . 19 (15): 4134–43. DOI : 10.1093 / emboj / 19.15.4134 . PMC 306597 . PMID 10921893 .  
  14. Перейти ↑ Wang Z, Roeder RG (июль 1995 г.). «Структура и функция субъединицы фактора транскрипции TFIIIB человека, которая является эволюционно консервативной и содержит домены, связанные как с TFIIB, так и с белком 2 группы высокой подвижности» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 92 (15): 7026–30. Bibcode : 1995PNAS ... 92.7026W . DOI : 10.1073 / pnas.92.15.7026 . PMC 41464 . PMID 7624363 .  
  15. ^ a b c d Скалли Р., Андерсон С.Ф., Чао Д.М., Вей В., Йе Л., Янг Р.А., Ливингстон Д.М., Парвин Д.Д. (май 1997 г.). «BRCA1 является компонентом холофермента РНК-полимеразы II» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 94 (11): 5605–10. Bibcode : 1997PNAS ... 94.5605S . DOI : 10.1073 / pnas.94.11.5605 . PMC 20825 . PMID 9159119 .  
  16. ^ Chicca JJ, Auble DT, Pugh BF (март 1998). «Клонирование и биохимическая характеристика TAF-172, человеческого гомолога дрожжевого Mot1» . Мол. Клетка. Биол . 18 (3): 1701–10. DOI : 10,1128 / MCB.18.3.1701 . PMC 108885 . PMID 9488487 .  
  17. ^ Metz R, Баннистер AJ, Sutherland JA, Hagemeier C, О'Рурк EC, Кук A, Bravo R, Kouzarides T (сентябрь 1994). «c-Fos-индуцированная активация промотора, содержащего ТАТА-бокс, включает прямой контакт со связывающим ТАТА-бокс белком» . Мол. Клетка. Биол . 14 (9): 6021–9. DOI : 10,1128 / MCB.14.9.6021 . PMC 359128 . PMID 8065335 .  
  18. Перейти ↑ Franklin CC, McCulloch AV, Kraft AS (февраль 1995 г.). «Связь in vitro между семейством белков Jun и общими факторами транскрипции, TBP и TFIIB» . Biochem. Дж . 305 (3): 967–74. DOI : 10.1042 / bj3050967 . PMC 1136352 . PMID 7848298 .  
  19. Перейти ↑ Brendel C, Gelman L, Auwerx J (июнь 2002 г.). «Мультибелковый мостиковый фактор-1 (MBF-1) является кофактором ядерных рецепторов, регулирующих липидный обмен» . Мол. Эндокринол . 16 (6): 1367–77. DOI : 10.1210 / mend.16.6.0843 . PMID 12040021 . 
  20. ^ Мариотти M, De БЕНЕДИКТИС L, Avon E, Maier JA (август 2000). «Взаимодействие между фактором-1, связанным с дифференцировкой эндотелия, и кальмодулином in vitro и in vivo» . J. Biol. Chem . 275 (31): 24047–51. DOI : 10.1074 / jbc.M001928200 . PMID 10816571 . 
  21. ^ Kabe Y, Гото М, Shima D, Имаи Т, Т Вада, Морохаш Кий, Сиракав М, Такефус S, Ханда Н (ноябрь 1999 года). «Роль человеческого MBF1 как транскрипционного коактиватора» . J. Biol. Chem . 274 (48): 34196–202. DOI : 10.1074 / jbc.274.48.34196 . PMID 10567391 . 
  22. ^ a b Tang H, Sun X, Reinberg D, Ebright RH (февраль 1996 г.). «Белковые взаимодействия в инициации транскрипции эукариот: структура преинициативного комплекса» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 93 (3): 1119–24. Bibcode : 1996PNAS ... 93.1119T . DOI : 10.1073 / pnas.93.3.1119 . PMC 40041 . PMID 8577725 .  CS1 maint: uses authors parameter (link)
  23. ↑ Bushnell DA, Westover KD, Davis RE, Kornberg RD (февраль 2004 г.). «Структурная основа транскрипции: сокристалл РНК-полимеразы II-TFIIB на 4,5 Ангстрема». Наука . 303 (5660): 983–8. Bibcode : 2004Sci ... 303..983B . DOI : 10.1126 / science.1090838 . PMID 14963322 . S2CID 36598301 .  
  24. ^ DeJong J Бернштейн R, Редер RG (апрель 1995). «Общий фактор транскрипции человека TFIIA: характеристика кДНК, кодирующей малую субъединицу, и потребность в базальной и активированной транскрипции» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 92 (8): 3313–7. Bibcode : 1995PNAS ... 92.3313D . DOI : 10.1073 / pnas.92.8.3313 . PMC 42156 . PMID 7724559 .  
  25. ^ Озер J, K Mitsouras, Зерби D, Carey M, Либерман PM (июнь 1998). «Фактор транскрипции IIA дерепрессирует фактор, связанный с ТАТА-связывающим белком (ТВР), ингибирование связывания ТВР-ДНК» . J. Biol. Chem . 273 (23): 14293–300. DOI : 10.1074 / jbc.273.23.14293 . PMID 9603936 . 
  26. ↑ Sun X, Ma D, Sheldon M, Yeung K, Reinberg D (октябрь 1994). «Восстановление активности человеческого TFIIA из рекомбинантных полипептидов: роль в TFIID-опосредованной транскрипции» . Genes Dev . 8 (19): 2336–48. DOI : 10,1101 / gad.8.19.2336 . PMID 7958900 . 
  27. ^ Ruppert S, Tjian R (ноябрь 1995). «Человеческий TAFII250 взаимодействует с RAP74: последствия для инициации РНК-полимеразы II» . Genes Dev . 9 (22): 2747–55. DOI : 10,1101 / gad.9.22.2747 . PMID 7590250 . 
  28. ^ Malik S, M Guermah, Редер RG (март 1998). «Динамическая модель функции коактиватора PC4 в транскрипции РНК-полимеразы II» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 95 (5): 2192–7. Bibcode : 1998PNAS ... 95.2192M . DOI : 10.1073 / pnas.95.5.2192 . PMC 19292 . PMID 9482861 .  
  29. ^ Thut CJ, Goodrich JA, Tjian R (август 1997). «Репрессия p53-опосредованной транскрипции с помощью MDM2: двойной механизм» . Genes Dev . 11 (15): 1974–86. DOI : 10,1101 / gad.11.15.1974 . PMC 316412 . PMID 9271120 .  
  30. ^ Léveillard T, Василик B (декабрь 1997). «С-концевой участок MDM2 связывается с TAFII250 и необходим для регуляции MDM2 промотора циклина А» . J. Biol. Chem . 272 (49): 30651–61. DOI : 10.1074 / jbc.272.49.30651 . PMID 9388200 . 
  31. ^ Шетти S, Такахаши Т, Мацуи Н, Ayengar R, R Raghow (май 1999 г.). «Транскрипционная авторепрессия гена Msx1 опосредуется взаимодействиями белка Msx1 с мультибелковым транскрипционным комплексом, содержащим ТАТА-связывающий белок, Sp1 и белок-связывающий белок, связывающий элемент цАМФ (CBP / p300)» . Biochem. Дж . 339 (3): 751–8. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3390751 . PMC 1220213 . PMID 10215616 .  
  32. ^ Чжан Н, Ху G, Ван Н, Р Sciavolino, Илер Н, Шен ММ, Абате-Шен С (май 1997 года). «Гетеродимеризация гомеопротеинов Msx и Dlx приводит к функциональному антагонизму» . Мол. Клетка. Биол . 17 (5): 2920–32. DOI : 10.1128 / mcb.17.5.2920 . PMC 232144 . PMID 9111364 .  
  33. ^ Zhang H, Catron KM, Абате-Shen C (март 1996). «Роль гомеодомена Msx-1 в регуляции транскрипции: остатки в N-концевом плече опосредуют взаимодействие связывающего ТАТА белка и репрессию транскрипции» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 93 (5): 1764–9. Bibcode : 1996PNAS ... 93.1764Z . DOI : 10.1073 / pnas.93.5.1764 . PMC 39855 . PMID 8700832 .  
  34. ^ a b c d e f g h Беллорини М., Ли Д. К., Дантонель Дж. К., Земзуми К., Рёдер Р. Г., Тора Л., Мантовани Р. (июнь 1997 г.). «CCAAT, связывающий взаимодействия NF-Y-TBP: NF-YB и NF-YC требуют коротких доменов, соседних с их гистоновыми укороченными мотивами для ассоциации с основными остатками TBP» . Nucleic Acids Res . 25 (11): 2174–81. DOI : 10.1093 / NAR / 25.11.2174 . PMC 146709 . PMID 9153318 .  
  35. ^ Сето Е, Ушева А, Zambetti П., Моманд Дж, Хорикоси Н, Weinmann R, Левин AJ, Шенк Т (декабрь 1992). «Р53 дикого типа связывается с ТАТА-связывающим белком и подавляет транскрипцию» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 89 (24): 12028–32. Bibcode : 1992PNAS ... 8912028S . DOI : 10.1073 / pnas.89.24.12028 . PMC 50691 . PMID 1465435 .  
  36. ^ a b Cvekl A, Kashanchi F, Brady JN, Piatigorsky J (июнь 1999 г.). «Взаимодействие Pax-6 с ТАТА-бокс-связывающим белком и белком ретинобластомы». Вкладывать деньги. Офтальмол. Vis. Sci . 40 (7): 1343–50. PMID 10359315 . 
  37. ↑ Zwilling S, Annweiler A, Wirth T (май 1994). «Домены POU транскрипционных факторов Oct1 и Oct2 опосредуют специфическое взаимодействие с TBP» . Nucleic Acids Res . 22 (9): 1655–62. DOI : 10.1093 / nar / 22.9.1655 . PMC 308045 . PMID 8202368 .  
  38. ^ Guermah M, S Malik, Редер RG (июнь 1998). «Участие компонентов TFIID и USA в транскрипционной активации промотора вируса иммунодефицита человека с помощью NF-kappaB и Sp1» . Мол. Клетка. Биол . 18 (6): 3234–44. DOI : 10.1128 / mcb.18.6.3234 . PMC 108905 . PMID 9584164 .  
  39. ^ Schmitz ML, Stelzer G, H Альтман, Meisterernst M, Baeuerle PA (март 1995). «Взаимодействие COOH-концевого домена трансактивации p65 NF-каппа B с ТАТА-связывающим белком, фактором транскрипции IIB и коактиваторами» . J. Biol. Chem . 270 (13): 7219–26. DOI : 10.1074 / jbc.270.13.7219 . PMID 7706261 . 
  40. ^ Шульман IG, Chakravarti D, Juguilon H, Ромо А, Эванс RM (август 1995). «Взаимодействие между ретиноидным рецептором Х и консервативной областью ТАТА-связывающего белка опосредует гормонозависимую трансактивацию» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 92 (18): 8288–92. Bibcode : 1995PNAS ... 92.8288S . DOI : 10,1073 / пнас.92.18.8288 . PMC 41142 . PMID 7667283 .  
  41. ^ Siegert JL, Robbins PD (январь 1999). «Rb ингибирует внутреннюю киназную активность TATA-связывающего белка фактора TAFII250» . Мол. Клетка. Биол . 19 (1): 846–54. DOI : 10,1128 / MCB.19.1.846 . PMC 83941 . PMID 9858607 .  
  42. ^ a b c d Рупперт С., Ван Э. Х., Тьянь Р. (март 1993 г.). «Клонирование и экспрессия человеческого TAFII250: TBP-ассоциированный фактор, участвующий в регуляции клеточного цикла». Природа . 362 (6416): 175–9. Bibcode : 1993Natur.362..175R . DOI : 10.1038 / 362175a0 . PMID 7680771 . S2CID 4364676 .  
  43. ↑ O'Brien T, Tjian R (май 1998 г.). «Функциональный анализ N-концевого домена киназы TAFII250 человека». Мол. Cell . 1 (6): 905–11. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (00) 80089-1 . PMID 9660973 . 
  44. ^ a b c Pointud JC, Mengus G, Brancorsini S, Monaco L, Parvinen M, Sassone-Corsi P, Davidson I (май 2003 г.). «Внутриклеточная локализация TAF7L, паралогии субъединицы TAF7 фактора транскрипции TFIID, онтогенетически регулируется во время дифференцировки мужских половых клеток» . J. Cell Sci . 116 (Pt 9): 1847–58. DOI : 10,1242 / jcs.00391 . PMID 12665565 . 
  45. ^ Тао У, Guermah М, Мартинес Е, Oelgeschläger Т, Hasegawa S, R Такада, Ямамото Т, Хорикоси М, Рёдер RG (март 1997 г.). «Специфические взаимодействия и потенциальные функции человеческого TAFII100» . J. Biol. Chem . 272 (10): 6714–21. DOI : 10.1074 / jbc.272.10.6714 . PMID 9045704 . 
  46. ^ Martinez E, Palhan VB, Tjernberg A, Лымарь Е.С., Gamper А.М., Кунду Т.К., Хаит BT, Редер RG (октябрь 2001). «Комплекс STAGA человека представляет собой коактиватор транскрипции, ацетилирующий хроматин, который взаимодействует с факторами сплайсинга пре-мРНК и факторами связывания повреждений ДНК in vivo» . Мол. Клетка. Биол . 21 (20): 6782–95. DOI : 10.1128 / MCB.21.20.6782-6795.2001 . PMC 99856 . PMID 11564863 .  
  47. ^ a b Mengus G, May M, Jacq X, Staub A, Tora L, Chambon P, Davidson I (апрель 1995 г.). «Клонирование и характеристика hTAFII18, hTAFII20 и hTAFII28: трех субъединиц человеческого фактора транскрипции TFIID» . EMBO J . 14 (7): 1520–31. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07138.x . PMC 398239 . PMID 7729427 .  
  48. ^ Мая M, Mengus G, Лавин AC, Шамбон P, Дэвидсон I (июнь 1996). «Человеческий TAF (II28) способствует стимуляции транскрипции за счет активации функции 2 ретиноидных рецепторов X» . EMBO J . 15 (12): 3093–104. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00672.x . PMC 450252 . PMID 8670810 .  
  49. Перейти ↑ Hoffmann A, Roeder RG (июль 1996 г.). «Клонирование и характеристика человеческого TAF20 / 15. Множественные взаимодействия предполагают центральную роль в образовании комплекса TFIID» . J. Biol. Chem . 271 (30): 18194–202. DOI : 10.1074 / jbc.271.30.18194 . PMID 8663456 . 
  50. ^ Hochheimer A, Tjian R (июнь 2003). «Разнообразные комплексы инициации транскрипции увеличивают селективность промотора и тканеспецифическую экспрессию генов» . Гены и развитие . 17 (11): 1309–20. DOI : 10,1101 / gad.1099903 . PMID 12782648 . 
  51. ^ Pugh BF (сентябрь 2000). «Контроль экспрессии генов посредством регулирования ТАТА-связывающего белка». Джин . 255 (1): 1–14. DOI : 10.1016 / s0378-1119 (00) 00288-2 . PMID 10974559 . 
  52. ^ 1942-, Уивер, Роберт Франклин (1 января 2012 г.). Молекулярная биология . Макгроу-Хилл. ISBN 9780073525327. OCLC  789601172 .CS1 maint: numeric names: authors list (link)
  53. ↑ Громче RK, He Y, López-Blanco JR, Fang J, Chacón P, Nogales E (март 2016 г.). «Структура TFIID, связанного с промотором, и модель сборки человеческого комплекса до инициации» . Природа . 531 (7596): 604–9. Bibcode : 2016Natur.531..604L . DOI : 10.1038 / nature17394 . PMC 4856295 . PMID 27007846 .  
  54. ^ Дэвидсон I (июль 2003 г.). «Генетика ТВР и факторов, связанных с ТВР». Направления биохимических наук . 28 (7): 391–8. DOI : 10.1016 / S0968-0004 (03) 00117-8 . PMID 12878007 . 
  55. ^ Николов ДБ, Ху Ш., Лин Дж., Гаш А, Хоффманн А, Хорикоши М, Чуа Н.Х., Рёдер Р.Г., Берли СК (ноябрь 1992 г.). «Кристаллическая структура связывающего белка TFIID TATA-бокса». Природа . 360 (6399): 40–6. Bibcode : 1992Natur.360 ... 40N . DOI : 10.1038 / 360040a0 . PMID 1436073 . S2CID 4307043 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о спиноцеребеллярной атаксии 17 типа
  • Интерактивная структура TBP на massey.ac.nz
  • PDB Молекула месяца ТАТА-связывающий белок
  • TATA-Box + Binding + Protein в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
  • FactorBook TBP
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P20226 (белок, связывающий TATA-бокс человека) в PDBe-KB .