Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлен из связывающего белка ТАТА )
Перейти к навигации Перейти к поиску

TBP
Белок TBP PDB 1c9b.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1TGH , 1C9B , 1JFI , 1NVP , 4ROC , 4ROE , 4ROD , 5IY9 , 5IYA , 5FUR , 5IYC , 5IYB , 5IY7 , 5IY8 , 5IYD , 5IY6

Идентификаторы
ПсевдонимыTBP , GTF2D, GTF2D1, HDL4, SCA17, TFIID, TATA-бокс-связывающий белок, TATA-связывающий белок
Внешние идентификаторыOMIM : 600075 MGI : 101838 HomoloGene : 2404 GeneCards : ТВР
Расположение гена ( человек )
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человека) [1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение TBP
Геномное расположение TBP
Группа6q27Начинать170 554 302 п.н. [1]
Конец170 572 870 п.н. [1]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE TBP 203135 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• Связывание ДНК
• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции
• Связывание фактора транскрипции
• Связывание ДНК с цис-регуляторной областью РНК-полимеразы II GO: 0000980, специфичное для последовательности
• Белок GO: 0001948 связывание
• РНК - полимераза II подавляя фактор транскрипция связывания
• фермента связывания
• подавляя связывания фактора транскрипции
• TFIIB класс связывания фактора транскрипции
• арил углеводородное связывание рецептора
• ГО: 0001158 ядра промотора проксимальной области последовательности специфических ДНК - связывающий
• ГО: 0001200, ГО: 0001133, ГО: 0001201 ДНК-связывающий фактор активности транскрипции РНК - полимеразы II , специфичные
• транскрипционный фактор активности, ядро РНК - полимеразы III связывания
• ГО: 0000983 РНК - полимеразы II общей транскрипции фактор инициации активности
• РНК - полимеразы II ядро Связывание ДНК, специфичное для промоторной последовательности
• Связывание с ДНК регуляторной области РНК-полимеразы III
Сотовый компонент• цитоплазма
• ядерный эухроматин
• комплекс фактора транскрипции TFIID
• мужской пронуклеус
• женский пронуклеус
• нуклеоплазма
• комплекс фактора транскрипции TFIIA
• пронуклеус
• ядерный хроматин
• ядро клетки
• комплекс преинициации транскрипции
• макромолекулярный комплекс
• комплекс фактора транскрипции TFIIIB
• комплекс регулятора транскрипции
Биологический процесс• прекращение транскрипции РНК-полимеразы I
• позитивная регуляция экспрессии генов, эпигенетика
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы I
• транскрипция, шаблон ДНК
• позитивная регуляция транскрипции, шаблон ДНК
• сперматогенез
• ДНК - предполагаемая транскрипция, инициация
• инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• транскрипция мяРНК с промотора РНК-полимеразы II
• регуляция передачи сигнала медиатором класса p53
• вирусный процесс GO: 0022415
• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы III
• транскрипция с промотора РНК-полимеразы II
• транскрипция с промотора РНК-полимеразы III
• сборка комплекса преинициации транскрипции РНК-полимеразы II
• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• сборка комплекса преинициации транскрипции РНК-полимеразы III
• удлинение транскрипции от промотора РНК-полимеразы I
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

6908

21374

Ансамбль

ENSG00000112592

ENSMUSG00000014767

UniProt

P20226

P29037

RefSeq (мРНК)

NM_003194
NM_001172085

NM_013684

RefSeq (белок)

NP_001165556
NP_003185

NP_038712

Расположение (UCSC)Chr 6: 170,55 - 170,57 Мбн / д
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши
TBP
кристаллическая структура тройного комплекса дрожжей brf1-tbp-dna
Идентификаторы
СимволTBP
PfamPF00352
Клан пфамCL0407
ИнтерПроIPR000814
PROSITEPDOC00303
SCOP21tbp / SCOPe / SUPFAM
Доступные белковые структуры:
Pfam  структуры / ECOD  
PDBRCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumкраткое изложение структуры

ТАТА-связывающий белок ( ТВР ) представляет собой общий фактор транскрипции , который специфически связывается с ДНК - последовательностью называется ТАТА - бокс . Эта последовательность ДНК находится примерно в 30 парах оснований перед сайтом начала транскрипции в промоторах некоторых эукариотических генов . [4]

Семейство генов TBP [ править ]

TBP является членом небольшого семейства генов факторов, связанных с TBP. [5] Первый фактор, связанный с ТВР (TRF / TRF1), был идентифицирован у плодовой мухи Drosophila , но, по-видимому, специфичен для мух или насекомых. Впоследствии TBPL1 / TRF2 был обнаружен в геномах многих многоклеточных , тогда как геномы позвоночных кодируют третьего члена семейства позвоночных, TBPL2 / TRF3. В определенных типах клеток или на определенных промоторах TBP может быть заменен одним из этих факторов, связанных с TBP, некоторые из которых взаимодействуют с боксом TATA аналогично TBP.

Роль как фактор транскрипции [ править ]

TBP является субъединицей общего транскрипционного фактора эукариот TFIID . TFIID первый белок для связывания с ДНК во время формирования транскрипции преиниационного комплекса из РНК - полимеразы II (РНК Pol II). [6] Являясь одним из немногих белков в преинициационном комплексе, который связывает ДНК специфическим для последовательности образом, он помогает позиционировать РНК-полимеразу II над сайтом начала транскрипции гена. Однако, по оценкам, только 10–20% промоторов человека имеют боксы ТАТА. Следовательно, TBP, вероятно, не единственный белок, участвующий в позиционировании РНК-полимеразы II. Большинство промоторов человека являются промоторами генов домашнего хозяйства без ТАТА. . Связывание ТВР с этими промоторами облегчается регуляторами генов домашнего хозяйства. [7] [8] Интересно, что транскрипция инициируется в узкой области примерно на 30 п.н. ниже ТАТА-бокса на ТАТА-содержащих промоторах [9], в то время как сайты начала транскрипции промоторов без ТАТА рассредоточены в области 200 п.н. [10] [8]

Связывание TFIID с ТАТА-боксом в промоторной области гена инициирует рекрутирование других факторов, необходимых для начала транскрипции РНК Pol II. Некоторые из других задействованных факторов транскрипции включают TFIIA , TFIIB и TFIIF . Каждый из этих факторов транскрипции содержит несколько белковых субъединиц.

TBP также важен для транскрипции РНК-полимеразой I и РНК-полимеразой III и, следовательно, участвует в инициации транскрипции всеми тремя РНК-полимеразами. [11]

TBP участвует в плавлении ДНК (разделении двух цепей), изгибая ДНК на 80 ° (последовательность, богатая AT, с которой он связывается, способствует легкому плавлению). TBP - необычный белок, который связывает малую бороздку с помощью β-листа.

Еще одна отличительная особенность ТВР - длинная цепочка глутаминов на N-конце белка. Эта область модулирует активность связывания ДНК на С-конце, а модуляция связывания ДНК влияет на скорость образования транскрипционных комплексов и инициацию транскрипции. Мутации, которые увеличивают количество повторов CAG, кодирующих этот полиглутаминовый тракт , и, таким образом, увеличивают длину полиглутаминовой цепочки, связаны со спиноцеребеллярной атаксией 17, нейродегенеративным расстройством, классифицируемым как полиглутаминовое заболевание . [12]

ДНК-белковые взаимодействия [ править ]

Когда ТВР связывается с ТАТА-боксом внутри ДНК , он искажает ДНК, вставляя боковые цепи аминокислот между парами оснований, частично раскручивая спираль и дважды изгибая ее. Искажение достигается за счет большого количества поверхностного контакта между белком и ДНК. ТВР связывается с отрицательно заряженными фосфатами в основной цепи ДНК через положительно заряженные аминокислотные остатки лизина и аргинина . Резкий изгиб ДНК создается за счет проецирования четырех объемных остатков фенилаланина в малую бороздку. По мере изгиба ДНК ее контакт с ТВР увеличивается, тем самым усиливая взаимодействие ДНК-белок.

Напряжение, наложенное на ДНК в результате этого взаимодействия, вызывает плавление или разделение цепей. Поскольку эта область ДНК богата остатками аденина и тимина , пары оснований которых связаны только двумя водородными связями , нити ДНК легче разделяются. Разделение двух цепей открывает основания и позволяет РНК-полимеразе II начать транскрипцию гена .

C-конец TBP имеет спиралевидную форму, которая (не полностью) дополняет область TATA ДНК. Эта неполнота позволяет ДНК пассивно склоняться к связыванию.

Для получения информации об использовании TBP в клетках см .: РНК-полимераза I , РНК-полимераза II и РНК-полимераза III .

Белковые взаимодействия [ править ]

Было показано, что ТАТА-связывающий белок взаимодействует с:

  • BRF1 , [13] [14]
  • BTAF1 , [15] [16]
  • C-Fos , [17]
  • C-июн , [18]
  • EDF1 , [19] [20] [21]
  • GTF2B (TFIIB), [22] [23]
  • GTF2A1 ( субъединица 1 TFIIA ), [22] [24] [25] [26]
  • GTF2F1 ( субъединица 1 TFIIF ) [15] [27] [28]
  • GTF2H4 ( субъединица 4 TFIIH ), [15]
  • Mdm2 , [29] [30]
  • MSX1 , [31] [32] [33]
  • NFYB , [34]
  • P53 , [35] [36]
  • PAX6 , [36]
  • POLR2A , [15]
  • ПОУ2Ф1 , [37]
  • РЕЛА , [38] [39]
  • NR2B1 , [40]
  • TAF1 , [34] [41] [42] [43]
  • TAF4 , [44]
  • TAF5 , [34] [42] [45]
  • TAF6 , [34] [42] [44]
  • TAF7 , [34] [44]
  • TAF9 . [34] [46]
  • TAF10 , [34] [42]
  • TAF11 , [34] [47] [48]
  • TAF13 , [47] и
  • TAF15 . [49]

Сложная сборка [ править ]

Белок, связывающий ТАТА-бокс (ТВР), необходим для инициации транскрипции РНК- полимеразами I, II и III с промоторов с ТАТА-боксом или без него. [50] [51] В присутствии промотора, не содержащего TATA, TBP связывается с помощью TBP-ассоциированных факторов (TAF). [52] [53] TBP связывается с множеством факторов, включая общие факторы транскрипции TFIIA, -B, -D, -E и -H, с образованием огромных мультисубъединичных преинициативных комплексов на коровом промоторе . Благодаря своей ассоциации с различными факторами транскрипции , TBP может инициировать транскрипцию.из разных РНК- полимераз . Существует несколько родственных TBP, включая TBP-подобные (TBPL) белки . [54]

Структура [ править ]

С-концевое ядро ​​ТВР (~ 180 остатков) является высококонсервативным и содержит два 88-аминокислотных повтора, которые образуют седловидную структуру , охватывающую ДНК; эта область связывается с ТАТА-боксом и взаимодействует с факторами транскрипции и регуляторными белками . [55] Напротив, N-концевой участок различается как по длине, так и по последовательности .

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000112592 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. Перейти ↑ Kornberg RD (2007). «Молекулярные основы эукариотической транскрипции» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 104 (32): 12955–61. Bibcode : 2007PNAS..10412955K . DOI : 10.1073 / pnas.0704138104 . PMC 1941834 . PMID 17670940 .  
  5. ↑ Akhtar W, Veenstra GJ (1 января 2011 г.). «Факторы, связанные с ТВР: парадигма разнообразия в инициации транскрипции» . Cell & Bioscience . 1 (1): 23. DOI : 10,1186 / 2045-3701-1-23 . PMC 3142196 . PMID 21711503 .  
  6. Перейти ↑ Lee TI, Young RA (2000). «Транскрипция генов, кодирующих эукариотические белки». Ежегодный обзор генетики . 34 : 77–137. DOI : 10.1146 / annurev.genet.34.1.77 . PMID 11092823 . 
  7. ^ Лам KC, Mühlpfordt F, Vaquerizas JM, Raja SJ, Holz H, Luscombe NM, Manke T, Akhtar A (2012). «Комплекс NSL регулирует гены домашнего хозяйства у дрозофилы» . PLOS Genetics . 8 (6): e1002736. DOI : 10.1371 / journal.pgen.1002736 . PMC 3375229 . PMID 22723752 .  
  8. ^ a b Лам К.С., Чунг Х.Р., Семплицио Г., Айер С.С., Гауб А, Бхардвадж В., Хольц Х., Георгиев П., Ахтар А. «Нуклеосомный ландшафт, опосредованный комплексом NSL, необходим для поддержания точности транскрипции и подавления транскрипционного шума» . Гены и развитие . 33 (7–8): 452–465. DOI : 10,1101 / gad.321489.118 . PMC 6446542 . PMID 30819819 .  
  9. ^ Carninci Р, Санделин А, Lenhard В, С Катаяма, Симокава К, Ponjavic Дж, и др. (Июнь 2006 г.). «Полногеномный анализ архитектуры и эволюции промоторов млекопитающих». Генетика природы . 38 (6): 626–35. DOI : 10.1038 / ng1789 . PMID 16645617 . S2CID 22205897 .  
  10. ↑ Ni T, Corcoran DL, Rach EA, Song S, Spana EP, Gao Y, Ohler U, Zhu J (июль 2010 г.). «Стратегия парного секвенирования для картирования сложного ландшафта инициации транскрипции» . Методы природы . 7 (7): 521–7. DOI : 10.1038 / nmeth.1464 . PMC 3197272 . PMID 20495556 .  
  11. ^ Vannini A, Крамер P (февраль 2012). «Сохранение между механизмами инициации транскрипции РНК-полимеразы I, II и III» . Молекулярная клетка . 45 (4): 439–46. DOI : 10.1016 / j.molcel.2012.01.023 . PMID 22365827 . 
  12. ^ "Entrez Gene: TBP TATA бокс-связывающий белок" .
  13. Перейти ↑ McCulloch V, Hardin P, Peng W, Ruppert JM, Lobo-Ruppert SM (август 2000 г.). «Альтернативно сплайсированные варианты hBRF функционируют на различных промоторах РНК-полимеразы III» . EMBO J . 19 (15): 4134–43. DOI : 10.1093 / emboj / 19.15.4134 . PMC 306597 . PMID 10921893 .  
  14. Перейти ↑ Wang Z, Roeder RG (июль 1995 г.). «Структура и функция субъединицы фактора транскрипции TFIIIB человека, которая является эволюционно консервативной и содержит домены, связанные как с TFIIB, так и с белком 2 группы высокой подвижности» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 92 (15): 7026–30. Bibcode : 1995PNAS ... 92.7026W . DOI : 10.1073 / pnas.92.15.7026 . PMC 41464 . PMID 7624363 .  
  15. ^ a b c d Скалли Р., Андерсон С.Ф., Чао Д.М., Вей В., Йе Л., Янг Р.А., Ливингстон Д.М., Парвин Д.Д. (май 1997 г.). «BRCA1 является компонентом холофермента РНК-полимеразы II» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 94 (11): 5605–10. Bibcode : 1997PNAS ... 94.5605S . DOI : 10.1073 / pnas.94.11.5605 . PMC 20825 . PMID 9159119 .  
  16. ^ Chicca JJ, Auble DT, Pugh BF (март 1998). «Клонирование и биохимическая характеристика TAF-172, человеческого гомолога дрожжевого Mot1» . Мол. Клетка. Биол . 18 (3): 1701–10. DOI : 10,1128 / MCB.18.3.1701 . PMC 108885 . PMID 9488487 .  
  17. ^ Metz R, Баннистер AJ, Sutherland JA, Hagemeier C, О'Рурк EC, Кук A, Bravo R, Kouzarides T (сентябрь 1994). «c-Fos-индуцированная активация промотора, содержащего ТАТА-бокс, включает прямой контакт со связывающим ТАТА-бокс белком» . Мол. Клетка. Биол . 14 (9): 6021–9. DOI : 10,1128 / MCB.14.9.6021 . PMC 359128 . PMID 8065335 .  
  18. Перейти ↑ Franklin CC, McCulloch AV, Kraft AS (февраль 1995 г.). «Связь in vitro между семейством белков Jun и общими факторами транскрипции, TBP и TFIIB» . Биохим. Дж . 305 (3): 967–74. DOI : 10.1042 / bj3050967 . PMC 1136352 . PMID 7848298 .  
  19. Перейти ↑ Brendel C, Gelman L, Auwerx J (июнь 2002 г.). «Мультибелковый мостиковый фактор-1 (MBF-1) является кофактором ядерных рецепторов, регулирующих метаболизм липидов» . Мол. Эндокринол . 16 (6): 1367–77. DOI : 10.1210 / mend.16.6.0843 . PMID 12040021 . 
  20. ^ Мариотти M, De БЕНЕДИКТИС L, Avon E, Maier JA (август 2000). «Взаимодействие между фактором-1, связанным с дифференцировкой эндотелия, и кальмодулином in vitro и in vivo» . J. Biol. Chem . 275 (31): 24047–51. DOI : 10.1074 / jbc.M001928200 . PMID 10816571 . 
  21. ^ Kabe Y, Гото М, Shima D, Имаи Т, Т Вада, Морохаш Кий, Сиракав М, Такефус S, Ханда Н (ноябрь 1999 года). «Роль человеческого MBF1 как транскрипционного коактиватора» . J. Biol. Chem . 274 (48): 34196–202. DOI : 10.1074 / jbc.274.48.34196 . PMID 10567391 . 
  22. ^ a b Tang H, Sun X, Reinberg D, Ebright RH (февраль 1996 г.). «Белковые взаимодействия в инициации эукариотической транскрипции: структура преинициативного комплекса» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 93 (3): 1119–24. Bibcode : 1996PNAS ... 93.1119T . DOI : 10.1073 / pnas.93.3.1119 . PMC 40041 . PMID 8577725 .  CS1 maint: uses authors parameter (link)
  23. Перейти ↑ Bushnell DA, Westover KD, Davis RE, Kornberg RD (февраль 2004 г.). «Структурная основа транскрипции: сокристалл РНК-полимеразы II-TFIIB при 4,5 Ангстрема». Наука . 303 (5660): 983–8. Bibcode : 2004Sci ... 303..983B . DOI : 10.1126 / science.1090838 . PMID 14963322 . S2CID 36598301 .  
  24. ^ DeJong J Бернштейн R, Редер RG (апрель 1995). «Общий фактор транскрипции человека TFIIA: характеристика кДНК, кодирующей малую субъединицу, и потребность в базовой и активированной транскрипции» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 92 (8): 3313–7. Bibcode : 1995PNAS ... 92.3313D . DOI : 10.1073 / pnas.92.8.3313 . PMC 42156 . PMID 7724559 .  
  25. ^ Озер J, K Mitsouras, Зерби D, Carey M, Либерман PM (июнь 1998). «Фактор транскрипции IIA дерепрессирует фактор, связанный с ТАТА-связывающим белком (ТВР), ингибирование связывания ТВР-ДНК» . J. Biol. Chem . 273 (23): 14293–300. DOI : 10.1074 / jbc.273.23.14293 . PMID 9603936 . 
  26. ↑ Sun X, Ma D, Sheldon M, Yeung K, Reinberg D (октябрь 1994). «Восстановление активности человеческого TFIIA из рекомбинантных полипептидов: роль в TFIID-опосредованной транскрипции» . Genes Dev . 8 (19): 2336–48. DOI : 10,1101 / gad.8.19.2336 . PMID 7958900 . 
  27. ^ Ruppert S, Tjian R (ноябрь 1995). «Человеческий TAFII250 взаимодействует с RAP74: последствия для инициации РНК-полимеразы II» . Genes Dev . 9 (22): 2747–55. DOI : 10,1101 / gad.9.22.2747 . PMID 7590250 . 
  28. ^ Malik S, M Guermah, Редер RG (март 1998). «Динамическая модель функции коактиватора PC4 в транскрипции РНК-полимеразы II» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 95 (5): 2192–7. Bibcode : 1998PNAS ... 95.2192M . DOI : 10.1073 / pnas.95.5.2192 . PMC 19292 . PMID 9482861 .  
  29. ^ Thut CJ, Goodrich JA, Tjian R (август 1997). «Репрессия p53-опосредованной транскрипции с помощью MDM2: двойной механизм» . Genes Dev . 11 (15): 1974–86. DOI : 10,1101 / gad.11.15.1974 . PMC 316412 . PMID 9271120 .  
  30. ^ Léveillard T, Василик B (декабрь 1997). «С-концевой участок MDM2 связывается с TAFII250 и необходим для регуляции MDM2 промотора циклина А» . J. Biol. Chem . 272 (49): 30651–61. DOI : 10.1074 / jbc.272.49.30651 . PMID 9388200 . 
  31. ^ Шетти S, Такахаши Т, Мацуи Н, Ayengar R, R Raghow (май 1999 г.). «Транскрипционная авторепрессия гена Msx1 опосредуется взаимодействиями белка Msx1 с мультибелковым транскрипционным комплексом, содержащим ТАТА-связывающий белок, Sp1 и белок-связывающий белок, связывающий элемент цАМФ (CBP / p300)» . Биохим. Дж . 339 (3): 751–8. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3390751 . PMC 1220213 . PMID 10215616 .  
  32. ^ Чжан Н, Ху G, Ван Н, Р Sciavolino, Илер Н, Шен ММ, Абате-Шен С (май 1997 года). «Гетеродимеризация гомеопротеинов Msx и Dlx приводит к функциональному антагонизму» . Мол. Клетка. Биол . 17 (5): 2920–32. DOI : 10.1128 / mcb.17.5.2920 . PMC 232144 . PMID 9111364 .  
  33. ^ Zhang H, Catron KM, Абате-Shen C (март 1996). «Роль гомеодомена Msx-1 в регуляции транскрипции: остатки в N-концевом плече опосредуют взаимодействие связывающего ТАТА белка и репрессию транскрипции» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 93 (5): 1764–9. Bibcode : 1996PNAS ... 93.1764Z . DOI : 10.1073 / pnas.93.5.1764 . PMC 39855 . PMID 8700832 .  
  34. ^ a b c d e f g h Беллорини М., Ли Д. К., Дантонель Дж. К., Земзуми К., Рёдер Р. Г., Тора Л., Мантовани Р. (июнь 1997 г.). «CCAAT, связывающий взаимодействия NF-Y-TBP: NF-YB и NF-YC требуют коротких доменов, соседних с их гистоновыми укороченными мотивами для ассоциации с основными остатками TBP» . Nucleic Acids Res . 25 (11): 2174–81. DOI : 10.1093 / NAR / 25.11.2174 . PMC 146709 . PMID 9153318 .  
  35. ^ Сето Е, Ушева А, Zambetti П., Моманд Дж, Хорикоси Н, Weinmann R, Левин AJ, Шенк Т (декабрь 1992). «Р53 дикого типа связывается с ТАТА-связывающим белком и подавляет транскрипцию» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 89 (24): 12028–32. Bibcode : 1992PNAS ... 8912028S . DOI : 10.1073 / pnas.89.24.12028 . PMC 50691 . PMID 1465435 .  
  36. ^ a b Cvekl A, Kashanchi F, Brady JN, Piatigorsky J (июнь 1999 г.). «Взаимодействие Pax-6 с ТАТА-бокс-связывающим белком и белком ретинобластомы». Вкладывать деньги. Офтальмол. Vis. Sci . 40 (7): 1343–50. PMID 10359315 . 
  37. ↑ Zwilling S, Annweiler A, Wirth T (май 1994). «Домены POU транскрипционных факторов Oct1 и Oct2 опосредуют специфическое взаимодействие с TBP» . Nucleic Acids Res . 22 (9): 1655–62. DOI : 10.1093 / nar / 22.9.1655 . PMC 308045 . PMID 8202368 .  
  38. ^ Guermah M, S Malik, Редер RG (июнь 1998). «Участие компонентов TFIID и USA в транскрипционной активации промотора вируса иммунодефицита человека с помощью NF-kappaB и Sp1» . Мол. Клетка. Биол . 18 (6): 3234–44. DOI : 10.1128 / mcb.18.6.3234 . PMC 108905 . PMID 9584164 .  
  39. ^ Schmitz ML, Stelzer G, H Альтман, Meisterernst M, Baeuerle PA (март 1995). «Взаимодействие COOH-концевого домена трансактивации p65 NF-каппа B с ТАТА-связывающим белком, фактором транскрипции IIB и коактиваторами» . J. Biol. Chem . 270 (13): 7219–26. DOI : 10.1074 / jbc.270.13.7219 . PMID 7706261 . 
  40. ^ Шульман IG, Chakravarti D, Juguilon H, Ромо А, Эванс RM (август 1995). «Взаимодействия между ретиноидным рецептором Х и консервативной областью ТАТА-связывающего белка опосредуют гормонозависимую трансактивацию» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 92 (18): 8288–92. Bibcode : 1995PNAS ... 92.8288S . DOI : 10.1073 / pnas.92.18.8288 . PMC 41142 . PMID 7667283 .  
  41. ^ Siegert JL, Robbins PD (январь 1999). «Rb ингибирует внутреннюю киназную активность ТАТА-связывающего белка фактора TAFII250» . Мол. Клетка. Биол . 19 (1): 846–54. DOI : 10,1128 / MCB.19.1.846 . PMC 83941 . PMID 9858607 .  
  42. ^ a b c d Рупперт С., Ван Э. Х., Тьянь Р. (март 1993 г.). «Клонирование и экспрессия человеческого TAFII250: TBP-ассоциированный фактор, участвующий в регуляции клеточного цикла». Природа . 362 (6416): 175–9. Bibcode : 1993Natur.362..175R . DOI : 10.1038 / 362175a0 . PMID 7680771 . S2CID 4364676 .  
  43. ↑ O'Brien T, Tjian R (май 1998 г.). «Функциональный анализ N-концевого домена киназы TAFII250 человека». Мол. Cell . 1 (6): 905–11. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (00) 80089-1 . PMID 9660973 . 
  44. ^ a b c Pointud JC, Mengus G, Brancorsini S, Monaco L, Parvinen M, Sassone-Corsi P, Davidson I (май 2003 г.). «Внутриклеточная локализация TAF7L, паралогии субъединицы TAF7 фактора транскрипции TFIID, онтогенетически регулируется во время дифференцировки мужских половых клеток» . J. Cell Sci . 116 (Pt 9): 1847–58. DOI : 10,1242 / jcs.00391 . PMID 12665565 . 
  45. ^ Тао У, Guermah М, Мартинес Е, Oelgeschläger Т, Hasegawa S, R Такада, Ямамото Т, Хорикоси М, Рёдер RG (март 1997 г.). «Специфические взаимодействия и потенциальные функции человеческого TAFII100» . J. Biol. Chem . 272 (10): 6714–21. DOI : 10.1074 / jbc.272.10.6714 . PMID 9045704 . 
  46. ^ Martinez E, Palhan VB, Tjernberg A, Лымарь Е.С., Gamper А.М., Кунду Т.К., Хаит BT, Редер RG (октябрь 2001). «Комплекс STAGA человека представляет собой коактиватор транскрипции, ацетилирующий хроматин, который взаимодействует с факторами сплайсинга пре-мРНК и факторами связывания повреждений ДНК in vivo» . Мол. Клетка. Биол . 21 (20): 6782–95. DOI : 10.1128 / MCB.21.20.6782-6795.2001 . PMC 99856 . PMID 11564863 .  
  47. ^ a b Mengus G, May M, Jacq X, Staub A, Tora L, Chambon P, Davidson I (апрель 1995 г.). «Клонирование и характеристика hTAFII18, hTAFII20 и hTAFII28: трех субъединиц человеческого фактора транскрипции TFIID» . EMBO J . 14 (7): 1520–31. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07138.x . PMC 398239 . PMID 7729427 .  
  48. ^ Мая M, Mengus G, Лавин AC, Шамбон P, Дэвидсон I (июнь 1996). «Человеческий TAF (II28) способствует стимуляции транскрипции за счет активации функции 2 ретиноидных Х-рецепторов» . EMBO J . 15 (12): 3093–104. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00672.x . PMC 450252 . PMID 8670810 .  
  49. Перейти ↑ Hoffmann A, Roeder RG (июль 1996 г.). «Клонирование и характеристика человеческого TAF20 / 15. Множественные взаимодействия предполагают центральную роль в образовании комплекса TFIID» . J. Biol. Chem . 271 (30): 18194–202. DOI : 10.1074 / jbc.271.30.18194 . PMID 8663456 . 
  50. ^ Hochheimer A, Tjian R (июнь 2003). «Разнообразные комплексы инициации транскрипции увеличивают селективность промотора и тканеспецифическую экспрессию генов» . Гены и развитие . 17 (11): 1309–20. DOI : 10,1101 / gad.1099903 . PMID 12782648 . 
  51. ^ Pugh BF (сентябрь 2000). «Контроль экспрессии генов посредством регуляции ТАТА-связывающего белка». Джин . 255 (1): 1–14. DOI : 10.1016 / s0378-1119 (00) 00288-2 . PMID 10974559 . 
  52. ^ 1942-, Уивер, Роберт Франклин (1 января 2012 г.). Молекулярная биология . Макгроу-Хилл. ISBN 9780073525327. OCLC  789601172 .CS1 maint: numeric names: authors list (link)
  53. ↑ Громче RK, He Y, López-Blanco JR, Fang J, Chacón P, Nogales E (март 2016). «Структура TFIID, связанного с промотором, и модель сборки человеческого комплекса до инициации» . Природа . 531 (7596): 604–9. Bibcode : 2016Natur.531..604L . DOI : 10.1038 / nature17394 . PMC 4856295 . PMID 27007846 .  
  54. ↑ Дэвидсон I (июль 2003 г.). «Генетика ТВР и факторов, связанных с ТВР». Направления биохимических наук . 28 (7): 391–8. DOI : 10.1016 / S0968-0004 (03) 00117-8 . PMID 12878007 . 
  55. ^ Николов ДБ, Ху Ш., Лин Дж., Гаш А, Хоффманн А, Хорикоши М, Чуа Н.Х., Рёдер Р.Г., Берли СК (ноябрь 1992). «Кристаллическая структура связывающего белка TFIID TATA-бокса». Природа . 360 (6399): 40–6. Bibcode : 1992Natur.360 ... 40N . DOI : 10.1038 / 360040a0 . PMID 1436073 . S2CID 4307043 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о спиноцеребеллярной атаксии 17 типа
  • Интерактивная структура TBP на massey.ac.nz
  • PDB Molecule of the Month ТАТА-связывающий белок
  • TATA-Box + Binding + Protein в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
  • FactorBook TBP
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P20226 (белок, связывающий TATA-бокс человека) в PDBe-KB .