Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
TBX21
Идентификаторы
ПсевдонимыTBX21 , T-PET, T-bet, TBET, TBLYM, T-box 21, фактор транскрипции T-box 21
Внешние идентификаторыOMIM : 604895 MGI : 1888984 HomoloGene : 8353 GeneCards : TBX21
Расположение гена ( человек )
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человека) [1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение TBX21
Геномное расположение TBX21
Группа17q21.32Начинать47 733 236 п.н. [1]
Конец47 746 122 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 11 (мышь)
Chr.Хромосома 11 (мышь) [2]
Хромосома 11 (мышь)
Геномное расположение TBX21
Геномное расположение TBX21
Группа11 | 11 ДНачинать97 098 071 п.н. [2]
Конец97 115 331 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE TBX21 220684 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции
• Связывание ДНК
• GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично
для РНК-полимеразы II • Связывание с ДНК, специфичное для последовательности
• Связывание с белком GO: 0001948
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II
Сотовый компонент• тело нейрональной клетки
• ядро клетки
Биологический процесс• развитие многоклеточного организма
• позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• клеточный ответ на органическое вещество
• позитивная регуляция переключения изотипа на изотипы IgG
• ответ на вирус
• дифференцировка Т-клеток
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• миграция лимфоцитов
• транскрипция, На основе ДНК
• регуляция иммунного ответа
• негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• негативная регуляция продукции интерлейкина-2
• протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс
• регуляция дифференцировки Т-клеток
• негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• негативная регуляция дифференцировки Т-хелперов 17 клеток
• негативная регуляция коммитирования клонов Т-хелперов 17
• негативная регуляция Т -помощь выработке цитокинов 2 клетками
• положительная регуляция экспрессии генов
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

30009

57765

Ансамбль

ENSG00000073861

ENSMUSG00000001444

UniProt

Q9UL17

Q9JKD8

RefSeq (мРНК)

NM_013351

NM_019507

RefSeq (белок)

NP_037483

NP_062380

Расположение (UCSC)Chr 17: 47.73 - 47.75 МбChr 11: 97.1 - 97.12 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Т-бокс фактор транскрипции TBX21 , также называемый Т-бет (Т-бокс выражается в Т - клетках) представляет собой белок , который у человека кодируется TBX21 гена . [5]

Функция [ править ]

Этот ген является членом филогенетически консервативного семейства генов, которые имеют общий ДНК-связывающий домен , Т-бокс . Гены Т-бокса кодируют факторы транскрипции, участвующие в регуляции процессов развития. Этот ген является человеческим ортологом гена Tbx21 / Tbet мыши. Исследования на мышах показывают, что белок Tbx21 является специфическим для клеток Th1 фактором транскрипции, который контролирует экспрессию отличительного цитокина Th1, интерферона-гамма ( IFNG ). Экспрессия ортолога человека также коррелирует с экспрессией IFNG в Th1 и естественных клетках-киллерах, предполагая роль этого гена в инициации развития линии Th1 из наивных клеток-предшественников Th. [5]

Роль в болезни [ править ]

Астма [ править ]

Фактором транскрипции, кодируемым TBX21, является T-bet, который регулирует развитие наивных Т-лимфоцитов . Астма - это заболевание хронического воспаления, и известно, что у трансгенных мышей, рожденных без TBX21, спонтанно развиваются нарушения функции легких, соответствующие астме. Считается, что TBX21, таким образом, также может играть роль в развитии астмы у людей. [6]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000073861 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001444 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ a b «Энтрез Джин: TBX21 T-box 21» .
  6. ^ Tantisira KG, Hwang Е.С., Raby Б.А., Silverman Е.С., озеро SL, Рихтер BG, Peng SL, Drazen JM, Глимчер LH и Вайс ST (декабрь 2004). «TBX21: функциональный вариант предсказывает улучшение при астме при использовании ингаляционных кортикостероидов» . PNAS . 101 (52): 18099–18104. DOI : 10.1073 / pnas.0408532102 . PMC 539815 . PMID 15604153 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID  9373149 .
  • Сабо С.Дж., Ким С.Т., Коста Г.Л., Чжан Икс, Фатман К.Г., Глимчер Л.Х. (март 2000 г.). «Новый фактор транскрипции, T-bet, управляет приверженностью к линии Th1». Cell . 100 (6): 655–69. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80702-3 . PMID  10761931 . S2CID  14326322 .
  • Чжан В.X., Ян С.Ю. (ноябрь 2000 г.). «Клонирование и характеристика нового члена семейства генов T-box». Геномика . 70 (1): 41–8. DOI : 10.1006 / geno.2000.6361 . PMID  11087660 .
  • Faedo A, Ficara F, Ghiani M, Aiuti A, Rubenstein JL, Bulfone A (август 2002 г.). «Развитие экспрессии фактора транскрипции T-box T-bet / Tbx21 во время эмбриогенеза мышей». Механизмы развития . 116 (1–2): 157–60. DOI : 10.1016 / S0925-4773 (02) 00114-4 . PMID  12128215 . S2CID  14925626 .
  • Chung HT, Kim LH, Park BL, Lee JH, Park HS, Choi BW, Hong SJ, Chae SC, Kim JJ, Park CS, Shin HD (сентябрь 2003 г.). «Анализ ассоциации новых вариантов TBX21 с фенотипами астмы». Мутация человека . 22 (3): 257. DOI : 10.1002 / humu.9169 . PMID  12938094 . S2CID  21977810 .
  • Ю Х.Р., Чанг Дж.С., Чен Р.Ф., Чуанг Х., Хун К.С., Ван Л., Ян К.Д. (ноябрь 2003 г.). «Различные антигены запускают разные реакции Th1 / Th2 в неонатальных мононуклеарных клетках (МНК), связанные с экспрессией T-bet / GATA-3». Журнал биологии лейкоцитов . 74 (5): 952–8. DOI : 10,1189 / jlb.0902474 . PMID  12960249 . S2CID  39107628 .
  • Ламетшвандтнер Дж., Бидерманн Т., Шварцлер С., Гюнтер С., Кунд Дж., Фассл С., Хинтеггер С., Карбаллидо-Перриг Н., Сабо С. Дж., Глимчер Л. Х., Карбаллидо Дж. М. (май 2004 г.). «Устойчивая экспрессия T-bet придает поляризованным клеткам TH2 человека TH1-подобную продукцию цитокинов и способность к миграции». Журнал аллергии и клинической иммунологии . 113 (5): 987–94. DOI : 10.1016 / j.jaci.2004.02.004 . PMID  15131585 .
  • Сасаки Ю., Ихара К., Мацуура Н., Коно Х., Нагафучи С., Куромару Р., Кусухара К., Такея Р., Хои Т., Сумимото Х., Хара Т. (август 2004 г.). «Идентификация нового гена восприимчивости к диабету 1 типа, T-bet». Генетика человека . 115 (3): 177–84. DOI : 10.1007 / s00439-004-1146-2 . PMID  15241679 . S2CID  32348097 .
  • Тантисира К.Г., Хванг Е.С., Раби Б.А., Сильверман Е.С., Лейк С.Л., Рихтер Б.Г., Пенг С.Л., Дразен Дж.М., Глимчер Л.Х., Вайс СТ (декабрь 2004 г.). «TBX21: функциональный вариант предсказывает улучшение при астме при использовании ингаляционных кортикостероидов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (52): 18099–104. DOI : 10.1073 / pnas.0408532102 . PMC  539815 . PMID  15604153 .
  • Atayar C, Poppema S, Blokzijl T, Harms G, Boot M, van den Berg A (январь 2005 г.). «Экспрессия факторов транскрипции Т-клеток, GATA-3 и T-bet, в неопластических клетках лимфом Ходжкина» . Американский журнал патологии . 166 (1): 127–34. DOI : 10.1016 / S0002-9440 (10) 62238-9 . PMC  1602286 . PMID  15632006 .
  • Тонг Y, Aune T, Boothby M (февраль 2005 г.). «T-bet препятствует рекрутированию mSin3a и трансактивирует полностью метилированный промотор IFN-гамма через консервативный полусайт T-бокса» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (6): 2034–9. DOI : 10.1073 / pnas.0409510102 . PMC  548570 . PMID  15684083 .
  • Dorfman DM, Hwang ES, Shahsafaei A, Glimcher LH (январь 2005 г.). «T-bet, фактор транскрипции, связанный с Т-клетками, экспрессируется в лимфоме Ходжкина». Патология человека . 36 (1): 10–5. DOI : 10.1016 / j.humpath.2004.10.006 . PMID  15712176 .
  • Кулкарни А., Рави Д.С., Сингх К., Рампалли С., Парех В., Митра Д., Чаттопадхьяй С. (апрель 2005 г.). «Tat ВИЧ-1 модулирует экспрессию T-bet и индуцирует иммунный ответ типа Th1». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 329 (2): 706–12. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2005.02.042 . PMID  15737643 .
  • Акахоши М., Обара К., Хирота Т., Мацуда А., Хасегава К., Такахаши Н., Симидзу М., Накашима К., Ченг Л., Дои С., Фудзивара Х, Миятаке А., Фудзита К., Хигаши Н., Танигути М., Эномото Т., Мао XQ. , Накашима Х., Адра С.Н., Накамура Ю., Тамари М., Сиракава Т. (июнь 2005 г.). «Полиморфизм функционального промотора в гене TBX21, связанный с аспирином-индуцированной астмой». Генетика человека . 117 (1): 16–26. DOI : 10.1007 / s00439-005-1285-0 . PMID  15806396 . S2CID  23920947 .
  • Kawana K, Kawana Y, Schust DJ (август 2005 г.). «Женские стероидные гормоны используют сигнальные преобразователи и активаторы путей, опосредованных белком транскрипции, чтобы модулировать экспрессию T-bet в эпителиальных клетках: механизм местной иммунной регуляции в репродуктивном тракте человека» . Молекулярная эндокринология . 19 (8): 2047–59. DOI : 10.1210 / me.2004-0489 . PMID  15860546 .
  • Харашима А., Мацуо Ю., Дрекслер Х. Г., Окочи А., Мотода Р., Танимото М., Орита К. (июль 2005 г.). «Экспрессия фактора транскрипции в линиях клеток-предшественников лейкемии В-клеток: предпочтительная экспрессия T-bet» . Исследование лейкемии . 29 (7): 841–8. DOI : 10.1016 / j.leukres.2004.12.010 . PMID  15927679 .
  • Дэн И, Кердилес И, Чу Дж, Юань С., Ван И, Чен Х, Мао Х, Чжан Л., Чжан Дж, Хьюз Т., Дэн И, Чжан Цюй, Ван Ф, Цзоу Х, Лю К.Г., Фрейд АГ, Ли Х , Калиджури М.А., Вивье Э., Ю. Дж. (Март 2015 г.). «Фактор транскрипции Foxo1 является негативным регулятором созревания и функции естественных клеток-киллеров» . Иммунитет . 42 (3): 457–70. DOI : 10.1016 / j.immuni.2015.02.006 . PMC  4400836 . PMID  25769609 .
  • Раби Б.А., Хванг Э.С., Ван Стин К., Тантисира К., Пенг С., Литонжуа А., Лазарус Р., Гиаллуракис К., Риу Д.Д., Воробей Д., Сильверман Е.К., Глимчер Л.Х., Вайс СТ (январь 2006 г.). «Полиморфизм T-bet связан с астмой и гиперреактивностью дыхательных путей» . Американский журнал респираторной медицины и реанимации . 173 (1): 64–70. DOI : 10,1164 / rccm.200503-505OC . PMC  2662983 . PMID  16179640 .

Внешние ссылки [ править ]

  • TBX21 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)


  • v
  • т
  • е