Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
ТГМ3
Белок TGM3 PDB 1l9m.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1L9M , 1L9N , 1NUD , 1NUF , 1NUG

Идентификаторы
ПсевдонимыTGM3 , TGE, трансглутаминаза 3, UHS2
Внешние идентификаторыOMIM : 600238 MGI : 98732 HomoloGene : 20690 GeneCards : TGM3
Расположение гена ( человек )
Хромосома 20 (человек)
Chr.Хромосома 20 (человека) [1]
Хромосома 20 (человек)
Геномное расположение TGM3
Геномное расположение TGM3
Группа20p13Начинать2 296 001 б.п. [1]
Конец2 341 079 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 2 (мышь)
Chr.Хромосома 2 (мышь) [2]
Хромосома 2 (мышь)
Геномное расположение TGM3
Геномное расположение TGM3
Группа2 | 2 F1Начинать130 012 349 п.н. [2]
Конец130 050 399 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE TGM3 206004 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• ион металла связывания
• связывания ионов кальция
• каталитическую активность
• белок-глутамина гамма-глутамилтрансферазы активности
• трансферазы активности
• трансферазной активности, перенос ацильных групп
Сотовый компонент• внешний компонент цитоплазматической стороны плазматической мембраны
• внеклеточная экзосома
• цитоплазма
Биологический процесс• кератинизация
• тетрамеризация белков
• морфогенез волосяных фолликулов
• организация клеточной оболочки
• перекрестное связывание пептидов
• процесс модификации клеточного белка
• дифференцировка кератиноцитов
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

7053

21818

Ансамбль

ENSG00000125780

ENSMUSG00000027401

UniProt

Q08188

Q08189

RefSeq (мРНК)

NM_003245

NM_009374

RefSeq (белок)

NP_003236

NP_033400

Расположение (UCSC)Chr 20: 2.3 - 2.34 МбChr 2: 130.01 - 130.05 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши
Чтобы узнать о игре в тетрис, см. Тетрис: Великий мастер .

Белок-глутамин гаммы-глутамилтрансфераза Е представляет собой фермент , который у человека кодируется TGM3 геном . [5] [6] [7]

Трансглутаминазы представляют собой ферменты, которые катализируют сшивание белков эпсилон-гамма-изопептидными связями глутамиллизина. Хотя первичная структура трансглутаминаз не консервативна, все они имеют одинаковую аминокислотную последовательность в своих активных сайтах, и их активность зависит от кальция. Белок, кодируемый этим геном, состоит из двух полипептидных цепей, активируемых протеолизом из одного белка-предшественника. Кодируемый белок участвует на более поздних стадиях формирования клеточной оболочки эпидермиса и волосяного фолликула. [7]

См. Также [ править ]

  • Проксимальный промотор

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000125780 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027401 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. Перейти ↑ Wang M, Kim IG, Steinert PM, McBride OW (март 1995 г.). «Присвоение генов трансглутаминазы 2 (TGM2) и трансглутаминазы 3 (TGM3) человека хромосоме 20q11.2» . Геномика . 23 (3): 721–2. DOI : 10.1006 / geno.1994.1571 . PMID 7851911 . 
  6. ^ Эшлиманн D, Koeller MK, Allen-Hoffmann BL, Мошер DF (март 1998). «Выделение кДНК, кодирующей новый член семейства генов трансглутаминаз, из кератиноцитов человека. Обнаружение и идентификация продуктов генов трансглутаминазы на основе полимеразной цепной реакции обратной транскрипции с вырожденными праймерами» . J Biol Chem . 273 (6): 3452–60. DOI : 10.1074 / jbc.273.6.3452 . PMID 9452468 . 
  7. ^ a b «Ген Entrez: трансглутаминаза 3 TGM3 (полипептид E, протеин-глутамин-гамма-глутамилтрансфераза)» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Ахвази Б., Бошанс К.М., Растинежад Ф. (2005). «Новое понимание структуры трансглутаминазы 3» . J. Struct. Биол . 147 (2): 200–7. DOI : 10.1016 / j.jsb.2004.03.009 . PMID  15193648 .
  • Райс Р.Х., Грин Х. (1978). «Связь синтеза белка и трансглутаминазной активности с образованием поперечно-сшитой оболочки во время терминальной дифференцировки культивируемых эпидермальных кератиноцитов человека» . J. Cell Biol . 76 (3): 705–11. DOI : 10,1083 / jcb.76.3.705 . PMC  2110014 . PMID  24643 .
  • Стек Т.Л. (1972). «Сшивка основных белков изолированной мембраны эритроцита». J. Mol. Биол . 66 (2): 295–305. DOI : 10.1016 / 0022-2836 (72) 90481-0 . PMID  5038456 .
  • Мариниелло Л., Эспозито С., Ди Пьерро П. и др. (1993). «Трансмембранный гликопротеин gp41 вируса иммунодефицита человека представляет собой аминоакцептор и донорный субстрат для трансглутаминазы in vitro». Евро. J. Biochem . 215 (1): 99–104. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1993.tb18011.x . PMID  7688299 .
  • Амендола А., Ломбарди Г., Оливерио С. и др. (1994). «ВИЧ-1 gp120-зависимая индукция апоптоза в антиген-специфических клонах Т-клеток человека характеризуется экспрессией« тканевой »трансглутаминазы и предотвращается циклоспорином А». FEBS Lett . 339 (3): 258–64. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (94) 80427-3 . PMID  7906657 . S2CID  39872629 .
  • Ким И.Г., Ли С.К., Ли Дж. Х. и др. (1994). «Структура и организация гена трансглутаминазы 3 человека: эволюционная связь с семейством трансглутаминаз». J. Invest. Дерматол . 103 (2): 137–42. DOI : 10.1111 / 1523-1747.ep12392470 . PMID  7913719 .
  • Ким И.Г., Горман Дж. Дж., Парк С.К. и др. (1993). «Выведенная последовательность новой протрансглутаминазы E (TGase3) человека и мыши». J. Biol. Chem . 268 (17): 12682–90. PMID  8099584 .
  • Ли Дж. Х., Чан С. И., Ян Дж. М. и др. (1996). «Проксимальный промотор гена трансглутаминазы 3 человека. Многослойная экспрессия плоского эпителия в культивируемых клетках опосредуется связыванием факторов транскрипции Sp1 и ets с проксимальным элементом промотора» . J. Biol. Chem . 271 (8): 4561–8. DOI : 10.1074 / jbc.271.8.4561 . PMID  8626812 .
  • Хиллиер Л.Д., Леннон Г., Беккер М. и др. (1997). «Создание и анализ 280 000 тегов последовательности, экспрессируемых человеком» . Genome Res . 6 (9): 807–28. DOI : 10.1101 / gr.6.9.807 . PMID  8889549 .
  • Ким С.И., Грант П., Ли Дж. Х. и др. (1999). «Дифференциальная экспрессия нескольких трансглютаминаз в мозге человека. Повышенная экспрессия и перекрестное связывание трансглютаминазами 1 и 2 при болезни Альцгеймера» . J. Biol. Chem . 274 (43): 30715–21. DOI : 10.1074 / jbc.274.43.30715 . PMID  10521460 .
  • Мехул Б., Бернар Д., Симонетти Л. и др. (2000). «Идентификация и клонирование нового кальмодулиноподобного белка из эпидермиса человека» . J. Biol. Chem . 275 (17): 12841–7. DOI : 10.1074 / jbc.275.17.12841 . PMID  10777582 .
  • Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека» . Природа . 414 (6866): 865–71. DOI : 10.1038 / 414865a . PMID  11780052 .
  • Сарди М., Карпати С., Меркл Б. и др. (2002). «Эпидермальная трансглутаминаза (TGase 3) является аутоантигеном герпетиформного дерматита» . J. Exp. Med . 195 (6): 747–57. DOI : 10,1084 / jem.20011299 . PMC  2193738 . PMID  11901200 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Ахвази Б., Бошанс К.М., Идлер В. и др. (2003). «Роль ионов кальция в активации и активности фермента трансглутаминазы 3» . J. Biol. Chem . 278 (26): 23834–41. DOI : 10.1074 / jbc.M301162200 . PMID  12679341 .
  • Хитоми К., Пресланд РБ, Накаяма Т. и др. (2004). «Анализ трансглутаминазы эпидермального типа (трансглутаминазы 3) в стратифицированном эпителии человека и культивируемых кератиноцитах с использованием моноклональных антител». J. Dermatol. Sci . 32 (2): 95–103. DOI : 10.1016 / S0923-1811 (03) 00091-4 . PMID  12850301 .
  • Гонсалес Х.Э., Гуджрати М., Фредерик М. и др. (2003). «Идентификация 9 генов, дифференциально экспрессируемых в плоскоклеточной карциноме головы и шеи» . Arch. Отоларингол. Head Neck Surg . 129 (7): 754–9. DOI : 10,1001 / archotol.129.7.754 . PMID  12874078 .
  • Ахвази Б., Бошанс К.М., Идлер В. и др. (2004). «Структурная основа координированной регуляции трансглутаминазы 3 с помощью гуаниновых нуклеотидов и кальция / магния» . J. Biol. Chem . 279 (8): 7180–92. DOI : 10.1074 / jbc.M312310200 . PMID  14645372 .
  • v
  • т
  • е