TIMP2

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
1BR9 , 1GXD , 2TMP , 4ILW

Идентификаторы

Псевдонимы

TIMP2 , CSC-21K, DDC8, ингибитор TIMP металлопептидазы 2

Внешние идентификаторы

OMIM : 188825 MGI : 98753 HomoloGene : 2444 GeneCards : TIMP2

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 17 (человека) ^[1]

Группа	17q25.3	Начинать	78 852 977 п.н. ^[1]
Группа	17q25.3	Конец	78 925 387 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 11 (мышь) ^[2]

Группа	11 E2 \| 11 83,09 см	Начинать	118 301 069 п.н. ^[2]
Группа	11 E2 \| 11 83,09 см	Конец	118 355 740 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• пептидазы ингибитора активности • ГО: 0048551 фермента ингибитора активности • связывание иона металла • интегрин связывания • GO: связывание белка 0001948 • Протеаза связывания • ингибитор активности metalloendopeptidase • иона цинка связывания
Сотовый компонент	• конус роста • внеклеточная область • поверхность клетки • тело нейрональной клетки • проекция нейрона • внеклеточная экзосома • внеклеточный матрикс GO: 0005578 • внеклеточное пространство • специфический просвет гранулы • просвет третичной гранулы • просвет гранулы, богатый фиколином-1 • внеклеточный матрикс, содержащий коллаген
Биологический процесс	• негативная регуляция протеолиза • ответ на цитокин • негативная регуляция активности пептидазы • позитивная регуляция активности аденилатциклазы • старение • разборка внеклеточного матрикса • негативная регуляция передачи сигнала Ras-белка • развитие центральной нервной системы • позитивная регуляция дифференцировки нейронов • ответ на гормон • негативная регуляция протеолиза эктодоменов мембранных белков • ответ на лекарственное средство • позитивная регуляция каскада MAPK • негативная регуляция пролиферации клеточной популяции • негативная регуляция митотического клеточного цикла • регуляция передачи сигнала Rap-белка • негативная регуляция активности эндопептидазы • дегрануляция нейтрофилов • негативная регуляция активности металлопептидазы • ответ на органическое вещество
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


7077


21858

Ансамбль


ENSG00000035862


ENSMUSG00000017466

UniProt


P16035


P25785

RefSeq (мРНК)


NM_003255


NM_011594

RefSeq (белок)


NP_003246


н / д

Расположение (UCSC)

Chr 17: 78,85 - 78,93 Мб

Chr 11: 118,3 - 118,36 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Тканевый ингибитор металлопротеиназы 2 (TIMP2) представляет собой ген и соответствующий белок . Ген является членом семейства генов TIMP . Считается, что белок подавляет метастазы . ^{[ необходима цитата ]}

Функция [ править ]

Белки, кодируемые этим семейством генов, являются естественными ингибиторами матриксных металлопротеиназ (ММП), группы пептидаз, участвующих в деградации внеклеточного матрикса. Помимо ингибирующей роли в отношении металлопротеиназ, кодируемый белок играет уникальную роль среди членов семейства TIMP в своей способности непосредственно подавлять пролиферацию эндотелиальных клеток. В результате кодируемый белок может иметь решающее значение для поддержания гомеостаза ткани за счет подавления пролиферации покоящихся тканей в ответ на ангиогенные факторы и за счет ингибирования активности протеаз в тканях, подвергающихся ремоделированию внеклеточного матрикса. ^[5]TIMP2 действует как ингибитор ММП и как активатор. ТИМП ингибируют активные ММП, но разные ТИМП ингибируют разные ММП лучше, чем другие. Например, TIMP-1 ингибирует MMP-7, MMP-9, MMP-1 и MMP-3 лучше, чем TIMP-2, а TIMP-2 ингибирует MMP-2 более эффективно, чем другие TIMP. ^[6]

В меланоцитарных клетках экспрессия гена TIMP2 может регулироваться MITF . ^[7]

Более недавнее открытие состоит в том, что TIMP2 играет важную роль в функции гиппокампа и когнитивной функции. Он играет решающую роль в пользе, которую получают старые мыши при введении человеческой пуповинной крови . ^[8]^[9]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что TIMP2 взаимодействует с:

MMP14 ^[10] и
MMP2 . ^[11]^[12]^[13]^[14]

См. Также [ править ]

ТИМП1 , ТИМП3 , ТИМП4

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000035862 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000017466 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Entrez Gene: TIMP2 TIMP металлопептидазы ингибитор 2" .
^ Bourboulia D, Stetler-Stevenson WG (июнь 2010). «Матричные металлопротеиназы (ММП) и тканевые ингибиторы металлопротеиназ (ТИМП): положительные и отрицательные регуляторы адгезии опухолевых клеток» . Семинары по биологии рака . 20 (3): 161–8. DOI : 10.1016 / j.semcancer.2010.05.002 . PMC 2941566 . PMID 20470890 .
^ Хоек К.С., Шлегель NC, Eichhoff ОМ, Уидмер Д.С., Преториус С, Эйнарсон ТАК, Valgeirsdottir S, Bergsteinsdottir К, Schepsky А, Dummer Р, Steingrimsson Е (2008). «Новые мишени MITF идентифицированы с использованием двухэтапной стратегии ДНК-микрочипов» . Pigment Cell Melanoma Res . 21 (6): 665–76. DOI : 10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x . PMID 19067971 . S2CID 24698373 .
^ Джозеф Кастеллано; и другие. (27 апреля, 2017). «Белки плазмы пуповины человека восстанавливают функцию гиппокампа у старых мышей» . Природа . 544 (7651): 488–492. DOI : 10.1038 / nature22067 . PMC 5586222 . PMID 28424512 .
^ «Кровь человеческих младенцев делает мозг пожилых мышей снова молодым» . Новый ученый . 29 апреля 2017.
↑ Zucker S, Drews M, Conner C, Foda HD, DeClerck YA, Langley KE, Bahou WF, Docherty AJ, Cao J (январь 1998 г.). «Тканевый ингибитор металлопротеиназы-2 (TIMP-2) связывается с каталитическим доменом рецептора клеточной поверхности, матричной металлопротеиназой 1 мембранного типа 1 (MT1-MMP)» . J. Biol. Chem . 273 (2): 1216–22. DOI : 10.1074 / jbc.273.2.1216 . PMID 9422789 .
^ Моргунова E, Tuuttila A, Bergmann U, Трюггвасон K (май 2002). «Структурное понимание комплексообразования латентной матричной металлопротеиназы 2 с тканевым ингибитором металлопротеиназы 2» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (11): 7414–9. DOI : 10.1073 / pnas.102185399 . PMC 124245 . PMID 12032297 .
^ Общий CM, Tam E, McQuibban GA, Morrison C, Wallon UM, Bigg HF, King AE, Roberts CR (декабрь 2000 г.). «Доменные взаимодействия в комплексе активации желатиназы A.TIMP-2MT1-MMP. Эктодомен 44-кДа формы матричной металлопротеиназы мембран типа 1 не модулирует активацию желатиназы A» . J. Biol. Chem . 275 (50): 39497–506. DOI : 10.1074 / jbc.M005932200 . PMID 10991943 .
^ Бигг HF, Ши YE, Лю YE, Steffensen B, Общий CM (июнь 1997). «Специфическое, высокоаффинное связывание тканевого ингибитора металлопротеиназы-4 (ТИМП-4) с СООН-концевым гемопексиноподобным доменом желатиназы человека А. ТИМП-4 связывает прогелатиназу А и СООН-концевой домен аналогично ТИМП. -2 " . J. Biol. Chem . 272 (24): 15496–500. DOI : 10.1074 / jbc.272.24.15496 . PMID 9182583 .
↑ Kai HS, Butler GS, Morrison CJ, King AE, Pelman GR, Complete CM (декабрь 2002 г.). «Использование новой системы экспрессии рекомбинантного слитого белка миоглобина для характеристики тканевого ингибитора металлопротеиназы (ТИМП) -4 и С-концевого домена и хвостов ТИМП-2 с помощью мутагенеза. Важность кислотных остатков в связывании ММР-2 гемопексина С- домен " . J. Biol. Chem . 277 (50): 48696–707. DOI : 10.1074 / jbc.M209177200 . PMID 12374789 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Лиотта Л.А., Стетлер-Стивенсон В., Стиг П.С. (1991). «Гены-супрессоры метастазов». Важный Adv. Онкол. : 85–100. PMID 1869284 .
Стетлер-Стивенсон WG, Seo DW (2005). «ТИМП-2: эндогенный ингибитор ангиогенеза». Тенденции в молекулярной медицине . 11 (3): 97–103. DOI : 10.1016 / j.molmed.2005.01.007 . PMID 15760767 .

Внешние ссылки [ править ]

Merops онлайновой базы данных для пептидазы и их ингибиторов: I35.002
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P16035 (ингибитор металлопротеиназы 2) в PDBe-KB .

Эта статья о гене в 17-й хромосоме человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000035862 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000017466 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[5] "Entrez Gene: TIMP2 TIMP металлопептидазы ингибитор 2" .

[6] Bourboulia D, Stetler-Stevenson WG (июнь 2010). «Матричные металлопротеиназы (ММП) и тканевые ингибиторы металлопротеиназ (ТИМП): положительные и отрицательные регуляторы адгезии опухолевых клеток» . Семинары по биологии рака . 20 (3): 161–8. DOI : 10.1016 / j.semcancer.2010.05.002 . PMC 2941566 . PMID 20470890 .

[pmid19067971-7] Хоек К.С., Шлегель NC, Eichhoff ОМ, Уидмер Д.С., Преториус С, Эйнарсон ТАК, Valgeirsdottir S, Bergsteinsdottir К, Schepsky А, Dummer Р, Steingrimsson Е (2008). «Новые мишени MITF идентифицированы с использованием двухэтапной стратегии ДНК-микрочипов» . Pigment Cell Melanoma Res . 21 (6): 665–76. DOI : 10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x . PMID 19067971 . S2CID 24698373 .

[8] Джозеф Кастеллано; и другие. (27 апреля, 2017). «Белки плазмы пуповины человека восстанавливают функцию гиппокампа у старых мышей» . Природа . 544 (7651): 488–492. DOI : 10.1038 / nature22067 . PMC 5586222 . PMID 28424512 .

[9] «Кровь человеческих младенцев делает мозг пожилых мышей снова молодым» . Новый ученый . 29 апреля 2017.

[pmid9422789-10] Zucker S, Drews M, Conner C, Foda HD, DeClerck YA, Langley KE, Bahou WF, Docherty AJ, Cao J (январь 1998 г.). «Тканевый ингибитор металлопротеиназы-2 (TIMP-2) связывается с каталитическим доменом рецептора клеточной поверхности, матричной металлопротеиназой 1 мембранного типа 1 (MT1-MMP)» . J. Biol. Chem . 273 (2): 1216–22. DOI : 10.1074 / jbc.273.2.1216 . PMID 9422789 .

[pmid12032297-11] Моргунова E, Tuuttila A, Bergmann U, Трюггвасон K (май 2002). «Структурное понимание комплексообразования латентной матричной металлопротеиназы 2 с тканевым ингибитором металлопротеиназы 2» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (11): 7414–9. DOI : 10.1073 / pnas.102185399 . PMC 124245 . PMID 12032297 .

[pmid10991943-12] Общий CM, Tam E, McQuibban GA, Morrison C, Wallon UM, Bigg HF, King AE, Roberts CR (декабрь 2000 г.). «Доменные взаимодействия в комплексе активации желатиназы A.TIMP-2MT1-MMP. Эктодомен 44-кДа формы матричной металлопротеиназы мембран типа 1 не модулирует активацию желатиназы A» . J. Biol. Chem . 275 (50): 39497–506. DOI : 10.1074 / jbc.M005932200 . PMID 10991943 .

[pmid9182583-13] Бигг HF, Ши YE, Лю YE, Steffensen B, Общий CM (июнь 1997). «Специфическое, высокоаффинное связывание тканевого ингибитора металлопротеиназы-4 (ТИМП-4) с СООН-концевым гемопексиноподобным доменом желатиназы человека А. ТИМП-4 связывает прогелатиназу А и СООН-концевой домен аналогично ТИМП. -2 " . J. Biol. Chem . 272 (24): 15496–500. DOI : 10.1074 / jbc.272.24.15496 . PMID 9182583 .

[pmid12374789-14] Kai HS, Butler GS, Morrison CJ, King AE, Pelman GR, Complete CM (декабрь 2002 г.). «Использование новой системы экспрессии рекомбинантного слитого белка миоглобина для характеристики тканевого ингибитора металлопротеиназы (ТИМП) -4 и С-концевого домена и хвостов ТИМП-2 с помощью мутагенеза. Важность кислотных остатков в связывании ММР-2 гемопексина С- домен " . J. Biol. Chem . 277 (50): 48696–707. DOI : 10.1074 / jbc.M209177200 . PMID 12374789 .

[1]