Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
TIMP4
Идентификаторы
ПсевдонимыТИМП4 , ингибитор металлопептидазы ТИМП 4, ТИМП-4
Внешние идентификаторыOMIM : 601915 MGI : 109125 HomoloGene : 37748 GeneCards : TIMP4
Расположение гена ( человек )
Хромосома 3 (человек)
Chr.Хромосома 3 (человек) [1]
Хромосома 3 (человек)
Геномное расположение TIMP4
Геномное расположение TIMP4
Группа3п25.2Начинать12 153 068 п.н. [1]
Конец12 158 912 п.н. [1]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE TIMP4 206243 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• пептидаза ингибитор активность
• ГО: 0048551 фермента ингибитор активность
• связывание иона металла
• Протеаза связывания
• ингибитор активность metalloendopeptidase
Сотовый компонент• саркомер
• внеклеточная область
• внеклеточное пространство
• внеклеточный матрикс GO: 0005578
Биологический процесс• сигнальный путь Notch
• негативная регуляция активности пептидазы
• ответ на пептидный гормон
• развитие центральной нервной системы
• ответ на липополисахарид
• цикл овуляции
• негативная регуляция протеолиза эктодомена мембранного белка
• ответ на лекарство
• GO: 0048553 негативная регуляция каталитической активности
• негатив регуляция активности эндопептидазы
• ответ на гормон
• ответ на цитокин
• биологический процесс
• ответ на органическое вещество
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

7079

110595

Ансамбль

ENSG00000157150

ENSMUSG00000030317

UniProt

Q99727

Q9JHB3

RefSeq (мРНК)

NM_003256

NM_080639
NM_001356406

RefSeq (белок)

NP_003247

NP_542370
NP_001343335

Расположение (UCSC)Chr 3: 12.15 - 12.16 Мбн / д
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Ингибитор металлопротеиназы 4 представляет собой фермент , который у человека кодируется TIMP4 геном . [4] [5] [6]

Этот ген принадлежит к тканевому ингибитору семейства генов металлопротеиназ . Белки, кодируемые этим семейством генов, являются ингибиторами матриксных металлопротеиназ, группы пептидаз, участвующих в деградации внеклеточного матрикса. Секретируемый белок, содержащий домен нетрина, кодируемый этим геном, участвует в регуляции агрегации и рекрутирования тромбоцитов и может играть роль в гормональной регуляции и ремоделировании ткани эндометрия. [6]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что TIMP4 взаимодействует с MMP2 . [7] [8]

См. Также [ править ]

  • ТИМП1 , ТИМП2 , ТИМП3

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000157150 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ↑ Greene J, Wang M, Liu YE, Raymond LA, Rosen C, Shi YE (январь 1997 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика человеческого тканевого ингибитора металлопротеиназы 4» . J Biol Chem . 271 (48): 30375–30380. DOI : 10.1074 / jbc.271.48.30375 . PMID 8939999 . 
  5. ^ Олсон ТМ, Hirohata С, Е. Дж, Leco К, Seldin МФ, Apte СС (сентябрь 1998). «Клонирование человеческого тканевого ингибитора гена металлопротеиназы-4 (TIMP4) и локализация генов TIMP4 и Timp4 в хромосоме 3p25 человека и хромосоме 6 мыши соответственно». Геномика . 51 (1): 148–151. DOI : 10.1006 / geno.1998.5362 . PMID 9693046 . 
  6. ^ a b «Ген Entrez: TIMP4 TIMP-металлопептидаза ингибитор 4» .
  7. ^ Бигг, ВЧ; Ши ЙЕ; Лю Ю.Е .; Steffensen B; Общий CM (июнь 1997 г.). «Специфическое, высокоаффинное связывание тканевого ингибитора металлопротеиназы-4 (ТИМП-4) с СООН-концевым гемопексиноподобным доменом желатиназы человека А. ТИМП-4 связывает прогелатиназу А и СООН-концевой домен аналогично ТИМП. -2 " . J. Biol. Chem . 272 (24): 15496–15500. DOI : 10.1074 / jbc.272.24.15496 . ISSN 0021-9258 . PMID 9182583 .  
  8. ^ Кай, Хайди ST; Батлер Джорджина С; Моррисон Шарлотта Дж; Король Анджела Э; Пельман Гейл Р; В целом Christopher M (декабрь 2002 г.). «Использование новой системы экспрессии рекомбинантного слитого белка миоглобина для характеристики тканевого ингибитора металлопротеиназы (ТИМП) -4 и С-концевого домена и хвостов ТИМП-2 с помощью мутагенеза. Важность кислотных остатков в связывании ММР-2 гемопексина С- домен " . J. Biol. Chem . 277 (50): 48696–48707. DOI : 10.1074 / jbc.M209177200 . ISSN 0021-9258 . PMID 12374789 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Bigg HF, Shi YE, Liu YE и др. (1997). «Специфическое, высокоаффинное связывание тканевого ингибитора металлопротеиназы-4 (ТИМП-4) с СООН-концевым гемопексиноподобным доменом желатиназы человека А. ТИМП-4 связывает прогелатиназу А и СООН-концевой домен аналогично ТИМП. -2 " . J. Biol. Chem . 272 (24): 15496–15500. DOI : 10.1074 / jbc.272.24.15496 . PMID  9182583 .
  • Pohar N, Godenschwege TA, Buchner E (1999). «Тканевый ингибитор металлопротеиназы беспозвоночных: структура и организация вложенных генов в локусе синапсина сохраняются от дрозофилы к человеку». Геномика . 57 (2): 293–296. DOI : 10.1006 / geno.1999.5776 . PMID  10198170 .
  • Эрнандес-Баррантес С., Шимура Ю., Солоуэй П.Д. и др. (2001). «Различная роль TIMP-4 и TIMP-2 в активации pro-MMP-2 с помощью MT1-MMP». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 281 (1): 126–130. DOI : 10.1006 / bbrc.2001.4323 . PMID  11178970 .
  • Хуанг В., Ли В.К., Денэйд Ф., Зафарулла М. (2002). «Экспрессия гена тканевого ингибитора металлопротеиназы-4 (ТИМП-4) повышена в хряще головки бедренной кости человека при остеоартрите». J. Cell. Биохим . 85 (2): 295–303. DOI : 10.1002 / jcb.10138 . PMID  11948685 . S2CID  43053515 .
  • Чжан Дж., Цао Ю. Дж., Чжао Ю. Г. и др. (2003). «Экспрессия матричной металлопротеиназы-26 и тканевого ингибитора металлопротеиназы-4 в нормальных клетках цитотрофобласта человека и клеточной линии хориокарциномы, JEG-3» . Мол. Гм. Репродукция . 8 (7): 659–666. DOI : 10.1093 / molehr / 8.7.659 . PMID  12087081 .
  • Кай Х.С., Батлер Г.С., Моррисон С.Дж. и др. (2003). «Использование новой системы экспрессии рекомбинантного слитого белка миоглобина для характеристики тканевого ингибитора металлопротеиназы (ТИМП) -4 и С-концевого домена и хвостов ТИМП-2 с помощью мутагенеза. Важность кислотных остатков в связывании ММР-2 гемопексина С- домен " . J. Biol. Chem . 277 (50): 48696–48707. DOI : 10.1074 / jbc.M209177200 . PMID  12374789 .
  • Радомский А., Юрас П., Сандерс Э. Дж. И др. (2003). «Идентификация, регуляция и роль тканевого ингибитора металлопротеиназы-4 (ТИМП-4) в тромбоцитах человека» . Br. J. Pharmacol . 137 (8): 1330–1338. DOI : 10.1038 / sj.bjp.0704936 . PMC  1573597 . PMID  12466243 .
  • Троеберг Л., Танака М., Уэйт Р. и др. (2003). «Экспрессия ТИМП-4 в E. coli и сравнительные кинетические исследования с ТИМП-1 и ТИМП-2: понимание взаимодействий ТИМП и матриксной металлопротеиназы 2 (желатиназы А)». Биохимия . 41 (50): 15025–15035. DOI : 10.1021 / bi026454l . PMID  12475252 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–16903. Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M . DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Чегини Н, Ротон-Власак А, Уильямс Р.С. (2003). «Экспрессия матричной металлопротеиназы-26 и тканевого ингибитора матричной металлопротеиназы-3 и -4 в эндометрии на протяжении нормального менструального цикла и изменение у пользователей имплантатов левоноргестрела, которые испытывают нерегулярные маточные кровотечения». Fertil. Стерил . 80 (3): 564–570. DOI : 10.1016 / S0015-0282 (03) 00797-0 . PMID  12969699 .
  • Чжао Ю.Г., Сяо А.З., Пак Х.И. и др. (2004). «Эндометаза / матрилизин-2 в протоковой карциноме молочной железы человека in situ и ее ингибирование тканевыми ингибиторами металлопротеиназ-2 и -4: предполагаемая роль в инициации инвазии рака молочной железы» . Cancer Res . 64 (2): 590–598. DOI : 10.1158 / 0008-5472.CAN-03-1932 . PMID  14744773 .
  • Пилка Р., Домански Х., Ханссон С. и др. (2005). «Уровень мРНК эндометрия TIMP-4 высок в середине цикла и при гиперплазии, но подавляется в злокачественных опухолях. Координированная экспрессия с MMP-26» . Мол. Гм. Репродукция . 10 (9): 641–650. DOI : 10.1093 / molehr / gah092 . PMID  15273280 .
  • Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–2127. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC  528928 . PMID  15489334 .
  • Ли М. Х., Рапти М., Мерфи Г. (2005). «Полная конверсия тканевого ингибитора металлопротеиназы (TIMP) для нацеливания на специфическую металлопротеиназу: точная настройка TIMP-4 для оптимального ингибирования фермента, превращающего фактор некроза опухоли - альфа» . J. Biol. Chem . 280 (16): 15967–75. DOI : 10.1074 / jbc.M500897200 . PMID  15713681 .
  • Lizarraga F, Espinosa M, Maldonado V, Melendez-Zajgla J (2005). «Тканевый ингибитор металлопротеиназы-4 экспрессируется у больных раком шейки матки». Anticancer Res . 25 (1B): 623–7. PMID  15816637 .
  • Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети белок-белкового взаимодействия человека». Природа . 437 (7062): 1173–1178. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . DOI : 10,1038 / природа04209 . PMID  16189514 . S2CID  4427026 .
  • Koskivirta I, Rahkonen O, Mäyränpää M, et al. (2007). «Тканевый ингибитор металлопротеиназы 4 (TIMP4) участвует в воспалительных процессах сердечно-сосудистой патологии человека». Histochem. Cell Biol . 126 (3): 335–342. DOI : 10.1007 / s00418-006-0163-8 . PMID  16521002 . S2CID  10581957 .
  • Пилка Р., Носкова В., Доманский Н. и др. (2006). «МРНК TIMP-4 эндометрия экспрессируется в строме, в то время как белок TIMP-4 накапливается в эпителии и выделяется в маточную жидкость» . Мол. Гм. Репродукция . 12 (8): 497–503. DOI : 10.1093 / molehr / gal055 . PMID  16809379 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Merops онлайновой базы данных для пептидазы и их ингибиторов: I35.004