Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
ТРИО
Протеин TRIO PDB 1nty.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1NTY , 2NZ8

Идентификаторы
ПсевдонимыTRIO , ARHGEF23, tgat, фактор обмена трио гуаниновых нуклеотидов, MEBAS, MRD44, MRD63
Внешние идентификаторыOMIM : 601893 MGI : 1927230 HomoloGene : 20847 GeneCards : TRIO
Расположение гена ( человек )
Хромосома 5 (человек)
Chr.Хромосома 5 (человека) [1]
Хромосома 5 (человек)
Геномное расположение TRIO
Геномное расположение TRIO
Группа5п15.2Начинать14 143 342 п.н. [1]
Конец14 532 128 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 15 (мышь)
Chr.Хромосома 15 (мышь) [2]
Хромосома 15 (мышь)
Геномное расположение TRIO
Геномное расположение TRIO
Группа15 | 15 B1Начинать27 730 651 п.н. [2]
Конец28 025 848 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE TRIO 209012 в формате fs.png

PBB GE TRIO 209010 s в формате fs.png

PBB GE TRIO 208178 x в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• трансферазной активность
• связывание нуклеотида
• активность протеинкиназы
• обмена активность фактора гуанил-нуклеотид
• активность киназы
• белок серин / треонин киназа
• ГО: связывание белка 0001948
• связывание АТФ
• Rho обмена активность фактор гуанил-нуклеотид
Сотовый компонент• цитоплазма
• цитозоль
Биологический процесс• фосфорилирование
• фосфорилирование белков
• трансмембранного белок рецептора тирозин фосфатазы сигнального путь
• положительного регулирование апоптотического процесс
• регуляция Rho сигнал белка трансдукции
• регулирование малой трансдукции ГТФазы опосредованного сигнала
• отрицательное регулирование дифференциации жировых клеток
• G-белок рецептор сигнального пути
• управление аксонами
• развитие центральной нервной системы
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

7204

223435

Ансамбль

ENSG00000038382

ENSMUSG00000022263

UniProt

O75962

Q0KL02

RefSeq (мРНК)

NM_007118

NM_001081302

RefSeq (белок)

NP_009049

NP_001074771

Расположение (UCSC)Chr 5: 14.14 - 14.53 МбChr 15: 27.73 - 28.03 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Тройной функциональный белок домена представляет собой белок , который у человека кодируется TRIO гена . [5] [6]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что TRIO (ген) взаимодействует с филамином [7] и RHOA . [8]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000038382 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022263 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Debant А, Серра-Пажес С, Seipel К, О'Брайен S, Тан М, Парк SH, Штрёли М (май 1996 г.). «Мультидоменный белок Trio связывает трансмембранную тирозинфосфатазу LAR, содержит домен протеинкиназы и имеет отдельные rac-специфические и rho-специфические домены фактора обмена гуаниновых нуклеотидов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (11): 5466–71. DOI : 10.1073 / pnas.93.11.5466 . PMC 39269 . PMID 8643598 .  
  6. ^ «Энтрез Ген: тройной функциональный домен TRIO (взаимодействие PTPRF)» .
  7. ^ Bellanger JM, Астие С, Sardet С, Охтами Y, Стоссла Т.П., Debant А (декабрь 2000). «Rac1- и RhoG-специфический домен GEF Trio нацелен на филамин для ремоделирования актина цитоскелета». Природа клеточной биологии . 2 (12): 888–92. DOI : 10.1038 / 35046533 . PMID 11146652 . S2CID 10182923 .  
  8. ↑ Medley QG, ​​Serra-Pagès C, Iannotti E, Seipel K, Tang M, O'Brien SP, Streuli M (ноябрь 2000 г.). «Фактор обмена триогуаниновых нуклеотидов является мишенью для RhoA. Связывание RhoA с трио иммуноглобулиноподобным доменом» . Журнал биологической химии . 275 (46): 36116–23. DOI : 10.1074 / jbc.M003775200 . PMID 10948190 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Taviaux S, Diriong S, Bellanger JM, Streuli M, Debant A (1997). «Отнесение TRIO, гена Trio (взаимодействие PTPRF) к полосам хромосомы человека 5p 15.1 -> p 14 посредством гибридизации in situ». Цитогенетика и клеточная генетика . 76 (1–2): 107–8. DOI : 10.1159 / 000134524 . PMID  9154137 .
  • Лю X, Ван Х., Эберштадт М., Шнухель А., Олейничак Е.Т., Медоуз Р.П., Шкерянц Ю.М., Яновик Д.А., Харлан Дж.Э., Харрис Е.А., Стонтон Д.Е., Фесик С.В. (октябрь 1998 г.). «Структура ЯМР и мутагенез N-концевого домена гомологии Dbl фактора обмена нуклеотидов Trio». Cell . 95 (2): 269–77. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81757-2 . PMID  9790533 . S2CID  18146575 .
  • Зайпель К., Медли К.Г., Кедерша Н.Л., Чжан Х.А., О'Брайен С.П., Серра-Пейдж С., Хемлер М.Э., Штреули М. (июнь 1999 г.) «Экспрессия домена фактора обмена трио-аминоконцевых гуаниновых нуклеотидов способствует реорганизации актинового цитоскелета, миграции клеток и независимому от закрепления росту клеток». Журнал клеточной науки . 112 (Pt 12) (12): 1825–34. PMID  10341202 .
  • Medley QG, ​​Serra-Pagès C, Iannotti E, Seipel K, Tang M, O'Brien SP, Streuli M (ноябрь 2000 г.). «Фактор обмена триогуаниновых нуклеотидов является мишенью для RhoA. Связывание RhoA с трио иммуноглобулиноподобным доменом» . Журнал биологической химии . 275 (46): 36116–23. DOI : 10.1074 / jbc.M003775200 . PMID  10948190 .
  • Белланджер Дж. М., Астье С., Сардет С., Охта Ю., Штоссель Т. П., Дебант А. (декабрь 2000 г.). «Rac1- и RhoG-специфический домен GEF Trio нацелен на филамин для ремоделирования актина цитоскелета». Природа клеточной биологии . 2 (12): 888–92. DOI : 10.1038 / 35046533 . PMID  11146652 . S2CID  10182923 .
  • Гао Ю., Син Дж., Стрели М., Лето Т.Л., Чжэн Ю. (декабрь 2001 г.). «Trp (56) rac1 определяет взаимодействие с подмножеством факторов обмена гуаниновых нуклеотидов» . Журнал биологической химии . 276 (50): 47530–41. DOI : 10.1074 / jbc.M108865200 . PMID  11595749 .
  • Сковронек KR, Guo F, Zheng Y, Nassar N (сентябрь 2004 г.). «С-концевой основной хвост RhoG помогает трио фактора обмена гуаниновых нуклеотидов в связывании с фосфолипидами» . Журнал биологической химии . 279 (36): 37895–907. DOI : 10.1074 / jbc.M312677200 . PMID  15199069 .
  • Чжэн М., Саймон Р., Мирлахер М., Маурер Р., Гассер Т., Форстер Т., Динер П.А., Михатч М.Дж., Заутер Г., Шрамл П. (июль 2004 г.). «Амплификация TRIO и обильная экспрессия мРНК связаны с инвазивным ростом опухоли и быстрой пролиферацией опухолевых клеток при раке мочевого пузыря» . Американский журнал патологии . 165 (1): 63–9. DOI : 10.1016 / S0002-9440 (10) 63275-0 . PMC  1618551 . PMID  15215162 .
  • Йошизука Н., Мориучи Р., Мори Т., Ямада К., Хасэгава С., Маэда Т., Шимада Т., Ямада И., Камихира С., Томонага М., Катамине С. (октябрь 2004 г.). «Альтернативный транскрипт, полученный из трио локуса, кодирует фактор обмена гуанозиновых нуклеотидов с потенциалом трансформации мышиных клеток» . Журнал биологической химии . 279 (42): 43998–4004. DOI : 10.1074 / jbc.M406082200 . PMID  15308664 .
  • Portales-Casamar E, Briançon-Marjollet A, Fromont S, Triboulet R, Debant A (март 2006 г.). «Идентификация новых изоформ нейронов трио Rho-GEF». Биология клетки . 98 (3): 183–93. DOI : 10.1042 / BC20050009 . PMID  16033331 . S2CID  24166861 .
  • Тао В.А., Воллшайд Б., О'Брайен Р., Энг Дж. К., Ли XJ, Боденмиллер Б., Уоттс Д. Д., Худ Л., Эберсолд Р. (август 2005 г.). «Количественный анализ фосфопротеома с использованием химии конъюгации дендримеров и тандемной масс-спектрометрии». Методы природы . 2 (8): 591–8. DOI : 10.1038 / nmeth776 . PMID  16094384 . S2CID  20475874 .
  • Адамович М., Радлвиммер Б., Рикер Р.Дж., Мертенс Д., Шварцбах М., Шрамл П., Беннер А., Лихтер П., Мехтершеймер Г., Йоос С. (сентябрь 2006 г.). «Частые амплификации и обильная экспрессия TRIO, NKD2 и IRX2 в саркомах мягких тканей». Гены, хромосомы и рак . 45 (9): 829–38. DOI : 10.1002 / gcc.20343 . PMID  16752383 . S2CID  24491021 .
  • Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635–48. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983 . S2CID  7827573 .
  • Chhatriwala MK, Betts L, Worthylake DK, Sondek J (май 2007 г.). «Домены DH и PH Trio координированно взаимодействуют с Rho GTPases для их эффективной активации» . Журнал молекулярной биологии . 368 (5): 1307–20. DOI : 10.1016 / j.jmb.2007.02.060 . PMC  1890047 . PMID  17391702 .
  • Рохас Р.Дж., Йохе М.Э., Гершбург С., Кавано Т., Козаса Т., Сондек Дж. (Октябрь 2007 г.). «Galphaq напрямую активирует p63RhoGEF и Trio через консервативное расширение домена гомологии плекстрина, ассоциированного с Dbl» . Журнал биологической химии . 282 (40): 29201–10. DOI : 10.1074 / jbc.M703458200 . PMC  2655113 . PMID  17606614 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O75962 (белок с тройным функциональным доменом) в PDBe-KB .


  • v
  • т
  • е