ТАР-ассоциированный гликопротеин также известный как tapasin или TAPBP является белком [5] [6] , что в организме человека кодируется TAPBP гена . [7]
ТАПБП | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | TAPBP , NGS17, TAPA, TPN, TPSN, TAP-связывающий белок (тапазин), TAP-связывающий белок | ||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | OMIM : 601962 MGI : 1201689 HomoloGene : 2401 GeneCards : TAPBP | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||||||||||
Разновидность | Человек | Мышь | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ансамбль |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (белок) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Расположение (UCSC) | Chr 6: 33,3 - 33,31 Мб | Chr 17: 33.92 - 33.93 Мб | |||||||||||||||||||||||
PubMed поиск | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||
|
Функция
Этот ген кодирует трансмембранный гликопротеин, который опосредует взаимодействие между недавно собранными молекулами главного комплекса гистосовместимости ( MHC ) класса I и транспортером, связанным с процессингом антигена (TAP), который необходим для транспорта антигенных пептидов через мембрану эндоплазматического ретикулума . Это взаимодействие способствует оптимальной нагрузке пептида на молекулу MHC класса I. До четырех комплексов MHC класса I и тапазина могут быть связаны с одной молекулой TAP. Тапазин содержит С-концевой мотив двойного лизина (KKKAE), который, как известно, поддерживает мембранные белки в эндоплазматическом ретикулуме. У человека ген тапазина находится в главном комплексе гистосовместимости на хромосоме 6. Альтернативный сплайсинг приводит к трем вариантам транскрипта, кодирующим разные изоформы. [7]
Tapasin является МНС класса I антигеном -переработки молекулы , присутствующего в просвете эндоплазматического ретикулума . Он играет важную роль в созревании молекул MHC класса I в просвете ER. Тапазин является одним из компонентов комплекса, нагружающего пептиды, и его можно обнаружить связанным с молекулами MHC класса I после того, как тяжелая цепь MHC класса I была связана с микроглобулином Beta 2 . Пептидный загрузочный комплекс состоит из ТАР, тапазина, MHC класса I, кальретикулина и ERp57. Тапазин привлекает молекулы MHC класса I к транспортеру пептидов TAP, а также увеличивает загрузку MHC класса I пептидами с высокой аффинностью . После загрузки MHC класса I высокоаффинным лигандом взаимодействие между тапазином и MHC класса I исчезает. [8]
Взаимодействия
Было показано, что тапасин взаимодействует с:
- HLA-A , [9] и
- TAP1 [9] [10]
Смотрите также
- Транспортер, связанный с процессингом антигена («ТАР»)
Рекомендации
- ^ Б с ENSG00000236490, ENSG00000206281, ENSG00000206208, ENSG00000112493 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000231925, ENSG00000236490, ENSG00000206281, ENSG00000206208, ENSG00000112493 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024308 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Садасиван Б., Ленер П.Дж., Ортманн Б., Шпион Т., Крессвелл П. (август 1996 г.). «Роли кальретикулина и нового гликопротеина, тапазина, во взаимодействии молекул MHC класса I с TAP». Иммунитет . 5 (2): 103–14. DOI : 10.1016 / S1074-7613 (00) 80487-2 . PMID 8769474 .
- ^ Ли С., Сьегрен Х.О., Хеллман У., Петтерссон РФ, Ван П. (август 1997 г.). «Клонирование и функциональная характеристика субъединицы транспортера, связанного с процессингом антигена» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (16): 8708–13. Bibcode : 1997PNAS ... 94.8708L . DOI : 10.1073 / pnas.94.16.8708 . PMC 23091 . PMID 9238042 .
- ^ а б «Ген Entrez: TAPBP TAP-связывающий белок (тапазин)» .
- ^ Чжан Ю., Уильямс ДБ (2006). «Сборка молекул MHC класса I в эндоплазматическом ретикулуме». Иммунологические исследования . 35 (1–2): 151–62. DOI : 10.1385 / ИК: 35: 1: 151 . PMID 17003517 . S2CID 27816994 .
- ^ а б Полссон К.М., Клеймер М.Дж., Гриффит Дж., Джевон М., Чен С., Андерсон П.О., Шегрен Х.О., Ли С., Ван П. (май 2002 г.). «Ассоциация тапазина и COPI обеспечивает механизм ретроградного транспорта молекул класса I главного комплекса гистосовместимости (MHC) из комплекса Гольджи в эндоплазматический ретикулум» . Журнал биологической химии . 277 (21): 18266–71. DOI : 10.1074 / jbc.M201388200 . PMID 11884415 .
- ^ Рагхураман Г., Лапинский П.Е., Рагхаван М. (ноябрь 2002 г.). «Тапазин взаимодействует с трансмембранными доменами обеих субъединиц TAP и повышает структурную стабильность комплексов TAP1 x TAP2» . Журнал биологической химии . 277 (44): 41786–94. DOI : 10.1074 / jbc.M207128200 . PMID 12213826 .
дальнейшее чтение
- Бейли А., Далчау Н., Картер Р., Эммотт С., Филлипс А., Вернер Дж. М., Эллиот Т. (октябрь 2015 г.). «Селекторная функция молекул MHC I определяется пластичностью белка» . Научные отчеты . 5 : 14928. Bibcode : 2015NatSR ... 514928B . DOI : 10.1038 / srep14928 . PMC 5224517 . PMID 26482009 .
- Williams AP, Peh CA, Purcell AW, McCluskey J, Elliott T. (апрель 2002 г.). «Оптимизация груза пептида MHC класса I зависит от тапазина». Иммунитет . 16 (4): 509–20. DOI : 10.1016 / s1074-7613 (02) 00304-7 . PMID 11970875 .
- Ховарт М., Уильямс А., Толструп А.Б., Эллиотт Т. (август 2004 г.). «Тапазин усиливает представление пептида MHC класса I в соответствии с периодом полужизни пептида» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (32): 11737–42. Bibcode : 2004PNAS..10111737H . DOI : 10.1073 / pnas.0306294101 . PMC 511045 . PMID 15286279 .
- Schneeweiss C, Garstka M, Smith J, Hütt MT, Springer S (июнь 2009 г.). «Механизм действия тапазина в пептидном обмене на молекулы MHC класса I, определенный на основе исследований кинетического моделирования». Молекулярная иммунология . 46 (10): 2054–63. DOI : 10.1016 / j.molimm.2009.02.032 . PMID 19362740 .
- Turnquist HR, Vargas SE, Schenk EL, McIlhaney MM, Reber AJ, Solheim JC (2002). «Интерфейс между тапазином и MHC класса I: идентификация аминокислотных остатков в обоих белках, которые влияют на их взаимодействие». Иммунологические исследования . 25 (3): 261–9. DOI : 10.1385 / IR: 25: 3: 261 . PMID 12018464 . S2CID 42534968 .
- Момбург Ф., Тан П. (октябрь 2002 г.). «Тапазин - краеугольный камень загрузочного комплекса, оптимизирующего связывание пептидов молекулами MHC класса I в эндоплазматическом ретикулуме». Молекулярная иммунология . 39 (3–4): 217–33. DOI : 10.1016 / S0161-5890 (02) 00103-7 . PMID 12200052 .
- Диссемонд Дж., Котен Т., Мёрс Дж., Вейманн Т.К., Линдеке А., Гус М., Вагнер С.Н. (июнь 2003 г.). «Снижение экспрессии тапазина при прогрессирующей злокачественной меланоме человека». Архив дерматологических исследований . 295 (2): 43–9. DOI : 10.1007 / s00403-003-0393-8 . PMID 12682852 . S2CID 6496902 .
- Паулссон К., Ван П. (июнь 2003 г.). «Шапероны и сворачивание молекул MHC класса I в эндоплазматическом ретикулуме». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Исследование молекулярных клеток . 1641 (1): 1–12. DOI : 10.1016 / S0167-4889 (03) 00048-X . PMID 12788224 .
- Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Ю.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (апрель 1996 г.). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Аналитическая биохимия . 236 (1): 107–13. DOI : 10.1006 / abio.1996.0138 . PMID 8619474 .
- Садасиван Б., Ленер П.Дж., Ортманн Б., Шпион Т., Крессвелл П. (август 1996 г.). «Роли кальретикулина и нового гликопротеина, тапазина, во взаимодействии молекул MHC класса I с TAP». Иммунитет . 5 (2): 103–14. DOI : 10.1016 / S1074-7613 (00) 80487-2 . PMID 8769474 .
- Льюис Дж. У., Нейзиг А., Нифджес Дж., Эллиот Т. (июль 1996 г.). «Точечные мутации в альфа-2-домене HLA-A2.1 определяют функционально релевантное взаимодействие с TAP» . Текущая биология . 6 (7): 873–83. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (02) 00611-5 . PMID 8805302 .
- Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. К., Музни Д. М., Дин Й., Лю В., Рикафренте Д. Ю., Вентланд М. А., Леннон Г., Гиббс Р. А. (апрель 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК» . Геномные исследования . 7 (4): 353–8. DOI : 10.1101 / gr.7.4.353 . PMC 139146 . PMID 9110174 .
- Ли С., Сьегрен Х.О., Хеллман У., Петтерссон РФ, Ван П. (август 1997 г.). «Клонирование и функциональная характеристика субъединицы транспортера, связанного с процессингом антигена» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (16): 8708–13. Bibcode : 1997PNAS ... 94.8708L . DOI : 10.1073 / pnas.94.16.8708 . PMC 23091 . PMID 9238042 .
- Ортманн Б., Копман Дж., Ленер П.Дж., Садасиван Б., Херберг Д.А., Грандеа А.Г., Ридделл С.Р., Тампе Р., Шпион Т., Троусдейл Дж., Крессвелл П. (август 1997 г.). «Важнейшая роль тапасина в сборке и функционировании мультимерных комплексов MHC класса I-TAP». Наука . 277 (5330): 1306–9. DOI : 10.1126 / science.277.5330.1306 . PMID 9271576 .
- Херберг Дж. А., Сгоурос Дж., Джонс Т., Копман Дж., Хамфрей С. Дж., Шир Д., Крессвелл П., Бек С., Троусдейл Дж. (Февраль 1998 г.). «Геномный анализ гена Tapasin, расположенного рядом с локусами TAP в MHC» . Европейский журнал иммунологии . 28 (2): 459–67. DOI : 10.1002 / (SICI) 1521-4141 (199802) 28:02 <459 :: AID-IMMU459> 3.0.CO; 2-Z . PMID 9521053 .
- Линдквист Дж. А., Йенсен О. Н., Манн М., Хэммерлинг Г. Дж. (Апрель 1998 г.). «ER-60, шаперон с тиол-зависимой редуктазной активностью, участвующий в сборке MHC класса I» . Журнал EMBO . 17 (8): 2186–95. DOI : 10.1093 / emboj / 17.8.2186 . PMC 1170563 . PMID 9545232 .
- Херберг Дж. А., Бек С., Троусдейл Дж. (Апрель 1998 г.). «TAPASIN, DAXX, RGL2, HKE2 и четыре новых гена (BING 1, 3-5) образуют плотный кластер на центромерном конце MHC». Журнал молекулярной биологии . 277 (4): 839–57. DOI : 10.1006 / jmbi.1998.1637 . PMID 9545376 .
- Фурукава Х., Касивасе К., Ябэ Т., Исикава Ю., Аказа Т., Тадокоро К., Тохма С., Иноуэ Т., Токунага К., Ямамото К., Джуджи Т. (сентябрь 1998 г.). «Полиморфизм TAPASIN и его неравновесие по сцеплению с генами HLA класса II в популяции Японии». Тканевые антигены . 52 (3): 279–81. DOI : 10.1111 / j.1399-0039.1998.tb03044.x . PMID 9802609 .
- El Ouakfaoui S, Heitz D, Paquin R, Beaulieu AD (февраль 1999 г.). «Гранулоцитарно-макрофагальный колониестимулирующий фактор модулирует экспрессию тапазина в нейтрофилах человека» . Журнал биологии лейкоцитов . 65 (2): 205–10. DOI : 10.1002 / jlb.65.2.205 . PMID 10088603 . S2CID 31764268 .
- Бангиа Н., Ленер П.Дж., Хьюз Е.А., Сурман М., Крессвелл П. (июнь 1999 г.). «N-концевой участок тапасина необходим для стабилизации комплекса нагрузки MHC класса I» . Европейский журнал иммунологии . 29 (6): 1858–70. DOI : 10.1002 / (SICI) 1521-4141 (199906) 29:06 <1858 :: AID-IMMU1858> 3.0.CO; 2-C . PMID 10382748 .
- Knittler MR, Alberts P, Deverson EV, Howard JC (сентябрь 1999 г.). «Связывание нуклеотидов с помощью TAP опосредует ассоциацию с пептидом и высвобождение собранных молекул MHC класса I». Текущая биология . 9 (18): 999–1008. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (99) 80448-5 . PMID 10508608 . S2CID 18539813 .
- Ли С., Паульссон К.М., Чен С., Сьёгрен Х.О., Ван П. (январь 2000 г.). «Тапазин необходим для эффективного связывания пептида с переносчиком, связанным с процессингом антигена» . Журнал биологической химии . 275 (3): 1581–6. DOI : 10.1074 / jbc.275.3.1581 . PMID 10636848 .
- Tan P, Kropshofer H, Mandelboim O, Bulbuc N, Hämmerling GJ, Momburg F (февраль 2002 г.). «Рекрутирование молекул MHC класса I тапазином в транспортер, связанный с комплексом, связанным с процессингом антигена, является важным для оптимальной загрузки пептидов» . Журнал иммунологии . 168 (4): 1950–60. DOI : 10.4049 / jimmunol.168.4.1950 . PMID 11823531 .
- Mayer WE, Klein J (декабрь 2001 г.). «Является ли тапасин модифицированной молекулой Mhc класса I?». Иммуногенетика . 53 (9): 719–23. DOI : 10.1007 / s00251-001-0403-у . PMID 11862402 . S2CID 43163810 .
Внешние ссылки
- тапасин в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
- PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Human Tapasin.