Tectiviridae - это семейство вирусов, состоящее из10 видов и пяти родов. Бактерии служат естественными хозяевами. [2] [3] Теквирусы не имеют структуры "голова-хвост", но способны образовывать хвостообразные трубки размером ~ 60 × 10 нм при адсорбции или послеобработки хлороформом . Название происходит от латинского tectus (что означает «покрытый»). [4]
Tectiviridae | |
---|---|
КриоЭМ- модель капсида PRD1 фага энтеробактерий. Запись PDB 1gw7 [1] | |
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Царство : | Вариднавирия |
Королевство: | Bamfordvirae |
Тип: | Preplasmiviricota |
Класс: | Tectiliviricetes |
Заказ: | Kalamavirales |
Семья: | Tectiviridae |
Роды | |
Вирусология
В вирионов из Tectiviridae видов не охватило, икосаэдрическая и отображать псевдо T = 25 симметрии. [2] капсид имеет два слоя. Внешний слой представляет собой белковую структуру из 240 тримеров капсидных белков, а внутренний - белковую липидную мембрану, которая обволакивает геном вируса . Апикальные шипы, простирающиеся примерно на 20 нанометров (нм), выступают из вершин икосаэдров.
Геном представляет собой одиночную молекулу линейной двухцепочечной ДНК длиной 15 кило оснований и имеет 30 открытых рамок считывания. [2] Он образует плотно упакованную спираль и кодирует несколько структурных белков. Он кодирует около 30 белков, которые транскрибируются в оперонах. В вироне присутствует не менее 9 структурных белков. Геном имеет вес около 66 мегадальтон и составляет 14-15% вириона по весу. Липиды составляют еще 15 мас.%. Углеводов нет.
Жизненный цикл
Репликация вируса происходит в цитоплазме. Попадание в хозяйскую клетку достигается путем адсорбции в хозяйской клетке. [2] После адсорбции на поверхности клетки-хозяина вирион вытесняет структуру хвостовой трубки через вершину для доставки генома в хозяина. Репликация следует модели смещения цепи ДНК. Транскрипция с использованием ДНК-шаблона - это метод транскрипции. [2] Капсидные белки полимеризуются вокруг липопротеиновой везикулы, перемещаемой в цитоплазму факторами сборки вириона.
Зрелые вироны высвобождаются путем лизиса, который в случае PRD1 достигается с помощью кодируемого вирусом механизма лизиса, состоящего из четырех белков: P15 ( эндолизин ), [5] P35 (холин), [6] P36 и P37. (гомологи белков Rz / Rz1 фага лямбда). [7]
Таксономия
Tectiviridae включает следующие роды и виды: [3]
- Alphatectivirus
- Вирус псевдомонады PR4
- Вирус псевдомонады PRD1
- Betatectivirus
- Вирус Bacillus AP50
- Вирус Bacillus Bam35
- Вирус бациллы GIL16
- Вирус Bacillus Wip1
- Deltatectivirus
- Вирус Streptomyces Forthebois
- Вирус Streptomyces WheeHeim
- Эпсилонтективирус
- Вирус родококка Тойл
- Гамматективирус
- Глюконобактерный вирус GC1
Рекомендации
- ^ Сан-Мартин, C; Huiskonen, JT; Bamford, JK; Мясник, SJ; Фуллер, SD; Bamford, DH; Бернетт, RM (2002). «Минорные белки, подвижные руки и взаимодействия мембраны-капсида в капсиде бактериофага PRD1». Структурная биология природы . 9 (10): 756–63. DOI : 10.1038 / nsb837 . PMID 12219080 .
- ^ а б в г д «Вирусная зона» . ExPASy . Проверено 15 июня 2015 года .
- ^ а б «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 . Проверено 22 мая 2021 года .
- ^ «Девятый отчет ICTV; Выпуск таксономии 2009 г .: Tectiviridae » . ICTV . ICTV . Проверено 18 сентября 2020 .
- ^ Caldentey J, Hänninen AL, Bamford DH (1994). «Ген XV бактериофага PRD1 кодирует литический фермент с мурамидазной активностью» . Eur J Biochem . 225 (1): 341–346. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1994.00341.x . PMID 7925454 .
- ^ Райдман П.С., Бэмфорд Д.Х. (2003). «Идентификация и мутационный анализ холинового белка P35 бактериофага PRD1» . J Bacteriol . 185 (13): 3795–3803. DOI : 10.1128 / JB.185.13.3795-3803.2003 . PMC 161566 . PMID 12813073 .
- ^ Крупович М., Цвиркайте-Крупович В., Бэмфорд Д.Х. (2008). «Идентификация и функциональный анализ Rz / Rz1-подобных дополнительных генов лизиса в мембранном бактериофаге PRD1» . Mol Microbiol . 68 (2): 492–503. DOI : 10.1111 / j.1365-2958.2008.06165.x . PMID 18366440 .
дальнейшее чтение
- ICTVdB - Управление универсальной базой данных вирусов ICTVdB (2006 г.). 00.068. Tectiviridae. В: ICTVdB - Универсальная база данных вирусов, версия 3. Бюхен-Осмонд, К. (Эд), Колумбийский университет, Нью-Йорк, США.
- Таксономия вирусов : восьмой отчет Международного комитета по таксономии вирусов HV Van Regenmortel, DHL Bishop, MH Van Regenmortel, Claude M. Fauquet (ред.)
- 68.0.1. Теквирус
Внешние ссылки
- Viralzone : Tectivirus
- ICTV