Тенасцину-R представляет собой белок , который у человека кодируется TNR гена . [5] [6] [7]
TNR | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | TNR , TN-R, тенасцин R | ||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | OMIM : 601995 MGI : 99516 HomoloGene : 124416 GeneCards : TNR | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||||||||||
Разновидность | Человек | Мышь | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ансамбль |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (белок) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Расположение (UCSC) | Chr 1: 175.32 - 175.74 Мб | Chr 1: 159.52 - 159.93 Мб | |||||||||||||||||||||||
PubMed поиск | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||
|
Функция
Тенасцин-R (TNR) представляет собой белок внеклеточного матрикса, экспрессируемый в основном в центральной нервной системе. Он является членом семейства генов тенасцина (TN), которое включает по крайней мере 3 гена у млекопитающих: TNC (или гексабрахион), TNX (TNXB) и TNR. [8] Гены экспрессируются в разных тканях в разное время во время эмбрионального развития и присутствуют во взрослых тканях. [Предоставлено OMIM] [7]
Рекомендации
- ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000116147 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015829 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Карнемолла Б., Леприни А., Борси Л., Кверзе Дж., Урбини С., Зарди Л. (апрель 1996 г.). «Человеческий тенасцин-R. Полная первичная структура, альтернативный сплайсинг пре-мРНК и локализация гена на хромосоме 1q23-q24» . Журнал биологической химии . 271 (14): 8157–60. DOI : 10.1074 / jbc.271.14.8157 . PMID 8626505 .
- ^ Леприни А., Герци Р., Сири А., Кверзе Дж., Вити Ф, Зарди Л. (декабрь 1996 г.). «Ген тенасцина-R человека» . Журнал биологической химии . 271 (49): 31251–4. DOI : 10.1074 / jbc.271.49.31251 . PMID 8940128 .
- ^ а б «Энтрез Ген: TNR тенасцин R (рестриктин, янусин)» .
- ^ Эриксон HP (октябрь 1993 г.). «Tenascin-C, tenascin-R и tenascin-X: семейство талантливых белков в поисках функций». Текущее мнение в клеточной биологии . 5 (5): 869–76. DOI : 10.1016 / 0955-0674 (93) 90037-Q . PMID 7694605 .
дальнейшее чтение
- Эриксон HP (октябрь 1993 г.). «Tenascin-C, tenascin-R и tenascin-X: семейство талантливых белков в поисках функций». Текущее мнение в клеточной биологии . 5 (5): 869–76. DOI : 10.1016 / 0955-0674 (93) 90037-Q . PMID 7694605 .
- Сяо З.С., Тейлор Дж., Монтаг Д., Ругон Дж., Шахнер М. (апрель 1996 г.). «Отчетливые эффекты рекомбинантных доменов тенасцина-R на функции нейрональных клеток и идентификация домена, взаимодействующего с молекулой распознавания нейронов F3 / 11». Европейский журнал неврологии . 8 (4): 766–82. DOI : 10.1111 / j.1460-9568.1996.tb01262.x . PMID 9081628 . S2CID 30389358 .
- Аспберг А., Миура Р., Бурдулус С., Шимонака М., Хейнегард Д., Шахнер М., Руослахти Е., Ямагути Ю. (сентябрь 1997 г.). «Лектиновые домены С-типа лектиканов, семейства агрегационных хондроитинсульфатных протеогликанов, связывают тенасцин-R посредством белок-белковых взаимодействий независимо от углеводной части» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (19): 10116–21. Bibcode : 1997PNAS ... 9410116A . DOI : 10.1073 / pnas.94.19.10116 . PMC 23322 . PMID 9294172 .
- Xiao ZC, Hillenbrand R, Schachner M, Thermes S, Rougon G, Gomez S (сентябрь 1997 г.). «Сигнальные события после взаимодействия молекулы нейрональной адгезии F3 с N-концевым доменом тенасцина-R». Журнал неврологических исследований . 49 (6): 698–709. DOI : 10.1002 / (SICI) 1097-4547 (19970915) 49: 6 <698 :: AID-JNR4> 3.0.CO; 2-2 . PMID 9335257 .
- Арриго Дж., Герци Р., Бональя М.С., Леприни А., Зуффарди О, Зарди Л. (1997). «Отнесение гена тенасцина-R (Tnr) к полосе E2 хромосомы 4 мыши путем флуоресцентной гибридизации in situ; уточнение положения TNR человека на хромосоме 1q24». Цитогенетика и клеточная генетика . 78 (2): 145–6. DOI : 10.1159 / 000134650 . PMID 9371410 .
- Фолькмер Х., Захариас У., Неренберг У., Ратиен Ф.Г. (август 1998 г.). «Рассмотрение сложных молекулярных взаимодействий нейрофасцина с аксонином-1, F11 и тенасцином-R, которые способствуют прикреплению и формированию нейритов тектальных клеток» . Журнал клеточной биологии . 142 (4): 1083–93. DOI : 10,1083 / jcb.142.4.1083 . PMC 2132869 . PMID 9722619 .
- Замзе С., Харви Д. Д., Пешева П., Матту Т. С., Шахнер М., Двек Р. А., Wing DR (август 1999 г.). «В гликозилировании гликопротеина внеклеточного матрикса, специфичного для ЦНС, тенасцина-R, преобладают О-связанные сиалированные гликаны и нейтральные N-гликаны« мозгового типа »» . Гликобиология . 9 (8): 823–31. DOI : 10.1093 / glycob / 9.8.823 . PMID 10406848 .
- Олин А.И., Моргелин М., Сасаки Т., Тимпл Р., Хейнегард Д., Аспберг А. (январь 2001 г.). «Протеогликаны аггрекан и версикан образуют сети с фибулином-2 посредством связывания их лектинового домена» . Журнал биологической химии . 276 (2): 1253–61. DOI : 10.1074 / jbc.M006783200 . PMID 11038354 .
- Xu XR, Huang J, Xu ZG, Qian BZ, Zhu ZD, Yan Q, Cai T, Zhang X, Xiao HS, Qu J, Liu F, Huang QH, Cheng ZH, Li NG, Du JJ, Hu W, Shen KT , Лу Г, Фу Г, Чжун М, Сюй Ш, Гу Вай, Хуанг У, Чжао XT, Ху ГХ, Гу Дж. Р., Чен З, Хан Ц. (декабрь 2001 г.). «Понимание гепатоцеллюлярного канцерогенеза на уровне транскриптома путем сравнения профилей экспрессии генов гепатоцеллюлярной карциномы с профилями соответствующей доброкачественной печени» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (26): 15089–94. Bibcode : 2001PNAS ... 9815089X . DOI : 10.1073 / pnas.241522398 . PMC 64988 . PMID 11752456 .
- Вудворт А., Пешева П., Фите Д., Баензигер Ю.Ю. (март 2004 г.). «Нейрон-специфический синтез и гликозилирование тенасцина-R» . Журнал биологической химии . 279 (11): 10413–21. DOI : 10.1074 / jbc.M312466200 . PMID 14681222 .
- Букало О., Шахнер М., Дитятьев А. (май 2007 г.). «Метапластичность гиппокампа, вызванная дефицитом гликопротеина тенасцина-R внеклеточного матрикса» . Журнал неврологии . 27 (22): 6019–28. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.1022-07.2007 . PMC 6672247 . PMID 17537973 .